MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 67186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021012	AGATCG	2	12	298489	298500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479146454
4502	NC_021012	AGG	2	6	298501	298506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146454
4503	NC_021012	A	6	6	298527	298532	100 %	0 %	0 %	0 %	479146454
4504	NC_021012	AT	3	6	298598	298603	50 %	50 %	0 %	0 %	479146454
4505	NC_021012	CTT	2	6	298629	298634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146454
4506	NC_021012	A	7	7	298655	298661	100 %	0 %	0 %	0 %	479146454
4507	NC_021012	TGA	2	6	298736	298741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146454
4508	NC_021012	TTTC	2	8	298787	298794	0 %	75 %	0 %	25 %	479146454
4509	NC_021012	AG	3	6	298829	298834	50 %	0 %	50 %	0 %	479146454
4510	NC_021012	TAT	2	6	298835	298840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146454
4511	NC_021012	CATT	2	8	298904	298911	25 %	50 %	0 %	25 %	479146454
4512	NC_021012	AGA	2	6	298933	298938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146454
4513	NC_021012	AGCAG	2	10	299146	299155	40 %	0 %	40 %	20 %	479146455
4514	NC_021012	T	6	6	299180	299185	0 %	100 %	0 %	0 %	479146455
4515	NC_021012	ACA	2	6	299204	299209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146455
4516	NC_021012	A	6	6	299209	299214	100 %	0 %	0 %	0 %	479146455
4517	NC_021012	A	6	6	299230	299235	100 %	0 %	0 %	0 %	479146455
4518	NC_021012	A	6	6	299298	299303	100 %	0 %	0 %	0 %	479146455
4519	NC_021012	TCGCA	2	10	299307	299316	20 %	20 %	20 %	40 %	479146455
4520	NC_021012	CGGA	2	8	299348	299355	25 %	0 %	50 %	25 %	479146455
4521	NC_021012	AAG	2	6	299360	299365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146455
4522	NC_021012	A	6	6	299391	299396	100 %	0 %	0 %	0 %	479146455
4523	NC_021012	CAG	2	6	299438	299443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4524	NC_021012	AGC	2	6	299538	299543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4525	NC_021012	AGA	2	6	299593	299598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146455
4526	NC_021012	TAT	2	6	299659	299664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146455
4527	NC_021012	TGG	2	6	299691	299696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146455
4528	NC_021012	TGC	2	6	299707	299712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4529	NC_021012	GAT	2	6	299714	299719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146455
4530	NC_021012	TGC	2	6	299728	299733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4531	NC_021012	GAT	2	6	299738	299743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146455
4532	NC_021012	TGA	2	6	299782	299787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146455
4533	NC_021012	AAAAG	2	10	299833	299842	80 %	0 %	20 %	0 %	479146455
4534	NC_021012	CAG	2	6	299939	299944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4535	NC_021012	AGATG	2	10	299971	299980	40 %	20 %	40 %	0 %	479146455
4536	NC_021012	TGA	2	6	300031	300036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146455
4537	NC_021012	AGC	2	6	300044	300049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4538	NC_021012	AGG	2	6	300093	300098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146455
4539	NC_021012	A	6	6	300126	300131	100 %	0 %	0 %	0 %	479146455
4540	NC_021012	GGGA	2	8	300168	300175	25 %	0 %	75 %	0 %	479146455
4541	NC_021012	CAA	2	6	300286	300291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146455
4542	NC_021012	ACA	2	6	300299	300304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146455
4543	NC_021012	CAG	2	6	300359	300364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4544	NC_021012	ATG	2	6	300473	300478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146455
4545	NC_021012	GAA	2	6	300695	300700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146455
4546	NC_021012	GAA	2	6	300731	300736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146455
4547	NC_021012	GGA	2	6	300784	300789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146455
4548	NC_021012	CAT	2	6	300824	300829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146455
4549	NC_021012	TGGA	2	8	300837	300844	25 %	25 %	50 %	0 %	479146455
4550	NC_021012	ATG	2	6	300918	300923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146455
4551	NC_021012	A	6	6	300947	300952	100 %	0 %	0 %	0 %	479146455
4552	NC_021012	GCA	2	6	300996	301001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146455
4553	NC_021012	TCT	2	6	301018	301023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146455
4554	NC_021012	AT	3	6	301026	301031	50 %	50 %	0 %	0 %	479146455
4555	NC_021012	ACA	2	6	301060	301065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146455
