MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021012	CT	3	6	153919	153924	0 %	50 %	0 %	50 %	479146345
2502	NC_021012	CTG	2	6	154023	154028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146345
2503	NC_021012	TCC	2	6	154033	154038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146345
2504	NC_021012	TCC	2	6	154041	154046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146345
2505	NC_021012	ATG	2	6	154065	154070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146345
2506	NC_021012	CA	3	6	154281	154286	50 %	0 %	0 %	50 %	479146345
2507	NC_021012	TGC	2	6	154307	154312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146345
2508	NC_021012	AAC	2	6	160189	160194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146346
2509	NC_021012	CAC	2	6	160215	160220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146346
2510	NC_021012	CAGG	2	8	160341	160348	25 %	0 %	50 %	25 %	479146346
2511	NC_021012	CCAC	2	8	160361	160368	25 %	0 %	0 %	75 %	479146346
2512	NC_021012	CAT	2	6	160379	160384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146346
2513	NC_021012	CTC	2	6	160404	160409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146346
2514	NC_021012	CGG	2	6	160479	160484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146346
2515	NC_021012	TCC	2	6	160504	160509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146346
2516	NC_021012	TAA	2	6	160550	160555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146346
2517	NC_021012	GCT	2	6	160696	160701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146346
2518	NC_021012	CAG	2	6	160713	160718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146346
2519	NC_021012	CTC	2	6	160749	160754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146346
2520	NC_021012	GTT	2	6	160762	160767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146346
2521	NC_021012	T	6	6	160812	160817	0 %	100 %	0 %	0 %	479146346
2522	NC_021012	TCC	2	6	160831	160836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146346
2523	NC_021012	CAG	2	6	160920	160925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146346
2524	NC_021012	CCT	2	6	163830	163835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146347
2525	NC_021012	TTTC	2	8	163910	163917	0 %	75 %	0 %	25 %	479146347
2526	NC_021012	T	6	6	163923	163928	0 %	100 %	0 %	0 %	479146347
2527	NC_021012	CAG	2	6	163961	163966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146347
2528	NC_021012	GCTC	2	8	164000	164007	0 %	25 %	25 %	50 %	479146347
2529	NC_021012	CCG	2	6	164049	164054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146347
2530	NC_021012	TCC	2	6	164057	164062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146347
2531	NC_021012	AGC	2	6	164082	164087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146347
2532	NC_021012	A	6	6	164109	164114	100 %	0 %	0 %	0 %	479146347
2533	NC_021012	GCA	2	6	164131	164136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146347
2534	NC_021012	CCA	2	6	164149	164154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146347
2535	NC_021012	AAC	2	6	164156	164161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146347
2536	NC_021012	CCG	2	6	164200	164205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146347
2537	NC_021012	A	7	7	164221	164227	100 %	0 %	0 %	0 %	479146347
2538	NC_021012	AGCC	2	8	164231	164238	25 %	0 %	25 %	50 %	479146347
2539	NC_021012	GCC	2	6	164265	164270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146348
2540	NC_021012	TTC	2	6	164271	164276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146348
2541	NC_021012	CTC	2	6	164286	164291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146348
2542	NC_021012	CCT	2	6	164294	164299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146348
2543	NC_021012	CTG	2	6	164322	164327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146348
2544	NC_021012	GGCAAG	2	12	164523	164534	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479146348
2545	NC_021012	CTGC	2	8	164597	164604	0 %	25 %	25 %	50 %	479146348
2546	NC_021012	CTG	2	6	164631	164636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146348
2547	NC_021012	CTT	2	6	167391	167396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146349
2548	NC_021012	TA	3	6	167464	167469	50 %	50 %	0 %	0 %	479146349
2549	NC_021012	TTCTT	2	10	167560	167569	0 %	80 %	0 %	20 %	479146349
2550	NC_021012	T	8	8	167585	167592	0 %	100 %	0 %	0 %	479146349
2551	NC_021012	CTT	2	6	167593	167598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146349
2552	NC_021012	CTG	2	6	167632	167637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146349
2553	NC_021012	A	6	6	167662	167667	100 %	0 %	0 %	0 %	479146349
2554	NC_021012	ATC	2	6	167683	167688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146349
2555	NC_021012	TGT	2	6	172455	172460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146350
2556	NC_021012	CGG	2	6	172626	172631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146350
