MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_020125	TAT	2	6	123688	123693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313810
2503	NC_020125	A	6	6	123696	123701	100 %	0 %	0 %	0 %	442313810
2504	NC_020125	ATA	2	6	123731	123736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313810
2505	NC_020125	AGG	2	6	123809	123814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313810
2506	NC_020125	CAAC	2	8	123853	123860	50 %	0 %	0 %	50 %	442313810
2507	NC_020125	TCC	2	6	123898	123903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313810
2508	NC_020125	CCTA	2	8	123954	123961	25 %	25 %	0 %	50 %	442313811
2509	NC_020125	TAACC	2	10	123970	123979	40 %	20 %	0 %	40 %	442313811
2510	NC_020125	TTAA	2	8	123983	123990	50 %	50 %	0 %	0 %	442313811
2511	NC_020125	T	6	6	124012	124017	0 %	100 %	0 %	0 %	442313811
2512	NC_020125	CAA	2	6	124018	124023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313811
2513	NC_020125	GAA	2	6	124059	124064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313811
2514	NC_020125	A	6	6	124063	124068	100 %	0 %	0 %	0 %	442313811
2515	NC_020125	TC	4	8	124095	124102	0 %	50 %	0 %	50 %	442313811
2516	NC_020125	CTTT	2	8	124115	124122	0 %	75 %	0 %	25 %	442313811
2517	NC_020125	A	6	6	124168	124173	100 %	0 %	0 %	0 %	442313811
2518	NC_020125	ATT	2	6	124225	124230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313811
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2520	NC_020125	A	6	6	124350	124355	100 %	0 %	0 %	0 %	442313811
2521	NC_020125	CTT	2	6	124360	124365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313811
2522	NC_020125	TCA	2	6	124397	124402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313811
2523	NC_020125	TGA	2	6	124436	124441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313811
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2525	NC_020125	AT	3	6	124500	124505	50 %	50 %	0 %	0 %	442313811
2526	NC_020125	TATC	2	8	124509	124516	25 %	50 %	0 %	25 %	442313811
2527	NC_020125	TCA	2	6	124583	124588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313811
2528	NC_020125	ACC	2	6	124613	124618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313811
2529	NC_020125	TCT	2	6	124652	124657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313811
2530	NC_020125	ATC	2	6	124678	124683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313811
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2532	NC_020125	TACA	2	8	124743	124750	50 %	25 %	0 %	25 %	442313811
2533	NC_020125	CAT	2	6	124836	124841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313811
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2535	NC_020125	GAA	2	6	124886	124891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313811
2536	NC_020125	TTG	2	6	125042	125047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313812
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2539	NC_020125	A	6	6	125117	125122	100 %	0 %	0 %	0 %	442313812
2540	NC_020125	A	7	7	125212	125218	100 %	0 %	0 %	0 %	442313812
2541	NC_020125	TCG	2	6	125240	125245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313812
2542	NC_020125	GAA	2	6	125353	125358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313812
2543	NC_020125	A	6	6	125361	125366	100 %	0 %	0 %	0 %	442313812
2544	NC_020125	CAA	2	6	125377	125382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313812
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2547	NC_020125	CCTT	2	8	125515	125522	0 %	50 %	0 %	50 %	442313812
2548	NC_020125	TAA	2	6	125525	125530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313812
2549	NC_020125	TTAC	2	8	125549	125556	25 %	50 %	0 %	25 %	442313812
2550	NC_020125	GGT	2	6	125599	125604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313812
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2552	NC_020125	ATA	2	6	125699	125704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313812
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2554	NC_020125	AAGG	2	8	125747	125754	50 %	0 %	50 %	0 %	442313812
2555	NC_020125	CCT	2	6	125834	125839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313812
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2557	NC_020125	TAT	2	6	125953	125958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313812
2558	NC_020125	ACG	2	6	125966	125971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313812
2559	NC_020125	TGA	2	6	126012	126017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313812
2560	NC_020125	GGA	2	6	126037	126042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313812
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2562	NC_020125	ACC	2	6	126114	126119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313812
2563	NC_020125	A	6	6	126120	126125	100 %	0 %	0 %	0 %	442313812
2564	NC_020125	AAC	2	6	126259	126264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313813
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2584	NC_020125	GT	3	6	127027	127032	0 %	50 %	50 %	0 %	442313814
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2592	NC_020125	GAAAA	2	10	127510	127519	80 %	0 %	20 %	0 %	442313814
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2596	NC_020125	T	7	7	127851	127857	0 %	100 %	0 %	0 %	442313814
2597	NC_020125	CATC	2	8	127870	127877	25 %	25 %	0 %	50 %	442313814
2598	NC_020125	AGT	2	6	127878	127883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313814
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2602	NC_020125	ATTT	2	8	128105	128112	25 %	75 %	0 %	0 %	442313814
2603	NC_020125	ATTT	2	8	128124	128131	25 %	75 %	0 %	0 %	442313814
2604	NC_020125	AAAG	2	8	128149	128156	75 %	0 %	25 %	0 %	442313814
2605	NC_020125	TTA	2	6	128179	128184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313814
