MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 1743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	GTAGC	2	10	736	745	20 %	20 %	40 %	20 %	442313697
2	NC_020125	ATCAC	2	10	2457	2466	40 %	20 %	0 %	40 %	442313699
3	NC_020125	GGGGC	2	10	4668	4677	0 %	0 %	80 %	20 %	442313701
4	NC_020125	GGTTT	2	10	5773	5782	0 %	60 %	40 %	0 %	442313701
5	NC_020125	AAGAA	2	10	7333	7342	80 %	0 %	20 %	0 %	442313702
6	NC_020125	ACTAC	3	15	8499	8513	40 %	20 %	0 %	40 %	442313703
7	NC_020125	AGACA	2	10	8544	8553	60 %	0 %	20 %	20 %	442313703
8	NC_020125	ATTGT	2	10	18208	18217	20 %	60 %	20 %	0 %	442313708
9	NC_020125	ATTAT	2	10	18976	18985	40 %	60 %	0 %	0 %	442313709
10	NC_020125	TGATT	2	10	21278	21287	20 %	60 %	20 %	0 %	442313711
11	NC_020125	TATCC	2	10	21657	21666	20 %	40 %	0 %	40 %	442313711
12	NC_020125	ATTTG	2	10	21767	21776	20 %	60 %	20 %	0 %	442313711
13	NC_020125	TGAGC	2	10	21994	22003	20 %	20 %	40 %	20 %	442313711
14	NC_020125	TATTT	2	10	24814	24823	20 %	80 %	0 %	0 %	442313716
15	NC_020125	TTCTT	2	10	29766	29775	0 %	80 %	0 %	20 %	442313724
16	NC_020125	CTTTT	2	10	29796	29805	0 %	80 %	0 %	20 %	442313724
17	NC_020125	ATACA	2	10	30057	30066	60 %	20 %	0 %	20 %	442313724
18	NC_020125	CTTCT	2	10	30082	30091	0 %	60 %	0 %	40 %	442313724
19	NC_020125	ATTTT	2	10	30685	30694	20 %	80 %	0 %	0 %	442313724
20	NC_020125	TTTCA	2	10	31020	31029	20 %	60 %	0 %	20 %	442313724
21	NC_020125	TTAAA	2	10	32294	32303	60 %	40 %	0 %	0 %	442313725
22	NC_020125	CATTT	2	10	32655	32664	20 %	60 %	0 %	20 %	442313725
23	NC_020125	CTTTT	2	10	33603	33612	0 %	80 %	0 %	20 %	442313725
24	NC_020125	GTAAG	2	10	35378	35387	40 %	20 %	40 %	0 %	442313727
25	NC_020125	GAACT	2	10	36518	36527	40 %	20 %	20 %	20 %	442313727
26	NC_020125	TAAAG	2	10	36838	36847	60 %	20 %	20 %	0 %	442313727
27	NC_020125	GATAC	2	10	39133	39142	40 %	20 %	20 %	20 %	442313728
28	NC_020125	CTTCT	2	10	39717	39726	0 %	60 %	0 %	40 %	442313728
29	NC_020125	AGGAA	2	10	40414	40423	60 %	0 %	40 %	0 %	442313728
30	NC_020125	AAATC	2	10	41453	41462	60 %	20 %	0 %	20 %	442313728
31	NC_020125	AACTA	2	10	43801	43810	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
32	NC_020125	AACTA	2	10	44092	44101	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
33	NC_020125	AACTA	2	10	44383	44392	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
34	NC_020125	AACTA	2	10	44674	44683	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
35	NC_020125	AACTA	2	10	44965	44974	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
36	NC_020125	AACTA	2	10	45256	45265	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
37	NC_020125	ATTCT	2	10	46663	46672	20 %	60 %	0 %	20 %	442313731
38	NC_020125	TTGAA	2	10	47755	47764	40 %	40 %	20 %	0 %	442313733
39	NC_020125	TCCAT	2	10	48081	48090	20 %	40 %	0 %	40 %	442313733
40	NC_020125	AAGTA	2	10	49747	49756	60 %	20 %	20 %	0 %	442313735
41	NC_020125	ATCTT	2	10	50744	50753	20 %	60 %	0 %	20 %	442313737
42	NC_020125	AGAAA	2	10	51583	51592	80 %	0 %	20 %	0 %	442313738
43	NC_020125	AGTTA	2	10	52358	52367	40 %	40 %	20 %	0 %	442313740
44	NC_020125	ATATA	2	10	54140	54149	60 %	40 %	0 %	0 %	442313741
