MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 2326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021012	ATTAT	2	10	1334	1343	40 %	60 %	0 %	0 %	479146201
2	NC_021012	AGAAA	2	10	3548	3557	80 %	0 %	20 %	0 %	479146203
3	NC_021012	GATGT	2	10	4228	4237	20 %	40 %	40 %	0 %	479146203
4	NC_021012	TGCAT	2	10	5867	5876	20 %	40 %	20 %	20 %	479146207
5	NC_021012	CAACA	2	10	8643	8652	60 %	0 %	0 %	40 %	479146210
6	NC_021012	CTGCC	2	10	13385	13394	0 %	20 %	20 %	60 %	479146216
7	NC_021012	CCGCA	2	10	17135	17144	20 %	0 %	20 %	60 %	479146219
8	NC_021012	GCGCG	2	10	18935	18944	0 %	0 %	60 %	40 %	479146220
9	NC_021012	CCGAC	2	10	19435	19444	20 %	0 %	20 %	60 %	479146220
10	NC_021012	GTCCG	2	10	19505	19514	0 %	20 %	40 %	40 %	479146220
11	NC_021012	ATGGA	2	10	22962	22971	40 %	20 %	40 %	0 %	479146221
12	NC_021012	TTATC	2	10	26887	26896	20 %	60 %	0 %	20 %	479146226
13	NC_021012	GGTGT	2	10	28543	28552	0 %	40 %	60 %	0 %	479146227
14	NC_021012	GGAAT	2	10	29788	29797	40 %	20 %	40 %	0 %	479146229
15	NC_021012	TACAA	2	10	32975	32984	60 %	20 %	0 %	20 %	479146234
16	NC_021012	TTATA	2	10	33757	33766	40 %	60 %	0 %	0 %	479146234
17	NC_021012	TGATG	2	10	33793	33802	20 %	40 %	40 %	0 %	479146234
18	NC_021012	GTGAT	2	10	34309	34318	20 %	40 %	40 %	0 %	479146236
19	NC_021012	ATGAT	2	10	36348	36357	40 %	40 %	20 %	0 %	479146236
20	NC_021012	TCTTG	2	10	38293	38302	0 %	60 %	20 %	20 %	479146238
21	NC_021012	TGCAC	2	10	40888	40897	20 %	20 %	20 %	40 %	479146240
22	NC_021012	CGGTA	2	10	42637	42646	20 %	20 %	40 %	20 %	479146242
23	NC_021012	AAGAT	2	10	48518	48527	60 %	20 %	20 %	0 %	479146245
24	NC_021012	ACAGC	2	10	52450	52459	40 %	0 %	20 %	40 %	479146248
25	NC_021012	ATCCC	2	10	52976	52985	20 %	20 %	0 %	60 %	479146249
26	NC_021012	ATTTA	2	10	59523	59532	40 %	60 %	0 %	0 %	479146253
27	NC_021012	TATAT	2	10	59808	59817	40 %	60 %	0 %	0 %	479146253
28	NC_021012	TAAGT	2	10	60528	60537	40 %	40 %	20 %	0 %	479146255
29	NC_021012	TTTTA	2	10	64058	64067	20 %	80 %	0 %	0 %	479146257
30	NC_021012	CGTGG	2	10	67482	67491	0 %	20 %	60 %	20 %	479146260
31	NC_021012	GAAAA	2	10	67803	67812	80 %	0 %	20 %	0 %	479146260
32	NC_021012	TAAAT	2	10	68860	68869	60 %	40 %	0 %	0 %	479146261
33	NC_021012	AGCGA	2	10	70150	70159	40 %	0 %	40 %	20 %	479146262
34	NC_021012	TGGTC	2	10	71537	71546	0 %	40 %	40 %	20 %	479146264
35	NC_021012	GCAGA	2	10	74004	74013	40 %	0 %	40 %	20 %	479146266
36	NC_021012	AGCAA	2	10	76504	76513	60 %	0 %	20 %	20 %	479146267
