MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020125	GCTT	2	8	202460	202467	0 %	50 %	25 %	25 %	442313907
4002	NC_020125	TAT	2	6	202493	202498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313907
4003	NC_020125	GAAA	2	8	202570	202577	75 %	0 %	25 %	0 %	442313907
4004	NC_020125	AAAC	2	8	202623	202630	75 %	0 %	0 %	25 %	442313907
4005	NC_020125	TAA	2	6	202652	202657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313907
4006	NC_020125	CAA	2	6	202680	202685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313907
4007	NC_020125	ATC	2	6	202715	202720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313908
4008	NC_020125	GT	3	6	202746	202751	0 %	50 %	50 %	0 %	442313908
4009	NC_020125	CAA	2	6	202793	202798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313908
4010	NC_020125	ACT	2	6	202845	202850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313908
4011	NC_020125	AGT	2	6	202888	202893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313908
4012	NC_020125	AGCA	2	8	202950	202957	50 %	0 %	25 %	25 %	442313908
4013	NC_020125	AAGT	2	8	202986	202993	50 %	25 %	25 %	0 %	442313908
4014	NC_020125	TAT	2	6	203096	203101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313908
4015	NC_020125	AT	3	6	203202	203207	50 %	50 %	0 %	0 %	442313908
4016	NC_020125	TGA	2	6	203212	203217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313908
4017	NC_020125	AAC	2	6	203318	203323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313908
4018	NC_020125	TAC	2	6	203328	203333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313908
4019	NC_020125	ACC	2	6	203336	203341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313908
4020	NC_020125	TAA	2	6	203373	203378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313908
4021	NC_020125	A	7	7	203385	203391	100 %	0 %	0 %	0 %	442313908
4022	NC_020125	CAG	2	6	203452	203457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313909
4023	NC_020125	GAA	2	6	203493	203498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313909
4024	NC_020125	A	6	6	203574	203579	100 %	0 %	0 %	0 %	442313909
4025	NC_020125	ATA	2	6	203722	203727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313909
4026	NC_020125	AGCG	2	8	203738	203745	25 %	0 %	50 %	25 %	442313909
4027	NC_020125	ATA	2	6	203806	203811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313909
4028	NC_020125	AGA	3	9	203834	203842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313909
4029	NC_020125	GAAA	2	8	203884	203891	75 %	0 %	25 %	0 %	442313909
4030	NC_020125	CTC	2	6	203893	203898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313909
4031	NC_020125	AGA	2	6	203933	203938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313909
4032	NC_020125	ACA	2	6	204041	204046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313910
4033	NC_020125	AGA	3	9	204106	204114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313910
4034	NC_020125	GAA	2	6	204128	204133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313910
4035	NC_020125	AGTA	2	8	204196	204203	50 %	25 %	25 %	0 %	442313910
4036	NC_020125	TAT	2	6	204252	204257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313910
4037	NC_020125	TTAA	2	8	204329	204336	50 %	50 %	0 %	0 %	442313910
4038	NC_020125	A	6	6	204383	204388	100 %	0 %	0 %	0 %	442313910
4039	NC_020125	AGC	2	6	204477	204482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313911
4040	NC_020125	TAT	2	6	204488	204493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313911
4041	NC_020125	T	7	7	204528	204534	0 %	100 %	0 %	0 %	442313911
4042	NC_020125	T	6	6	204615	204620	0 %	100 %	0 %	0 %	442313911
4043	NC_020125	AGA	2	6	204642	204647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313911
4044	NC_020125	ATA	2	6	204709	204714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313911
4045	NC_020125	AAACG	2	10	204729	204738	60 %	0 %	20 %	20 %	442313911
4046	NC_020125	A	6	6	204780	204785	100 %	0 %	0 %	0 %	442313911
4047	NC_020125	TAA	2	6	204928	204933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313911
4048	NC_020125	ATG	2	6	205035	205040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313912
4049	NC_020125	A	6	6	205071	205076	100 %	0 %	0 %	0 %	442313912
4050	NC_020125	A	6	6	205091	205096	100 %	0 %	0 %	0 %	442313912
4051	NC_020125	GAA	2	6	205128	205133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313912
4052	NC_020125	AAT	2	6	205190	205195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313913
4053	NC_020125	GAA	2	6	205208	205213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
4054	NC_020125	CAA	2	6	205454	205459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313913
4055	NC_020125	CAG	2	6	205463	205468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313913
4056	NC_020125	ATA	2	6	205497	205502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313913
4057	NC_020125	ATTG	2	8	205510	205517	25 %	50 %	25 %	0 %	442313913
4058	NC_020125	CCAA	2	8	205539	205546	50 %	0 %	0 %	50 %	442313913
4059	NC_020125	ATT	2	6	205567	205572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313913