4556	NC_021012	TCA	2	6	301071	301076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146455
4557	NC_021012	AT	3	6	301105	301110	50 %	50 %	0 %	0 %	479146455
4558	NC_021012	ATC	2	6	301128	301133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146455
4559	NC_021012	GAA	2	6	301151	301156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146455
4560	NC_021012	GCT	2	6	301323	301328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146456
4561	NC_021012	GCA	2	6	301367	301372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146456
4562	NC_021012	CAGA	2	8	301380	301387	50 %	0 %	25 %	25 %	479146456
4563	NC_021012	AG	3	6	301390	301395	50 %	0 %	50 %	0 %	479146456
4564	NC_021012	GCC	2	6	301398	301403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146456
4565	NC_021012	TGGTG	2	10	301417	301426	0 %	40 %	60 %	0 %	479146456
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4569	NC_021012	GGT	2	6	301522	301527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146456
4570	NC_021012	AGC	2	6	301529	301534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146456
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4572	NC_021012	CAT	2	6	301680	301685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146456
4573	NC_021012	GAT	2	6	301753	301758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146456
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4577	NC_021012	GT	3	6	302867	302872	0 %	50 %	50 %	0 %	479146457
4578	NC_021012	GAAA	2	8	302874	302881	75 %	0 %	25 %	0 %	479146457
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4581	NC_021012	ATG	2	6	303024	303029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146457
4582	NC_021012	GAT	2	6	303043	303048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146457
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4584	NC_021012	GTG	2	6	303077	303082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146457
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4588	NC_021012	TGG	2	6	303429	303434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146457
4589	NC_021012	TGT	2	6	303486	303491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146457
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4592	NC_021012	AG	3	6	303685	303690	50 %	0 %	50 %	0 %	479146457
4593	NC_021012	GTA	2	6	303719	303724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146457
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4598	NC_021012	T	7	7	304625	304631	0 %	100 %	0 %	0 %	479146458
4599	NC_021012	ATGA	2	8	304638	304645	50 %	25 %	25 %	0 %	479146458
4600	NC_021012	ATATGT	2	12	304646	304657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479146458
4601	NC_021012	GA	3	6	304703	304708	50 %	0 %	50 %	0 %	479146458
4602	NC_021012	AGA	2	6	304730	304735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146458
4603	NC_021012	A	6	6	304746	304751	100 %	0 %	0 %	0 %	479146458
4604	NC_021012	AAT	2	6	304797	304802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146458
4605	NC_021012	AGG	2	6	304813	304818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146458
4606	NC_021012	TAAA	2	8	304855	304862	75 %	25 %	0 %	0 %	479146458
4607	NC_021012	TGT	2	6	304883	304888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146458
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4609	NC_021012	ATAGA	2	10	304909	304918	60 %	20 %	20 %	0 %	479146458
4610	NC_021012	CGC	2	6	304965	304970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146458
4611	NC_021012	A	6	6	304984	304989	100 %	0 %	0 %	0 %	479146458
4612	NC_021012	TCT	2	6	305025	305030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146458
4613	NC_021012	CAT	2	6	305048	305053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146458
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4615	NC_021012	GA	3	6	305083	305088	50 %	0 %	50 %	0 %	479146458
4616	NC_021012	AT	3	6	305093	305098	50 %	50 %	0 %	0 %	479146458
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4620	NC_021012	AG	3	6	305268	305273	50 %	0 %	50 %	0 %	479146458
4621	NC_021012	TGG	2	6	305323	305328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146458
4622	NC_021012	TCC	2	6	305445	305450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146458
4623	NC_021012	GAA	2	6	305458	305463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146458
4624	NC_021012	CTCA	2	8	305505	305512	25 %	25 %	0 %	50 %	479146458
4625	NC_021012	GTGTA	2	10	305575	305584	20 %	40 %	40 %	0 %	479146458
4626	NC_021012	ATG	2	6	305614	305619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146458
4627	NC_021012	ATC	2	6	305649	305654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146458
