MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 4898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	GGGA	2	8	289	296	25 %	0 %	75 %	0 %	440222966
2	NC_020062	GAAT	2	8	2241	2248	50 %	25 %	25 %	0 %	440222968
3	NC_020062	TGCG	2	8	2440	2447	0 %	25 %	50 %	25 %	440222968
4	NC_020062	TGGC	2	8	2580	2587	0 %	25 %	50 %	25 %	440222968
5	NC_020062	CAGC	2	8	2910	2917	25 %	0 %	25 %	50 %	440222968
6	NC_020062	GCCG	2	8	3009	3016	0 %	0 %	50 %	50 %	440222968
7	NC_020062	TCGA	2	8	3082	3089	25 %	25 %	25 %	25 %	440222968
8	NC_020062	CGCC	2	8	3232	3239	0 %	0 %	25 %	75 %	440222968
9	NC_020062	GATC	2	8	3434	3441	25 %	25 %	25 %	25 %	440222968
10	NC_020062	GCAA	2	8	3487	3494	50 %	0 %	25 %	25 %	440222968
11	NC_020062	CCGC	2	8	3628	3635	0 %	0 %	25 %	75 %	440222968
12	NC_020062	GCAT	2	8	5683	5690	25 %	25 %	25 %	25 %	440222970
13	NC_020062	CTGC	2	8	5935	5942	0 %	25 %	25 %	50 %	440222970
14	NC_020062	ACGC	2	8	5969	5976	25 %	0 %	25 %	50 %	440222970
15	NC_020062	AGCA	2	8	5980	5987	50 %	0 %	25 %	25 %	440222970
16	NC_020062	ACGC	2	8	6413	6420	25 %	0 %	25 %	50 %	440222970
17	NC_020062	CTGC	2	8	6430	6437	0 %	25 %	25 %	50 %	440222970
18	NC_020062	ACGC	2	8	6803	6810	25 %	0 %	25 %	50 %	440222970
19	NC_020062	TCGG	2	8	7581	7588	0 %	25 %	50 %	25 %	440222972
20	NC_020062	ATCG	2	8	7814	7821	25 %	25 %	25 %	25 %	440222973
21	NC_020062	GCTG	2	8	8585	8592	0 %	25 %	50 %	25 %	440222974
22	NC_020062	ACCT	2	8	8675	8682	25 %	25 %	0 %	50 %	440222974
23	NC_020062	TTCA	2	8	9190	9197	25 %	50 %	0 %	25 %	440222974
24	NC_020062	AGGA	2	8	9632	9639	50 %	0 %	50 %	0 %	440222975
25	NC_020062	CGCC	2	8	9727	9734	0 %	0 %	25 %	75 %	440222975
26	NC_020062	CGAA	2	8	9857	9864	50 %	0 %	25 %	25 %	440222975
27	NC_020062	GGAT	2	8	10238	10245	25 %	25 %	50 %	0 %	440222976
28	NC_020062	GCAT	2	8	10283	10290	25 %	25 %	25 %	25 %	440222976
29	NC_020062	GCCG	2	8	10758	10765	0 %	0 %	50 %	50 %	440222976
30	NC_020062	GTGG	2	8	12530	12537	0 %	25 %	75 %	0 %	440222978
31	NC_020062	GAGC	2	8	12977	12984	25 %	0 %	50 %	25 %	440222979
32	NC_020062	TGCG	2	8	13049	13056	0 %	25 %	50 %	25 %	440222979
33	NC_020062	CTGA	2	8	13332	13339	25 %	25 %	25 %	25 %	440222979
34	NC_020062	ACCG	2	8	13890	13897	25 %	0 %	25 %	50 %	440222979
35	NC_020062	CAGC	2	8	14501	14508	25 %	0 %	25 %	50 %	440222980
36	NC_020062	TCGG	2	8	14697	14704	0 %	25 %	50 %	25 %	440222980
37	NC_020062	CTGC	2	8	16673	16680	0 %	25 %	25 %	50 %	440222982
38	NC_020062	TCGT	2	8	17031	17038	0 %	50 %	25 %	25 %	440222982
39	NC_020062	CGGC	2	8	17445	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	440222982
40	NC_020062	GTCC	2	8	17573	17580	0 %	25 %	25 %	50 %	440222982
41	NC_020062	GCTC	2	8	17600	17607	0 %	25 %	25 %	50 %	440222982
42	NC_020062	GGAA	2	8	18073	18080	50 %	0 %	50 %	0 %	440222982
43	NC_020062	TGCC	2	8	19030	19037	0 %	25 %	25 %	50 %	440222984
44	NC_020062	TGGA	2	8	19215	19222	25 %	25 %	50 %	0 %	440222985
45	NC_020062	GGCA	2	8	19228	19235	25 %	0 %	50 %	25 %	440222985
46	NC_020062	ATGT	2	8	19530	19537	25 %	50 %	25 %	0 %	440222985
47	NC_020062	GCCG	2	8	19757	19764	0 %	0 %	50 %	50 %	440222985
48	NC_020062	ATGT	2	8	20854	20861	25 %	50 %	25 %	0 %	440222986
49	NC_020062	CCGG	2	8	21138	21145	0 %	0 %	50 %	50 %	440222986
