MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020062	TTG	2	6	27673	27678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222988
502	NC_020062	CGG	2	6	27707	27712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
503	NC_020062	GTC	2	6	27750	27755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
504	NC_020062	CCG	2	6	27842	27847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
505	NC_020062	CGT	2	6	27870	27875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
506	NC_020062	CGAT	2	8	27886	27893	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
507	NC_020062	CTG	2	6	27933	27938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
508	NC_020062	GCA	2	6	27950	27955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
509	NC_020062	CGG	3	9	27996	28004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
510	NC_020062	GCA	2	6	28022	28027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
511	NC_020062	ATG	2	6	28036	28041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222988
512	NC_020062	GCG	2	6	28153	28158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222988
513	NC_020062	GTC	2	6	28167	28172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
514	NC_020062	AGG	2	6	28178	28183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222988
515	NC_020062	CTG	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
516	NC_020062	ATA	2	6	28209	28214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222988
517	NC_020062	CCG	2	6	28273	28278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
518	NC_020062	TCG	2	6	28330	28335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
519	NC_020062	GCCCG	2	10	28380	28389	0 %	0 %	40 %	60 %	440222988
520	NC_020062	GAG	2	6	28470	28475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222988
521	NC_020062	CCA	2	6	28494	28499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222988
522	NC_020062	GTT	2	6	28527	28532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222988
523	NC_020062	CCG	2	6	28566	28571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222988
524	NC_020062	GC	3	6	28659	28664	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
525	NC_020062	GTC	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222988
526	NC_020062	CGA	3	9	28748	28756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
527	NC_020062	GAA	2	6	28767	28772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222988
528	NC_020062	GGCA	2	8	28780	28787	25 %	0 %	50 %	25 %	440222988
529	NC_020062	CG	3	6	28790	28795	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
530	NC_020062	ATC	2	6	28833	28838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222989
531	NC_020062	TTG	2	6	28920	28925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222989
532	NC_020062	GCTG	2	8	28966	28973	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
533	NC_020062	ATG	2	6	28974	28979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222989
534	NC_020062	GCG	2	6	28984	28989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
535	NC_020062	GCC	2	6	28994	28999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222989
536	NC_020062	CCG	2	6	29008	29013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222989
537	NC_020062	ACC	2	6	29016	29021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222989
538	NC_020062	CGA	2	6	29038	29043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
539	NC_020062	GGC	2	6	29079	29084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
540	NC_020062	CAC	2	6	29161	29166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222989
541	NC_020062	CGA	2	6	29209	29214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
542	NC_020062	GCCT	2	8	29225	29232	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
543	NC_020062	GCG	2	6	29307	29312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
544	NC_020062	GCC	2	6	29361	29366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222989
545	NC_020062	GGT	2	6	29384	29389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222989
546	NC_020062	GCG	2	6	29407	29412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
547	NC_020062	GGC	3	9	29433	29441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
548	NC_020062	GCTCG	2	10	29477	29486	0 %	20 %	40 %	40 %	440222989
549	NC_020062	AGC	2	6	29487	29492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
550	NC_020062	CGA	2	6	29503	29508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
551	NC_020062	GCG	2	6	29700	29705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
552	NC_020062	AGG	2	6	29713	29718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222989
553	NC_020062	CAG	2	6	29768	29773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
554	NC_020062	CGT	2	6	29843	29848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
555	NC_020062	TGGT	2	8	29933	29940	0 %	50 %	50 %	0 %	440222989
556	NC_020062	GCGGAA	2	12	29948	29959	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440222989
557	NC_020062	GCG	2	6	29973	29978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
558	NC_020062	ATCCG	2	10	29993	30002	20 %	20 %	20 %	40 %	440222989
559	NC_020062	GCGG	2	8	30069	30076	0 %	0 %	75 %	25 %	440222989
560	NC_020062	GC	3	6	30094	30099	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
561	NC_020062	TCG	2	6	30138	30143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
562	NC_020062	CGA	2	6	30187	30192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