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2611	NC_020125	ATA	2	6	128814	128819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313815
2612	NC_020125	CT	3	6	128824	128829	0 %	50 %	0 %	50 %	442313815
2613	NC_020125	CAT	3	9	128894	128902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313815
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2615	NC_020125	TATATC	2	12	128972	128983	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	442313815
2616	NC_020125	TTG	2	6	129140	129145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313815
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2622	NC_020125	TCCT	2	8	129418	129425	0 %	50 %	0 %	50 %	442313816
2623	NC_020125	GAC	2	6	129427	129432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313816
2624	NC_020125	GGT	2	6	129517	129522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313816
2625	NC_020125	GT	4	8	129521	129528	0 %	50 %	50 %	0 %	442313816
2626	NC_020125	ATT	2	6	129622	129627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313816
2627	NC_020125	CAT	2	6	129749	129754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313816
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2629	NC_020125	AGC	2	6	129832	129837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313817
2630	NC_020125	A	6	6	129878	129883	100 %	0 %	0 %	0 %	442313817
2631	NC_020125	CA	3	6	129919	129924	50 %	0 %	0 %	50 %	442313817
2632	NC_020125	AGTG	2	8	129928	129935	25 %	25 %	50 %	0 %	442313817
2633	NC_020125	TAC	2	6	129976	129981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313817
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2637	NC_020125	ACC	2	6	130085	130090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313817
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2641	NC_020125	TCA	2	6	130217	130222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313817
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2645	NC_020125	T	6	6	130589	130594	0 %	100 %	0 %	0 %	442313818
2646	NC_020125	ACT	2	6	130599	130604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313818
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2657	NC_020125	TTG	2	6	131027	131032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313819
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2715	NC_020125	TAAG	2	8	134320	134327	50 %	25 %	25 %	0 %	442313822
2716	NC_020125	CCTGT	2	10	134358	134367	0 %	40 %	20 %	40 %	442313822
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2718	NC_020125	CT	3	6	134747	134752	0 %	50 %	0 %	50 %	442313823
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2722	NC_020125	TCC	2	6	134912	134917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313823
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2727	NC_020125	A	6	6	135161	135166	100 %	0 %	0 %	0 %	442313823
2728	NC_020125	GTG	2	6	135179	135184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313823
2729	NC_020125	ATCT	2	8	135206	135213	25 %	50 %	0 %	25 %	442313823
2730	NC_020125	ATA	2	6	135339	135344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313823
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2733	NC_020125	TCA	2	6	135411	135416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313823
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2735	NC_020125	ATC	2	6	135525	135530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313823
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2737	NC_020125	CATT	2	8	135625	135632	25 %	50 %	0 %	25 %	442313823
2738	NC_020125	A	6	6	135784	135789	100 %	0 %	0 %	0 %	442313824
2739	NC_020125	CAC	2	6	135792	135797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313824
2740	NC_020125	TAC	2	6	135814	135819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313824
2741	NC_020125	GTCCT	2	10	135854	135863	0 %	40 %	20 %	40 %	442313824
2742	NC_020125	AGAA	2	8	135909	135916	75 %	0 %	25 %	0 %	442313824
2743	NC_020125	AGT	2	6	135927	135932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313824
2744	NC_020125	AAGCT	2	10	135998	136007	40 %	20 %	20 %	20 %	442313824
2745	NC_020125	TGG	2	6	136059	136064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313824
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2747	NC_020125	TGG	2	6	136145	136150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313824
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2871	NC_020125	GCATCT	2	12	141597	141608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442313830
2872	NC_020125	AGTT	2	8	141610	141617	25 %	50 %	25 %	0 %	442313830
2873	NC_020125	TAAAAT	2	12	141620	141631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313830
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2887	NC_020125	AATC	2	8	142320	142327	50 %	25 %	0 %	25 %	442313831
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2991	NC_020125	AGA	2	6	147064	147069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313835
2992	NC_020125	AAG	2	6	147138	147143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313835
2993	NC_020125	AGTAT	2	10	147188	147197	40 %	40 %	20 %	0 %	442313835
2994	NC_020125	ATC	2	6	147279	147284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313836
2995	NC_020125	AC	3	6	147293	147298	50 %	0 %	0 %	50 %	442313836
2996	NC_020125	GAT	2	6	147330	147335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313836
2997	NC_020125	CAC	2	6	147391	147396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313836
2998	NC_020125	TAA	2	6	147443	147448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313836
2999	NC_020125	TAT	2	6	147518	147523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313836
3000	NC_020125	AT	3	6	147680	147685	50 %	50 %	0 %	0 %	442313837

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