MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021012	TAC	2	6	91685	91690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146280
1502	NC_021012	TGA	2	6	91730	91735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146280
1503	NC_021012	CGCAG	2	10	91738	91747	20 %	0 %	40 %	40 %	479146280
1504	NC_021012	GA	3	6	91789	91794	50 %	0 %	50 %	0 %	479146280
1505	NC_021012	GCT	2	6	91796	91801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146280
1506	NC_021012	ATG	2	6	91837	91842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146280
1507	NC_021012	GTT	2	6	91935	91940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146280
1508	NC_021012	GGA	2	6	92010	92015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146280
1509	NC_021012	TCA	2	6	92048	92053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146280
1510	NC_021012	ATA	2	6	92110	92115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146280
1511	NC_021012	T	6	6	92161	92166	0 %	100 %	0 %	0 %	479146280
1512	NC_021012	AAC	2	6	92178	92183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146280
1513	NC_021012	ATC	2	6	92200	92205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146280
1514	NC_021012	GCA	4	12	92221	92232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146280
1515	NC_021012	TGA	2	6	92297	92302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146280
1516	NC_021012	GCA	2	6	92354	92359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146280
1517	NC_021012	GAAA	2	8	92391	92398	75 %	0 %	25 %	0 %	479146280
1518	NC_021012	CAG	3	9	92401	92409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146280
1519	NC_021012	GAT	2	6	92436	92441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146280
1520	NC_021012	TCTG	2	8	92452	92459	0 %	50 %	25 %	25 %	479146280
1521	NC_021012	A	6	6	92481	92486	100 %	0 %	0 %	0 %	479146280
1522	NC_021012	GAT	2	6	92493	92498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146280
1523	NC_021012	GC	3	6	92586	92591	0 %	0 %	50 %	50 %	479146280
1524	NC_021012	CCGACA	2	12	92620	92631	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479146280
1525	NC_021012	CAA	2	6	92699	92704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146280
1526	NC_021012	AG	3	6	92726	92731	50 %	0 %	50 %	0 %	479146280
1527	NC_021012	ATTTT	2	10	92803	92812	20 %	80 %	0 %	0 %	479146280
1528	NC_021012	TCC	2	6	92823	92828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146280
1529	NC_021012	A	6	6	92847	92852	100 %	0 %	0 %	0 %	479146280
1530	NC_021012	GAT	2	6	93086	93091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146281
1531	NC_021012	ATCT	2	8	93119	93126	25 %	50 %	0 %	25 %	479146281
1532	NC_021012	ATG	2	6	93224	93229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146281
1533	NC_021012	GATG	2	8	93235	93242	25 %	25 %	50 %	0 %	479146281
1534	NC_021012	GACT	2	8	93333	93340	25 %	25 %	25 %	25 %	479146281
1535	NC_021012	GC	3	6	93392	93397	0 %	0 %	50 %	50 %	479146281
1536	NC_021012	TC	3	6	93457	93462	0 %	50 %	0 %	50 %	479146281
1537	NC_021012	CGG	2	6	93466	93471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146281
1538	NC_021012	GAC	2	6	93482	93487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146281
1539	NC_021012	GCA	2	6	93489	93494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146281
1540	NC_021012	ACGGA	2	10	93630	93639	40 %	0 %	40 %	20 %	479146281
1541	NC_021012	TG	3	6	93718	93723	0 %	50 %	50 %	0 %	479146281
1542	NC_021012	GCA	2	6	96813	96818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146282
1543	NC_021012	CCG	2	6	96907	96912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146282
1544	NC_021012	CGGG	2	8	96914	96921	0 %	0 %	75 %	25 %	479146282
1545	NC_021012	TGG	2	6	96967	96972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146282
1546	NC_021012	GAA	2	6	96994	96999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146282
1547	NC_021012	CG	3	6	97057	97062	0 %	0 %	50 %	50 %	479146282
1548	NC_021012	CTG	2	6	97390	97395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146283
1549	NC_021012	CTGT	2	8	97443	97450	0 %	50 %	25 %	25 %	479146283
1550	NC_021012	TAG	2	6	97518	97523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146283