2557	NC_021012	GCA	2	6	172655	172660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146350
2558	NC_021012	TCTT	2	8	172675	172682	0 %	75 %	0 %	25 %	479146350
2559	NC_021012	T	7	7	172681	172687	0 %	100 %	0 %	0 %	479146350
2560	NC_021012	GCA	2	6	172700	172705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146350
2561	NC_021012	A	6	6	172725	172730	100 %	0 %	0 %	0 %	479146350
2562	NC_021012	ATT	2	6	172737	172742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146350
2563	NC_021012	ATT	2	6	172761	172766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146350
2564	NC_021012	TCAG	2	8	172990	172997	25 %	25 %	25 %	25 %	479146350
2565	NC_021012	TTC	2	6	173092	173097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146350
2566	NC_021012	TGAT	2	8	173104	173111	25 %	50 %	25 %	0 %	479146350
2567	NC_021012	CA	3	6	173193	173198	50 %	0 %	0 %	50 %	479146350
2568	NC_021012	AAT	2	6	173322	173327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146350
2569	NC_021012	TCC	2	6	173335	173340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146350
2570	NC_021012	ATA	2	6	173368	173373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146350
2571	NC_021012	GCT	2	6	173570	173575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146350
2572	NC_021012	CCG	2	6	173605	173610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146350
2573	NC_021012	TTC	2	6	173695	173700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146350
2574	NC_021012	ATCTC	2	10	173722	173731	20 %	40 %	0 %	40 %	479146350
2575	NC_021012	ATAATT	2	12	173839	173850	50 %	50 %	0 %	0 %	479146350
2576	NC_021012	ATT	2	6	173906	173911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146351
2577	NC_021012	GTT	2	6	173921	173926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146351
2578	NC_021012	T	6	6	174005	174010	0 %	100 %	0 %	0 %	479146351
2579	NC_021012	ATA	3	9	174129	174137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146351
2580	NC_021012	CTC	2	6	174191	174196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146351
2581	NC_021012	AAT	2	6	174271	174276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146351
2582	NC_021012	ACC	2	6	174314	174319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146351
2583	NC_021012	GTG	2	6	174329	174334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146351
2584	NC_021012	GCA	2	6	174345	174350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146351
2585	NC_021012	A	6	6	174392	174397	100 %	0 %	0 %	0 %	479146351
2586	NC_021012	CT	3	6	174399	174404	0 %	50 %	0 %	50 %	479146351
2587	NC_021012	CTT	2	6	174410	174415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146351
2588	NC_021012	CTT	2	6	174424	174429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146351
2589	NC_021012	CTC	2	6	174455	174460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146351
2590	NC_021012	TCG	2	6	174618	174623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146351
2591	NC_021012	ATAG	2	8	174739	174746	50 %	25 %	25 %	0 %	479146351
2592	NC_021012	TCGC	2	8	174758	174765	0 %	25 %	25 %	50 %	479146351
2593	NC_021012	CT	3	6	174767	174772	0 %	50 %	0 %	50 %	479146351
2594	NC_021012	TAC	2	6	174793	174798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146351
2595	NC_021012	ATT	2	6	174826	174831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146352
2596	NC_021012	TTTCTG	2	12	174880	174891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479146352
2597	NC_021012	CATG	2	8	174893	174900	25 %	25 %	25 %	25 %	479146352
2598	NC_021012	CCGCAT	2	12	174902	174913	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479146352
2599	NC_021012	T	6	6	175062	175067	0 %	100 %	0 %	0 %	479146353
2600	NC_021012	CGC	2	6	175137	175142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146353
2601	NC_021012	CGC	2	6	175212	175217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146353
2602	NC_021012	ACA	2	6	175268	175273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146353
2603	NC_021012	TCAA	2	8	175276	175283	50 %	25 %	0 %	25 %	479146353
2604	NC_021012	AGAAAT	2	12	175296	175307	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479146353
2605	NC_021012	CTG	2	6	175336	175341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146353
2606	NC_021012	GAT	2	6	175362	175367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146353
2607	NC_021012	TGC	2	6	175403	175408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146353
2608	NC_021012	AAT	2	6	175499	175504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146353
2609	NC_021012	GCAATC	2	12	175528	175539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479146353
2610	NC_021012	T	6	6	175659	175664	0 %	100 %	0 %	0 %	479146353
2611	NC_021012	CAT	2	6	175685	175690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146353
2612	NC_021012	TAA	2	6	175691	175696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146353
