MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020125	CAA	2	6	31313	31318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313724
502	NC_020125	CAG	2	6	31400	31405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313724
503	NC_020125	ATTC	2	8	31413	31420	25 %	50 %	0 %	25 %	442313724
504	NC_020125	CTA	2	6	31518	31523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313725
505	NC_020125	GAA	2	6	31551	31556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313725
506	NC_020125	ATT	2	6	31680	31685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
507	NC_020125	TGA	2	6	31753	31758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313725
508	NC_020125	AAT	2	6	31808	31813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
509	NC_020125	ACC	2	6	31891	31896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313725
510	NC_020125	AAT	2	6	31907	31912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
511	NC_020125	TTTA	2	8	31980	31987	25 %	75 %	0 %	0 %	442313725
512	NC_020125	ATT	2	6	31992	31997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
513	NC_020125	TTAAA	2	10	32294	32303	60 %	40 %	0 %	0 %	442313725
514	NC_020125	T	8	8	32319	32326	0 %	100 %	0 %	0 %	442313725
515	NC_020125	T	6	6	32364	32369	0 %	100 %	0 %	0 %	442313725
516	NC_020125	TTGT	2	8	32382	32389	0 %	75 %	25 %	0 %	442313725
517	NC_020125	TAA	2	6	32397	32402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
518	NC_020125	CAA	2	6	32415	32420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313725
519	NC_020125	TTA	2	6	32443	32448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
520	NC_020125	AGA	2	6	32464	32469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313725
521	NC_020125	AATTAT	2	12	32519	32530	50 %	50 %	0 %	0 %	442313725
522	NC_020125	CATTT	2	10	32655	32664	20 %	60 %	0 %	20 %	442313725
523	NC_020125	GTT	2	6	32723	32728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313725
524	NC_020125	ATG	2	6	32772	32777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313725
525	NC_020125	AAT	2	6	32782	32787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
526	NC_020125	TAT	2	6	32792	32797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
527	NC_020125	GATT	2	8	32810	32817	25 %	50 %	25 %	0 %	442313725
528	NC_020125	TGC	2	6	32862	32867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313725
529	NC_020125	T	6	6	32869	32874	0 %	100 %	0 %	0 %	442313725
530	NC_020125	CAT	2	6	32906	32911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313725
531	NC_020125	AAT	2	6	32912	32917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
532	NC_020125	ATT	2	6	32955	32960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
533	NC_020125	ATA	2	6	33088	33093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
534	NC_020125	AAAC	2	8	33135	33142	75 %	0 %	0 %	25 %	442313725
535	NC_020125	T	6	6	33183	33188	0 %	100 %	0 %	0 %	442313725
536	NC_020125	CCA	2	6	33232	33237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313725
537	NC_020125	ATT	2	6	33273	33278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
538	NC_020125	TCT	2	6	33298	33303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313725
539	NC_020125	TCC	2	6	33414	33419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313725
540	NC_020125	T	6	6	33431	33436	0 %	100 %	0 %	0 %	442313725
541	NC_020125	ATT	2	6	33486	33491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
542	NC_020125	CTTT	2	8	33549	33556	0 %	75 %	0 %	25 %	442313725
543	NC_020125	ACA	2	6	33586	33591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313725
544	NC_020125	CTTTT	2	10	33603	33612	0 %	80 %	0 %	20 %	442313725
545	NC_020125	TAA	2	6	33642	33647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
546	NC_020125	A	6	6	33646	33651	100 %	0 %	0 %	0 %	442313725
547	NC_020125	TCAA	2	8	33689	33696	50 %	25 %	0 %	25 %	442313725
548	NC_020125	TTA	2	6	33752	33757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313726
549	NC_020125	TAT	2	6	33769	33774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313726
550	NC_020125	TTG	2	6	33911	33916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313726
551	NC_020125	TGAA	2	8	33933	33940	50 %	25 %	25 %	0 %	442313726
552	NC_020125	AAAC	2	8	33946	33953	75 %	0 %	0 %	25 %	442313726
553	NC_020125	GCT	2	6	33999	34004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313726
554	NC_020125	AATGTT	2	12	34022	34033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442313726
555	NC_020125	TTG	2	6	34053	34058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313726
556	NC_020125	AATT	2	8	34146	34153	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
557	NC_020125	TTA	2	6	34170	34175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313727
558	NC_020125	GCT	2	6	34287	34292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313727
559	NC_020125	TAG	2	6	34306	34311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313727
560	NC_020125	TCT	2	6	34431	34436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
561	NC_020125	CT	3	6	34435	34440	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
562	NC_020125	TC	3	6	34467	34472	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
563	NC_020125	ATC	2	6	34479	34484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
564	NC_020125	CCA	2	6	34608	34613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313727
565	NC_020125	TCA	2	6	34633	34638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
566	NC_020125	GAT	2	6	34649	34654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313727
567	NC_020125	TCA	2	6	34668	34673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
568	NC_020125	CT	3	6	34903	34908	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
569	NC_020125	TAC	2	6	34925	34930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
570	NC_020125	TAC	2	6	34946	34951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
571	NC_020125	TTAA	2	8	35046	35053	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
572	NC_020125	TCT	2	6	35071	35076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
573	NC_020125	CAT	2	6	35080	35085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
574	NC_020125	GGTA	2	8	35159	35166	25 %	25 %	50 %	0 %	442313727
