MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021012	GAT	2	6	330286	330291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146478
5002	NC_021012	TGAT	2	8	330324	330331	25 %	50 %	25 %	0 %	479146478
5003	NC_021012	CAGAGA	2	12	330414	330425	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479146478
5004	NC_021012	A	7	7	330491	330497	100 %	0 %	0 %	0 %	479146478
5005	NC_021012	TGA	2	6	330582	330587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146478
5006	NC_021012	TGA	2	6	330610	330615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146478
5007	NC_021012	ATG	2	6	330636	330641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146478
5008	NC_021012	GT	3	6	330734	330739	0 %	50 %	50 %	0 %	479146478
5009	NC_021012	TTC	2	6	330753	330758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146478
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5011	NC_021012	TAA	2	6	330784	330789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146478
5012	NC_021012	AGA	2	6	330790	330795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146478
5013	NC_021012	ATT	2	6	330849	330854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146478
5014	NC_021012	AAGC	2	8	330870	330877	50 %	0 %	25 %	25 %	479146478
5015	NC_021012	CAG	2	6	330881	330886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146478
5016	NC_021012	TTCC	2	8	330940	330947	0 %	50 %	0 %	50 %	479146478
5017	NC_021012	TTG	2	6	330966	330971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146478
5018	NC_021012	AGA	2	6	331039	331044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146478
5019	NC_021012	GAA	2	6	331099	331104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146478
5020	NC_021012	ACA	2	6	331170	331175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146478
5021	NC_021012	A	6	6	331225	331230	100 %	0 %	0 %	0 %	479146478
5022	NC_021012	A	8	8	331236	331243	100 %	0 %	0 %	0 %	479146478
5023	NC_021012	GGA	2	6	331316	331321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146478
5024	NC_021012	TGA	2	6	331470	331475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146478
5025	NC_021012	GA	3	6	331536	331541	50 %	0 %	50 %	0 %	479146478
5026	NC_021012	GA	3	6	331556	331561	50 %	0 %	50 %	0 %	479146478
5027	NC_021012	ATT	2	6	331586	331591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146478
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5030	NC_021012	GCA	2	6	331662	331667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146479
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5033	NC_021012	ATTT	2	8	331790	331797	25 %	75 %	0 %	0 %	479146479
5034	NC_021012	T	6	6	331840	331845	0 %	100 %	0 %	0 %	479146479
5035	NC_021012	TTG	2	6	331900	331905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146479
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5038	NC_021012	GTA	2	6	332136	332141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146479
5039	NC_021012	TTG	2	6	332188	332193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146479
5040	NC_021012	ATACA	2	10	332231	332240	60 %	20 %	0 %	20 %	479146479
5041	NC_021012	ACA	2	6	332322	332327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146479
5042	NC_021012	AGG	2	6	332393	332398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146479
5043	NC_021012	TAT	2	6	332444	332449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146479
5044	NC_021012	ATA	2	6	332455	332460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146479
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5047	NC_021012	GTT	2	6	332535	332540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146479
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5051	NC_021012	CAGC	2	8	332759	332766	25 %	0 %	25 %	50 %	479146480
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5057	NC_021012	TAT	2	6	333073	333078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146480
5058	NC_021012	TGC	2	6	333084	333089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146480
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5061	NC_021012	AGA	2	6	333324	333329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146480
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5080	NC_021012	GTT	2	6	335349	335354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146481
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5102	NC_021012	GA	3	6	336736	336741	50 %	0 %	50 %	0 %	479146481
5103	NC_021012	ATC	2	6	336773	336778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146481
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5109	NC_021012	A	6	6	338842	338847	100 %	0 %	0 %	0 %	479146482
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5112	NC_021012	GATG	2	8	338969	338976	25 %	25 %	50 %	0 %	479146482
5113	NC_021012	CATA	2	8	339021	339028	50 %	25 %	0 %	25 %	479146482
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5246	NC_021012	A	6	6	346701	346706	100 %	0 %	0 %	0 %	479146488
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5368	NC_021012	A	6	6	354115	354120	100 %	0 %	0 %	0 %	479146491
5369	NC_021012	GCA	2	6	354184	354189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146491
5370	NC_021012	TCC	2	6	354245	354250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146491
5371	NC_021012	GA	3	6	354288	354293	50 %	0 %	50 %	0 %	479146491
5372	NC_021012	A	6	6	354396	354401	100 %	0 %	0 %	0 %	479146491
5373	NC_021012	A	6	6	354414	354419	100 %	0 %	0 %	0 %	479146492
5374	NC_021012	GGA	2	6	354551	354556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146492
5375	NC_021012	TGG	2	6	354562	354567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146492
5376	NC_021012	GCAG	2	8	354587	354594	25 %	0 %	50 %	25 %	479146492
5377	NC_021012	TCTG	2	8	354600	354607	0 %	50 %	25 %	25 %	479146492
5378	NC_021012	TAC	2	6	354622	354627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146492
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5380	NC_021012	GTG	2	6	354672	354677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146492
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5382	NC_021012	CGA	2	6	354780	354785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146492
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5384	NC_021012	GCG	2	6	354890	354895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146492
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5386	NC_021012	CAA	2	6	355039	355044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146492