4060	NC_020125	ACG	2	6	205659	205664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313913
4061	NC_020125	A	6	6	205887	205892	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4062	NC_020125	TCAA	2	8	205902	205909	50 %	25 %	0 %	25 %	442313913
4063	NC_020125	AG	3	6	205915	205920	50 %	0 %	50 %	0 %	442313913
4064	NC_020125	A	6	6	205937	205942	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4065	NC_020125	A	6	6	205945	205950	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4066	NC_020125	TGA	2	6	205969	205974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313913
4067	NC_020125	GAA	2	6	205991	205996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
4068	NC_020125	GA	3	6	206104	206109	50 %	0 %	50 %	0 %	442313913
4069	NC_020125	CAA	2	6	206175	206180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313913
4070	NC_020125	CTG	2	6	206211	206216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313913
4071	NC_020125	GAA	2	6	206273	206278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
4072	NC_020125	TAT	2	6	206290	206295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313913
4073	NC_020125	CAG	2	6	206333	206338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313913
4074	NC_020125	A	6	6	206353	206358	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4075	NC_020125	CTA	2	6	206373	206378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313913
4076	NC_020125	CAG	2	6	206409	206414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313913
4077	NC_020125	TAA	2	6	206481	206486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313913
4078	NC_020125	TCC	2	6	206490	206495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313913
4079	NC_020125	A	6	6	206540	206545	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4080	NC_020125	TTAT	2	8	206620	206627	25 %	75 %	0 %	0 %	442313913
4081	NC_020125	A	6	6	206656	206661	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4082	NC_020125	GTT	2	6	206662	206667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313913
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4085	NC_020125	AGA	2	6	206775	206780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
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4087	NC_020125	A	6	6	206852	206857	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4088	NC_020125	AGA	2	6	206867	206872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
4089	NC_020125	TTG	2	6	206901	206906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313913
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4091	NC_020125	AACGA	2	10	206976	206985	60 %	0 %	20 %	20 %	442313913
4092	NC_020125	A	6	6	206993	206998	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4093	NC_020125	AGC	2	6	207031	207036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313913
4094	NC_020125	A	6	6	207038	207043	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4095	NC_020125	CAAGA	2	10	207057	207066	60 %	0 %	20 %	20 %	442313913
4096	NC_020125	ATG	2	6	207227	207232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313913
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4099	NC_020125	TTG	2	6	207398	207403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313913
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4103	NC_020125	TGA	2	6	207592	207597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313913
4104	NC_020125	GATA	2	8	207610	207617	50 %	25 %	25 %	0 %	442313913
4105	NC_020125	CAA	2	6	207626	207631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313913
4106	NC_020125	CT	3	6	207767	207772	0 %	50 %	0 %	50 %	442313913
4107	NC_020125	AGA	2	6	207794	207799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
4108	NC_020125	TAG	2	6	207808	207813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313913
4109	NC_020125	A	6	6	207896	207901	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4110	NC_020125	ACC	2	6	207920	207925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313913
4111	NC_020125	TTG	2	6	207950	207955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313913
4112	NC_020125	AAG	2	6	207963	207968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
4113	NC_020125	AAC	2	6	208032	208037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313913
4114	NC_020125	ATG	2	6	208155	208160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313913
4115	NC_020125	TAT	2	6	208270	208275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313913
4116	NC_020125	T	6	6	208302	208307	0 %	100 %	0 %	0 %	442313913
4117	NC_020125	GA	3	6	208326	208331	50 %	0 %	50 %	0 %	442313913
4118	NC_020125	GAAA	2	8	208334	208341	75 %	0 %	25 %	0 %	442313913
4119	NC_020125	A	6	6	208358	208363	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4120	NC_020125	ATG	2	6	208368	208373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313913
4121	NC_020125	CAACT	2	10	208388	208397	40 %	20 %	0 %	40 %	442313913
4122	NC_020125	AGA	2	6	208426	208431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