50	NC_020062	CTGG	2	8	23057	23064	0 %	25 %	50 %	25 %	440222987
51	NC_020062	TGCA	2	8	23081	23088	25 %	25 %	25 %	25 %	440222987
52	NC_020062	CAGG	2	8	23200	23207	25 %	0 %	50 %	25 %	440222987
53	NC_020062	GCCA	2	8	24250	24257	25 %	0 %	25 %	50 %	440222987
54	NC_020062	CCGG	2	8	24648	24655	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
55	NC_020062	TGGC	2	8	24769	24776	0 %	25 %	50 %	25 %	440222987
56	NC_020062	CAGG	2	8	25005	25012	25 %	0 %	50 %	25 %	440222987
57	NC_020062	TCGC	2	8	25294	25301	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
58	NC_020062	CGGA	2	8	25362	25369	25 %	0 %	50 %	25 %	440222988
59	NC_020062	GTGG	2	8	25536	25543	0 %	25 %	75 %	0 %	440222988
60	NC_020062	GATC	2	8	25556	25563	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
61	NC_020062	CGAT	2	8	25600	25607	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
62	NC_020062	GGGA	2	8	25895	25902	25 %	0 %	75 %	0 %	440222988
63	NC_020062	CACC	2	8	26168	26175	25 %	0 %	0 %	75 %	440222988
64	NC_020062	GGGA	2	8	27017	27024	25 %	0 %	75 %	0 %	440222988
65	NC_020062	GCGT	2	8	27059	27066	0 %	25 %	50 %	25 %	440222988
66	NC_020062	TCGC	2	8	27067	27074	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
67	NC_020062	CGGT	2	8	27122	27129	0 %	25 %	50 %	25 %	440222988
68	NC_020062	AGCC	2	8	27189	27196	25 %	0 %	25 %	50 %	440222988
69	NC_020062	CGGC	2	8	27335	27342	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
70	NC_020062	CCTG	2	8	27647	27654	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
71	NC_020062	CGAT	2	8	27886	27893	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
72	NC_020062	GGCA	2	8	28780	28787	25 %	0 %	50 %	25 %	440222988
73	NC_020062	GCTG	2	8	28966	28973	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
74	NC_020062	GCCT	2	8	29225	29232	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
75	NC_020062	TGGT	2	8	29933	29940	0 %	50 %	50 %	0 %	440222989
76	NC_020062	GCGG	2	8	30069	30076	0 %	0 %	75 %	25 %	440222989
77	NC_020062	TCCG	2	8	30266	30273	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
78	NC_020062	GGCT	2	8	30598	30605	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
79	NC_020062	GGTG	2	8	30853	30860	0 %	25 %	75 %	0 %	440222989
80	NC_020062	GTAT	2	8	31346	31353	25 %	50 %	25 %	0 %	440222989
81	NC_020062	ATCG	2	8	31580	31587	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
82	NC_020062	TGGG	2	8	31794	31801	0 %	25 %	75 %	0 %	440222989
83	NC_020062	CCGA	2	8	31977	31984	25 %	0 %	25 %	50 %	440222989
84	NC_020062	AGCA	2	8	32279	32286	50 %	0 %	25 %	25 %	440222989
85	NC_020062	CGAT	2	8	32532	32539	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
86	NC_020062	GCGG	2	8	32757	32764	0 %	0 %	75 %	25 %	440222989
87	NC_020062	GAGC	2	8	33033	33040	25 %	0 %	50 %	25 %	440222989
88	NC_020062	CTGC	2	8	33242	33249	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
89	NC_020062	GCCG	2	8	33434	33441	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
90	NC_020062	GCCG	2	8	33960	33967	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
91	NC_020062	TGGT	2	8	34071	34078	0 %	50 %	50 %	0 %	440222989
92	NC_020062	GCCC	2	8	34888	34895	0 %	0 %	25 %	75 %	440222989
93	NC_020062	CAGG	2	8	34978	34985	25 %	0 %	50 %	25 %	440222989
