MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020062	CTT	2	6	193629	193634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223132
3502	NC_020062	ATG	2	6	193692	193697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223132
3503	NC_020062	CGG	2	6	193709	193714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223132
3504	NC_020062	AAC	2	6	193760	193765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223132
3505	NC_020062	TCC	2	6	193800	193805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223132
3506	NC_020062	GCG	2	6	193837	193842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223132
3507	NC_020062	TC	3	6	193867	193872	0 %	50 %	0 %	50 %	440223132
3508	NC_020062	TCA	2	6	193885	193890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223132
3509	NC_020062	GCAAG	2	10	193916	193925	40 %	0 %	40 %	20 %	440223132
3510	NC_020062	CCTG	2	8	193947	193954	0 %	25 %	25 %	50 %	440223132
3511	NC_020062	ATC	2	6	194014	194019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223133
3512	NC_020062	ATG	2	6	194068	194073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223133
3513	NC_020062	CTG	2	6	194115	194120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223133
3514	NC_020062	GTT	2	6	194126	194131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223133
3515	NC_020062	TTC	2	6	194334	194339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223133
3516	NC_020062	TGCTG	2	10	194354	194363	0 %	40 %	40 %	20 %	440223133
3517	NC_020062	T	6	6	194391	194396	0 %	100 %	0 %	0 %	440223133
3518	NC_020062	CA	3	6	194464	194469	50 %	0 %	0 %	50 %	440223133
3519	NC_020062	A	6	6	194496	194501	100 %	0 %	0 %	0 %	440223133
3520	NC_020062	TGCT	2	8	194616	194623	0 %	50 %	25 %	25 %	440223133
3521	NC_020062	C	6	6	194657	194662	0 %	0 %	0 %	100 %	440223133
3522	NC_020062	ATG	2	6	194836	194841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223134
3523	NC_020062	TGT	2	6	194842	194847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223134
3524	NC_020062	AG	3	6	194883	194888	50 %	0 %	50 %	0 %	440223134
3525	NC_020062	AGGA	2	8	194890	194897	50 %	0 %	50 %	0 %	440223134
3526	NC_020062	ATC	2	6	194906	194911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223134
3527	NC_020062	CCG	2	6	194922	194927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223134
3528	NC_020062	CCG	2	6	194930	194935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223134
3529	NC_020062	GTC	2	6	195064	195069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3530	NC_020062	AGC	2	6	195191	195196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3531	NC_020062	CATGGT	2	12	195241	195252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440223134
3532	NC_020062	GACGAT	2	12	195274	195285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440223134
3533	NC_020062	ATC	2	6	195299	195304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223134
3534	NC_020062	TCC	2	6	195358	195363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223134
3535	NC_020062	CGATA	2	10	195369	195378	40 %	20 %	20 %	20 %	440223134
3536	NC_020062	CTG	2	6	195424	195429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3537	NC_020062	TTC	2	6	195514	195519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223134
3538	NC_020062	TCA	2	6	195576	195581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223134
3539	NC_020062	AAT	2	6	195695	195700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223134
3540	NC_020062	CTG	2	6	195706	195711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3541	NC_020062	GCT	2	6	195713	195718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3542	NC_020062	CCG	2	6	195720	195725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223134
3543	NC_020062	GCA	2	6	195771	195776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3544	NC_020062	GCT	2	6	195867	195872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3545	NC_020062	ATG	2	6	195887	195892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223134
3546	NC_020062	GTCC	2	8	195966	195973	0 %	25 %	25 %	50 %	440223134
3547	NC_020062	ACG	2	6	196034	196039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3548	NC_020062	GAA	3	9	196081	196089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223134
3549	NC_020062	GAG	2	6	196092	196097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223134
3550	NC_020062	GCT	2	6	196137	196142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3551	NC_020062	CGT	3	9	196177	196185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3552	NC_020062	GAA	2	6	196249	196254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223134
3553	NC_020062	TGC	2	6	196256	196261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3554	NC_020062	ACG	2	6	196280	196285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3555	NC_020062	ACC	2	6	196307	196312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223134
3556	NC_020062	ATC	2	6	196349	196354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223134
3557	NC_020062	GGC	2	6	196362	196367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223134
3558	NC_020062	GCC	2	6	196399	196404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223134
3559	NC_020062	GCA	2	6	196425	196430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3560	NC_020062	CGA	2	6	196464	196469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3561	NC_020062	CAC	2	6	196495	196500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223134
3562	NC_020062	AGA	2	6	196503	196508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223134
3563	NC_020062	CGG	2	6	196527	196532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223134
3564	NC_020062	GAT	2	6	196564	196569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223134
3565	NC_020062	GCC	2	6	196598	196603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223134
3566	NC_020062	GGC	3	9	196621	196629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223134
3567	NC_020062	ATCC	2	8	196639	196646	25 %	25 %	0 %	50 %	440223134