563	NC_020062	AGG	2	6	30196	30201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222989
564	NC_020062	TCG	2	6	30216	30221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
565	NC_020062	ATG	2	6	30222	30227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222989
566	NC_020062	CGA	2	6	30238	30243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
567	NC_020062	TCCG	2	8	30266	30273	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
568	NC_020062	CGA	2	6	30286	30291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
569	NC_020062	ATG	2	6	30294	30299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222989
570	NC_020062	TGCCGT	2	12	30424	30435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
571	NC_020062	GCATC	2	10	30482	30491	20 %	20 %	20 %	40 %	440222989
572	NC_020062	GGC	2	6	30496	30501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
573	NC_020062	AGT	2	6	30583	30588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222989
574	NC_020062	GGCT	2	8	30598	30605	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
575	NC_020062	AGC	2	6	30612	30617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
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578	NC_020062	TGTCG	2	10	30723	30732	0 %	40 %	40 %	20 %	440222989
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582	NC_020062	GGTG	2	8	30853	30860	0 %	25 %	75 %	0 %	440222989
583	NC_020062	TCC	2	6	30920	30925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222989
584	NC_020062	TCG	2	6	31140	31145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
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588	NC_020062	CAG	2	6	31232	31237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
589	NC_020062	CGG	2	6	31258	31263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
590	NC_020062	CCA	2	6	31283	31288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222989
591	NC_020062	CAG	2	6	31291	31296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
592	NC_020062	GTAT	2	8	31346	31353	25 %	50 %	25 %	0 %	440222989
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594	NC_020062	GCA	2	6	31498	31503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
595	NC_020062	GAT	2	6	31505	31510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222989
596	NC_020062	ATCG	2	8	31580	31587	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
597	NC_020062	GCT	2	6	31595	31600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
598	NC_020062	CAG	2	6	31610	31615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
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605	NC_020062	CGA	2	6	31855	31860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
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607	NC_020062	CCGA	2	8	31977	31984	25 %	0 %	25 %	50 %	440222989
608	NC_020062	CAT	2	6	31996	32001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222989
609	NC_020062	CCG	2	6	32052	32057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222989
610	NC_020062	GAA	2	6	32180	32185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222989
611	NC_020062	GC	3	6	32259	32264	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
612	NC_020062	AGCA	2	8	32279	32286	50 %	0 %	25 %	25 %	440222989
613	NC_020062	GCC	2	6	32332	32337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222989
614	NC_020062	GTCGAT	2	12	32342	32353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440222989
615	NC_020062	TCG	2	6	32365	32370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
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617	NC_020062	CGAT	2	8	32532	32539	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
618	NC_020062	CG	3	6	32581	32586	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
619	NC_020062	TCG	2	6	32625	32630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
620	NC_020062	CGG	2	6	32631	32636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222989
621	NC_020062	GCGG	2	8	32757	32764	0 %	0 %	75 %	25 %	440222989
622	NC_020062	TGATGT	2	12	32893	32904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440222989
623	NC_020062	TCG	2	6	32923	32928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
624	NC_020062	GTC	2	6	32961	32966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
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626	NC_020062	GAGC	2	8	33033	33040	25 %	0 %	50 %	25 %	440222989
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752	NC_020062	TTC	2	6	39206	39211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222993
753	NC_020062	CTT	2	6	39223	39228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222993
754	NC_020062	GCC	2	6	39235	39240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222993
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757	NC_020062	GGCA	2	8	39420	39427	25 %	0 %	50 %	25 %	440222993
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760	NC_020062	GTG	2	6	39845	39850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222994
761	NC_020062	CTG	2	6	39869	39874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222994
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785	NC_020062	TGG	2	6	40835	40840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222995
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1000	NC_020062	GGC	2	6	49987	49992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223004

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