MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020125	TTTA	2	8	147710	147717	25 %	75 %	0 %	0 %	442313837
3002	NC_020125	T	6	6	147747	147752	0 %	100 %	0 %	0 %	442313837
3003	NC_020125	T	6	6	147756	147761	0 %	100 %	0 %	0 %	442313837
3004	NC_020125	AGT	2	6	147807	147812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313837
3005	NC_020125	AGA	2	6	147819	147824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313837
3006	NC_020125	GGCT	2	8	147885	147892	0 %	25 %	50 %	25 %	442313837
3007	NC_020125	TAT	2	6	147937	147942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313837
3008	NC_020125	TGA	2	6	147967	147972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313837
3009	NC_020125	T	6	6	148034	148039	0 %	100 %	0 %	0 %	442313837
3010	NC_020125	CTTGGC	2	12	148090	148101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313837
3011	NC_020125	TGG	2	6	148169	148174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313837
3012	NC_020125	ATC	2	6	148191	148196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313837
3013	NC_020125	TAA	2	6	148255	148260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313837
3014	NC_020125	A	6	6	148259	148264	100 %	0 %	0 %	0 %	442313837
3015	NC_020125	CTG	2	6	148279	148284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313837
3016	NC_020125	TTG	2	6	148288	148293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313837
3017	NC_020125	GGA	2	6	148512	148517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313837
3018	NC_020125	AAGCA	2	10	148536	148545	60 %	0 %	20 %	20 %	442313837
3019	NC_020125	AGA	2	6	148562	148567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313837
3020	NC_020125	CCA	2	6	148577	148582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313837
3021	NC_020125	TAT	2	6	148662	148667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313837
3022	NC_020125	AAAG	2	8	148958	148965	75 %	0 %	25 %	0 %	442313837
3023	NC_020125	TGG	2	6	149001	149006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313837
3024	NC_020125	GA	3	6	149125	149130	50 %	0 %	50 %	0 %	442313837
3025	NC_020125	ACG	2	6	149188	149193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313837
3026	NC_020125	ACT	2	6	149196	149201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313837
3027	NC_020125	TAT	2	6	149224	149229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313837
3028	NC_020125	TGA	2	6	149287	149292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313837
3029	NC_020125	CAT	2	6	149483	149488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313838
3030	NC_020125	TCT	2	6	149535	149540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313838
3031	NC_020125	T	6	6	149544	149549	0 %	100 %	0 %	0 %	442313838
3032	NC_020125	AC	3	6	149563	149568	50 %	0 %	0 %	50 %	442313838
3033	NC_020125	ATC	2	6	149643	149648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313838
3034	NC_020125	AAG	2	6	149653	149658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313838
3035	NC_020125	ACT	2	6	149743	149748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313838
3036	NC_020125	TAT	2	6	149802	149807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313838
3037	NC_020125	ATG	2	6	150016	150021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313838
3038	NC_020125	TA	3	6	150100	150105	50 %	50 %	0 %	0 %	442313838
3039	NC_020125	AAAG	2	8	150208	150215	75 %	0 %	25 %	0 %	442313838
3040	NC_020125	TCA	2	6	150236	150241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313838
3041	NC_020125	AAC	2	6	150319	150324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313838
3042	NC_020125	ATC	2	6	150443	150448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313839
3043	NC_020125	T	6	6	150458	150463	0 %	100 %	0 %	0 %	442313839
3044	NC_020125	GA	3	6	150471	150476	50 %	0 %	50 %	0 %	442313839
3045	NC_020125	TTC	2	6	150503	150508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313839
3046	NC_020125	T	6	6	150520	150525	0 %	100 %	0 %	0 %	442313839
3047	NC_020125	CT	3	6	150610	150615	0 %	50 %	0 %	50 %	442313839
3048	NC_020125	T	6	6	150683	150688	0 %	100 %	0 %	0 %	442313839
3049	NC_020125	GTA	2	6	150696	150701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313839
3050	NC_020125	TATC	2	8	150736	150743	25 %	50 %	0 %	25 %	442313839
3051	NC_020125	TCT	2	6	150774	150779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313839
3052	NC_020125	A	6	6	150870	150875	100 %	0 %	0 %	0 %	442313839
3053	NC_020125	A	7	7	150893	150899	100 %	0 %	0 %	0 %	442313839
3054	NC_020125	T	6	6	150970	150975	0 %	100 %	0 %	0 %	442313839
3055	NC_020125	GATA	2	8	151038	151045	50 %	25 %	25 %	0 %	442313839
3056	NC_020125	TTC	2	6	151050	151055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313839