575	NC_020125	T	6	6	35171	35176	0 %	100 %	0 %	0 %	442313727
576	NC_020125	TTC	2	6	35201	35206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
577	NC_020125	CTGT	2	8	35212	35219	0 %	50 %	25 %	25 %	442313727
578	NC_020125	ATA	2	6	35253	35258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313727
579	NC_020125	TTC	2	6	35337	35342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
580	NC_020125	GTAAG	2	10	35378	35387	40 %	20 %	40 %	0 %	442313727
581	NC_020125	CAC	2	6	35453	35458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313727
582	NC_020125	CTT	2	6	35476	35481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
583	NC_020125	TC	3	6	35529	35534	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
584	NC_020125	TGG	2	6	35583	35588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313727
585	NC_020125	TGC	2	6	35633	35638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313727
586	NC_020125	ATC	2	6	35667	35672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
587	NC_020125	CT	3	6	35716	35721	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
588	NC_020125	GAAC	2	8	35742	35749	50 %	0 %	25 %	25 %	442313727
589	NC_020125	TCT	2	6	35779	35784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
590	NC_020125	TTC	2	6	35792	35797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
591	NC_020125	AT	4	8	35846	35853	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
592	NC_020125	CTA	2	6	35896	35901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
593	NC_020125	TCA	2	6	35904	35909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
594	NC_020125	CCG	2	6	36019	36024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313727
595	NC_020125	CAT	2	6	36236	36241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
596	NC_020125	AT	3	6	36240	36245	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
597	NC_020125	ACC	2	6	36257	36262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313727
598	NC_020125	GGTC	2	8	36265	36272	0 %	25 %	50 %	25 %	442313727
599	NC_020125	ATCA	2	8	36326	36333	50 %	25 %	0 %	25 %	442313727
600	NC_020125	ATC	2	6	36389	36394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
601	NC_020125	CCG	2	6	36406	36411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313727
602	NC_020125	TCT	2	6	36427	36432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
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604	NC_020125	CCT	2	6	36471	36476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313727
605	NC_020125	GAACT	2	10	36518	36527	40 %	20 %	20 %	20 %	442313727
606	NC_020125	TTC	2	6	36582	36587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
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608	NC_020125	AGT	2	6	36653	36658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313727
609	NC_020125	T	6	6	36693	36698	0 %	100 %	0 %	0 %	442313727
610	NC_020125	TCC	2	6	36810	36815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313727
611	NC_020125	CTT	2	6	36826	36831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
612	NC_020125	TAAAG	2	10	36838	36847	60 %	20 %	20 %	0 %	442313727
613	NC_020125	AAG	2	6	37106	37111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313727
614	NC_020125	TCTA	2	8	37166	37173	25 %	50 %	0 %	25 %	442313727
615	NC_020125	CT	3	6	37210	37215	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
616	NC_020125	TGA	3	9	37228	37236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313727
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619	NC_020125	AAGT	2	8	37346	37353	50 %	25 %	25 %	0 %	442313727
620	NC_020125	AGA	2	6	37433	37438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313727
621	NC_020125	TAT	2	6	37447	37452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313727
622	NC_020125	CTT	2	6	37471	37476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
623	NC_020125	GTT	2	6	37544	37549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313727
624	NC_020125	CCA	2	6	37602	37607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313727
625	NC_020125	TGG	2	6	37634	37639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313727
626	NC_020125	CTA	2	6	37714	37719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
627	NC_020125	TTC	2	6	37744	37749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
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629	NC_020125	TAA	2	6	37820	37825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313727
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644	NC_020125	TC	3	6	38708	38713	0 %	50 %	0 %	50 %	442313728
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749	NC_020125	T	7	7	43253	43259	0 %	100 %	0 %	0 %	442313729
750	NC_020125	ATT	2	6	43261	43266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313729
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756	NC_020125	CCT	2	6	43790	43795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313730
757	NC_020125	AACTA	2	10	43801	43810	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
758	NC_020125	TGA	2	6	43846	43851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313730
759	NC_020125	CCT	2	6	43883	43888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313730
760	NC_020125	ACT	2	6	43895	43900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313730
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762	NC_020125	ACT	2	6	43937	43942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313730
763	NC_020125	GCT	2	6	44021	44026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313730
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766	NC_020125	TGA	2	6	44137	44142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313730
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773	NC_020125	AACTA	2	10	44383	44392	60 %	20 %	0 %	20 %	442313730
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878	NC_020125	AT	3	6	48814	48819	50 %	50 %	0 %	0 %	442313733
879	NC_020125	T	7	7	48825	48831	0 %	100 %	0 %	0 %	442313733
880	NC_020125	ATT	2	6	48971	48976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313734
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882	NC_020125	CTT	2	6	49049	49054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313734
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