1551	NC_021012	ATAC	2	8	97574	97581	50 %	25 %	0 %	25 %	479146283
1552	NC_021012	CAG	2	6	97669	97674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146283
1553	NC_021012	TACA	2	8	97780	97787	50 %	25 %	0 %	25 %	479146283
1554	NC_021012	GTCT	2	8	97989	97996	0 %	50 %	25 %	25 %	479146284
1555	NC_021012	TACCG	2	10	98246	98255	20 %	20 %	20 %	40 %	479146284
1556	NC_021012	TTC	2	6	98273	98278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146284
1557	NC_021012	GGT	2	6	98311	98316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146284
1558	NC_021012	CTT	2	6	98336	98341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146284
1559	NC_021012	GCT	2	6	98353	98358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146284
1560	NC_021012	AT	5	10	100303	100312	50 %	50 %	0 %	0 %	479146285
1561	NC_021012	A	6	6	100327	100332	100 %	0 %	0 %	0 %	479146285
1562	NC_021012	GGCA	2	8	100333	100340	25 %	0 %	50 %	25 %	479146285
1563	NC_021012	TGC	2	6	100411	100416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146285
1564	NC_021012	AAT	2	6	100531	100536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146285
1565	NC_021012	CAT	2	6	100548	100553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146285
1566	NC_021012	T	7	7	100561	100567	0 %	100 %	0 %	0 %	479146285
1567	NC_021012	T	7	7	100581	100587	0 %	100 %	0 %	0 %	479146285
1568	NC_021012	GA	3	6	100672	100677	50 %	0 %	50 %	0 %	479146285
1569	NC_021012	AGCC	2	8	100679	100686	25 %	0 %	25 %	50 %	479146285
1570	NC_021012	CCG	2	6	100694	100699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146285
1571	NC_021012	GAA	2	6	100703	100708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146285
1572	NC_021012	AGA	2	6	100723	100728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146285
1573	NC_021012	AGA	2	6	100741	100746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146285
1574	NC_021012	ATGC	2	8	100748	100755	25 %	25 %	25 %	25 %	479146285
1575	NC_021012	AGA	2	6	100759	100764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146285
1576	NC_021012	ATGC	2	8	100766	100773	25 %	25 %	25 %	25 %	479146285
1577	NC_021012	AGA	2	6	100777	100782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146285
1578	NC_021012	ATATC	2	10	100800	100809	40 %	40 %	0 %	20 %	479146285
1579	NC_021012	GCA	2	6	100829	100834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146285
1580	NC_021012	AGC	2	6	100866	100871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146285
1581	NC_021012	CG	3	6	100942	100947	0 %	0 %	50 %	50 %	479146285
1582	NC_021012	TTTC	2	8	100951	100958	0 %	75 %	0 %	25 %	479146285
1583	NC_021012	GGAC	2	8	100971	100978	25 %	0 %	50 %	25 %	479146285
1584	NC_021012	A	7	7	101028	101034	100 %	0 %	0 %	0 %	479146285
1585	NC_021012	A	6	6	101081	101086	100 %	0 %	0 %	0 %	479146285
1586	NC_021012	T	6	6	101126	101131	0 %	100 %	0 %	0 %	479146285
1587	NC_021012	AGA	3	9	101161	101169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146285
1588	NC_021012	ATC	2	6	101234	101239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146285
1589	NC_021012	GCT	2	6	101286	101291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146285
1590	NC_021012	T	7	7	101299	101305	0 %	100 %	0 %	0 %	479146285
1591	NC_021012	GAT	2	6	101409	101414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146286
1592	NC_021012	A	7	7	101434	101440	100 %	0 %	0 %	0 %	479146286
1593	NC_021012	GATGAA	2	12	101532	101543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479146286
1594	NC_021012	T	6	6	101569	101574	0 %	100 %	0 %	0 %	479146286
1595	NC_021012	TGC	2	6	101608	101613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146286
1596	NC_021012	TGC	2	6	101647	101652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146286
1597	NC_021012	GAT	2	6	101683	101688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146286
1598	NC_021012	TGT	2	6	101732	101737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146286
1599	NC_021012	CTGC	2	8	101769	101776	0 %	25 %	25 %	50 %	479146286
1600	NC_021012	GTCT	2	8	101905	101912	0 %	50 %	25 %	25 %	479146286
1601	NC_021012	AAG	2	6	101928	101933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146286
