MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021013	CCG	2	6	423028	423033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150419
6002	NC_021013	ATC	2	6	423136	423141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150419
6003	NC_021013	TAC	2	6	423152	423157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150419
6004	NC_021013	TCA	2	6	423242	423247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150420
6005	NC_021013	T	6	6	423257	423262	0 %	100 %	0 %	0 %	479150420
6006	NC_021013	CCG	2	6	423309	423314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150420
6007	NC_021013	AAC	2	6	423328	423333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150420
6008	NC_021013	TTC	2	6	423376	423381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150420
6009	NC_021013	TCA	2	6	423471	423476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150420
6010	NC_021013	CCT	2	6	424423	424428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150421
6011	NC_021013	T	7	7	424568	424574	0 %	100 %	0 %	0 %	479150421
6012	NC_021013	TTC	2	6	424784	424789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150421
6013	NC_021013	CA	3	6	424886	424891	50 %	0 %	0 %	50 %	479150421
6014	NC_021013	CCT	2	6	424934	424939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150422
6015	NC_021013	CTT	2	6	424940	424945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150422
6016	NC_021013	ACG	2	6	424965	424970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150422
6017	NC_021013	CCG	2	6	425014	425019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150422
6018	NC_021013	TCAT	2	8	425062	425069	25 %	50 %	0 %	25 %	479150422
6019	NC_021013	TCT	2	6	425176	425181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150423
6020	NC_021013	TCA	2	6	425248	425253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150423
6021	NC_021013	CATT	2	8	425268	425275	25 %	50 %	0 %	25 %	479150423
6022	NC_021013	TTCT	2	8	425334	425341	0 %	75 %	0 %	25 %	479150423
6023	NC_021013	CGC	2	6	425362	425367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150423
6024	NC_021013	TTCAAA	2	12	425411	425422	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479150423
6025	NC_021013	CCT	2	6	425437	425442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150424
6026	NC_021013	CGC	2	6	425516	425521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150424
6027	NC_021013	GAA	2	6	425569	425574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150424
6028	NC_021013	CCG	2	6	425685	425690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150424
6029	NC_021013	TC	3	6	425715	425720	0 %	50 %	0 %	50 %	479150424
6030	NC_021013	TCA	2	6	425763	425768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150424
6031	NC_021013	AAT	2	6	425828	425833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150424
6032	NC_021013	ATC	2	6	425865	425870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150424
6033	NC_021013	TCT	2	6	425878	425883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150425
6034	NC_021013	CA	3	6	425891	425896	50 %	0 %	0 %	50 %	479150425
6035	NC_021013	ATA	2	6	425931	425936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150425
6036	NC_021013	T	6	6	425987	425992	0 %	100 %	0 %	0 %	479150425
6037	NC_021013	AATA	2	8	426021	426028	75 %	25 %	0 %	0 %	479150425
6038	NC_021013	TGT	2	6	426089	426094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150425
6039	NC_021013	CCG	2	6	426136	426141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150425
6040	NC_021013	TCA	2	6	426203	426208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150425
6041	NC_021013	CCT	2	6	426567	426572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150426
6042	NC_021013	TCA	2	6	426580	426585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150426
6043	NC_021013	CGG	2	6	426619	426624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150426
6044	NC_021013	AAC	2	6	426680	426685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150426
6045	NC_021013	GCCT	2	8	426689	426696	0 %	25 %	25 %	50 %	479150426
6046	NC_021013	GAA	2	6	426763	426768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150426
6047	NC_021013	GA	3	6	426841	426846	50 %	0 %	50 %	0 %	479150426
6048	NC_021013	TCT	2	6	426856	426861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150426
6049	NC_021013	GCC	2	6	426950	426955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150426
6050	NC_021013	CGG	2	6	426976	426981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150426
6051	NC_021013	AT	3	6	427044	427049	50 %	50 %	0 %	0 %	479150426
6052	NC_021013	AAGCG	2	10	427095	427104	40 %	0 %	40 %	20 %	479150426
6053	NC_021013	ATG	2	6	427111	427116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150426
6054	NC_021013	CAA	2	6	427117	427122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150426
6055	NC_021013	CGA	2	6	427201	427206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150426
6056	NC_021013	ATC	2	6	427220	427225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150426
6057	NC_021013	TGTC	2	8	427270	427277	0 %	50 %	25 %	25 %	479150426
6058	NC_021013	CT	3	6	427309	427314	0 %	50 %	0 %	50 %	479150426
6059	NC_021013	A	6	6	427379	427384	100 %	0 %	0 %	0 %	479150426
6060	NC_021013	CCTTAA	2	12	427411	427422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150426
6061	NC_021013	ATAC	2	8	427538	427545	50 %	25 %	0 %	25 %	479150426
6062	NC_021013	ATA	2	6	427578	427583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150426
