MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021012	GAG	2	6	30895	30900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146232
502	NC_021012	GGA	2	6	30993	30998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146232
503	NC_021012	CAT	2	6	31027	31032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146232
504	NC_021012	GAG	2	6	31042	31047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146232
505	NC_021012	GGA	2	6	31062	31067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146232
506	NC_021012	GCA	2	6	31078	31083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146232
507	NC_021012	ATGA	2	8	31090	31097	50 %	25 %	25 %	0 %	479146232
508	NC_021012	A	6	6	31192	31197	100 %	0 %	0 %	0 %	479146232
509	NC_021012	GATC	2	8	31206	31213	25 %	25 %	25 %	25 %	479146232
510	NC_021012	TG	3	6	31214	31219	0 %	50 %	50 %	0 %	479146232
511	NC_021012	TTTC	2	8	31231	31238	0 %	75 %	0 %	25 %	479146232
512	NC_021012	ATC	2	6	31283	31288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146232
513	NC_021012	ACA	2	6	31289	31294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146232
514	NC_021012	A	6	6	31366	31371	100 %	0 %	0 %	0 %	479146232
515	NC_021012	CGG	2	6	31401	31406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146232
516	NC_021012	ATC	2	6	31408	31413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146232
517	NC_021012	GGA	2	6	31431	31436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146232
518	NC_021012	TGC	2	6	31611	31616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146232
519	NC_021012	CAGG	2	8	31657	31664	25 %	0 %	50 %	25 %	479146232
520	NC_021012	GCATCC	2	12	31666	31677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479146232
521	NC_021012	GAC	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146232
522	NC_021012	AGA	2	6	31740	31745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146232
523	NC_021012	AGA	2	6	31779	31784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146232
524	NC_021012	GGAA	2	8	31840	31847	50 %	0 %	50 %	0 %	479146233
525	NC_021012	GGAT	2	8	31863	31870	25 %	25 %	50 %	0 %	479146233
526	NC_021012	TTTA	2	8	31882	31889	25 %	75 %	0 %	0 %	479146233
527	NC_021012	A	6	6	31942	31947	100 %	0 %	0 %	0 %	479146233
528	NC_021012	AGA	2	6	31954	31959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146233
529	NC_021012	GCG	2	6	32226	32231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146233
530	NC_021012	TGA	2	6	32254	32259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146233
531	NC_021012	CAT	2	6	32378	32383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146233
532	NC_021012	ATC	2	6	32415	32420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146233
533	NC_021012	GGA	2	6	32434	32439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146233
534	NC_021012	AT	3	6	32461	32466	50 %	50 %	0 %	0 %	479146233
535	NC_021012	GATG	2	8	32518	32525	25 %	25 %	50 %	0 %	479146233
536	NC_021012	TGG	2	6	32753	32758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146234
537	NC_021012	TACAA	2	10	32975	32984	60 %	20 %	0 %	20 %	479146234
538	NC_021012	GAT	2	6	33065	33070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146234
539	NC_021012	GAA	2	6	33092	33097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146234
540	NC_021012	A	6	6	33096	33101	100 %	0 %	0 %	0 %	479146234
541	NC_021012	ACCG	2	8	33118	33125	25 %	0 %	25 %	50 %	479146234
542	NC_021012	GGA	2	6	33139	33144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146234
543	NC_021012	GCT	2	6	33193	33198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146234
544	NC_021012	TTTC	2	8	33231	33238	0 %	75 %	0 %	25 %	479146234
545	NC_021012	TG	3	6	33258	33263	0 %	50 %	50 %	0 %	479146234
546	NC_021012	ATG	2	6	33270	33275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146234
547	NC_021012	TGA	2	6	33289	33294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146234
548	NC_021012	GAA	2	6	33312	33317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146234
549	NC_021012	GACC	2	8	33474	33481	25 %	0 %	25 %	50 %	479146234
550	NC_021012	GAA	2	6	33572	33577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146234
551	NC_021012	AAG	2	6	33621	33626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146234
552	NC_021012	TAT	2	6	33631	33636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146234
553	NC_021012	GGC	2	6	33638	33643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146234
554	NC_021012	TG	3	6	33650	33655	0 %	50 %	50 %	0 %	479146234
555	NC_021012	AGC	2	6	33670	33675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146234
556	NC_021012	CAG	2	6	33689	33694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146234
557	NC_021012	CCGT	2	8	33721	33728	0 %	25 %	25 %	50 %	479146234
558	NC_021012	TTATA	2	10	33757	33766	40 %	60 %	0 %	0 %	479146234
559	NC_021012	GAGGAA	2	12	33767	33778	50 %	0 %	50 %	0 %	479146234
560	NC_021012	TGATG	2	10	33793	33802	20 %	40 %	40 %	0 %	479146234
561	NC_021012	TAT	2	6	33928	33933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146235
562	NC_021012	TTAC	2	8	34004	34011	25 %	50 %	0 %	25 %	479146235
563	NC_021012	GTT	2	6	34027	34032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146235
564	NC_021012	GGT	2	6	34105	34110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146235
565	NC_021012	TGC	2	6	34154	34159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146236
