MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021012	ATT	2	6	426217	426222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146549
6502	NC_021012	AGG	2	6	426320	426325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146549
6503	NC_021012	TCATA	2	10	426337	426346	40 %	40 %	0 %	20 %	479146549
6504	NC_021012	A	6	6	426444	426449	100 %	0 %	0 %	0 %	479146549
6505	NC_021012	GCAA	2	8	426463	426470	50 %	0 %	25 %	25 %	479146549
6506	NC_021012	AATG	2	8	426525	426532	50 %	25 %	25 %	0 %	479146549
6507	NC_021012	TTA	2	6	426540	426545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146549
6508	NC_021012	ATAC	2	8	426559	426566	50 %	25 %	0 %	25 %	479146549
6509	NC_021012	A	7	7	426622	426628	100 %	0 %	0 %	0 %	479146549
6510	NC_021012	GAT	2	6	426685	426690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146549
6511	NC_021012	ATT	2	6	426695	426700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146549
6512	NC_021012	GAC	2	6	426794	426799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146549
6513	NC_021012	GGA	2	6	426856	426861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146549
6514	NC_021012	GAT	2	6	426952	426957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146549
6515	NC_021012	TGT	2	6	426966	426971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146549
6516	NC_021012	CAG	2	6	426990	426995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146549
6517	NC_021012	ATT	2	6	427012	427017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146549
6518	NC_021012	TTG	2	6	427040	427045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146549
6519	NC_021012	TGT	2	6	427056	427061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146549
6520	NC_021012	ATG	2	6	427066	427071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146549
6521	NC_021012	A	6	6	427105	427110	100 %	0 %	0 %	0 %	479146549
6522	NC_021012	TATAT	2	10	427279	427288	40 %	60 %	0 %	0 %	479146550
6523	NC_021012	ATT	2	6	427306	427311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146550
6524	NC_021012	TGG	2	6	427345	427350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146550
6525	NC_021012	CAT	2	6	427417	427422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146550
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6527	NC_021012	GAT	2	6	427455	427460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146550
6528	NC_021012	A	6	6	427489	427494	100 %	0 %	0 %	0 %	479146550
6529	NC_021012	GAA	2	6	427521	427526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146550
6530	NC_021012	GAA	2	6	427530	427535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146550
6531	NC_021012	GAT	2	6	427716	427721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146551
6532	NC_021012	TGAAA	2	10	427869	427878	60 %	20 %	20 %	0 %	479146551
6533	NC_021012	CAG	2	6	427982	427987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146551
6534	NC_021012	TGAAA	2	10	428001	428010	60 %	20 %	20 %	0 %	479146551
6535	NC_021012	GCT	2	6	428366	428371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146552
6536	NC_021012	ATG	2	6	428415	428420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146552
6537	NC_021012	GGC	2	6	428436	428441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146552
6538	NC_021012	CAT	2	6	428469	428474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146552
6539	NC_021012	GAG	2	6	428642	428647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146553
6540	NC_021012	A	6	6	428657	428662	100 %	0 %	0 %	0 %	479146553
6541	NC_021012	GAA	2	6	428669	428674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146553
6542	NC_021012	TCG	2	6	428676	428681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146553
6543	NC_021012	A	6	6	428686	428691	100 %	0 %	0 %	0 %	479146553
6544	NC_021012	ATT	2	6	428742	428747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146553
6545	NC_021012	A	6	6	428816	428821	100 %	0 %	0 %	0 %	479146553
6546	NC_021012	GAA	2	6	428915	428920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146554
6547	NC_021012	GCT	2	6	428966	428971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146554
6548	NC_021012	GGT	2	6	429273	429278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146556
6549	NC_021012	TGC	2	6	429353	429358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146556
6550	NC_021012	ATC	2	6	429414	429419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146556
6551	NC_021012	GTAT	2	8	429421	429428	25 %	50 %	25 %	0 %	479146556
6552	NC_021012	GAT	2	6	429432	429437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146556
6553	NC_021012	CT	3	6	429465	429470	0 %	50 %	0 %	50 %	479146556
6554	NC_021012	TTC	2	6	429474	429479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146556
6555	NC_021012	ATG	2	6	429490	429495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146556
6556	NC_021012	ATG	2	6	429543	429548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146556
6557	NC_021012	AG	3	6	429601	429606	50 %	0 %	50 %	0 %	479146556
6558	NC_021012	GTG	2	6	429628	429633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146556
6559	NC_021012	TAT	2	6	429651	429656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146556
6560	NC_021012	CGG	2	6	429685	429690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146556
6561	NC_021012	TTG	2	6	429787	429792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146556
6562	NC_021012	CAA	2	6	429821	429826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146556
6563	NC_021012	GAT	2	6	429867	429872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146556
6564	NC_021012	ACT	2	6	429907	429912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146556
