MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020125	CTT	2	6	254593	254598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5002	NC_020125	ACA	2	6	254649	254654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313955
5003	NC_020125	CCT	2	6	254686	254691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313955
5004	NC_020125	AGT	2	6	254754	254759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313955
5005	NC_020125	CTA	2	6	254785	254790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
5006	NC_020125	CTG	2	6	254803	254808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313955
5007	NC_020125	CTT	2	6	254824	254829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5008	NC_020125	TA	3	6	254863	254868	50 %	50 %	0 %	0 %	442313955
5009	NC_020125	GGTT	2	8	254902	254909	0 %	50 %	50 %	0 %	442313955
5010	NC_020125	ACC	2	6	254916	254921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313955
5011	NC_020125	GGC	2	6	255044	255049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313955
5012	NC_020125	ATA	2	6	255117	255122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313955
5013	NC_020125	CAC	2	6	255164	255169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313955
5014	NC_020125	GTC	2	6	255176	255181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313955
5015	NC_020125	GT	3	6	255222	255227	0 %	50 %	50 %	0 %	442313955
5016	NC_020125	CT	3	6	255231	255236	0 %	50 %	0 %	50 %	442313955
5017	NC_020125	CTC	2	6	255263	255268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313955
5018	NC_020125	TCC	2	6	255285	255290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313955
5019	NC_020125	GAA	2	6	255347	255352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313955
5020	NC_020125	AT	3	6	255378	255383	50 %	50 %	0 %	0 %	442313955
5021	NC_020125	ATT	2	6	255413	255418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313955
5022	NC_020125	T	7	7	255417	255423	0 %	100 %	0 %	0 %	442313955
5023	NC_020125	ATCA	2	8	255425	255432	50 %	25 %	0 %	25 %	442313955
5024	NC_020125	AT	3	6	255483	255488	50 %	50 %	0 %	0 %	442313955
5025	NC_020125	TTA	2	6	255516	255521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313955
5026	NC_020125	CTT	2	6	255598	255603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5027	NC_020125	T	7	7	255626	255632	0 %	100 %	0 %	0 %	442313955
5028	NC_020125	TCT	2	6	255661	255666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5029	NC_020125	CAT	2	6	255763	255768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
5030	NC_020125	TTA	2	6	255879	255884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313955
5031	NC_020125	GTAA	2	8	255890	255897	50 %	25 %	25 %	0 %	442313955
5032	NC_020125	TCT	2	6	255917	255922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5033	NC_020125	CTA	2	6	256087	256092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
5034	NC_020125	ACC	2	6	256130	256135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313955
5035	NC_020125	ACACC	2	10	256141	256150	40 %	0 %	0 %	60 %	442313955
5036	NC_020125	GCA	2	6	256203	256208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313955
5037	NC_020125	TCA	2	6	256233	256238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
5038	NC_020125	GAA	2	6	256363	256368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313955
5039	NC_020125	CTTCT	2	10	256382	256391	0 %	60 %	0 %	40 %	442313955
5040	NC_020125	CTT	2	6	256402	256407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5041	NC_020125	T	6	6	256406	256411	0 %	100 %	0 %	0 %	442313955
5042	NC_020125	TTG	2	6	256425	256430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313955
5043	NC_020125	CTT	2	6	256438	256443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5044	NC_020125	TCA	2	6	256446	256451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
5045	NC_020125	CTT	2	6	256516	256521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5046	NC_020125	ATTTT	2	10	256524	256533	20 %	80 %	0 %	0 %	442313955
5047	NC_020125	TTC	2	6	256538	256543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
5048	NC_020125	T	6	6	256546	256551	0 %	100 %	0 %	0 %	442313955
5049	NC_020125	TTTTA	2	10	256598	256607	20 %	80 %	0 %	0 %	442313955
5050	NC_020125	ACT	2	6	256611	256616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
5051	NC_020125	A	6	6	256680	256685	100 %	0 %	0 %	0 %	442313955
5052	NC_020125	TTTAAT	2	12	256790	256801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313956
5053	NC_020125	TCT	2	6	256885	256890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313956
5054	NC_020125	CTA	2	6	256907	256912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313956
5055	NC_020125	ATA	2	6	257017	257022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313956
5056	NC_020125	ACT	2	6	257111	257116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313957
5057	NC_020125	T	6	6	257140	257145	0 %	100 %	0 %	0 %	442313957
5058	NC_020125	TGT	2	6	257188	257193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313957
5059	NC_020125	T	6	6	257216	257221	0 %	100 %	0 %	0 %	442313957
5060	NC_020125	CCTG	2	8	257230	257237	0 %	25 %	25 %	50 %	442313957
5061	NC_020125	TTA	2	6	257248	257253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313957
5062	NC_020125	TCT	2	6	257359	257364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313957
5063	NC_020125	AAT	2	6	257394	257399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313957
5064	NC_020125	ATC	2	6	257400	257405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313957
5065	NC_020125	TTA	2	6	257458	257463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313957
5066	NC_020125	ATT	2	6	257470	257475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313957
5067	NC_020125	A	6	6	257529	257534	100 %	0 %	0 %	0 %	442313957
5068	NC_020125	CCATA	2	10	257552	257561	40 %	20 %	0 %	40 %	442313957
5069	NC_020125	ATG	2	6	257565	257570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313957
5070	NC_020125	CA	3	6	257592	257597	50 %	0 %	0 %	50 %	442313957
5071	NC_020125	T	6	6	257598	257603	0 %	100 %	0 %	0 %	442313957
5072	NC_020125	T	6	6	257660	257665	0 %	100 %	0 %	0 %	442313957
5073	NC_020125	ATT	2	6	257667	257672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313957
5074	NC_020125	AGA	3	9	257685	257693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313957
5075	NC_020125	CTT	2	6	257765	257770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313957
5076	NC_020125	GGAC	2	8	257797	257804	25 %	0 %	50 %	25 %	442313957
5077	NC_020125	GCC	2	6	257815	257820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313957
