MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021012	TTC	2	6	361693	361698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146502
5502	NC_021012	ATT	2	6	361722	361727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146502
5503	NC_021012	GGT	2	6	361772	361777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146502
5504	NC_021012	ACA	2	6	361815	361820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146502
5505	NC_021012	ATCA	2	8	361985	361992	50 %	25 %	0 %	25 %	479146502
5506	NC_021012	ATATT	2	10	362046	362055	40 %	60 %	0 %	0 %	479146502
5507	NC_021012	ATG	2	6	362163	362168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146502
5508	NC_021012	TGAA	2	8	362340	362347	50 %	25 %	25 %	0 %	479146502
5509	NC_021012	GCA	2	6	362364	362369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146502
5510	NC_021012	AAG	2	6	362382	362387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146502
5511	NC_021012	TG	4	8	362398	362405	0 %	50 %	50 %	0 %	479146502
5512	NC_021012	AAG	2	6	362409	362414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146502
5513	NC_021012	CAG	2	6	362418	362423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146502
5514	NC_021012	A	8	8	362445	362452	100 %	0 %	0 %	0 %	479146502
5515	NC_021012	AAAT	2	8	362474	362481	75 %	25 %	0 %	0 %	479146502
5516	NC_021012	A	6	6	362539	362544	100 %	0 %	0 %	0 %	479146504
5517	NC_021012	ATT	2	6	362551	362556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146504
5518	NC_021012	ATGG	2	8	362563	362570	25 %	25 %	50 %	0 %	479146504
5519	NC_021012	GCC	2	6	362587	362592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146504
5520	NC_021012	TGC	2	6	362758	362763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146504
5521	NC_021012	ATT	2	6	362777	362782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146504
5522	NC_021012	A	6	6	362838	362843	100 %	0 %	0 %	0 %	479146504
5523	NC_021012	ATCATT	2	12	362903	362914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479146504
5524	NC_021012	ATT	2	6	362921	362926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146504
5525	NC_021012	AAT	2	6	362950	362955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146504
5526	NC_021012	ATG	2	6	363044	363049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146504
5527	NC_021012	CAG	2	6	363051	363056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146504
5528	NC_021012	TGC	2	6	363081	363086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146504
5529	NC_021012	ACT	2	6	363203	363208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146505
5530	NC_021012	TTC	2	6	363317	363322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146505
5531	NC_021012	GGA	2	6	363404	363409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146505
5532	NC_021012	ATC	2	6	363501	363506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146505
5533	NC_021012	ATC	3	9	363514	363522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146505
5534	NC_021012	CGA	2	6	363583	363588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146505
5535	NC_021012	ATA	2	6	363613	363618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146505
5536	NC_021012	AGA	2	6	363630	363635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146505
5537	NC_021012	AAT	2	6	363675	363680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146505
5538	NC_021012	TGA	2	6	363731	363736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146505
5539	NC_021012	TGA	2	6	363785	363790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146505
5540	NC_021012	ATG	2	6	363832	363837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146505
5541	NC_021012	AT	3	6	363883	363888	50 %	50 %	0 %	0 %	479146505
5542	NC_021012	TGCT	2	8	363898	363905	0 %	50 %	25 %	25 %	479146505
5543	NC_021012	AAG	2	6	363910	363915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146505
5544	NC_021012	CGT	2	6	363926	363931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146505
5545	NC_021012	GGC	3	9	364035	364043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146505
5546	NC_021012	GGA	2	6	364059	364064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146505
5547	NC_021012	A	6	6	364152	364157	100 %	0 %	0 %	0 %	479146505
5548	NC_021012	AATGAC	2	12	364730	364741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479146506
5549	NC_021012	AAG	2	6	364748	364753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146506
5550	NC_021012	AAGG	2	8	364769	364776	50 %	0 %	50 %	0 %	479146506
5551	NC_021012	CTT	2	6	364958	364963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146506
5552	NC_021012	GAA	2	6	364988	364993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146506
5553	NC_021012	TCA	2	6	365010	365015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146506
5554	NC_021012	A	6	6	365015	365020	100 %	0 %	0 %	0 %	479146506
5555	NC_021012	TTAC	2	8	365109	365116	25 %	50 %	0 %	25 %	479146506
5556	NC_021012	TGG	2	6	365141	365146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146506
5557	NC_021012	AGG	2	6	365238	365243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146506
5558	NC_021012	TG	3	6	365369	365374	0 %	50 %	50 %	0 %	479146506
5559	NC_021012	TAT	2	6	365423	365428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146506
5560	NC_021012	A	6	6	365597	365602	100 %	0 %	0 %	0 %	479146506
5561	NC_021012	GAT	2	6	365684	365689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146506
5562	NC_021012	GAA	2	6	365700	365705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146506
5563	NC_021012	AAAG	2	8	365785	365792	75 %	0 %	25 %	0 %	479146506
5564	NC_021012	CTG	2	6	365872	365877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146506
5565	NC_021012	AC	3	6	365886	365891	50 %	0 %	0 %	50 %	479146506
5566	NC_021012	CTA	2	6	365899	365904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146506
5567	NC_021012	CAA	3	9	365959	365967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146506