6565	NC_021012	CGG	2	6	429914	429919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146556
6566	NC_021012	CAT	3	9	429941	429949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146556
6567	NC_021012	TA	3	6	429976	429981	50 %	50 %	0 %	0 %	479146556
6568	NC_021012	CAG	2	6	430029	430034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146556
6569	NC_021012	CTG	2	6	430041	430046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146556
6570	NC_021012	ACA	2	6	430105	430110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146556
6571	NC_021012	GGACC	2	10	430117	430126	20 %	0 %	40 %	40 %	479146556
6572	NC_021012	GAT	2	6	430134	430139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146556
6573	NC_021012	ATA	2	6	430223	430228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146556
6574	NC_021012	TAT	2	6	430329	430334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146557
6575	NC_021012	CAG	2	6	430374	430379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146557
6576	NC_021012	GCA	2	6	430447	430452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146557
6577	NC_021012	CAG	2	6	430499	430504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146557
6578	NC_021012	CTTC	2	8	430573	430580	0 %	50 %	0 %	50 %	479146557
6579	NC_021012	TCTGC	2	10	430620	430629	0 %	40 %	20 %	40 %	479146557
6580	NC_021012	TGA	2	6	430658	430663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146557
6581	NC_021012	AT	3	6	430707	430712	50 %	50 %	0 %	0 %	479146557
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6583	NC_021012	GGC	2	6	430903	430908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146557
6584	NC_021012	GTAT	2	8	430913	430920	25 %	50 %	25 %	0 %	479146557
6585	NC_021012	GAT	2	6	430935	430940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146557
6586	NC_021012	CAG	2	6	430995	431000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146557
6587	NC_021012	AGG	2	6	431012	431017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146557
6588	NC_021012	GTT	2	6	431167	431172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146557
6589	NC_021012	TCCA	2	8	431173	431180	25 %	25 %	0 %	50 %	479146557
6590	NC_021012	ACC	2	6	432038	432043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146558
6591	NC_021012	GAT	2	6	432213	432218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146559
6592	NC_021012	TCC	2	6	432231	432236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146559
6593	NC_021012	AAG	2	6	432346	432351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146559
6594	NC_021012	GAA	2	6	432358	432363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146559
6595	NC_021012	AGA	2	6	432381	432386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146559
6596	NC_021012	TG	3	6	432972	432977	0 %	50 %	50 %	0 %	479146560
6597	NC_021012	AATG	2	8	433027	433034	50 %	25 %	25 %	0 %	479146560
6598	NC_021012	CGC	2	6	433062	433067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146560
6599	NC_021012	TCT	2	6	433139	433144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146560
6600	NC_021012	CGG	2	6	433228	433233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146560
6601	NC_021012	TTTTA	2	10	435826	435835	20 %	80 %	0 %	0 %	479146561
6602	NC_021012	CAA	2	6	435864	435869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146561
6603	NC_021012	CAA	2	6	435958	435963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146561
6604	NC_021012	CCT	2	6	435977	435982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146561
6605	NC_021012	T	6	6	436033	436038	0 %	100 %	0 %	0 %	479146561
6606	NC_021012	CGAAG	2	10	436938	436947	40 %	0 %	40 %	20 %	479146562
6607	NC_021012	GAA	2	6	436989	436994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146562
6608	NC_021012	CGGG	2	8	437013	437020	0 %	0 %	75 %	25 %	479146562
6609	NC_021012	TAC	2	6	437029	437034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146562
6610	NC_021012	GGT	2	6	437046	437051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146562
6611	NC_021012	GCGG	2	8	437066	437073	0 %	0 %	75 %	25 %	479146562
6612	NC_021012	TGG	2	6	437117	437122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146562
6613	NC_021012	GCA	2	6	438329	438334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146563
6614	NC_021012	GGAAA	2	10	438336	438345	60 %	0 %	40 %	0 %	479146563
6615	NC_021012	GAAATC	2	12	438379	438390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479146563
6616	NC_021012	GGAAA	2	10	438403	438412	60 %	0 %	40 %	0 %	479146563
6617	NC_021012	TC	3	6	438426	438431	0 %	50 %	0 %	50 %	479146563
6618	NC_021012	AGC	2	6	438456	438461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146563
6619	NC_021012	CAG	2	6	438481	438486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146563
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6621	NC_021012	CAG	2	6	438920	438925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146564
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6987	NC_021012	AG	3	6	458355	458360	50 %	0 %	50 %	0 %	479146578
6988	NC_021012	TCT	2	6	458398	458403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146578
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6990	NC_021012	GAA	2	6	458691	458696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146579
6991	NC_021012	TAA	2	6	458742	458747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146579
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6999	NC_021012	CAA	2	6	459048	459053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146580
7000	NC_021012	ATA	2	6	459092	459097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146580

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