3057	NC_020125	CTC	2	6	151103	151108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313839
3058	NC_020125	CAAT	2	8	151131	151138	50 %	25 %	0 %	25 %	442313839
3059	NC_020125	TATG	2	8	151393	151400	25 %	50 %	25 %	0 %	442313839
3060	NC_020125	TCC	2	6	151452	151457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313839
3061	NC_020125	CAT	2	6	151621	151626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313839
3062	NC_020125	TAA	2	6	151630	151635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313839
3063	NC_020125	ATC	2	6	151700	151705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313839
3064	NC_020125	TAAA	2	8	151796	151803	75 %	25 %	0 %	0 %	442313839
3065	NC_020125	AT	3	6	151836	151841	50 %	50 %	0 %	0 %	442313839
3066	NC_020125	TTGAG	2	10	151843	151852	20 %	40 %	40 %	0 %	442313839
3067	NC_020125	CTG	2	6	151922	151927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313839
3068	NC_020125	TGG	2	6	152042	152047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313839
3069	NC_020125	CCA	2	6	152085	152090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313839
3070	NC_020125	CAT	2	6	152132	152137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313839
3071	NC_020125	TAA	2	6	152176	152181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313839
3072	NC_020125	TTTAG	2	10	152205	152214	20 %	60 %	20 %	0 %	442313839
3073	NC_020125	GTA	2	6	152283	152288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313839
3074	NC_020125	A	7	7	152291	152297	100 %	0 %	0 %	0 %	442313839
3075	NC_020125	GAAT	2	8	152322	152329	50 %	25 %	25 %	0 %	442313839
3076	NC_020125	GCT	2	6	152352	152357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313839
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3078	NC_020125	AT	3	6	152455	152460	50 %	50 %	0 %	0 %	442313839
3079	NC_020125	ATTC	2	8	152498	152505	25 %	50 %	0 %	25 %	442313839
3080	NC_020125	TAAA	2	8	152573	152580	75 %	25 %	0 %	0 %	442313840
3081	NC_020125	ATTT	2	8	152686	152693	25 %	75 %	0 %	0 %	442313840
3082	NC_020125	ATT	2	6	152702	152707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313840
3083	NC_020125	ATA	2	6	152721	152726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313840
3084	NC_020125	AAT	2	6	152761	152766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313840
3085	NC_020125	TAT	2	6	152797	152802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313840
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3087	NC_020125	AAG	2	6	152984	152989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313840
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3089	NC_020125	TAA	2	6	153016	153021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313840
3090	NC_020125	ATC	2	6	153023	153028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313840
3091	NC_020125	TCA	2	6	153070	153075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313840
3092	NC_020125	TG	3	6	153205	153210	0 %	50 %	50 %	0 %	442313841
3093	NC_020125	CCA	2	6	153254	153259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313841
3094	NC_020125	ATT	2	6	153351	153356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313841
3095	NC_020125	GCA	2	6	153392	153397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313841
3096	NC_020125	TAG	2	6	153512	153517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313841
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3098	NC_020125	ATC	2	6	153730	153735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313842
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3101	NC_020125	CAA	2	6	154003	154008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313842
3102	NC_020125	AAG	2	6	154013	154018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313842
3103	NC_020125	TGA	2	6	154058	154063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313842
3104	NC_020125	TTG	2	6	154067	154072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313842
3105	NC_020125	TTA	2	6	154084	154089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313842
3106	NC_020125	TTG	2	6	154199	154204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313842
3107	NC_020125	GAT	2	6	154216	154221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313842
3108	NC_020125	TGG	2	6	154244	154249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313842
3109	NC_020125	TGG	2	6	154284	154289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313842
3110	NC_020125	A	6	6	154334	154339	100 %	0 %	0 %	0 %	442313842
3111	NC_020125	TC	3	6	154433	154438	0 %	50 %	0 %	50 %	442313842
3112	NC_020125	ATG	2	6	154448	154453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313842