3568	NC_020062	CAC	2	6	196660	196665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223134
3569	NC_020062	TCG	2	6	196691	196696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3570	NC_020062	GC	3	6	196722	196727	0 %	0 %	50 %	50 %	440223134
3571	NC_020062	GAA	2	6	196744	196749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223134
3572	NC_020062	ATG	2	6	196766	196771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223134
3573	NC_020062	GAC	2	6	196777	196782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3574	NC_020062	ACG	2	6	196811	196816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3575	NC_020062	TGA	2	6	196839	196844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223134
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3577	NC_020062	CTG	2	6	197026	197031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3578	NC_020062	GAC	2	6	197035	197040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223134
3579	NC_020062	AGGT	2	8	197078	197085	25 %	25 %	50 %	0 %	440223134
3580	NC_020062	CGC	2	6	197105	197110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223134
3581	NC_020062	AG	3	6	197125	197130	50 %	0 %	50 %	0 %	440223134
3582	NC_020062	ATCG	2	8	197230	197237	25 %	25 %	25 %	25 %	440223134
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3586	NC_020062	CTT	2	6	197551	197556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223134
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3588	NC_020062	GTGG	2	8	197588	197595	0 %	25 %	75 %	0 %	440223134
3589	NC_020062	CG	3	6	197721	197726	0 %	0 %	50 %	50 %	440223134
3590	NC_020062	TCT	2	6	197783	197788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223134
3591	NC_020062	GCAA	2	8	197828	197835	50 %	0 %	25 %	25 %	440223134
3592	NC_020062	GAA	2	6	197842	197847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223134
3593	NC_020062	CT	3	6	197859	197864	0 %	50 %	0 %	50 %	440223134
3594	NC_020062	AGAT	2	8	197881	197888	50 %	25 %	25 %	0 %	440223134
3595	NC_020062	TTGG	2	8	197898	197905	0 %	50 %	50 %	0 %	440223134
3596	NC_020062	CGA	2	6	197966	197971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223135
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3598	NC_020062	ACC	2	6	197998	198003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223135
3599	NC_020062	CCT	2	6	198008	198013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223135
3600	NC_020062	TCT	2	6	198020	198025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223135
3601	NC_020062	T	6	6	198059	198064	0 %	100 %	0 %	0 %	440223135
3602	NC_020062	CGT	2	6	198095	198100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223135
3603	NC_020062	CCG	2	6	198122	198127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223135
3604	NC_020062	GCT	2	6	198190	198195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223135
3605	NC_020062	CGG	2	6	198242	198247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223135
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3607	NC_020062	CAC	2	6	198411	198416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223135
3608	NC_020062	CGA	2	6	198440	198445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223135
3609	NC_020062	CAG	2	6	198468	198473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223135
3610	NC_020062	GCG	2	6	198517	198522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223135
3611	NC_020062	TGC	2	6	198549	198554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223135
3612	NC_020062	GAG	2	6	198575	198580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223135
3613	NC_020062	GCC	2	6	198586	198591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223135
3614	NC_020062	GGC	2	6	198609	198614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223135
3615	NC_020062	TC	3	6	198621	198626	0 %	50 %	0 %	50 %	440223135
3616	NC_020062	GGTC	2	8	198701	198708	0 %	25 %	50 %	25 %	440223135
3617	NC_020062	TCG	2	6	198709	198714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223135
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3620	NC_020062	CCA	2	6	198869	198874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223135
3621	NC_020062	GGC	2	6	198886	198891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223135
3622	NC_020062	TTCC	2	8	198920	198927	0 %	50 %	0 %	50 %	440223135
3623	NC_020062	AACG	2	8	198945	198952	50 %	0 %	25 %	25 %	440223135
3624	NC_020062	GCC	2	6	198967	198972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223135
3625	NC_020062	AGTC	2	8	199115	199122	25 %	25 %	25 %	25 %	440223136
3626	NC_020062	TCA	2	6	199153	199158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223136
3627	NC_020062	ACAA	2	8	199252	199259	75 %	0 %	0 %	25 %	440223136
3628	NC_020062	GCC	2	6	199281	199286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223136
3629	NC_020062	GC	4	8	199298	199305	0 %	0 %	50 %	50 %	440223136
3630	NC_020062	AAG	2	6	199319	199324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223136
3631	NC_020062	TC	3	6	199382	199387	0 %	50 %	0 %	50 %	440223136
3632	NC_020062	GA	3	6	199402	199407	50 %	0 %	50 %	0 %	440223136
3633	NC_020062	TGG	2	6	199426	199431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223136
3634	NC_020062	GCAGA	2	10	199454	199463	40 %	0 %	40 %	20 %	440223136
3635	NC_020062	CAG	2	6	199535	199540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223136
3636	NC_020062	GGCGAT	2	12	199559	199570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223136
3637	NC_020062	CAT	2	6	199607	199612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223136
3638	NC_020062	GC	3	6	199674	199679	0 %	0 %	50 %	50 %	440223136
3639	NC_020062	TGC	2	6	199688	199693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223136
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3641	NC_020062	TCG	2	6	199969	199974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223137
3642	NC_020062	CT	3	6	200029	200034	0 %	50 %	0 %	50 %	440223137
3643	NC_020062	GAGG	2	8	200048	200055	25 %	0 %	75 %	0 %	440223137