37	NC_021012	GATGA	2	10	77692	77701	40 %	20 %	40 %	0 %	479146268
38	NC_021012	TTAAA	2	10	77893	77902	60 %	40 %	0 %	0 %	479146268
39	NC_021012	AGATC	2	10	80828	80837	40 %	20 %	20 %	20 %	479146271
40	NC_021012	AACTG	2	10	82407	82416	40 %	20 %	20 %	20 %	479146272
41	NC_021012	AAAAG	2	10	82603	82612	80 %	0 %	20 %	0 %	479146272
42	NC_021012	GCAGT	2	10	84839	84848	20 %	20 %	40 %	20 %	479146274
43	NC_021012	AAATG	2	10	87163	87172	60 %	20 %	20 %	0 %	479146277
44	NC_021012	TATCT	2	10	88048	88057	20 %	60 %	0 %	20 %	479146278
45	NC_021012	ATGAT	2	10	89125	89134	40 %	40 %	20 %	0 %	479146278
46	NC_021012	GATGC	2	10	89355	89364	20 %	20 %	40 %	20 %	479146278
47	NC_021012	GGAAA	2	10	89795	89804	60 %	0 %	40 %	0 %	479146279
48	NC_021012	CGCAG	2	10	91738	91747	20 %	0 %	40 %	40 %	479146280
49	NC_021012	ATTTT	2	10	92803	92812	20 %	80 %	0 %	0 %	479146280
50	NC_021012	ACGGA	2	10	93630	93639	40 %	0 %	40 %	20 %	479146281
51	NC_021012	TACCG	2	10	98246	98255	20 %	20 %	20 %	40 %	479146284
52	NC_021012	ATATC	2	10	100800	100809	40 %	40 %	0 %	20 %	479146285
53	NC_021012	ACAGA	2	10	108578	108587	60 %	0 %	20 %	20 %	479146292
54	NC_021012	CATAA	2	10	109476	109485	60 %	20 %	0 %	20 %	479146294
55	NC_021012	TTTTA	2	10	110241	110250	20 %	80 %	0 %	0 %	479146294
56	NC_021012	TTCGT	2	10	110754	110763	0 %	60 %	20 %	20 %	479146296
57	NC_021012	GACTG	2	10	112779	112788	20 %	20 %	40 %	20 %	479146297
58	NC_021012	CGGAC	2	10	121076	121085	20 %	0 %	40 %	40 %	479146306
59	NC_021012	AGAAC	2	10	121516	121525	60 %	0 %	20 %	20 %	479146307
60	NC_021012	ATCGA	2	10	122859	122868	40 %	20 %	20 %	20 %	479146309
61	NC_021012	TAAAG	2	10	124641	124650	60 %	20 %	20 %	0 %	479146312
62	NC_021012	TATCA	2	10	125404	125413	40 %	40 %	0 %	20 %	479146312
63	NC_021012	CGGTG	2	10	128381	128390	0 %	20 %	60 %	20 %	479146314
64	NC_021012	AGAAA	2	10	129056	129065	80 %	0 %	20 %	0 %	479146314
65	NC_021012	GATCC	2	10	129701	129710	20 %	20 %	20 %	40 %	479146315
66	NC_021012	AAGAC	2	10	136446	136455	60 %	0 %	20 %	20 %	479146325
67	NC_021012	GACTA	2	10	139852	139861	40 %	20 %	20 %	20 %	479146329
68	NC_021012	AAAAG	2	10	142444	142453	80 %	0 %	20 %	0 %	479146332
69	NC_021012	GAAAT	2	10	145975	145984	60 %	20 %	20 %	0 %	479146335
70	NC_021012	GTTTG	2	10	147787	147796	0 %	60 %	40 %	0 %	479146339
71	NC_021012	TGTTC	2	10	148571	148580	0 %	60 %	20 %	20 %	479146339
72	NC_021012	GTTTT	2	10	149238	149247	0 %	80 %	20 %	0 %	479146341
73	NC_021012	GTCCG	2	10	153386	153395	0 %	20 %	40 %	40 %	479146345