2613	NC_021012	CTG	2	6	175759	175764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146353
2614	NC_021012	ATT	2	6	175812	175817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146353
2615	NC_021012	CTT	2	6	175871	175876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146353
2616	NC_021012	CAAGTT	2	12	175919	175930	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479146353
2617	NC_021012	TC	3	6	175955	175960	0 %	50 %	0 %	50 %	479146353
2618	NC_021012	CTG	2	6	175995	176000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146353
2619	NC_021012	GTT	2	6	176034	176039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146353
2620	NC_021012	CTG	2	6	176061	176066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146353
2621	NC_021012	CGT	2	6	176069	176074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146353
2622	NC_021012	CTC	2	6	176133	176138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146353
2623	NC_021012	CAT	2	6	176150	176155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146353
2624	NC_021012	AAC	2	6	176169	176174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146353
2625	NC_021012	TAAAC	2	10	176220	176229	60 %	20 %	0 %	20 %	479146353
2626	NC_021012	T	7	7	176283	176289	0 %	100 %	0 %	0 %	479146353
2627	NC_021012	T	6	6	176298	176303	0 %	100 %	0 %	0 %	479146353
2628	NC_021012	TAA	2	6	176333	176338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146353
2629	NC_021012	CCTT	2	8	176377	176384	0 %	50 %	0 %	50 %	479146353
2630	NC_021012	TAT	2	6	176411	176416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146353
2631	NC_021012	T	6	6	176446	176451	0 %	100 %	0 %	0 %	479146353
2632	NC_021012	ATGA	2	8	176841	176848	50 %	25 %	25 %	0 %	479146354
2633	NC_021012	ATC	2	6	176880	176885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146354
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2635	NC_021012	TTACAG	2	12	176976	176987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479146354
2636	NC_021012	GGCG	2	8	177018	177025	0 %	0 %	75 %	25 %	479146354
2637	NC_021012	CTG	2	6	177105	177110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146354
2638	NC_021012	CT	4	8	177119	177126	0 %	50 %	0 %	50 %	479146354
2639	NC_021012	GCA	2	6	177132	177137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146354
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2641	NC_021012	CGGAC	2	10	177179	177188	20 %	0 %	40 %	40 %	479146354
2642	NC_021012	GCA	2	6	177198	177203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146354
2643	NC_021012	CCG	2	6	177287	177292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146354
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2645	NC_021012	CAG	2	6	177329	177334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146354
2646	NC_021012	CGCTC	2	10	177337	177346	0 %	20 %	20 %	60 %	479146354
2647	NC_021012	CAA	2	6	177407	177412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146354
2648	NC_021012	TCA	2	6	177445	177450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146354
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2651	NC_021012	CGCT	2	8	177559	177566	0 %	25 %	25 %	50 %	479146354
2652	NC_021012	AAC	2	6	177579	177584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146354
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2655	NC_021012	AGC	2	6	177725	177730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146354
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2657	NC_021012	A	7	7	177821	177827	100 %	0 %	0 %	0 %	479146354
2658	NC_021012	GGT	2	6	177894	177899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146354
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2660	NC_021012	TCC	2	6	178056	178061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146354
2661	NC_021012	CTG	2	6	178277	178282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146354
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2664	NC_021012	ATC	2	6	178614	178619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146354
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2666	NC_021012	TGA	2	6	178640	178645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146354
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2674	NC_021012	CAAAAT	2	12	178995	179006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479146355
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2710	NC_021012	AGAC	2	8	181356	181363	50 %	0 %	25 %	25 %	479146357
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2732	NC_021012	CAT	2	6	182728	182733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146359
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2734	NC_021012	CA	3	6	182884	182889	50 %	0 %	0 %	50 %	479146360
2735	NC_021012	TCCG	2	8	182890	182897	0 %	25 %	25 %	50 %	479146360
2736	NC_021012	AC	3	6	182899	182904	50 %	0 %	0 %	50 %	479146360
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2740	NC_021012	TG	3	6	183094	183099	0 %	50 %	50 %	0 %	479146360
