MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020062	GATC	2	8	305367	305374	25 %	25 %	25 %	25 %	440223235
5502	NC_020062	CGA	2	6	305376	305381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223235
5503	NC_020062	GTG	2	6	305396	305401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223235
5504	NC_020062	ACA	2	6	305423	305428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223235
5505	NC_020062	GC	3	6	305435	305440	0 %	0 %	50 %	50 %	440223235
5506	NC_020062	CTT	2	6	305454	305459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223235
5507	NC_020062	CCG	2	6	305576	305581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223235
5508	NC_020062	CTTC	2	8	305591	305598	0 %	50 %	0 %	50 %	440223235
5509	NC_020062	CGA	2	6	305676	305681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223235
5510	NC_020062	CGC	2	6	305685	305690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223235
5511	NC_020062	GAT	2	6	305713	305718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223235
5512	NC_020062	TTG	2	6	305728	305733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223235
5513	NC_020062	CAG	2	6	305748	305753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223235
5514	NC_020062	GC	3	6	305783	305788	0 %	0 %	50 %	50 %	440223236
5515	NC_020062	GCC	2	6	305832	305837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223236
5516	NC_020062	GGC	2	6	305880	305885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5517	NC_020062	GGC	2	6	305985	305990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5518	NC_020062	GATC	2	8	306008	306015	25 %	25 %	25 %	25 %	440223236
5519	NC_020062	AGC	3	9	306025	306033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223236
5520	NC_020062	TGGC	2	8	306045	306052	0 %	25 %	50 %	25 %	440223236
5521	NC_020062	TTC	2	6	306094	306099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223236
5522	NC_020062	GGC	2	6	306180	306185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5523	NC_020062	AGG	2	6	306202	306207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223236
5524	NC_020062	CGC	2	6	306227	306232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223236
5525	NC_020062	CGG	2	6	306290	306295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5526	NC_020062	AGC	2	6	306298	306303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223236
5527	NC_020062	GATC	2	8	306353	306360	25 %	25 %	25 %	25 %	440223236
5528	NC_020062	GCA	2	6	306361	306366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223236
5529	NC_020062	GCG	2	6	306415	306420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5530	NC_020062	ATG	2	6	306544	306549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223236
5531	NC_020062	GGT	2	6	306555	306560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223236
5532	NC_020062	CGG	2	6	306573	306578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5533	NC_020062	AAG	2	6	306588	306593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223236
5534	NC_020062	TGCC	2	8	306609	306616	0 %	25 %	25 %	50 %	440223236
5535	NC_020062	GGC	2	6	306645	306650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5536	NC_020062	CGG	3	9	306656	306664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223236
5537	NC_020062	TGC	2	6	306784	306789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223236
5538	NC_020062	GCC	2	6	306792	306797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223236
5539	NC_020062	GACT	2	8	306871	306878	25 %	25 %	25 %	25 %	440223236
5540	NC_020062	CCG	2	6	306889	306894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223236
5541	NC_020062	CGT	2	6	306911	306916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223236
5542	NC_020062	CGA	2	6	306989	306994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223236
5543	NC_020062	TC	3	6	307037	307042	0 %	50 %	0 %	50 %	440223236
5544	NC_020062	CCA	2	6	307109	307114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223236
5545	NC_020062	CGC	2	6	307127	307132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223236
5546	NC_020062	CAA	2	6	307181	307186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223236
5547	NC_020062	ATTGC	2	10	307195	307204	20 %	40 %	20 %	20 %	440223236
5548	NC_020062	TGGC	2	8	307234	307241	0 %	25 %	50 %	25 %	440223236
5549	NC_020062	CTT	2	6	307756	307761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223237
5550	NC_020062	CGG	3	9	307777	307785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5551	NC_020062	GCGG	2	8	307788	307795	0 %	0 %	75 %	25 %	440223237
5552	NC_020062	GGA	2	6	307840	307845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223237
5553	NC_020062	GAA	2	6	307877	307882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223237
5554	NC_020062	CTGG	2	8	307940	307947	0 %	25 %	50 %	25 %	440223237
5555	NC_020062	ACG	2	6	307980	307985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5556	NC_020062	AAGC	2	8	307996	308003	50 %	0 %	25 %	25 %	440223237
5557	NC_020062	TCA	2	6	308008	308013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223237
5558	NC_020062	AGC	2	6	308036	308041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5559	NC_020062	CAG	2	6	308057	308062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5560	NC_020062	TAA	2	6	308079	308084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223237
5561	NC_020062	CGA	2	6	308098	308103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5562	NC_020062	TTC	2	6	308115	308120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223237
5563	NC_020062	GAT	2	6	308132	308137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223237
5564	NC_020062	GGA	2	6	308182	308187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223237
5565	NC_020062	CGC	2	6	308189	308194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223237
5566	NC_020062	ATG	2	6	308208	308213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223237
5567	NC_020062	CAG	2	6	308273	308278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5568	NC_020062	CG	3	6	308344	308349	0 %	0 %	50 %	50 %	440223237