566	NC_021012	TTC	2	6	34217	34222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146236
567	NC_021012	CAT	2	6	34247	34252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146236
568	NC_021012	T	7	7	34276	34282	0 %	100 %	0 %	0 %	479146236
569	NC_021012	T	7	7	34289	34295	0 %	100 %	0 %	0 %	479146236
570	NC_021012	GTGAT	2	10	34309	34318	20 %	40 %	40 %	0 %	479146236
571	NC_021012	CAG	2	6	34350	34355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146236
572	NC_021012	CGG	2	6	34360	34365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146236
573	NC_021012	GCT	2	6	34467	34472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146236
574	NC_021012	AT	3	6	34665	34670	50 %	50 %	0 %	0 %	479146236
575	NC_021012	CCG	2	6	34671	34676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146236
576	NC_021012	GAT	2	6	34699	34704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146236
577	NC_021012	GCC	2	6	34751	34756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146236
578	NC_021012	CAC	2	6	34759	34764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146236
579	NC_021012	CCA	2	6	34831	34836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146236
580	NC_021012	AGC	2	6	34850	34855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146236
581	NC_021012	AT	3	6	34878	34883	50 %	50 %	0 %	0 %	479146236
582	NC_021012	CAG	2	6	34979	34984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146236
583	NC_021012	ATA	2	6	35159	35164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146236
584	NC_021012	CTGTGG	2	12	35165	35176	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479146236
585	NC_021012	TCC	2	6	35265	35270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146236
586	NC_021012	A	7	7	35273	35279	100 %	0 %	0 %	0 %	479146236
587	NC_021012	GT	3	6	35324	35329	0 %	50 %	50 %	0 %	479146236
588	NC_021012	GCG	2	6	35352	35357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146236
589	NC_021012	CCG	3	9	35379	35387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146236
590	NC_021012	TGCA	2	8	35429	35436	25 %	25 %	25 %	25 %	479146236
591	NC_021012	CTG	2	6	35527	35532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146236
592	NC_021012	ATA	2	6	35574	35579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146236
593	NC_021012	CA	3	6	35590	35595	50 %	0 %	0 %	50 %	479146236
594	NC_021012	TTC	2	6	35620	35625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146236
595	NC_021012	GAGG	2	8	35630	35637	25 %	0 %	75 %	0 %	479146236
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597	NC_021012	T	7	7	35663	35669	0 %	100 %	0 %	0 %	479146236
598	NC_021012	TTC	2	6	35675	35680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146236
599	NC_021012	TGT	2	6	35704	35709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146236
600	NC_021012	TTCA	2	8	35723	35730	25 %	50 %	0 %	25 %	479146236
601	NC_021012	T	6	6	35843	35848	0 %	100 %	0 %	0 %	479146236
602	NC_021012	TGG	2	6	36181	36186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146236
603	NC_021012	CCG	2	6	36201	36206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146236
604	NC_021012	CCG	2	6	36208	36213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146236
605	NC_021012	CGG	2	6	36232	36237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146236
606	NC_021012	CGG	2	6	36253	36258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146236
607	NC_021012	TGT	2	6	36271	36276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146236
608	NC_021012	TG	3	6	36318	36323	0 %	50 %	50 %	0 %	479146236
609	NC_021012	ATA	2	6	36338	36343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146236
610	NC_021012	ATGAT	2	10	36348	36357	40 %	40 %	20 %	0 %	479146236
611	NC_021012	GGC	2	6	36380	36385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146236
612	NC_021012	TGA	2	6	36449	36454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146236
613	NC_021012	TGC	2	6	36456	36461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146236
614	NC_021012	GAT	2	6	36468	36473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146236
615	NC_021012	TGT	2	6	36485	36490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146236
616	NC_021012	TGC	2	6	36495	36500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146236
617	NC_021012	TCA	2	6	36539	36544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146237
618	NC_021012	TCT	2	6	36582	36587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146237
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620	NC_021012	TCT	2	6	36656	36661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146237
621	NC_021012	GACA	2	8	36684	36691	50 %	0 %	25 %	25 %	479146237
622	NC_021012	TGC	2	6	36894	36899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146237
623	NC_021012	CCG	2	6	36917	36922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146237
624	NC_021012	GA	3	6	36964	36969	50 %	0 %	50 %	0 %	479146237
625	NC_021012	T	7	7	36995	37001	0 %	100 %	0 %	0 %	479146237
626	NC_021012	T	6	6	37008	37013	0 %	100 %	0 %	0 %	479146237
627	NC_021012	T	6	6	37063	37068	0 %	100 %	0 %	0 %	479146237
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629	NC_021012	CGG	2	6	37281	37286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146237
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