5078	NC_020125	CAC	2	6	257829	257834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313957
5079	NC_020125	GAT	2	6	257843	257848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313957
5080	NC_020125	T	6	6	257858	257863	0 %	100 %	0 %	0 %	442313957
5081	NC_020125	CTT	2	6	257870	257875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313957
5082	NC_020125	ATA	2	6	257892	257897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313957
5083	NC_020125	TTA	2	6	257914	257919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313957
5084	NC_020125	AAG	2	6	257924	257929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313957
5085	NC_020125	TGT	2	6	257973	257978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313957
5086	NC_020125	TAT	2	6	257999	258004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313957
5087	NC_020125	ATC	2	6	258030	258035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313957
5088	NC_020125	TGA	2	6	258050	258055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313957
5089	NC_020125	TCC	2	6	258111	258116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313957
5090	NC_020125	TCT	2	6	258134	258139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313957
5091	NC_020125	GAA	2	6	258307	258312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313958
5092	NC_020125	AAG	2	6	258444	258449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313958
5093	NC_020125	GAA	2	6	258620	258625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313958
5094	NC_020125	TAC	2	6	258650	258655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313958
5095	NC_020125	CTT	2	6	258721	258726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313958
5096	NC_020125	TGA	2	6	258775	258780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313958
5097	NC_020125	TAC	2	6	258827	258832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313958
5098	NC_020125	TAT	2	6	258856	258861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313958
5099	NC_020125	GAT	2	6	258881	258886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313958
5100	NC_020125	A	7	7	259020	259026	100 %	0 %	0 %	0 %	442313958
5101	NC_020125	A	6	6	259069	259074	100 %	0 %	0 %	0 %	442313958
5102	NC_020125	TAG	2	6	259116	259121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313958
5103	NC_020125	GGA	2	6	259132	259137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313958
5104	NC_020125	AGA	2	6	259162	259167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313958
5105	NC_020125	AGA	2	6	259329	259334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313959
5106	NC_020125	AAAT	2	8	259388	259395	75 %	25 %	0 %	0 %	442313959
5107	NC_020125	GAA	2	6	259459	259464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313959
5108	NC_020125	GA	3	6	259539	259544	50 %	0 %	50 %	0 %	442313959
5109	NC_020125	AG	3	6	259574	259579	50 %	0 %	50 %	0 %	442313959
5110	NC_020125	A	7	7	259720	259726	100 %	0 %	0 %	0 %	442313960
5111	NC_020125	AGG	2	6	259743	259748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313960
5112	NC_020125	GCT	2	6	259753	259758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313960
5113	NC_020125	AATT	2	8	259764	259771	50 %	50 %	0 %	0 %	442313960
5114	NC_020125	CTG	2	6	259829	259834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313960
5115	NC_020125	GTTT	2	8	259839	259846	0 %	75 %	25 %	0 %	442313960
5116	NC_020125	GAA	2	6	259909	259914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313960
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5118	NC_020125	ATT	2	6	259957	259962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313960
5119	NC_020125	TATT	2	8	260054	260061	25 %	75 %	0 %	0 %	442313960
5120	NC_020125	CTA	2	6	260099	260104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313960
5121	NC_020125	ATTTAG	2	12	260111	260122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442313960
5122	NC_020125	CAT	2	6	260142	260147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313960
5123	NC_020125	AGA	2	6	260154	260159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313960
5124	NC_020125	TGGTT	2	10	260175	260184	0 %	60 %	40 %	0 %	442313960
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5230	NC_020125	A	6	6	264965	264970	100 %	0 %	0 %	0 %	442313966
5231	NC_020125	A	6	6	265015	265020	100 %	0 %	0 %	0 %	442313967
5232	NC_020125	A	6	6	265135	265140	100 %	0 %	0 %	0 %	442313967
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5239	NC_020125	T	6	6	265372	265377	0 %	100 %	0 %	0 %	442313968
5240	NC_020125	ATTT	2	8	265405	265412	25 %	75 %	0 %	0 %	442313968
5241	NC_020125	TGT	2	6	265452	265457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313968
5242	NC_020125	ATC	2	6	265502	265507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313968
5243	NC_020125	TCT	2	6	265536	265541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313968
5244	NC_020125	GT	4	8	265549	265556	0 %	50 %	50 %	0 %	442313968
5245	NC_020125	T	6	6	265613	265618	0 %	100 %	0 %	0 %	442313968
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5372	NC_020125	AAAG	2	8	271125	271132	75 %	0 %	25 %	0 %	442313973
5373	NC_020125	TAC	2	6	271154	271159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313973
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5376	NC_020125	A	7	7	271312	271318	100 %	0 %	0 %	0 %	442313973
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5381	NC_020125	TTTG	2	8	271509	271516	0 %	75 %	25 %	0 %	442313973
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5385	NC_020125	CTT	2	6	271675	271680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313973
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5388	NC_020125	TTC	2	6	271747	271752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313973
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5400	NC_020125	TGA	2	6	272373	272378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313973
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5494	NC_020125	GATGT	2	10	276991	277000	20 %	40 %	40 %	0 %	442313978
5495	NC_020125	CTT	2	6	277001	277006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313978
5496	NC_020125	TTG	2	6	277007	277012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313978
5497	NC_020125	AAG	2	6	277097	277102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313978
5498	NC_020125	CTGG	2	8	277163	277170	0 %	25 %	50 %	25 %	442313978
5499	NC_020125	ATT	2	6	277200	277205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313978
5500	NC_020125	GTG	2	6	277247	277252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313978

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