94	NC_020062	TCGA	2	8	35454	35461	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
95	NC_020062	TGCG	2	8	35811	35818	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
96	NC_020062	CGAA	2	8	36391	36398	50 %	0 %	25 %	25 %	440222990
97	NC_020062	ACCG	2	8	36649	36656	25 %	0 %	25 %	50 %	440222990
98	NC_020062	GGCG	2	8	36748	36755	0 %	0 %	75 %	25 %	440222990
99	NC_020062	CGTG	2	8	37041	37048	0 %	25 %	50 %	25 %	440222990
100	NC_020062	GCAG	2	8	37718	37725	25 %	0 %	50 %	25 %	440222991
101	NC_020062	ATTG	2	8	39056	39063	25 %	50 %	25 %	0 %	440222992
102	NC_020062	GGCA	2	8	39420	39427	25 %	0 %	50 %	25 %	440222993
103	NC_020062	CGGA	2	8	40212	40219	25 %	0 %	50 %	25 %	440222994
104	NC_020062	TCGA	2	8	40367	40374	25 %	25 %	25 %	25 %	440222994
105	NC_020062	AAGT	2	8	40613	40620	50 %	25 %	25 %	0 %	440222994
106	NC_020062	CATG	2	8	40932	40939	25 %	25 %	25 %	25 %	440222995
107	NC_020062	TGGG	2	8	41243	41250	0 %	25 %	75 %	0 %	440222995
108	NC_020062	TGCC	2	8	41429	41436	0 %	25 %	25 %	50 %	440222995
109	NC_020062	ATGT	2	8	41668	41675	25 %	50 %	25 %	0 %	440222995
110	NC_020062	GGCG	2	8	42255	42262	0 %	0 %	75 %	25 %	440222995
111	NC_020062	AACC	2	8	42409	42416	50 %	0 %	0 %	50 %	440222995
112	NC_020062	CTGG	2	8	42533	42540	0 %	25 %	50 %	25 %	440222996
113	NC_020062	ATCC	2	8	42907	42914	25 %	25 %	0 %	50 %	440222996
114	NC_020062	TGGG	2	8	42961	42968	0 %	25 %	75 %	0 %	440222996
115	NC_020062	AGCG	2	8	43255	43262	25 %	0 %	50 %	25 %	440222997
116	NC_020062	AGGG	2	8	43611	43618	25 %	0 %	75 %	0 %	440222997
117	NC_020062	GGCT	2	8	44204	44211	0 %	25 %	50 %	25 %	440222998
118	NC_020062	CGAT	2	8	44757	44764	25 %	25 %	25 %	25 %	440222999
119	NC_020062	TCAA	2	8	44982	44989	50 %	25 %	0 %	25 %	440222999
120	NC_020062	GCGA	2	8	45213	45220	25 %	0 %	50 %	25 %	440222999
121	NC_020062	AACG	2	8	45317	45324	50 %	0 %	25 %	25 %	440222999
122	NC_020062	GTCG	2	8	45810	45817	0 %	25 %	50 %	25 %	440223000
123	NC_020062	TCGA	2	8	46752	46759	25 %	25 %	25 %	25 %	440223001
124	NC_020062	ACGG	2	8	47950	47957	25 %	0 %	50 %	25 %	440223003
125	NC_020062	GCCG	2	8	47972	47979	0 %	0 %	50 %	50 %	440223003
126	NC_020062	CGAC	2	8	48099	48106	25 %	0 %	25 %	50 %	440223003
127	NC_020062	CGGC	2	8	48937	48944	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
128	NC_020062	GCCG	2	8	49032	49039	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
129	NC_020062	GGGC	2	8	49511	49518	0 %	0 %	75 %	25 %	440223004
130	NC_020062	ATTG	2	8	50803	50810	25 %	50 %	25 %	0 %	440223004
131	NC_020062	GATC	2	8	50817	50824	25 %	25 %	25 %	25 %	440223004
132	NC_020062	CCTT	2	8	50864	50871	0 %	50 %	0 %	50 %	440223004
133	NC_020062	GCAA	2	8	51214	51221	50 %	0 %	25 %	25 %	440223004
134	NC_020062	TCCA	2	8	51741	51748	25 %	25 %	0 %	50 %	440223005
135	NC_020062	GATC	2	8	51950	51957	25 %	25 %	25 %	25 %	440223005
136	NC_020062	GATG	2	8	52300	52307	25 %	25 %	50 %	0 %	440223005
137	NC_020062	TCGG	2	8	52739	52746	0 %	25 %	50 %	25 %	440223006
138	NC_020062	CTGA	2	8	53391	53398	25 %	25 %	25 %	25 %	440223008
139	NC_020062	AGCC	2	8	53632	53639	25 %	0 %	25 %	50 %	440223008
140	NC_020062	ATGG	2	8	53911	53918	25 %	25 %	50 %	0 %	440223009
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