3113	NC_020125	AGG	2	6	154527	154532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313842
3114	NC_020125	A	7	7	154630	154636	100 %	0 %	0 %	0 %	442313843
3115	NC_020125	ATT	2	6	154642	154647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313843
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3117	NC_020125	ATT	2	6	154756	154761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313843
3118	NC_020125	TAT	2	6	154771	154776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313843
3119	NC_020125	CTC	2	6	154839	154844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313843
3120	NC_020125	A	6	6	154860	154865	100 %	0 %	0 %	0 %	442313843
3121	NC_020125	TAG	2	6	154887	154892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313843
3122	NC_020125	AGA	2	6	155044	155049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313843
3123	NC_020125	A	7	7	155056	155062	100 %	0 %	0 %	0 %	442313843
3124	NC_020125	TTG	2	6	155251	155256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313843
3125	NC_020125	TCA	2	6	155296	155301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313843
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3127	NC_020125	A	6	6	155438	155443	100 %	0 %	0 %	0 %	442313843
3128	NC_020125	A	6	6	155450	155455	100 %	0 %	0 %	0 %	442313843
3129	NC_020125	AGA	2	6	155503	155508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313843
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3131	NC_020125	AGG	2	6	155545	155550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313843
3132	NC_020125	GAA	2	6	155624	155629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313843
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3154	NC_020125	TCT	2	6	156852	156857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313845
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3223	NC_020125	CAA	2	6	161726	161731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313850
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3225	NC_020125	TCTTTA	2	12	161922	161933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442313850
3226	NC_020125	GGTTT	2	10	161988	161997	0 %	60 %	40 %	0 %	442313850
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3229	NC_020125	TAC	2	6	162215	162220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313851
3230	NC_020125	AAG	2	6	162312	162317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313851
3231	NC_020125	CTTT	2	8	162342	162349	0 %	75 %	0 %	25 %	442313851
3232	NC_020125	ACT	2	6	162395	162400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313851
3233	NC_020125	TCA	2	6	162414	162419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313851
3234	NC_020125	CTA	2	6	162426	162431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313851
3235	NC_020125	A	6	6	162445	162450	100 %	0 %	0 %	0 %	442313851
3236	NC_020125	T	6	6	162454	162459	0 %	100 %	0 %	0 %	442313851
3237	NC_020125	CATAA	2	10	162460	162469	60 %	20 %	0 %	20 %	442313851
3238	NC_020125	TA	3	6	162557	162562	50 %	50 %	0 %	0 %	442313852
3239	NC_020125	AAT	2	6	162570	162575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313852
3240	NC_020125	CAAA	2	8	162580	162587	75 %	0 %	0 %	25 %	442313852
3241	NC_020125	GGC	2	6	162605	162610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313852
3242	NC_020125	CTT	2	6	162690	162695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313853
3243	NC_020125	TCA	2	6	162725	162730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313853
3244	NC_020125	TCA	2	6	162809	162814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313853
3245	NC_020125	GAC	2	6	162856	162861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313853
3246	NC_020125	T	7	7	162930	162936	0 %	100 %	0 %	0 %	442313853
3247	NC_020125	CCCTC	2	10	163075	163084	0 %	20 %	0 %	80 %	442313854
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3492	NC_020125	ATC	2	6	175457	175462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313869
3493	NC_020125	ATTTTT	2	12	175463	175474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442313869
3494	NC_020125	GGA	2	6	175475	175480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313869
3495	NC_020125	T	6	6	175505	175510	0 %	100 %	0 %	0 %	442313869
3496	NC_020125	AAC	2	6	175534	175539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313869
3497	NC_020125	GAA	2	6	175733	175738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313869
3498	NC_020125	CTCA	2	8	175772	175779	25 %	25 %	0 %	50 %	442313869
3499	NC_020125	ATT	2	6	175800	175805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313869
3500	NC_020125	AAG	2	6	175890	175895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313869

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