74	NC_021012	TTCTT	2	10	167560	167569	0 %	80 %	0 %	20 %	479146349
75	NC_021012	ATCTC	2	10	173722	173731	20 %	40 %	0 %	40 %	479146350
76	NC_021012	TAAAC	2	10	176220	176229	60 %	20 %	0 %	20 %	479146353
77	NC_021012	CGGAC	2	10	177179	177188	20 %	0 %	40 %	40 %	479146354
78	NC_021012	CGCTC	2	10	177337	177346	0 %	20 %	20 %	60 %	479146354
79	NC_021012	ATTTT	2	10	177709	177718	20 %	80 %	0 %	0 %	479146354
80	NC_021012	GATAA	2	10	188474	188483	60 %	20 %	20 %	0 %	479146367
81	NC_021012	TACCT	2	10	193452	193461	20 %	40 %	0 %	40 %	479146372
82	NC_021012	CCTTT	2	10	197133	197142	0 %	60 %	0 %	40 %	479146378
83	NC_021012	TTCTC	2	10	198097	198106	0 %	60 %	0 %	40 %	479146380
84	NC_021012	CTGTT	2	10	199576	199585	0 %	60 %	20 %	20 %	479146382
85	NC_021012	TCTCT	2	10	200512	200521	0 %	60 %	0 %	40 %	479146384
86	NC_021012	CGATG	2	10	202969	202978	20 %	20 %	40 %	20 %	479146386
87	NC_021012	TCTGC	2	10	203077	203086	0 %	40 %	20 %	40 %	479146386
88	NC_021012	TCCGC	2	10	206043	206052	0 %	20 %	20 %	60 %	479146388
89	NC_021012	TTCTT	2	10	207149	207158	0 %	80 %	0 %	20 %	479146389
90	NC_021012	TCTGA	2	10	207759	207768	20 %	40 %	20 %	20 %	479146390
91	NC_021012	GTTTT	2	10	209044	209053	0 %	80 %	20 %	0 %	479146391
92	NC_021012	TTGCA	2	10	210449	210458	20 %	40 %	20 %	20 %	479146393
93	NC_021012	CGCAC	2	10	210637	210646	20 %	0 %	20 %	60 %	479146393
94	NC_021012	GATGT	2	10	213178	213187	20 %	40 %	40 %	0 %	479146396
95	NC_021012	CATTC	2	10	213351	213360	20 %	40 %	0 %	40 %	479146396
96	NC_021012	TCCCT	2	10	213898	213907	0 %	40 %	0 %	60 %	479146396
97	NC_021012	GATCC	2	10	216310	216319	20 %	20 %	20 %	40 %	479146398
98	NC_021012	GTGGA	2	10	217029	217038	20 %	20 %	60 %	0 %	479146399
99	NC_021012	CATTA	2	10	217495	217504	40 %	40 %	0 %	20 %	479146399
100	NC_021012	TTCCA	2	10	218406	218415	20 %	40 %	0 %	40 %	479146400
101	NC_021012	TCCGC	2	10	219239	219248	0 %	20 %	20 %	60 %	479146400
102	NC_021012	ATTTT	2	10	221061	221070	20 %	80 %	0 %	0 %	479146402
103	NC_021012	CTGCC	2	10	221335	221344	0 %	20 %	20 %	60 %	479146402
104	NC_021012	AGCAC	2	10	222673	222682	40 %	0 %	20 %	40 %	479146404
105	NC_021012	TTCCA	2	10	223275	223284	20 %	40 %	0 %	40 %	479146405
106	NC_021012	TCTCT	2	10	226137	226146	0 %	60 %	0 %	40 %	479146408
107	NC_021012	CCAAT	2	10	233968	233977	40 %	20 %	0 %	40 %	479146411
108	NC_021012	TACGG	2	10	236237	236246	20 %	20 %	40 %	20 %	479146412
109	NC_021012	CGATA	2	10	236615	236624	40 %	20 %	20 %	20 %	479146412
