MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020062	CTC	2	6	75706	75711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223031
1502	NC_020062	TTC	2	6	75953	75958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223031
1503	NC_020062	GCT	2	6	76002	76007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1504	NC_020062	GCGCA	2	10	76035	76044	20 %	0 %	40 %	40 %	440223031
1505	NC_020062	ATC	2	6	76049	76054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223031
1506	NC_020062	CCA	2	6	76068	76073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223031
1507	NC_020062	CCT	2	6	76107	76112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223031
1508	NC_020062	CATCT	2	10	76120	76129	20 %	40 %	0 %	40 %	440223031
1509	NC_020062	ATCG	2	8	76135	76142	25 %	25 %	25 %	25 %	440223031
1510	NC_020062	GAT	2	6	76144	76149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223031
1511	NC_020062	CAG	2	6	76180	76185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1512	NC_020062	GC	3	6	76191	76196	0 %	0 %	50 %	50 %	440223031
1513	NC_020062	CGA	2	6	76235	76240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1514	NC_020062	CATT	2	8	76275	76282	25 %	50 %	0 %	25 %	440223031
1515	NC_020062	CT	3	6	76284	76289	0 %	50 %	0 %	50 %	440223031
1516	NC_020062	ATC	2	6	76454	76459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223031
1517	NC_020062	CTT	2	6	76491	76496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223031
1518	NC_020062	TCG	2	6	76511	76516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1519	NC_020062	GC	5	10	76575	76584	0 %	0 %	50 %	50 %	440223031
1520	NC_020062	TCCA	2	8	76586	76593	25 %	25 %	0 %	50 %	440223031
1521	NC_020062	CAT	2	6	76630	76635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223031
1522	NC_020062	GCA	2	6	76674	76679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1523	NC_020062	AG	3	6	76747	76752	50 %	0 %	50 %	0 %	440223031
1524	NC_020062	TTG	2	6	76775	76780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223031
1525	NC_020062	CAG	2	6	76797	76802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1526	NC_020062	GC	4	8	76881	76888	0 %	0 %	50 %	50 %	440223031
1527	NC_020062	TCA	2	6	76892	76897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223031
1528	NC_020062	TCGATG	2	12	76898	76909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440223031
1529	NC_020062	CCG	2	6	76934	76939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223031
1530	NC_020062	TCG	2	6	76943	76948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1531	NC_020062	ACG	2	6	76996	77001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1532	NC_020062	AGC	2	6	77168	77173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1533	NC_020062	GAA	2	6	77182	77187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223031
1534	NC_020062	TGC	2	6	77315	77320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1535	NC_020062	GGC	2	6	77329	77334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223031
1536	NC_020062	CTGG	2	8	77422	77429	0 %	25 %	50 %	25 %	440223031
1537	NC_020062	GAC	2	6	77479	77484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1538	NC_020062	CGG	2	6	77508	77513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223031
1539	NC_020062	AGT	2	6	77519	77524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223031
1540	NC_020062	GGC	2	6	77525	77530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223031
1541	NC_020062	ATG	2	6	77531	77536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223031
1542	NC_020062	CGA	2	6	77682	77687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1543	NC_020062	CCA	2	6	77713	77718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223031
1544	NC_020062	CAAG	2	8	77762	77769	50 %	0 %	25 %	25 %	440223031
1545	NC_020062	CAC	2	6	77794	77799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223031
1546	NC_020062	CGA	2	6	77823	77828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223031
1547	NC_020062	CGG	3	9	77937	77945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223031
1548	NC_020062	CCGA	2	8	77996	78003	25 %	0 %	25 %	50 %	440223031
1549	NC_020062	CAC	2	6	78008	78013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223031
1550	NC_020062	G	6	6	78064	78069	0 %	0 %	100 %	0 %	440223031
1551	NC_020062	A	6	6	78142	78147	100 %	0 %	0 %	0 %	440223031
1552	NC_020062	CG	3	6	78186	78191	0 %	0 %	50 %	50 %	440223031
1553	NC_020062	CGG	2	6	78196	78201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223031
1554	NC_020062	GTGCG	2	10	78635	78644	0 %	20 %	60 %	20 %	440223032
1555	NC_020062	TAG	2	6	78651	78656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223032
1556	NC_020062	CGG	2	6	78694	78699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1557	NC_020062	GTC	2	6	78722	78727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223032
1558	NC_020062	ACG	2	6	78738	78743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223032
1559	NC_020062	CTT	2	6	78761	78766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223032
1560	NC_020062	GGCC	2	8	78826	78833	0 %	0 %	50 %	50 %	440223032
1561	NC_020062	CGG	2	6	79030	79035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1562	NC_020062	CGC	3	9	79096	79104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223032
1563	NC_020062	CGG	2	6	79156	79161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1564	NC_020062	TCG	2	6	79167	79172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223032
1565	NC_020062	GGCT	2	8	79203	79210	0 %	25 %	50 %	25 %	440223032
1566	NC_020062	ACG	2	6	79242	79247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223032
1567	NC_020062	GA	3	6	79315	79320	50 %	0 %	50 %	0 %	440223032
1568	NC_020062	GAC	2	6	79325	79330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223032
1569	NC_020062	GTA	2	6	79352	79357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223032
1570	NC_020062	GGC	3	9	79445	79453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1571	NC_020062	CGG	2	6	79468	79473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1572	NC_020062	CGG	2	6	79480	79485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223032
