MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021012	TAA	2	6	266089	266094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146431
4002	NC_021012	AT	3	6	266186	266191	50 %	50 %	0 %	0 %	479146431
4003	NC_021012	GAAAG	2	10	266198	266207	60 %	0 %	40 %	0 %	479146431
4004	NC_021012	GTAAAG	2	12	266227	266238	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479146431
4005	NC_021012	GAT	2	6	266249	266254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146431
4006	NC_021012	TGC	2	6	266291	266296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146431
4007	NC_021012	AGA	2	6	266333	266338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4008	NC_021012	CGT	2	6	266351	266356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146431
4009	NC_021012	CAG	2	6	266413	266418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146431
4010	NC_021012	ACA	2	6	266484	266489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146431
4011	NC_021012	TGA	2	6	266495	266500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146431
4012	NC_021012	GCA	2	6	266508	266513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146431
4013	NC_021012	AG	3	6	266525	266530	50 %	0 %	50 %	0 %	479146431
4014	NC_021012	AGA	2	6	266533	266538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4015	NC_021012	ACAG	2	8	266559	266566	50 %	0 %	25 %	25 %	479146431
4016	NC_021012	CAG	2	6	266587	266592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146431
4017	NC_021012	GGC	2	6	266634	266639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146431
4018	NC_021012	GA	3	6	266644	266649	50 %	0 %	50 %	0 %	479146431
4019	NC_021012	ATC	2	6	266650	266655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146431
4020	NC_021012	TAG	2	6	266704	266709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146431
4021	NC_021012	GCA	2	6	266766	266771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146431
4022	NC_021012	ATT	2	6	266792	266797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146431
4023	NC_021012	AGA	2	6	266885	266890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4024	NC_021012	AGA	2	6	266971	266976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4025	NC_021012	AGA	2	6	267125	267130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4026	NC_021012	AG	3	6	267319	267324	50 %	0 %	50 %	0 %	479146431
4027	NC_021012	AAAG	2	8	267369	267376	75 %	0 %	25 %	0 %	479146431
4028	NC_021012	CTAAGA	2	12	267385	267396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479146431
4029	NC_021012	AAG	2	6	267403	267408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4030	NC_021012	GAA	2	6	267417	267422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4031	NC_021012	AGA	2	6	267428	267433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4032	NC_021012	AGA	2	6	267440	267445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146431
4033	NC_021012	AG	3	6	267449	267454	50 %	0 %	50 %	0 %	479146431
4034	NC_021012	CAG	2	6	267599	267604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146432
4035	NC_021012	TTA	2	6	267636	267641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146432
4036	NC_021012	GAA	2	6	267666	267671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146432
4037	NC_021012	ACA	2	6	267681	267686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146432
4038	NC_021012	AGA	2	6	267725	267730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146432
4039	NC_021012	TA	3	6	267751	267756	50 %	50 %	0 %	0 %	479146432
4040	NC_021012	CAG	2	6	267781	267786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146432
4041	NC_021012	GCA	2	6	267852	267857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146432
4042	NC_021012	CGG	2	6	267881	267886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146432
4043	NC_021012	CGG	2	6	267944	267949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146432
4044	NC_021012	GCA	2	6	267981	267986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146432
4045	NC_021012	A	6	6	268005	268010	100 %	0 %	0 %	0 %	479146432
4046	NC_021012	TGC	2	6	268028	268033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146432
4047	NC_021012	ATG	2	6	268051	268056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146432
4048	NC_021012	GCA	2	6	268062	268067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146432
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4051	NC_021012	TGAT	2	8	268120	268127	25 %	50 %	25 %	0 %	479146432
4052	NC_021012	TCA	2	6	268132	268137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146432
4053	NC_021012	GAA	2	6	268176	268181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146433
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4055	NC_021012	AT	3	6	268261	268266	50 %	50 %	0 %	0 %	479146433
4056	NC_021012	GAA	2	6	268307	268312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146433
4057	NC_021012	ATG	2	6	268320	268325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146433
4058	NC_021012	GCA	2	6	268328	268333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146433
4059	NC_021012	GAT	2	6	268400	268405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146433
4060	NC_021012	A	7	7	268429	268435	100 %	0 %	0 %	0 %	479146433
4061	NC_021012	CTGT	2	8	268439	268446	0 %	50 %	25 %	25 %	479146433
4062	NC_021012	AGA	2	6	268506	268511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146433
4063	NC_021012	GACC	2	8	268530	268537	25 %	0 %	25 %	50 %	479146433
4064	NC_021012	ATC	2	6	268667	268672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146433
4065	NC_021012	GGC	2	6	268675	268680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146433
4066	NC_021012	CGA	2	6	268723	268728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146433
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4068	NC_021012	CAG	2	6	268796	268801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146433
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4070	NC_021012	G	6	6	268849	268854	0 %	0 %	100 %	0 %	479146433
4071	NC_021012	GCA	2	6	268867	268872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146433
4072	NC_021012	TTAT	2	8	268904	268911	25 %	75 %	0 %	0 %	479146433
4073	NC_021012	GCG	2	6	268914	268919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146433
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4081	NC_021012	A	6	6	271765	271770	100 %	0 %	0 %	0 %	479146434
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4090	NC_021012	A	7	7	272524	272530	100 %	0 %	0 %	0 %	479146435