5568	NC_021012	AG	3	6	366136	366141	50 %	0 %	50 %	0 %	479146506
5569	NC_021012	GGA	2	6	366154	366159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146506
5570	NC_021012	CTG	2	6	366256	366261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146506
5571	NC_021012	CT	3	6	366388	366393	0 %	50 %	0 %	50 %	479146506
5572	NC_021012	TAA	2	6	366418	366423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146506
5573	NC_021012	AGA	2	6	366477	366482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146506
5574	NC_021012	AGGA	2	8	366615	366622	50 %	0 %	50 %	0 %	479146506
5575	NC_021012	TTC	2	6	366662	366667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146506
5576	NC_021012	CAA	2	6	366699	366704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146506
5577	NC_021012	GCT	2	6	366748	366753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146506
5578	NC_021012	TGA	2	6	366832	366837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146506
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5580	NC_021012	AT	3	6	366925	366930	50 %	50 %	0 %	0 %	479146506
5581	NC_021012	GCT	2	6	366965	366970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146506
5582	NC_021012	GAT	2	6	366976	366981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146506
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5584	NC_021012	GTT	2	6	367133	367138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146506
5585	NC_021012	CGTG	2	8	367145	367152	0 %	25 %	50 %	25 %	479146506
5586	NC_021012	ATGT	2	8	367196	367203	25 %	50 %	25 %	0 %	479146506
5587	NC_021012	ATC	2	6	367241	367246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146506
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5589	NC_021012	CAGT	2	8	367446	367453	25 %	25 %	25 %	25 %	479146506
5590	NC_021012	GAT	2	6	367454	367459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146506
5591	NC_021012	GAA	2	6	367472	367477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146506
5592	NC_021012	ATA	2	6	367527	367532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146506
5593	NC_021012	AGGA	2	8	367578	367585	50 %	0 %	50 %	0 %	479146506
5594	NC_021012	TAA	2	6	367699	367704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146506
5595	NC_021012	CAT	2	6	367717	367722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146506
5596	NC_021012	GGAAT	2	10	367798	367807	40 %	20 %	40 %	0 %	479146506
5597	NC_021012	A	7	7	367837	367843	100 %	0 %	0 %	0 %	479146506
5598	NC_021012	CAA	2	6	367873	367878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146507
5599	NC_021012	A	6	6	367912	367917	100 %	0 %	0 %	0 %	479146507
5600	NC_021012	CAG	2	6	367949	367954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146507
5601	NC_021012	TGA	2	6	367999	368004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146507
5602	NC_021012	TAT	2	6	368054	368059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146507
5603	NC_021012	CAA	2	6	368095	368100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146507
5604	NC_021012	TGA	2	6	368164	368169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146507
5605	NC_021012	TGG	2	6	368206	368211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146507
5606	NC_021012	AGA	2	6	368310	368315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146507
5607	NC_021012	CGG	2	6	368413	368418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146507
5608	NC_021012	GGA	2	6	368440	368445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146507
5609	NC_021012	CAG	2	6	368705	368710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146507
5610	NC_021012	TTC	2	6	368714	368719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146507
5611	NC_021012	CAT	2	6	368762	368767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146507
5612	NC_021012	ACCA	2	8	368921	368928	50 %	0 %	0 %	50 %	479146507
5613	NC_021012	TCT	2	6	368970	368975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146507
5614	NC_021012	TATC	2	8	368992	368999	25 %	50 %	0 %	25 %	479146507
5615	NC_021012	GAG	2	6	369008	369013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146507
5616	NC_021012	ATTT	2	8	369025	369032	25 %	75 %	0 %	0 %	479146507
5617	NC_021012	GCA	2	6	369128	369133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146507
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5619	NC_021012	CAA	3	9	369226	369234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146507
5620	NC_021012	CA	3	6	369247	369252	50 %	0 %	0 %	50 %	479146507
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5622	NC_021012	GAC	2	6	369314	369319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146507
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5773	NC_021012	GGA	2	6	380310	380315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146517
5774	NC_021012	GA	3	6	380326	380331	50 %	0 %	50 %	0 %	479146517
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5852	NC_021012	GCA	2	6	384438	384443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146521
5853	NC_021012	GCT	2	6	384452	384457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146521
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5859	NC_021012	GTG	2	6	384842	384847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146522
5860	NC_021012	TAT	2	6	384883	384888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146522
5861	NC_021012	CATTT	2	10	385057	385066	20 %	60 %	0 %	20 %	479146522
5862	NC_021012	GGC	2	6	385230	385235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146522
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5865	NC_021012	GGA	2	6	385289	385294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146522
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5869	NC_021012	A	6	6	385472	385477	100 %	0 %	0 %	0 %	479146522
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5991	NC_021012	TTG	2	6	393353	393358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146528
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