45	NC_020125	AAACC	2	10	54370	54379	60 %	0 %	0 %	40 %	442313741
46	NC_020125	CTTTT	2	10	55776	55785	0 %	80 %	0 %	20 %	442313743
47	NC_020125	AACCC	2	10	59810	59819	40 %	0 %	0 %	60 %	442313748
48	NC_020125	CTATC	2	10	62435	62444	20 %	40 %	0 %	40 %	442313751
49	NC_020125	TATAT	2	10	63758	63767	40 %	60 %	0 %	0 %	442313751
50	NC_020125	AACTA	2	10	65408	65417	60 %	20 %	0 %	20 %	442313753
51	NC_020125	AAGAA	2	10	65738	65747	80 %	0 %	20 %	0 %	442313753
52	NC_020125	CCTTT	2	10	66051	66060	0 %	60 %	0 %	40 %	442313753
53	NC_020125	GAAGA	2	10	66959	66968	60 %	0 %	40 %	0 %	442313755
54	NC_020125	TGCAA	2	10	67456	67465	40 %	20 %	20 %	20 %	442313755
55	NC_020125	AGTGG	2	10	67594	67603	20 %	20 %	60 %	0 %	442313755
56	NC_020125	GAAAA	2	10	67726	67735	80 %	0 %	20 %	0 %	442313756
57	NC_020125	AATTT	2	10	69063	69072	40 %	60 %	0 %	0 %	442313756
58	NC_020125	TAAAA	2	10	69352	69361	80 %	20 %	0 %	0 %	442313757
59	NC_020125	ATCAA	2	10	70395	70404	60 %	20 %	0 %	20 %	442313759
60	NC_020125	AAGCC	2	10	70630	70639	40 %	0 %	20 %	40 %	442313759
61	NC_020125	TCCTA	2	10	70850	70859	20 %	40 %	0 %	40 %	442313759
62	NC_020125	CCTTA	2	10	70880	70889	20 %	40 %	0 %	40 %	442313759
63	NC_020125	TCACT	2	10	71353	71362	20 %	40 %	0 %	40 %	442313759
64	NC_020125	CGAAA	2	10	73383	73392	60 %	0 %	20 %	20 %	442313761
65	NC_020125	AAAAG	2	10	76107	76116	80 %	0 %	20 %	0 %	442313765
66	NC_020125	TACCA	2	10	76486	76495	40 %	20 %	0 %	40 %	442313766
67	NC_020125	TGATA	2	10	76962	76971	40 %	40 %	20 %	0 %	442313766
68	NC_020125	TAGAA	2	10	78198	78207	60 %	20 %	20 %	0 %	442313766
69	NC_020125	TATTT	2	10	80661	80670	20 %	80 %	0 %	0 %	442313769
70	NC_020125	CCTTA	2	10	81715	81724	20 %	40 %	0 %	40 %	442313769
71	NC_020125	ATTTT	2	10	82228	82237	20 %	80 %	0 %	0 %	442313770
72	NC_020125	CTATT	2	10	84435	84444	20 %	60 %	0 %	20 %	442313772
73	NC_020125	AAAGA	2	10	85616	85625	80 %	0 %	20 %	0 %	442313773
74	NC_020125	TAGCT	2	10	87943	87952	20 %	40 %	20 %	20 %	442313774
75	NC_020125	AAAAT	2	10	88310	88319	80 %	20 %	0 %	0 %	442313775
76	NC_020125	TTTAC	2	10	88672	88681	20 %	60 %	0 %	20 %	442313775
77	NC_020125	TATAA	2	10	90520	90529	60 %	40 %	0 %	0 %	442313777
78	NC_020125	TTTTC	2	10	92441	92450	0 %	80 %	0 %	20 %	442313778
79	NC_020125	CAAGG	2	10	92940	92949	40 %	0 %	40 %	20 %	442313778
80	NC_020125	CCCTA	2	10	93194	93203	20 %	20 %	0 %	60 %	442313779
81	NC_020125	AAAAC	2	10	95526	95535	80 %	0 %	0 %	20 %	442313781
82	NC_020125	ATTCT	2	10	99409	99418	20 %	60 %	0 %	20 %	442313784
83	NC_020125	TATGG	2	10	100007	100016	20 %	40 %	40 %	0 %	442313785
84	NC_020125	TTTGT	2	10	100146	100155	0 %	80 %	20 %	0 %	442313785
85	NC_020125	TAAAA	2	10	100465	100474	80 %	20 %	0 %	0 %	442313785
86	NC_020125	TAAAG	2	10	100528	100537	60 %	20 %	20 %	0 %	442313785
87	NC_020125	TATAA	2	10	100578	100587	60 %	40 %	0 %	0 %	442313785
88	NC_020125	ATGGA	2	10	101490	101499	40 %	20 %	40 %	0 %	442313786
89	NC_020125	AAAAG	2	10	102114	102123	80 %	0 %	20 %	0 %	442313787
90	NC_020125	TTATT	2	10	104696	104705	20 %	80 %	0 %	0 %	442313790
91	NC_020125	AAGCA	2	10	105445	105454	60 %	0 %	20 %	20 %	442313791
92	NC_020125	CCAAA	2	10	105609	105618	60 %	0 %	0 %	40 %	442313791