110	NC_021012	ATGAC	2	10	240931	240940	40 %	20 %	20 %	20 %	479146414
111	NC_021012	AATAA	2	10	243597	243606	80 %	20 %	0 %	0 %	479146417
112	NC_021012	TAACT	2	10	247809	247818	40 %	40 %	0 %	20 %	479146419
113	NC_021012	AACAA	2	10	251400	251409	80 %	0 %	0 %	20 %	479146421
114	NC_021012	AAAAT	2	10	251517	251526	80 %	20 %	0 %	0 %	479146421
115	NC_021012	AAGAT	2	10	253194	253203	60 %	20 %	20 %	0 %	479146423
116	NC_021012	GGCAA	2	10	256535	256544	40 %	0 %	40 %	20 %	479146425
117	NC_021012	CTGAT	2	10	260372	260381	20 %	40 %	20 %	20 %	479146428
118	NC_021012	TTAGA	2	10	260389	260398	40 %	40 %	20 %	0 %	479146428
119	NC_021012	GAAAG	2	10	266198	266207	60 %	0 %	40 %	0 %	479146431
120	NC_021012	TCCGT	2	10	273368	273377	0 %	40 %	20 %	40 %	479146435
121	NC_021012	CAGAG	2	10	274426	274435	40 %	0 %	40 %	20 %	479146436
122	NC_021012	CTGAT	2	10	276062	276071	20 %	40 %	20 %	20 %	479146437
123	NC_021012	ACATT	2	10	280934	280943	40 %	40 %	0 %	20 %	479146440
124	NC_021012	AAGCA	2	10	292711	292720	60 %	0 %	20 %	20 %	479146445
125	NC_021012	TAAAT	2	10	295092	295101	60 %	40 %	0 %	0 %	479146448
126	NC_021012	GACAG	2	10	295307	295316	40 %	0 %	40 %	20 %	479146448
127	NC_021012	AGCAG	2	10	299146	299155	40 %	0 %	40 %	20 %	479146455
128	NC_021012	TCGCA	2	10	299307	299316	20 %	20 %	20 %	40 %	479146455
129	NC_021012	AAAAG	2	10	299833	299842	80 %	0 %	20 %	0 %	479146455
130	NC_021012	AGATG	2	10	299971	299980	40 %	20 %	40 %	0 %	479146455
131	NC_021012	TGGTG	2	10	301417	301426	0 %	40 %	60 %	0 %	479146456
132	NC_021012	TGTTT	2	10	302808	302817	0 %	80 %	20 %	0 %	479146457
133	NC_021012	TATGA	2	10	303128	303137	40 %	40 %	20 %	0 %	479146457
134	NC_021012	ATAGA	2	10	304909	304918	60 %	20 %	20 %	0 %	479146458
135	NC_021012	GTGTA	2	10	305575	305584	20 %	40 %	40 %	0 %	479146458
136	NC_021012	ATCGG	2	10	305701	305710	20 %	20 %	40 %	20 %	479146458
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140	NC_021012	GAAAT	2	10	319545	319554	60 %	20 %	20 %	0 %	479146471
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148	NC_021012	ATTGA	2	10	341119	341128	40 %	40 %	20 %	0 %	479146483
149	NC_021012	CACTG	2	10	342072	342081	20 %	20 %	20 %	40 %	479146484
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156	NC_021012	AGATG	2	10	350308	350317	40 %	20 %	40 %	0 %	479146489
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174	NC_021012	CATTT	2	10	385057	385066	20 %	60 %	0 %	20 %	479146522
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