4091	NC_021012	CAA	2	6	272588	272593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146435
4092	NC_021012	GAT	2	6	272629	272634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146435
4093	NC_021012	AC	3	6	272650	272655	50 %	0 %	0 %	50 %	479146435
4094	NC_021012	AATG	2	8	272691	272698	50 %	25 %	25 %	0 %	479146435
4095	NC_021012	AT	3	6	272766	272771	50 %	50 %	0 %	0 %	479146435
4096	NC_021012	GCT	2	6	272805	272810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146435
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4099	NC_021012	TGA	2	6	272912	272917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146435
4100	NC_021012	AGA	3	9	272919	272927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146435
4101	NC_021012	A	6	6	272944	272949	100 %	0 %	0 %	0 %	479146435
4102	NC_021012	CAG	2	6	272963	272968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146435
4103	NC_021012	AGG	2	6	272973	272978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146435
4104	NC_021012	CCG	2	6	272982	272987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146435
4105	NC_021012	GCA	2	6	272995	273000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146435
4106	NC_021012	GTT	3	9	273061	273069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146435
4107	NC_021012	GCG	4	12	273074	273085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146435
4108	NC_021012	GCA	2	6	273151	273156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146435
4109	NC_021012	ATGT	2	8	273215	273222	25 %	50 %	25 %	0 %	479146435
4110	NC_021012	GAA	2	6	273292	273297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146435
4111	NC_021012	TGC	2	6	273320	273325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146435
4112	NC_021012	GGC	2	6	273336	273341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146435
4113	NC_021012	TCCGT	2	10	273368	273377	0 %	40 %	20 %	40 %	479146435
4114	NC_021012	TTA	2	6	273380	273385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146435
4115	NC_021012	GAT	2	6	273432	273437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146435
4116	NC_021012	TTGT	2	8	273537	273544	0 %	75 %	25 %	0 %	479146436
4117	NC_021012	AAGG	2	8	273566	273573	50 %	0 %	50 %	0 %	479146436
4118	NC_021012	GAG	2	6	273641	273646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146436
4119	NC_021012	GCA	2	6	273704	273709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146436
4120	NC_021012	GA	3	6	273742	273747	50 %	0 %	50 %	0 %	479146436
4121	NC_021012	ACGG	2	8	273752	273759	25 %	0 %	50 %	25 %	479146436
4122	NC_021012	GGA	2	6	273856	273861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146436
4123	NC_021012	GAT	2	6	273890	273895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146436
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4126	NC_021012	ATGATT	2	12	274104	274115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479146436
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4134	NC_021012	AAG	2	6	274367	274372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146436
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4140	NC_021012	TTAC	2	8	274573	274580	25 %	50 %	0 %	25 %	479146436
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4234	NC_021012	TAT	2	6	280978	280983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146440
4235	NC_021012	TGA	2	6	281060	281065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146440
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4237	NC_021012	CAT	2	6	281101	281106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146440
4238	NC_021012	CAGT	2	8	281117	281124	25 %	25 %	25 %	25 %	479146440
4239	NC_021012	CAA	2	6	281127	281132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146440
4240	NC_021012	AT	4	8	281160	281167	50 %	50 %	0 %	0 %	479146440
4241	NC_021012	AT	3	6	281193	281198	50 %	50 %	0 %	0 %	479146440
4242	NC_021012	GCA	2	6	281205	281210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146440
4243	NC_021012	CTT	2	6	281213	281218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146440
4244	NC_021012	CAG	2	6	281300	281305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146440
4245	NC_021012	GCA	2	6	281326	281331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146440
4246	NC_021012	GCT	2	6	281346	281351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146440
4247	NC_021012	AGA	2	6	281358	281363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146440
4248	NC_021012	AGG	2	6	281406	281411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146440
4249	NC_021012	TTA	2	6	281494	281499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146440
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4252	NC_021012	GAA	3	9	281805	281813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146441
4253	NC_021012	ATT	2	6	281826	281831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146441
4254	NC_021012	ATG	2	6	281854	281859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146441
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4257	NC_021012	GCA	2	6	281881	281886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146441
4258	NC_021012	CAG	2	6	281910	281915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146441
4259	NC_021012	GCA	2	6	281930	281935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146441
4260	NC_021012	CGC	2	6	281940	281945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146441
4261	NC_021012	CTG	2	6	282030	282035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146441
4262	NC_021012	AAC	2	6	282166	282171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146441
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4264	NC_021012	GCA	3	9	282202	282210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146441
4265	NC_021012	TAG	2	6	282233	282238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146441
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4271	NC_021012	CAA	2	6	282573	282578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146441
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4273	NC_021012	TGA	2	6	282618	282623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146441
4274	NC_021012	TGA	2	6	282642	282647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146441
4275	NC_021012	TGA	2	6	282699	282704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146441