4628	NC_021012	ATCGG	2	10	305701	305710	20 %	20 %	40 %	20 %	479146458
4629	NC_021012	TAT	2	6	305907	305912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146458
4630	NC_021012	AATG	2	8	306217	306224	50 %	25 %	25 %	0 %	479146459
4631	NC_021012	AGA	2	6	306274	306279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146459
4632	NC_021012	TAT	2	6	306284	306289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146459
4633	NC_021012	GCA	2	6	306403	306408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146459
4634	NC_021012	A	6	6	306534	306539	100 %	0 %	0 %	0 %	479146459
4635	NC_021012	AGC	2	6	306558	306563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146459
4636	NC_021012	TAT	2	6	306594	306599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146459
4637	NC_021012	TGA	2	6	306601	306606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146459
4638	NC_021012	ATG	2	6	306636	306641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146459
4639	NC_021012	TGAA	2	8	306660	306667	50 %	25 %	25 %	0 %	479146459
4640	NC_021012	AAG	2	6	306683	306688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146459
4641	NC_021012	A	6	6	306759	306764	100 %	0 %	0 %	0 %	479146459
4642	NC_021012	TAT	3	9	306773	306781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146459
4643	NC_021012	GA	3	6	306802	306807	50 %	0 %	50 %	0 %	479146459
4644	NC_021012	CGGA	2	8	306818	306825	25 %	0 %	50 %	25 %	479146459
4645	NC_021012	TGA	2	6	306883	306888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146459
4646	NC_021012	GGA	2	6	306920	306925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146459
4647	NC_021012	T	6	6	307034	307039	0 %	100 %	0 %	0 %	479146459
4648	NC_021012	GAA	2	6	307061	307066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146459
4649	NC_021012	ACCAG	2	10	307082	307091	40 %	0 %	20 %	40 %	479146459
4650	NC_021012	AT	3	6	307093	307098	50 %	50 %	0 %	0 %	479146459
4651	NC_021012	TGA	2	6	307120	307125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146459
4652	NC_021012	GCT	2	6	307138	307143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146459
4653	NC_021012	GATCCA	2	12	307166	307177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479146459
4654	NC_021012	ATC	2	6	307185	307190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146459
4655	NC_021012	ACA	2	6	307220	307225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146459
4656	NC_021012	TG	3	6	307350	307355	0 %	50 %	50 %	0 %	479146459
4657	NC_021012	TGC	2	6	307372	307377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146459
4658	NC_021012	CAT	2	6	307394	307399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146459
4659	NC_021012	A	6	6	307427	307432	100 %	0 %	0 %	0 %	479146459
4660	NC_021012	GGAA	2	8	307456	307463	50 %	0 %	50 %	0 %	479146459
4661	NC_021012	TGT	2	6	307465	307470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146459
4662	NC_021012	GCT	2	6	307533	307538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146459
4663	NC_021012	AGG	2	6	307657	307662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146459
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4665	NC_021012	TGA	2	6	307699	307704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146459
4666	NC_021012	ATC	2	6	308704	308709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146460
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4668	NC_021012	T	6	6	308754	308759	0 %	100 %	0 %	0 %	479146460
4669	NC_021012	CAT	2	6	308760	308765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146460
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4671	NC_021012	TGAAA	2	10	308949	308958	60 %	20 %	20 %	0 %	479146460
4672	NC_021012	TCAT	2	8	309017	309024	25 %	50 %	0 %	25 %	479146460
4673	NC_021012	TAC	2	6	309067	309072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146460
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4678	NC_021012	CAT	2	6	309273	309278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146460
4679	NC_021012	AAT	2	6	309323	309328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146460
4680	NC_021012	AT	3	6	309369	309374	50 %	50 %	0 %	0 %	479146460
4681	NC_021012	ATC	2	6	309385	309390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146460
4682	NC_021012	A	7	7	309418	309424	100 %	0 %	0 %	0 %	479146460
4683	NC_021012	ATC	2	6	309445	309450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146460
4684	NC_021012	ATTTGT	2	12	309460	309471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479146460
4685	NC_021012	CAT	2	6	309752	309757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146461
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4687	NC_021012	ATC	2	6	309822	309827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146461
