MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020125	CAC	2	6	55370	55375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313742
1003	NC_020125	ATC	2	6	55379	55384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313742
1004	NC_020125	TTTTCT	2	12	55419	55430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	442313742
1005	NC_020125	A	7	7	55449	55455	100 %	0 %	0 %	0 %	442313742
1006	NC_020125	ATTT	2	8	55492	55499	25 %	75 %	0 %	0 %	442313742
1007	NC_020125	T	6	6	55502	55507	0 %	100 %	0 %	0 %	442313742
1008	NC_020125	CTC	2	6	55517	55522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313742
1009	NC_020125	TGA	2	6	55530	55535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313742
1010	NC_020125	TTTC	2	8	55601	55608	0 %	75 %	0 %	25 %	442313743
1011	NC_020125	TTA	2	6	55644	55649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313743
1012	NC_020125	CTTTT	2	10	55776	55785	0 %	80 %	0 %	20 %	442313743
1013	NC_020125	T	8	8	55782	55789	0 %	100 %	0 %	0 %	442313743
1014	NC_020125	A	7	7	55868	55874	100 %	0 %	0 %	0 %	442313743
1015	NC_020125	TAG	2	6	55891	55896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313743
1016	NC_020125	CTTT	3	12	55898	55909	0 %	75 %	0 %	25 %	442313743
1017	NC_020125	TC	4	8	55957	55964	0 %	50 %	0 %	50 %	442313743
1018	NC_020125	TTA	2	6	55968	55973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313743
1019	NC_020125	TAA	2	6	56077	56082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313743
1020	NC_020125	TTTA	2	8	56084	56091	25 %	75 %	0 %	0 %	442313743
1021	NC_020125	TAA	2	6	56093	56098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313743
1022	NC_020125	TTC	2	6	56102	56107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313743
1023	NC_020125	AGA	2	6	56180	56185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313743
1024	NC_020125	AAT	2	6	56210	56215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313743
1025	NC_020125	ATT	2	6	56288	56293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313743
1026	NC_020125	TTA	2	6	56320	56325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313743
1027	NC_020125	T	6	6	56327	56332	0 %	100 %	0 %	0 %	442313743
1028	NC_020125	TTC	2	6	56561	56566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313744
1029	NC_020125	CTG	2	6	56606	56611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313744
1030	NC_020125	TCT	2	6	56612	56617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313744
1031	NC_020125	CTG	2	6	56639	56644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313744
1032	NC_020125	ACA	2	6	56664	56669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313744
1033	NC_020125	T	6	6	56696	56701	0 %	100 %	0 %	0 %	442313744
1034	NC_020125	T	6	6	56983	56988	0 %	100 %	0 %	0 %	442313745
1035	NC_020125	ACT	2	6	57080	57085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313745
1036	NC_020125	TTC	2	6	57120	57125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313745
1037	NC_020125	TATC	2	8	57151	57158	25 %	50 %	0 %	25 %	442313745
1038	NC_020125	CTA	2	6	57181	57186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313745
1039	NC_020125	CAT	2	6	57209	57214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313745
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1041	NC_020125	AGG	2	6	57266	57271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313745
1042	NC_020125	TAT	2	6	57314	57319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313745
1043	NC_020125	T	6	6	57352	57357	0 %	100 %	0 %	0 %	442313745
1044	NC_020125	ATT	2	6	57402	57407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313745
1045	NC_020125	T	6	6	57406	57411	0 %	100 %	0 %	0 %	442313745
1046	NC_020125	CTC	2	6	57432	57437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313745
1047	NC_020125	CTA	2	6	57504	57509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313745
1048	NC_020125	CCA	2	6	57556	57561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313745
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1050	NC_020125	TA	3	6	57773	57778	50 %	50 %	0 %	0 %	442313746
1051	NC_020125	TTTA	2	8	57786	57793	25 %	75 %	0 %	0 %	442313746
1052	NC_020125	ATC	2	6	57796	57801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313746
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1056	NC_020125	TC	3	6	58184	58189	0 %	50 %	0 %	50 %	442313746
1057	NC_020125	GGATTT	2	12	58297	58308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	442313746
1058	NC_020125	CTA	3	9	58376	58384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313746
1059	NC_020125	GAA	2	6	58438	58443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313746
1060	NC_020125	CTAT	2	8	58474	58481	25 %	50 %	0 %	25 %	442313746
1061	NC_020125	GCA	2	6	58579	58584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313746
1062	NC_020125	CTTT	2	8	58633	58640	0 %	75 %	0 %	25 %	442313746
1063	NC_020125	A	6	6	58643	58648	100 %	0 %	0 %	0 %	442313746
1064	NC_020125	A	6	6	58706	58711	100 %	0 %	0 %	0 %	442313746
1065	NC_020125	GGA	2	6	58798	58803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313746
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1068	NC_020125	T	6	6	58936	58941	0 %	100 %	0 %	0 %	442313747
1069	NC_020125	CTT	2	6	58971	58976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313747
1070	NC_020125	TCC	2	6	58991	58996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313747
1071	NC_020125	TGA	2	6	59079	59084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313747
1072	NC_020125	AAT	2	6	59116	59121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313747
1073	NC_020125	GCTT	2	8	59157	59164	0 %	50 %	25 %	25 %	442313747
1074	NC_020125	TAT	2	6	59200	59205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313747
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1076	NC_020125	T	7	7	59284	59290	0 %	100 %	0 %	0 %	442313747
1077	NC_020125	A	7	7	59397	59403	100 %	0 %	0 %	0 %	442313747
1078	NC_020125	TTA	2	6	59415	59420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313747
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1081	NC_020125	GAT	2	6	59521	59526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313747
1082	NC_020125	ATAA	2	8	59556	59563	75 %	25 %	0 %	0 %	442313747
1083	NC_020125	CAA	2	6	59581	59586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313748
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1087	NC_020125	A	6	6	59652	59657	100 %	0 %	0 %	0 %	442313748
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1090	NC_020125	TCC	2	6	59723	59728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313748
1091	NC_020125	TCC	2	6	59744	59749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313748
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1097	NC_020125	T	6	6	60133	60138	0 %	100 %	0 %	0 %	442313749
1098	NC_020125	ACA	2	6	60144	60149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313749
1099	NC_020125	TTC	2	6	60164	60169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313749
1100	NC_020125	AAC	2	6	60171	60176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313749
1101	NC_020125	TCAGCT	2	12	60198	60209	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442313749
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1109	NC_020125	CT	4	8	60451	60458	0 %	50 %	0 %	50 %	442313749
1110	NC_020125	GCT	2	6	60543	60548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313749
1111	NC_020125	AGT	2	6	60599	60604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313749
1112	NC_020125	AGT	2	6	60668	60673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313749
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1115	NC_020125	CTTCGA	2	12	60786	60797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442313750
1116	NC_020125	CAT	2	6	60804	60809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313750
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1123	NC_020125	CAT	2	6	61030	61035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313750
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1125	NC_020125	AT	3	6	61170	61175	50 %	50 %	0 %	0 %	442313750
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