1602	NC_021012	CCT	2	6	101961	101966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146286
1603	NC_021012	A	6	6	101981	101986	100 %	0 %	0 %	0 %	479146286
1604	NC_021012	TA	3	6	102007	102012	50 %	50 %	0 %	0 %	479146286
1605	NC_021012	GCG	2	6	102065	102070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146287
1606	NC_021012	GGCA	2	8	102075	102082	25 %	0 %	50 %	25 %	479146287
1607	NC_021012	A	7	7	102082	102088	100 %	0 %	0 %	0 %	479146287
1608	NC_021012	TG	3	6	102119	102124	0 %	50 %	50 %	0 %	479146287
1609	NC_021012	ATA	2	6	102159	102164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146287
1610	NC_021012	GAA	2	6	102165	102170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146287
1611	NC_021012	ATGT	2	8	102263	102270	25 %	50 %	25 %	0 %	479146287
1612	NC_021012	TG	3	6	102291	102296	0 %	50 %	50 %	0 %	479146287
1613	NC_021012	A	6	6	102323	102328	100 %	0 %	0 %	0 %	479146287
1614	NC_021012	GTG	2	6	102329	102334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146287
1615	NC_021012	GCA	2	6	102394	102399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146287
1616	NC_021012	ACC	2	6	102405	102410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146287
1617	NC_021012	T	6	6	102467	102472	0 %	100 %	0 %	0 %	479146287
1618	NC_021012	AAG	2	6	102491	102496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146287
1619	NC_021012	TCA	2	6	102912	102917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146288
1620	NC_021012	TGGT	2	8	102933	102940	0 %	50 %	50 %	0 %	479146288
1621	NC_021012	GCG	2	6	102950	102955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146288
1622	NC_021012	CGT	2	6	103042	103047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146288
1623	NC_021012	AGA	2	6	103159	103164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146288
1624	NC_021012	GAAA	2	8	103294	103301	75 %	0 %	25 %	0 %	479146288
1625	NC_021012	TTTGGA	2	12	103615	103626	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479146289
1626	NC_021012	A	7	7	103644	103650	100 %	0 %	0 %	0 %	479146289
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1745	NC_021012	AT	3	6	110939	110944	50 %	50 %	0 %	0 %	479146296
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1752	NC_021012	GCG	2	6	112536	112541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146297
1753	NC_021012	TAT	2	6	112766	112771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146297
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1756	NC_021012	CGAT	2	8	112875	112882	25 %	25 %	25 %	25 %	479146297
1757	NC_021012	TGGC	2	8	113020	113027	0 %	25 %	50 %	25 %	479146297
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1762	NC_021012	AG	3	6	113322	113327	50 %	0 %	50 %	0 %	479146297
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1782	NC_021012	A	7	7	114685	114691	100 %	0 %	0 %	0 %	479146298
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1854	NC_021012	TA	3	6	118380	118385	50 %	50 %	0 %	0 %	479146303
1855	NC_021012	TGA	2	6	118399	118404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146303
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1870	NC_021012	CA	3	6	119092	119097	50 %	0 %	0 %	50 %	479146303
1871	NC_021012	GCA	2	6	119132	119137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146303
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1990	NC_021012	TATCA	2	10	125404	125413	40 %	40 %	0 %	20 %	479146312
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1993	NC_021012	CAT	2	6	125688	125693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146312
1994	NC_021012	GCA	2	6	125703	125708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146312
1995	NC_021012	GGC	2	6	125733	125738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146312
1996	NC_021012	CGA	2	6	125763	125768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146312
1997	NC_021012	A	6	6	125768	125773	100 %	0 %	0 %	0 %	479146312
1998	NC_021012	A	6	6	125794	125799	100 %	0 %	0 %	0 %	479146312
1999	NC_021012	CGG	2	6	125857	125862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146312
2000	NC_021012	TGG	2	6	125906	125911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146312

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