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4124	NC_020125	AAG	2	6	208527	208532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
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4129	NC_020125	A	7	7	208885	208891	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
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4166	NC_020125	A	6	6	210978	210983	100 %	0 %	0 %	0 %	442313915
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4244	NC_020125	GCTAAA	2	12	215027	215038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442313917
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4248	NC_020125	TGT	2	6	215323	215328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313917
4249	NC_020125	AT	3	6	215372	215377	50 %	50 %	0 %	0 %	442313917
4250	NC_020125	TAT	2	6	215396	215401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313917
4251	NC_020125	AT	3	6	215443	215448	50 %	50 %	0 %	0 %	442313917
4252	NC_020125	CAG	2	6	215456	215461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313917
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4254	NC_020125	TACC	2	8	215548	215555	25 %	25 %	0 %	50 %	442313917
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4256	NC_020125	TTTAAA	2	12	215582	215593	50 %	50 %	0 %	0 %	442313917
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4264	NC_020125	T	7	7	216003	216009	0 %	100 %	0 %	0 %	442313919
4265	NC_020125	ATCT	2	8	216027	216034	25 %	50 %	0 %	25 %	442313919
4266	NC_020125	TAT	2	6	216044	216049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313919
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4270	NC_020125	GTC	2	6	216322	216327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313919
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4278	NC_020125	T	6	6	216716	216721	0 %	100 %	0 %	0 %	442313919
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4284	NC_020125	TGA	2	6	216965	216970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313919
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4286	NC_020125	GTAT	2	8	217027	217034	25 %	50 %	25 %	0 %	442313919
4287	NC_020125	GTA	2	6	217065	217070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313919
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4350	NC_020125	AGAAAT	2	12	220941	220952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442313922
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4352	NC_020125	AGA	2	6	221016	221021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313922
4353	NC_020125	TAG	2	6	221216	221221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313922
4354	NC_020125	AAT	2	6	221228	221233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313922
4355	NC_020125	A	6	6	221315	221320	100 %	0 %	0 %	0 %	442313923
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4358	NC_020125	A	6	6	221477	221482	100 %	0 %	0 %	0 %	442313923
4359	NC_020125	ATT	2	6	221641	221646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313923
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4361	NC_020125	A	6	6	221826	221831	100 %	0 %	0 %	0 %	442313924
4362	NC_020125	A	6	6	221972	221977	100 %	0 %	0 %	0 %	442313924
4363	NC_020125	ATT	2	6	221979	221984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313924
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4365	NC_020125	TGC	2	6	222050	222055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313924
4366	NC_020125	A	7	7	222107	222113	100 %	0 %	0 %	0 %	442313924
4367	NC_020125	ACA	2	6	222169	222174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313924
4368	NC_020125	GAG	2	6	222228	222233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313924
4369	NC_020125	CAA	2	6	222278	222283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313924
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4371	NC_020125	CAA	2	6	222332	222337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313924
4372	NC_020125	A	6	6	222352	222357	100 %	0 %	0 %	0 %	442313924
4373	NC_020125	A	6	6	222403	222408	100 %	0 %	0 %	0 %	442313924
4374	NC_020125	CTG	2	6	222424	222429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313924
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4380	NC_020125	A	6	6	222604	222609	100 %	0 %	0 %	0 %	442313924
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4385	NC_020125	A	7	7	222788	222794	100 %	0 %	0 %	0 %	442313924
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4494	NC_020125	TTG	2	6	227906	227911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313929
4495	NC_020125	TC	3	6	227962	227967	0 %	50 %	0 %	50 %	442313929
4496	NC_020125	TTC	2	6	228002	228007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313929
4497	NC_020125	TTTAAA	2	12	228089	228100	50 %	50 %	0 %	0 %	442313929
4498	NC_020125	TCT	2	6	228294	228299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313929
4499	NC_020125	TAA	2	6	228304	228309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313929
4500	NC_020125	AAT	2	6	228310	228315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313929

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