2741	NC_021012	TTC	2	6	183142	183147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146360
2742	NC_021012	T	6	6	183157	183162	0 %	100 %	0 %	0 %	479146360
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2744	NC_021012	AAT	2	6	183313	183318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146361
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2866	NC_021012	TTC	2	6	193724	193729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146372
2867	NC_021012	ATT	2	6	193793	193798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146373
2868	NC_021012	TAA	2	6	193826	193831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146373
2869	NC_021012	TCA	2	6	193834	193839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146373
2870	NC_021012	TCT	2	6	193875	193880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146373
2871	NC_021012	CAA	2	6	194099	194104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146373
2872	NC_021012	TGT	2	6	194108	194113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146373
2873	NC_021012	T	7	7	194150	194156	0 %	100 %	0 %	0 %	479146373
2874	NC_021012	GAT	2	6	194178	194183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146373
2875	NC_021012	ATT	2	6	194265	194270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146373
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2879	NC_021012	TGA	2	6	194713	194718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146374
2880	NC_021012	TCT	2	6	194719	194724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146374
2881	NC_021012	AT	3	6	194802	194807	50 %	50 %	0 %	0 %	479146374
2882	NC_021012	TGCGAT	2	12	194828	194839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479146374
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2884	NC_021012	ATG	2	6	194937	194942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146374
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2886	NC_021012	CT	3	6	195752	195757	0 %	50 %	0 %	50 %	479146375
2887	NC_021012	T	7	7	195801	195807	0 %	100 %	0 %	0 %	479146375
2888	NC_021012	TCCA	2	8	195811	195818	25 %	25 %	0 %	50 %	479146375
2889	NC_021012	GATG	2	8	195891	195898	25 %	25 %	50 %	0 %	479146375
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2892	NC_021012	CTT	2	6	196005	196010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146375
2893	NC_021012	TCTTTA	2	12	196013	196024	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479146375
2894	NC_021012	T	6	6	196051	196056	0 %	100 %	0 %	0 %	479146375
2895	NC_021012	TCC	2	6	196082	196087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146376
2896	NC_021012	CT	3	6	196141	196146	0 %	50 %	0 %	50 %	479146376
2897	NC_021012	TAA	3	9	196194	196202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146376
2898	NC_021012	CTG	2	6	196203	196208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146376
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2978	NC_021012	GTT	2	6	200398	200403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146384
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2980	NC_021012	TGC	2	6	200506	200511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146384
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2982	NC_021012	T	6	6	200521	200526	0 %	100 %	0 %	0 %	479146384
2983	NC_021012	AGT	2	6	200541	200546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146384
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2985	NC_021012	TTG	2	6	200598	200603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146384
2986	NC_021012	ACC	3	9	200650	200658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146384
2987	NC_021012	GCT	2	6	200712	200717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146384
2988	NC_021012	CTT	2	6	200793	200798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146384
2989	NC_021012	GTT	2	6	200941	200946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146385
2990	NC_021012	TGT	2	6	200980	200985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146385
2991	NC_021012	GAA	2	6	201044	201049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146385
2992	NC_021012	TGA	2	6	201068	201073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146385
2993	NC_021012	ACCTTT	2	12	201142	201153	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479146385
2994	NC_021012	CT	3	6	201250	201255	0 %	50 %	0 %	50 %	479146385
2995	NC_021012	TTTC	2	8	201333	201340	0 %	75 %	0 %	25 %	479146385
2996	NC_021012	TCTT	2	8	201371	201378	0 %	75 %	0 %	25 %	479146385
2997	NC_021012	CGT	2	6	201411	201416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146385
2998	NC_021012	TTG	2	6	201519	201524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146385
2999	NC_021012	TTC	2	6	201536	201541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146385
3000	NC_021012	AGC	2	6	202890	202895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146386

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