1573	NC_020062	GCC	2	6	79490	79495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223032
1574	NC_020062	GA	3	6	79515	79520	50 %	0 %	50 %	0 %	440223032
1575	NC_020062	ATAGC	2	10	79774	79783	40 %	20 %	20 %	20 %	440223033
1576	NC_020062	GCC	2	6	79791	79796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223033
1577	NC_020062	CGGC	3	12	79808	79819	0 %	0 %	50 %	50 %	440223033
1578	NC_020062	CGA	2	6	80104	80109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223034
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1580	NC_020062	CG	3	6	80225	80230	0 %	0 %	50 %	50 %	440223034
1581	NC_020062	GTG	2	6	80291	80296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223034
1582	NC_020062	GCT	2	6	80464	80469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223034
1583	NC_020062	CGC	2	6	80518	80523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223034
1584	NC_020062	GCC	2	6	80572	80577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223034
1585	NC_020062	GCC	2	6	80603	80608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223034
1586	NC_020062	GAT	2	6	80651	80656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223034
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1588	NC_020062	CGT	3	9	80677	80685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223034
1589	NC_020062	CGG	2	6	80695	80700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223034
1590	NC_020062	CA	3	6	80702	80707	50 %	0 %	0 %	50 %	440223034
1591	NC_020062	GGA	2	6	80827	80832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223034
1592	NC_020062	CGTC	2	8	80848	80855	0 %	25 %	25 %	50 %	440223034
1593	NC_020062	GGC	2	6	80869	80874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223034
1594	NC_020062	CCAC	2	8	80895	80902	25 %	0 %	0 %	75 %	440223034
1595	NC_020062	TCGG	2	8	80915	80922	0 %	25 %	50 %	25 %	440223034
1596	NC_020062	CGC	2	6	80929	80934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223034
1597	NC_020062	ACT	2	6	80973	80978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223034
1598	NC_020062	TCA	2	6	81153	81158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223035
1599	NC_020062	CGG	2	6	81160	81165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223035
1600	NC_020062	GCAA	2	8	81204	81211	50 %	0 %	25 %	25 %	440223035
1601	NC_020062	GCC	3	9	81227	81235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223035
1602	NC_020062	CGT	2	6	81298	81303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223035
1603	NC_020062	CCTT	2	8	81323	81330	0 %	50 %	0 %	50 %	440223035
1604	NC_020062	TTC	2	6	81353	81358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223035
1605	NC_020062	GCC	2	6	81395	81400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223035
1606	NC_020062	CAT	2	6	81410	81415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223035
1607	NC_020062	ATC	2	6	81428	81433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223035
1608	NC_020062	GC	3	6	81466	81471	0 %	0 %	50 %	50 %	440223035
1609	NC_020062	ATC	2	6	81491	81496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223035
1610	NC_020062	CGG	2	6	81553	81558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223035
1611	NC_020062	CCA	2	6	81573	81578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223035
1612	NC_020062	GCC	2	6	81650	81655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223035
1613	NC_020062	GGC	2	6	81664	81669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223035
1614	NC_020062	TCG	2	6	81726	81731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223035
1615	NC_020062	GGA	2	6	81808	81813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223035
1616	NC_020062	CG	3	6	81883	81888	0 %	0 %	50 %	50 %	440223035
1617	NC_020062	GAT	2	6	81924	81929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223036
1618	NC_020062	CCG	4	12	81971	81982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223036
1619	NC_020062	TC	3	6	82097	82102	0 %	50 %	0 %	50 %	440223036
1620	NC_020062	ACG	2	6	82175	82180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223036
1621	NC_020062	TCG	3	9	82292	82300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223036
1622	NC_020062	CAG	2	6	82302	82307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223036
1623	NC_020062	CAT	2	6	82429	82434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223037
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1625	NC_020062	TTC	2	6	82540	82545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223037
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1751	NC_020062	GCA	2	6	89452	89457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223041
1752	NC_020062	GGC	2	6	89465	89470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223041
1753	NC_020062	ACCA	2	8	89490	89497	50 %	0 %	0 %	50 %	440223041
1754	NC_020062	TGC	2	6	89573	89578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223041
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1763	NC_020062	GCC	2	6	89996	90001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223042
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1788	NC_020062	GCCG	2	8	91050	91057	0 %	0 %	50 %	50 %	440223043
1789	NC_020062	GGCA	2	8	91113	91120	25 %	0 %	50 %	25 %	440223043
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1859	NC_020062	CTG	2	6	93740	93745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223045
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1861	NC_020062	GATG	2	8	93880	93887	25 %	25 %	50 %	0 %	440223045
1862	NC_020062	CGT	3	9	93895	93903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223045
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1865	NC_020062	GC	3	6	93970	93975	0 %	0 %	50 %	50 %	440223045
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1872	NC_020062	GCG	3	9	94197	94205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223045
1873	NC_020062	CGG	2	6	94239	94244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223045
1874	NC_020062	GCG	2	6	94356	94361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223045