3644	NC_020062	GCC	2	6	200077	200082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223137
3645	NC_020062	TCA	2	6	200109	200114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223137
3646	NC_020062	CGT	2	6	200166	200171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223137
3647	NC_020062	ATC	2	6	200201	200206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223137
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3650	NC_020062	GCC	2	6	200274	200279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223137
3651	NC_020062	CGT	2	6	200298	200303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223137
3652	NC_020062	GC	3	6	200364	200369	0 %	0 %	50 %	50 %	440223137
3653	NC_020062	GCC	2	6	200384	200389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223137
3654	NC_020062	GCC	2	6	200411	200416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223137
3655	NC_020062	GCG	2	6	200454	200459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223137
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3657	NC_020062	CGC	2	6	200500	200505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223137
3658	NC_020062	CGCGT	2	10	200566	200575	0 %	20 %	40 %	40 %	440223137
3659	NC_020062	GGCA	2	8	200599	200606	25 %	0 %	50 %	25 %	440223137
3660	NC_020062	GCC	2	6	200648	200653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223137
3661	NC_020062	TCG	2	6	200667	200672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223137
3662	NC_020062	GAC	2	6	200680	200685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223137
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3665	NC_020062	CAC	2	6	200979	200984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223137
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3694	NC_020062	TCGA	2	8	202184	202191	25 %	25 %	25 %	25 %	440223138
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3708	NC_020062	GTC	2	6	202945	202950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223139
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3727	NC_020062	CGT	2	6	203583	203588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223139
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3734	NC_020062	GCCA	2	8	203779	203786	25 %	0 %	25 %	50 %	440223139
3735	NC_020062	GAT	2	6	203790	203795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223139
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3739	NC_020062	GC	3	6	203963	203968	0 %	0 %	50 %	50 %	440223140
3740	NC_020062	GT	3	6	204074	204079	0 %	50 %	50 %	0 %	440223140
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3742	NC_020062	TCG	2	6	204171	204176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223140
3743	NC_020062	GCT	3	9	204226	204234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223140
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3772	NC_020062	TGA	2	6	205298	205303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223141
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3865	NC_020062	CGG	2	6	210611	210616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223147
3866	NC_020062	TGC	2	6	210654	210659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223147
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3966	NC_020062	TTATA	2	10	217942	217951	40 %	60 %	0 %	0 %	440223155
3967	NC_020062	GGTA	2	8	217960	217967	25 %	25 %	50 %	0 %	440223155
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3970	NC_020062	CGT	2	6	218156	218161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223155
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3973	NC_020062	TCG	2	6	218285	218290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223155
3974	NC_020062	TTG	2	6	218301	218306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223155
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3976	NC_020062	AG	3	6	218720	218725	50 %	0 %	50 %	0 %	440223155
3977	NC_020062	ATC	2	6	218799	218804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223155
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3979	NC_020062	TTC	2	6	218869	218874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223155
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3981	NC_020062	TCA	2	6	218966	218971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223156
3982	NC_020062	GA	4	8	218991	218998	50 %	0 %	50 %	0 %	440223156
3983	NC_020062	CGG	2	6	219043	219048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223156
3984	NC_020062	CCA	2	6	219056	219061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223156
3985	NC_020062	GAT	2	6	219111	219116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223156
3986	NC_020062	GC	3	6	219199	219204	0 %	0 %	50 %	50 %	440223157
3987	NC_020062	CG	3	6	219253	219258	0 %	0 %	50 %	50 %	440223157
3988	NC_020062	AAC	2	6	219276	219281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223157
3989	NC_020062	GAT	2	6	219321	219326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223157
3990	NC_020062	CTT	2	6	219372	219377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223157
3991	NC_020062	AAT	2	6	219934	219939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223158
3992	NC_020062	CGTTG	2	10	219943	219952	0 %	40 %	40 %	20 %	440223158
3993	NC_020062	GTG	2	6	219965	219970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223158
3994	NC_020062	CG	3	6	219971	219976	0 %	0 %	50 %	50 %	440223158
3995	NC_020062	G	6	6	220048	220053	0 %	0 %	100 %	0 %	440223158
3996	NC_020062	GAT	3	9	220088	220096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223158
3997	NC_020062	CGA	2	6	220141	220146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223158
3998	NC_020062	GAC	2	6	220232	220237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223158
3999	NC_020062	ATC	2	6	220238	220243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223158
4000	NC_020062	ATC	2	6	220274	220279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223158

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