4688	NC_021012	CCA	2	6	309946	309951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146461
4689	NC_021012	AAT	2	6	309954	309959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146461
4690	NC_021012	TCA	2	6	309961	309966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146461
4691	NC_021012	TTG	2	6	309977	309982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146461
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4693	NC_021012	CATT	2	8	310105	310112	25 %	50 %	0 %	25 %	479146461
4694	NC_021012	CTG	2	6	310147	310152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146461
4695	NC_021012	A	6	6	310192	310197	100 %	0 %	0 %	0 %	479146461
4696	NC_021012	GCA	2	6	310201	310206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146461
4697	NC_021012	CGC	2	6	311490	311495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146462
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4699	NC_021012	GA	3	6	311559	311564	50 %	0 %	50 %	0 %	479146462
4700	NC_021012	GCC	2	6	311583	311588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146463
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4703	NC_021012	GTT	2	6	311698	311703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146463
4704	NC_021012	ACCTGC	2	12	311719	311730	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479146463
4705	NC_021012	TTTC	2	8	311741	311748	0 %	75 %	0 %	25 %	479146463
4706	NC_021012	CTG	2	6	311754	311759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146463
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4708	NC_021012	GT	3	6	311855	311860	0 %	50 %	50 %	0 %	479146463
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4712	NC_021012	CTG	2	6	311954	311959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146463
4713	NC_021012	TCA	2	6	312102	312107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146464
4714	NC_021012	TGGG	2	8	312240	312247	0 %	25 %	75 %	0 %	479146464
4715	NC_021012	CGGA	2	8	312258	312265	25 %	0 %	50 %	25 %	479146464
4716	NC_021012	GGC	2	6	312314	312319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146464
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4720	NC_021012	TTCA	2	8	312832	312839	25 %	50 %	0 %	25 %	479146465
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4724	NC_021012	TGG	2	6	313160	313165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146465
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4726	NC_021012	A	6	6	313321	313326	100 %	0 %	0 %	0 %	479146465
4727	NC_021012	GGT	2	6	313352	313357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146465
4728	NC_021012	CAAT	2	8	313406	313413	50 %	25 %	0 %	25 %	479146465
4729	NC_021012	CCG	2	6	313546	313551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146465
4730	NC_021012	GCA	2	6	313575	313580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146465
4731	NC_021012	AAAGG	2	10	313593	313602	60 %	0 %	40 %	0 %	479146465
4732	NC_021012	GATA	2	8	313604	313611	50 %	25 %	25 %	0 %	479146465
4733	NC_021012	AAAGCG	2	12	313685	313696	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479146466
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4737	NC_021012	CGGG	2	8	314245	314252	0 %	0 %	75 %	25 %	479146467
4738	NC_021012	TGA	2	6	314259	314264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146467
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4741	NC_021012	CGA	2	6	314518	314523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146467
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4745	NC_021012	CCG	2	6	314902	314907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146467
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4989	NC_021012	A	6	6	329243	329248	100 %	0 %	0 %	0 %	479146477
4990	NC_021012	TGC	2	6	329319	329324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146477
4991	NC_021012	TCTTT	2	10	329374	329383	0 %	80 %	0 %	20 %	479146477
4992	NC_021012	AG	3	6	329390	329395	50 %	0 %	50 %	0 %	479146477
4993	NC_021012	ATA	2	6	329427	329432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146477
4994	NC_021012	T	6	6	329471	329476	0 %	100 %	0 %	0 %	479146477
4995	NC_021012	ATGGA	2	10	329573	329582	40 %	20 %	40 %	0 %	479146477
4996	NC_021012	CAAA	2	8	329599	329606	75 %	0 %	0 %	25 %	479146477
4997	NC_021012	CA	3	6	329633	329638	50 %	0 %	0 %	50 %	479146477
4998	NC_021012	TCT	2	6	329691	329696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146477
4999	NC_021012	TA	3	6	329706	329711	50 %	50 %	0 %	0 %	479146477
5000	NC_021012	ATC	2	6	329714	329719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146477

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