1875	NC_020062	TCA	2	6	94467	94472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223046
1876	NC_020062	CGG	3	9	94509	94517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223046
1877	NC_020062	AGA	2	6	94519	94524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223046
1878	NC_020062	CGA	2	6	94570	94575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223046
1879	NC_020062	GCT	2	6	94708	94713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223046
1880	NC_020062	CG	4	8	94734	94741	0 %	0 %	50 %	50 %	440223046
1881	NC_020062	CAG	2	6	94802	94807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223046
1882	NC_020062	CGC	2	6	94988	94993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223046
1883	NC_020062	GCC	2	6	95047	95052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223046
1884	NC_020062	GCC	2	6	95096	95101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223046
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1888	NC_020062	TCA	2	6	95235	95240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223046
1889	NC_020062	TTC	2	6	95360	95365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223046
1890	NC_020062	CTG	2	6	95367	95372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223046
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1895	NC_020062	ATC	2	6	95454	95459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223046
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1901	NC_020062	CGG	2	6	95748	95753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223046
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1907	NC_020062	TGA	2	6	96303	96308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223047
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1922	NC_020062	AGGA	2	8	98369	98376	50 %	0 %	50 %	0 %	440223050
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1924	NC_020062	GGCAA	2	10	98420	98429	40 %	0 %	40 %	20 %	440223050
1925	NC_020062	ATC	2	6	98432	98437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223050
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1945	NC_020062	TGA	2	6	99537	99542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223050
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1954	NC_020062	GCG	2	6	100301	100306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223052
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1956	NC_020062	CGT	2	6	100325	100330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223052
1957	NC_020062	GC	3	6	100332	100337	0 %	0 %	50 %	50 %	440223052
1958	NC_020062	TGG	2	6	100364	100369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223052
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1961	NC_020062	CGT	2	6	100589	100594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223052
1962	NC_020062	CGT	2	6	100617	100622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223052
1963	NC_020062	GGCGA	2	10	100644	100653	20 %	0 %	60 %	20 %	440223052
1964	NC_020062	CGAT	2	8	100672	100679	25 %	25 %	25 %	25 %	440223052
1965	NC_020062	GAT	2	6	100719	100724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223052
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1968	NC_020062	ACTGCC	2	12	100833	100844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440223052
1969	NC_020062	GTC	2	6	100950	100955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223052
1970	NC_020062	TGA	2	6	100998	101003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223052
1971	NC_020062	CGAG	2	8	101071	101078	25 %	0 %	50 %	25 %	440223052
1972	NC_020062	CGC	2	6	101094	101099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223052
1973	NC_020062	ATG	2	6	101211	101216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223053
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1976	NC_020062	CGC	2	6	101386	101391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223053
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1978	NC_020062	GC	3	6	101487	101492	0 %	0 %	50 %	50 %	440223053
1979	NC_020062	TGCG	2	8	101494	101501	0 %	25 %	50 %	25 %	440223053
1980	NC_020062	AGT	2	6	101502	101507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223053
1981	NC_020062	GTC	2	6	101537	101542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223053
1982	NC_020062	TCG	2	6	101571	101576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223053
1983	NC_020062	AGC	2	6	101679	101684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223053
1984	NC_020062	TCG	2	6	101763	101768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223053
1985	NC_020062	CAT	2	6	101800	101805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223053
1986	NC_020062	CCG	2	6	101984	101989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223054
1987	NC_020062	TGC	2	6	101999	102004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223054
1988	NC_020062	ATG	2	6	102007	102012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223054
1989	NC_020062	TCC	2	6	102027	102032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223054
1990	NC_020062	CGC	2	6	102054	102059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223054
1991	NC_020062	GAC	2	6	102066	102071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223054
1992	NC_020062	CCG	2	6	102073	102078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223054
1993	NC_020062	TCA	2	6	102104	102109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223054
1994	NC_020062	TGC	2	6	102234	102239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223054
1995	NC_020062	GCG	2	6	102286	102291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223054
1996	NC_020062	GCCG	2	8	102342	102349	0 %	0 %	50 %	50 %	440223054
1997	NC_020062	CGC	2	6	102465	102470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223054
1998	NC_020062	CCGG	2	8	102472	102479	0 %	0 %	50 %	50 %	440223054
1999	NC_020062	CAGTGG	2	12	102496	102507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223054
2000	NC_020062	GGC	2	6	102553	102558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223055

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