MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021013	TTGC	2	8	319194	319201	0 %	50 %	25 %	25 %	479150345
4502	NC_021013	TCTTAT	2	12	319319	319330	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479150346
4503	NC_021013	CAATA	2	10	319338	319347	60 %	20 %	0 %	20 %	479150346
4504	NC_021013	CAA	2	6	319371	319376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150346
4505	NC_021013	GTTT	2	8	319378	319385	0 %	75 %	25 %	0 %	479150346
4506	NC_021013	T	6	6	319383	319388	0 %	100 %	0 %	0 %	479150346
4507	NC_021013	AGACAA	2	12	319826	319837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479150347
4508	NC_021013	GTG	2	6	319847	319852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150347
4509	NC_021013	GAA	2	6	319934	319939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150347
4510	NC_021013	GAG	2	6	320053	320058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150347
4511	NC_021013	GT	3	6	320065	320070	0 %	50 %	50 %	0 %	479150347
4512	NC_021013	GCA	2	6	320125	320130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150347
4513	NC_021013	T	6	6	320139	320144	0 %	100 %	0 %	0 %	479150347
4514	NC_021013	A	6	6	320225	320230	100 %	0 %	0 %	0 %	479150347
4515	NC_021013	CTGC	2	8	320294	320301	0 %	25 %	25 %	50 %	479150347
4516	NC_021013	ATC	2	6	320305	320310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150347
4517	NC_021013	CTG	2	6	320331	320336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150347
4518	NC_021013	TGC	2	6	320413	320418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150347
4519	NC_021013	AC	3	6	320495	320500	50 %	0 %	0 %	50 %	479150347
4520	NC_021013	A	6	6	320555	320560	100 %	0 %	0 %	0 %	479150347
4521	NC_021013	CAG	2	6	320562	320567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150347
4522	NC_021013	AGAA	2	8	320610	320617	75 %	0 %	25 %	0 %	479150347
4523	NC_021013	CAT	2	6	320675	320680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150347
4524	NC_021013	TCA	2	6	320711	320716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150347
4525	NC_021013	GAA	2	6	320727	320732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150347
4526	NC_021013	AGG	2	6	320780	320785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150347
4527	NC_021013	CA	3	6	320874	320879	50 %	0 %	0 %	50 %	479150347
4528	NC_021013	TGC	2	6	320898	320903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150347
4529	NC_021013	CAA	2	6	320936	320941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150347
4530	NC_021013	AAT	2	6	320952	320957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150347
4531	NC_021013	A	7	7	320985	320991	100 %	0 %	0 %	0 %	479150347
4532	NC_021013	CTT	2	6	321293	321298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4533	NC_021013	AGG	2	6	321340	321345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150348
4534	NC_021013	CTT	3	9	321362	321370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4535	NC_021013	GAG	2	6	321384	321389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150348
4536	NC_021013	CAT	2	6	321411	321416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150348
4537	NC_021013	CGG	2	6	321423	321428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150348
4538	NC_021013	TTC	2	6	321465	321470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4539	NC_021013	ATA	2	6	321477	321482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150348
4540	NC_021013	CTGTGC	2	12	321512	321523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150348
4541	NC_021013	TCA	2	6	321526	321531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150348
4542	NC_021013	CTT	2	6	321549	321554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4543	NC_021013	CTT	2	6	321558	321563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4544	NC_021013	TTC	2	6	321633	321638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4545	NC_021013	AATC	2	8	321668	321675	50 %	25 %	0 %	25 %	479150348
4546	NC_021013	CAA	2	6	321683	321688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150348
4547	NC_021013	CTT	2	6	321720	321725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4548	NC_021013	GAG	2	6	321789	321794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150348
4549	NC_021013	TCA	2	6	321889	321894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150348
4550	NC_021013	CCT	2	6	321914	321919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150348
4551	NC_021013	CT	4	8	321933	321940	0 %	50 %	0 %	50 %	479150348
4552	NC_021013	TC	3	6	322008	322013	0 %	50 %	0 %	50 %	479150348
4553	NC_021013	TCT	2	6	322037	322042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4554	NC_021013	GAT	2	6	322067	322072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150348
4555	NC_021013	TTC	2	6	322113	322118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4556	NC_021013	CTT	2	6	322143	322148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4557	NC_021013	TTC	2	6	322155	322160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4558	NC_021013	TTGCCT	2	12	322187	322198	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479150348
4559	NC_021013	TCA	2	6	322201	322206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150348
4560	NC_021013	GAAT	2	8	322207	322214	50 %	25 %	25 %	0 %	479150348
4561	NC_021013	TC	3	6	322266	322271	0 %	50 %	0 %	50 %	479150348
4562	NC_021013	TTG	3	9	322313	322321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150348
4563	NC_021013	CCT	2	6	322331	322336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150348
4564	NC_021013	CAT	2	6	322371	322376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150348
4565	NC_021013	CCG	2	6	322594	322599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150348
4566	NC_021013	CGG	2	6	322657	322662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150348
4567	NC_021013	TAC	2	6	322664	322669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150348
4568	NC_021013	ATA	2	6	322717	322722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150348
4569	NC_021013	TTC	3	9	322917	322925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150348