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5389	NC_021012	T	6	6	356198	356203	0 %	100 %	0 %	0 %	479146494
5390	NC_021012	CTTTTT	2	12	356236	356247	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479146494
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5392	NC_021012	CTT	2	6	356380	356385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146494
5393	NC_021012	T	6	6	356384	356389	0 %	100 %	0 %	0 %	479146494
5394	NC_021012	CAT	2	6	356483	356488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146494
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5396	NC_021012	GCGGCA	2	12	356580	356591	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479146494
5397	NC_021012	GCT	2	6	356593	356598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146494
5398	NC_021012	CTTT	2	8	356611	356618	0 %	75 %	0 %	25 %	479146494
5399	NC_021012	CTTT	2	8	356626	356633	0 %	75 %	0 %	25 %	479146494
5400	NC_021012	GAT	2	6	356660	356665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146494
5401	NC_021012	CAATA	2	10	356687	356696	60 %	20 %	0 %	20 %	479146494
5402	NC_021012	ATAA	2	8	356709	356716	75 %	25 %	0 %	0 %	479146494
5403	NC_021012	AATG	2	8	357082	357089	50 %	25 %	25 %	0 %	479146495
5404	NC_021012	TTATC	2	10	357155	357164	20 %	60 %	0 %	20 %	479146495
5405	NC_021012	TGG	2	6	357167	357172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146495
5406	NC_021012	A	6	6	357173	357178	100 %	0 %	0 %	0 %	479146495
5407	NC_021012	GATC	2	8	357182	357189	25 %	25 %	25 %	25 %	479146495
5408	NC_021012	CTG	2	6	357214	357219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146495
5409	NC_021012	A	6	6	357234	357239	100 %	0 %	0 %	0 %	479146495
5410	NC_021012	AGC	2	6	357272	357277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146495
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5413	NC_021012	CAGA	2	8	357330	357337	50 %	0 %	25 %	25 %	479146495
5414	NC_021012	CTAT	2	8	357367	357374	25 %	50 %	0 %	25 %	479146495
5415	NC_021012	ATT	2	6	357439	357444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146495
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5417	NC_021012	ATG	2	6	357567	357572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146495
5418	NC_021012	GATC	2	8	357626	357633	25 %	25 %	25 %	25 %	479146495
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5421	NC_021012	GA	3	6	357680	357685	50 %	0 %	50 %	0 %	479146495
5422	NC_021012	AT	3	6	357695	357700	50 %	50 %	0 %	0 %	479146495
5423	NC_021012	TAA	3	9	357710	357718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146495
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5426	NC_021012	AATG	2	8	357767	357774	50 %	25 %	25 %	0 %	479146495
5427	NC_021012	AGG	2	6	357829	357834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146495
5428	NC_021012	GAA	2	6	357858	357863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146495
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5432	NC_021012	AGGA	2	8	358207	358214	50 %	0 %	50 %	0 %	479146496
5433	NC_021012	TCAG	2	8	358219	358226	25 %	25 %	25 %	25 %	479146496
5434	NC_021012	CA	3	6	358247	358252	50 %	0 %	0 %	50 %	479146496
5435	NC_021012	CGG	2	6	358313	358318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146496
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5443	NC_021012	GGA	2	6	358807	358812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146497
5444	NC_021012	GGC	2	6	358867	358872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146497
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5452	NC_021012	CAT	2	6	359149	359154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146498
5453	NC_021012	ATC	2	6	359196	359201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146498
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5460	NC_021012	A	6	6	359503	359508	100 %	0 %	0 %	0 %	479146498
5461	NC_021012	AAT	2	6	359615	359620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146500
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5463	NC_021012	TGG	2	6	359650	359655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146500
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5465	NC_021012	AG	3	6	359672	359677	50 %	0 %	50 %	0 %	479146500
5466	NC_021012	A	6	6	359709	359714	100 %	0 %	0 %	0 %	479146500
5467	NC_021012	AT	3	6	359764	359769	50 %	50 %	0 %	0 %	479146500
5468	NC_021012	TGTT	2	8	359781	359788	0 %	75 %	25 %	0 %	479146500
5469	NC_021012	TCCG	2	8	359943	359950	0 %	25 %	25 %	50 %	479146500
5470	NC_021012	TGTT	2	8	360018	360025	0 %	75 %	25 %	0 %	479146500
5471	NC_021012	AGA	2	6	360052	360057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146500
5472	NC_021012	TCCG	2	8	360096	360103	0 %	25 %	25 %	50 %	479146500
5473	NC_021012	CTG	2	6	360169	360174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146500
5474	NC_021012	TAC	2	6	360188	360193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146500
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5476	NC_021012	GGT	2	6	360278	360283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146500
5477	NC_021012	AGA	2	6	360321	360326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146500
5478	NC_021012	CAT	2	6	360397	360402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146500
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5480	NC_021012	GAT	2	6	360533	360538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146500
5481	NC_021012	TGA	2	6	360540	360545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146500
5482	NC_021012	GCA	2	6	360593	360598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146500
5483	NC_021012	GAT	2	6	360632	360637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146500
5484	NC_021012	AGT	2	6	360757	360762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146500
5485	NC_021012	A	6	6	360782	360787	100 %	0 %	0 %	0 %	479146501
5486	NC_021012	GCAC	2	8	360794	360801	25 %	0 %	25 %	50 %	479146501
5487	NC_021012	GTG	2	6	360857	360862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146501
5488	NC_021012	A	6	6	361022	361027	100 %	0 %	0 %	0 %	479146502
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5491	NC_021012	GAA	2	6	361190	361195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146502
5492	NC_021012	AGAC	2	8	361258	361265	50 %	0 %	25 %	25 %	479146502
5493	NC_021012	GCAG	2	8	361303	361310	25 %	0 %	50 %	25 %	479146502
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5495	NC_021012	AAG	2	6	361428	361433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146502
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