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4278	NC_021012	GCA	2	6	282781	282786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146441
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4280	NC_021012	GGT	2	6	282856	282861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146441
4281	NC_021012	GCA	2	6	282874	282879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146441
4282	NC_021012	ATG	3	9	282935	282943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146441
4283	NC_021012	ATC	2	6	282955	282960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146441
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4285	NC_021012	GAA	2	6	283146	283151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146441
4286	NC_021012	AGA	2	6	283176	283181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146441
4287	NC_021012	GGCG	2	8	283295	283302	0 %	0 %	75 %	25 %	479146442
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4292	NC_021012	GTA	2	6	283462	283467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146442
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4295	NC_021012	AGT	2	6	285527	285532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146443
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4297	NC_021012	GAT	2	6	285567	285572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146443
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4302	NC_021012	CAG	2	6	286151	286156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146444
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4308	NC_021012	AAG	2	6	286728	286733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146444
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4313	NC_021012	GAA	2	6	286892	286897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146444
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4315	NC_021012	AGC	2	6	286945	286950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146444
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4317	NC_021012	GAT	2	6	287090	287095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146444
4318	NC_021012	AGA	2	6	287206	287211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146444
4319	NC_021012	CGA	2	6	287356	287361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146444
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4321	NC_021012	TGG	2	6	287397	287402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146444
4322	NC_021012	ATGG	2	8	287411	287418	25 %	25 %	50 %	0 %	479146444
4323	NC_021012	GTG	2	6	287459	287464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146444
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4329	NC_021012	GAT	2	6	288115	288120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146444
4330	NC_021012	GAA	2	6	288136	288141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146444
4331	NC_021012	TG	3	6	288239	288244	0 %	50 %	50 %	0 %	479146444
4332	NC_021012	TGG	2	6	288255	288260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146444
4333	NC_021012	AGC	2	6	288321	288326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146444
4334	NC_021012	TCACGG	2	12	288327	288338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479146444
4335	NC_021012	GC	3	6	288385	288390	0 %	0 %	50 %	50 %	479146444
4336	NC_021012	GGC	2	6	288452	288457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146444
4337	NC_021012	GAT	2	6	288512	288517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146444
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4340	NC_021012	GTAA	2	8	289121	289128	50 %	25 %	25 %	0 %	479146444
4341	NC_021012	GGAT	2	8	289165	289172	25 %	25 %	50 %	0 %	479146444
4342	NC_021012	GGA	2	6	289192	289197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146444
4343	NC_021012	GGT	2	6	289249	289254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146444
4344	NC_021012	ATTT	2	8	289255	289262	25 %	75 %	0 %	0 %	479146444
4345	NC_021012	TAT	3	9	289306	289314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146444
4346	NC_021012	GACA	2	8	289363	289370	50 %	0 %	25 %	25 %	479146444
4347	NC_021012	ATCA	2	8	289454	289461	50 %	25 %	0 %	25 %	479146444
4348	NC_021012	AG	3	6	289469	289474	50 %	0 %	50 %	0 %	479146444
4349	NC_021012	AGG	2	6	289488	289493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146444
4350	NC_021012	GAA	2	6	289509	289514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146444
4351	NC_021012	CGATGG	2	12	289569	289580	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479146444
4352	NC_021012	GAT	2	6	289600	289605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146444
4353	NC_021012	GCT	2	6	289651	289656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146444
4354	NC_021012	GTG	2	6	289667	289672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146444
4355	NC_021012	TGG	2	6	289710	289715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146444
4356	NC_021012	A	7	7	289728	289734	100 %	0 %	0 %	0 %	479146444
4357	NC_021012	A	6	6	290222	290227	100 %	0 %	0 %	0 %	479146445
4358	NC_021012	GCA	2	6	290265	290270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146445
4359	NC_021012	GCC	3	9	290293	290301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146445
4360	NC_021012	ACA	2	6	290340	290345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146445
4361	NC_021012	AGGTAA	2	12	290436	290447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479146445
4362	NC_021012	A	6	6	290459	290464	100 %	0 %	0 %	0 %	479146445
4363	NC_021012	CAT	2	6	290545	290550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146445
4364	NC_021012	GA	4	8	290588	290595	50 %	0 %	50 %	0 %	479146445
4365	NC_021012	GCT	2	6	290616	290621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146445
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4367	NC_021012	TTG	2	6	290805	290810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146445
4368	NC_021012	GAC	3	9	290870	290878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146445
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4476	NC_021012	GCA	2	6	297374	297379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146452
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4482	NC_021012	GAA	2	6	297678	297683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146452
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4487	NC_021012	AGC	2	6	297919	297924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146452
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