4570	NC_021013	CCTTGC	2	12	322994	323005	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479150348
4571	NC_021013	TTG	2	6	323102	323107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150348
4572	NC_021013	CTGC	2	8	323125	323132	0 %	25 %	25 %	50 %	479150348
4573	NC_021013	T	6	6	323133	323138	0 %	100 %	0 %	0 %	479150348
4574	NC_021013	CTG	2	6	323190	323195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150348
4575	NC_021013	CGC	2	6	323334	323339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150349
4576	NC_021013	CAA	2	6	323355	323360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150349
4577	NC_021013	TCTG	3	12	323472	323483	0 %	50 %	25 %	25 %	479150349
4578	NC_021013	AAC	2	6	323503	323508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150349
4579	NC_021013	TCA	2	6	323546	323551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150349
4580	NC_021013	TAG	2	6	323583	323588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150349
4581	NC_021013	ATA	2	6	323603	323608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150349
4582	NC_021013	CAT	3	9	323625	323633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150349
4583	NC_021013	T	6	6	323708	323713	0 %	100 %	0 %	0 %	479150349
4584	NC_021013	TTG	2	6	323763	323768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150349
4585	NC_021013	GAGGT	2	10	324878	324887	20 %	20 %	60 %	0 %	479150350
4586	NC_021013	CCGC	2	8	324996	325003	0 %	0 %	25 %	75 %	479150350
4587	NC_021013	CCG	3	9	325032	325040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150350
4588	NC_021013	TG	3	6	325069	325074	0 %	50 %	50 %	0 %	479150350
4589	NC_021013	CTG	2	6	325080	325085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150350
4590	NC_021013	CAA	2	6	325093	325098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150350
4591	NC_021013	CAA	2	6	325117	325122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150350
4592	NC_021013	ATG	2	6	325134	325139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150350
4593	NC_021013	CCG	2	6	325161	325166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150350
4594	NC_021013	GAT	2	6	325263	325268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150350
4595	NC_021013	TGA	2	6	325280	325285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150350
4596	NC_021013	TGA	2	6	325307	325312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150350
4597	NC_021013	GCT	2	6	325325	325330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150350
4598	NC_021013	TGA	2	6	325331	325336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150350
4599	NC_021013	GCTTGA	2	12	325340	325351	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479150350
4600	NC_021013	AGC	2	6	325367	325372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150350
4601	NC_021013	GCA	2	6	325380	325385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150350
4602	NC_021013	TCA	2	6	325428	325433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150350
4603	NC_021013	TTA	2	6	325524	325529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150350
4604	NC_021013	CTG	2	6	325559	325564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150350
4605	NC_021013	TCTT	2	8	325575	325582	0 %	75 %	0 %	25 %	479150350
4606	NC_021013	TCT	2	6	325600	325605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150350
4607	NC_021013	ATC	2	6	325847	325852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150350
4608	NC_021013	T	6	6	325888	325893	0 %	100 %	0 %	0 %	479150350
4609	NC_021013	GAACCT	2	12	325900	325911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479150350
4610	NC_021013	ATC	2	6	325964	325969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150350
4611	NC_021013	TCT	2	6	325975	325980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150350
4612	NC_021013	GCT	2	6	326005	326010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150350
4613	NC_021013	TGT	2	6	326016	326021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150350
4614	NC_021013	CAG	2	6	326044	326049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150350
4615	NC_021013	AGT	2	6	326054	326059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150350
4616	NC_021013	GAA	2	6	326227	326232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150351
4617	NC_021013	GCC	2	6	326263	326268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150351
4618	NC_021013	AATC	2	8	326301	326308	50 %	25 %	0 %	25 %	479150351
4619	NC_021013	TTG	2	6	326487	326492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150351
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4621	NC_021013	ACAA	2	8	326539	326546	75 %	0 %	0 %	25 %	479150351
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4868	NC_021013	GAA	2	6	343601	343606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150369
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4871	NC_021013	GAA	2	6	343914	343919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150369
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4985	NC_021013	CATTA	2	10	355123	355132	40 %	40 %	0 %	20 %	479150374
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4989	NC_021013	CAG	2	6	355304	355309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150374
4990	NC_021013	AACCG	2	10	355339	355348	40 %	0 %	20 %	40 %	479150374
4991	NC_021013	TTG	2	6	355365	355370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150374
4992	NC_021013	T	6	6	355381	355386	0 %	100 %	0 %	0 %	479150374
4993	NC_021013	CCG	2	6	355391	355396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150374
4994	NC_021013	AAAG	2	8	355411	355418	75 %	0 %	25 %	0 %	479150374
4995	NC_021013	ATA	2	6	355558	355563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150374
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4997	NC_021013	TCC	2	6	355724	355729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150374
4998	NC_021013	TTCGG	2	10	355748	355757	0 %	40 %	40 %	20 %	479150374
4999	NC_021013	TCA	2	6	355758	355763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150374
5000	NC_021013	T	6	6	355767	355772	0 %	100 %	0 %	0 %	479150374

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