93	NC_020125	TGCTG	2	10	106796	106805	0 %	40 %	40 %	20 %	442313792
94	NC_020125	CTTGA	2	10	107987	107996	20 %	40 %	20 %	20 %	442313792
95	NC_020125	TACTT	2	10	109247	109256	20 %	60 %	0 %	20 %	442313794
96	NC_020125	ATTTA	2	10	110022	110031	40 %	60 %	0 %	0 %	442313795
97	NC_020125	CCCAT	2	10	110578	110587	20 %	20 %	0 %	60 %	442313798
98	NC_020125	TTCCA	2	10	110605	110614	20 %	40 %	0 %	40 %	442313798
99	NC_020125	CTTAC	2	10	112382	112391	20 %	40 %	0 %	40 %	442313799
100	NC_020125	AATCA	2	10	112450	112459	60 %	20 %	0 %	20 %	442313799
101	NC_020125	TAAGA	2	10	112551	112560	60 %	20 %	20 %	0 %	442313799
102	NC_020125	TACCT	2	10	113343	113352	20 %	40 %	0 %	40 %	442313800
103	NC_020125	ATTAT	2	10	113422	113431	40 %	60 %	0 %	0 %	442313800
104	NC_020125	TAACT	2	10	113562	113571	40 %	40 %	0 %	20 %	442313800
105	NC_020125	TTACT	2	10	114890	114899	20 %	60 %	0 %	20 %	442313801
106	NC_020125	ACACT	2	10	115960	115969	40 %	20 %	0 %	40 %	442313802
107	NC_020125	TAAAT	2	10	120552	120561	60 %	40 %	0 %	0 %	442313807
108	NC_020125	TTTCA	2	10	121484	121493	20 %	60 %	0 %	20 %	442313808
109	NC_020125	CATTC	2	10	121681	121690	20 %	40 %	0 %	40 %	442313808
110	NC_020125	TAACC	2	10	123970	123979	40 %	20 %	0 %	40 %	442313811
111	NC_020125	AATCT	2	10	126921	126930	40 %	40 %	0 %	20 %	442313813
112	NC_020125	GAAAA	2	10	127510	127519	80 %	0 %	20 %	0 %	442313814
113	NC_020125	CAATA	2	10	130979	130988	60 %	20 %	0 %	20 %	442313819
114	NC_020125	GGCTC	2	10	131778	131787	0 %	20 %	40 %	40 %	442313820
115	NC_020125	CTCTA	2	10	133252	133261	20 %	40 %	0 %	40 %	442313822
116	NC_020125	TCAAA	2	10	133434	133443	60 %	20 %	0 %	20 %	442313822
117	NC_020125	TATTT	2	10	134003	134012	20 %	80 %	0 %	0 %	442313822
118	NC_020125	CTTCT	2	10	134019	134028	0 %	60 %	0 %	40 %	442313822
119	NC_020125	CCTGT	2	10	134358	134367	0 %	40 %	20 %	40 %	442313822
120	NC_020125	GTCCT	2	10	135854	135863	0 %	40 %	20 %	40 %	442313824
121	NC_020125	AAGCT	2	10	135998	136007	40 %	20 %	20 %	20 %	442313824
122	NC_020125	GAAAA	2	10	137313	137322	80 %	0 %	20 %	0 %	442313825
123	NC_020125	AAACT	2	10	139046	139055	60 %	20 %	0 %	20 %	442313826
124	NC_020125	AGCAA	2	10	139096	139105	60 %	0 %	20 %	20 %	442313826
125	NC_020125	TAAAC	2	10	139819	139828	60 %	20 %	0 %	20 %	442313828
126	NC_020125	ACCAT	2	10	140103	140112	40 %	20 %	0 %	40 %	442313828
127	NC_020125	ATTTT	2	10	140324	140333	20 %	80 %	0 %	0 %	442313828
128	NC_020125	ACCAA	2	10	142375	142384	60 %	0 %	0 %	40 %	442313831
129	NC_020125	TATCC	2	10	142942	142951	20 %	40 %	0 %	40 %	442313832
130	NC_020125	GATAG	2	10	145901	145910	40 %	20 %	40 %	0 %	442313835
131	NC_020125	GAAAA	2	10	145997	146006	80 %	0 %	20 %	0 %	442313835
132	NC_020125	AGTAT	2	10	147188	147197	40 %	40 %	20 %	0 %	442313835
133	NC_020125	AAGCA	2	10	148536	148545	60 %	0 %	20 %	20 %	442313837
134	NC_020125	TTGAG	2	10	151843	151852	20 %	40 %	40 %	0 %	442313839
135	NC_020125	TTTAG	2	10	152205	152214	20 %	60 %	20 %	0 %	442313839
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263	NC_020125	AGATG	2	10	306228	306237	40 %	20 %	40 %	0 %	442314000
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