6063	NC_021013	CT	3	6	427646	427651	0 %	50 %	0 %	50 %	479150427
6064	NC_021013	GTT	2	6	427656	427661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150427
6065	NC_021013	CGC	2	6	427672	427677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150427
6066	NC_021013	AAC	2	6	427754	427759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150427
6067	NC_021013	CA	3	6	427785	427790	50 %	0 %	0 %	50 %	479150427
6068	NC_021013	GCCT	2	8	427856	427863	0 %	25 %	25 %	50 %	479150427
6069	NC_021013	ATA	3	9	427929	427937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150427
6070	NC_021013	ACTGA	2	10	427950	427959	40 %	20 %	20 %	20 %	479150428
6071	NC_021013	GCT	2	6	428023	428028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150428
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6073	NC_021013	AT	3	6	428212	428217	50 %	50 %	0 %	0 %	479150428
6074	NC_021013	CTG	2	6	428230	428235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150428
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6076	NC_021013	TGCC	2	8	428333	428340	0 %	25 %	25 %	50 %	479150428
6077	NC_021013	ACGGC	2	10	428351	428360	20 %	0 %	40 %	40 %	479150428
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6079	NC_021013	CA	3	6	428470	428475	50 %	0 %	0 %	50 %	479150428
6080	NC_021013	CA	3	6	428479	428484	50 %	0 %	0 %	50 %	479150428
6081	NC_021013	ATA	2	6	428545	428550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150428
6082	NC_021013	CCTTG	2	10	428583	428592	0 %	40 %	20 %	40 %	479150428
6083	NC_021013	GTA	2	6	428598	428603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150428
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6087	NC_021013	T	6	6	428819	428824	0 %	100 %	0 %	0 %	479150428
6088	NC_021013	CAA	2	6	428894	428899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150428
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6090	NC_021013	TCC	2	6	430090	430095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150429
6091	NC_021013	GTC	2	6	430164	430169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150429
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6093	NC_021013	GTCT	2	8	430303	430310	0 %	50 %	25 %	25 %	479150429
6094	NC_021013	CA	3	6	430407	430412	50 %	0 %	0 %	50 %	479150429
6095	NC_021013	CTC	2	6	430458	430463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150429
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6098	NC_021013	T	6	6	430531	430536	0 %	100 %	0 %	0 %	479150429
6099	NC_021013	ATG	2	6	430553	430558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150429
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6101	NC_021013	CAA	2	6	430907	430912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150429
6102	NC_021013	TCA	2	6	431021	431026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150429
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6106	NC_021013	T	6	6	431313	431318	0 %	100 %	0 %	0 %	479150429
6107	NC_021013	TTG	2	6	432107	432112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150430
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6109	NC_021013	TTTC	2	8	432240	432247	0 %	75 %	0 %	25 %	479150430
6110	NC_021013	ATC	2	6	432260	432265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150430
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6112	NC_021013	GTA	2	6	432405	432410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150431
6113	NC_021013	T	6	6	433204	433209	0 %	100 %	0 %	0 %	479150432
6114	NC_021013	AC	3	6	433317	433322	50 %	0 %	0 %	50 %	479150432
6115	NC_021013	ACA	2	6	433349	433354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150432
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6117	NC_021013	GAC	2	6	433930	433935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150433
6118	NC_021013	AACAC	2	10	433949	433958	60 %	0 %	0 %	40 %	479150433
6119	NC_021013	GAG	2	6	433987	433992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150433
6120	NC_021013	ACAA	2	8	434011	434018	75 %	0 %	0 %	25 %	479150433
6121	NC_021013	GAA	2	6	434155	434160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150433
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6123	NC_021013	TCAA	2	8	434218	434225	50 %	25 %	0 %	25 %	479150433
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6249	NC_021013	TGT	2	6	441849	441854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150437
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6361	NC_021013	TG	4	8	451148	451155	0 %	50 %	50 %	0 %	479150442
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6490	NC_021013	CAA	2	6	462072	462077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150450
6491	NC_021013	GGC	2	6	462112	462117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150450
6492	NC_021013	CCA	2	6	462295	462300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150450
6493	NC_021013	AT	3	6	462304	462309	50 %	50 %	0 %	0 %	479150450
6494	NC_021013	TA	3	6	462337	462342	50 %	50 %	0 %	0 %	479150450
6495	NC_021013	CA	3	6	462510	462515	50 %	0 %	0 %	50 %	479150451
6496	NC_021013	GCCT	2	8	462521	462528	0 %	25 %	25 %	50 %	479150451
6497	NC_021013	CCG	2	6	462561	462566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150451
6498	NC_021013	CAT	2	6	462635	462640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150451
6499	NC_021013	CAGG	2	8	462729	462736	25 %	0 %	50 %	25 %	479150451
6500	NC_021013	CTTGA	2	10	462774	462783	20 %	40 %	20 %	20 %	479150451

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