5569	NC_020062	GGC	2	6	308417	308422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5570	NC_020062	TGC	2	6	308441	308446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5571	NC_020062	TCG	2	6	308464	308469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5572	NC_020062	CGA	2	6	308485	308490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5573	NC_020062	CGG	2	6	308515	308520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5574	NC_020062	ACG	2	6	308527	308532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5575	NC_020062	CCG	2	6	308547	308552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223237
5576	NC_020062	TTGCG	2	10	308554	308563	0 %	40 %	40 %	20 %	440223237
5577	NC_020062	TCA	2	6	308575	308580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223237
5578	NC_020062	TGCGGC	2	12	308596	308607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223237
5579	NC_020062	CTG	2	6	308627	308632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5580	NC_020062	GCC	2	6	308763	308768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223237
5581	NC_020062	CAC	2	6	308798	308803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223237
5582	NC_020062	GCC	2	6	308814	308819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223237
5583	NC_020062	CCG	2	6	308836	308841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223237
5584	NC_020062	CTTG	2	8	308842	308849	0 %	50 %	25 %	25 %	440223237
5585	NC_020062	TCG	2	6	308902	308907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5586	NC_020062	GGC	3	9	308925	308933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5587	NC_020062	AGG	2	6	308944	308949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223237
5588	NC_020062	CG	3	6	308983	308988	0 %	0 %	50 %	50 %	440223237
5589	NC_020062	GCGAT	2	10	309154	309163	20 %	20 %	40 %	20 %	440223237
5590	NC_020062	CGG	2	6	309185	309190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5591	NC_020062	CGA	2	6	309202	309207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5592	NC_020062	TCT	2	6	309222	309227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223237
5593	NC_020062	GGCCGA	2	12	309265	309276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223237
5594	NC_020062	GC	3	6	309317	309322	0 %	0 %	50 %	50 %	440223237
5595	NC_020062	AGGC	2	8	309324	309331	25 %	0 %	50 %	25 %	440223237
5596	NC_020062	CCG	2	6	309349	309354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223237
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5599	NC_020062	ATG	2	6	309404	309409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223237
5600	NC_020062	GAC	2	6	309491	309496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5601	NC_020062	GAT	2	6	309521	309526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223237
5602	NC_020062	GAA	2	6	309542	309547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223237
5603	NC_020062	TTGCG	2	10	309623	309632	0 %	40 %	40 %	20 %	440223237
5604	NC_020062	CGG	2	6	309638	309643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5605	NC_020062	ACG	2	6	309684	309689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5606	NC_020062	CGT	2	6	309694	309699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5607	NC_020062	CGA	2	6	309700	309705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5608	NC_020062	ATG	2	6	309771	309776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223237
5609	NC_020062	ACG	2	6	309804	309809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
5610	NC_020062	TCGA	2	8	309906	309913	25 %	25 %	25 %	25 %	440223237
5611	NC_020062	GAA	2	6	309968	309973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223237
5612	NC_020062	GAT	2	6	310169	310174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223237
5613	NC_020062	CGA	2	6	310210	310215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223237
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5615	NC_020062	GACC	2	8	310333	310340	25 %	0 %	25 %	50 %	440223237
5616	NC_020062	GGC	2	6	310414	310419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5617	NC_020062	CATC	2	8	310468	310475	25 %	25 %	0 %	50 %	440223237
5618	NC_020062	GTCG	2	8	310481	310488	0 %	25 %	50 %	25 %	440223237
5619	NC_020062	CTT	2	6	310525	310530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223237
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5621	NC_020062	GCG	2	6	310756	310761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5622	NC_020062	AGG	2	6	310774	310779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223237
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5624	NC_020062	CGG	2	6	310807	310812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223237
5625	NC_020062	ATG	2	6	310860	310865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223237
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5733	NC_020062	GCC	2	6	316834	316839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223243
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5739	NC_020062	CGA	2	6	317094	317099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223243
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5741	NC_020062	ATG	2	6	317240	317245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223243
5742	NC_020062	TCG	2	6	317265	317270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223243
5743	NC_020062	GTC	2	6	317641	317646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223244
5744	NC_020062	TGG	2	6	317678	317683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223244
5745	NC_020062	CGG	2	6	317689	317694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223244
5746	NC_020062	GCTG	2	8	317757	317764	0 %	25 %	50 %	25 %	440223244
5747	NC_020062	CGG	2	6	317876	317881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223244
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5755	NC_020062	CGA	2	6	318201	318206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223244
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5758	NC_020062	GCCG	2	8	318271	318278	0 %	0 %	50 %	50 %	440223244
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5763	NC_020062	CGC	2	6	318414	318419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223244
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5773	NC_020062	GC	3	6	318870	318875	0 %	0 %	50 %	50 %	440223244
5774	NC_020062	CGC	3	9	318873	318881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223244
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5776	NC_020062	GC	3	6	319023	319028	0 %	0 %	50 %	50 %	440223244
5777	NC_020062	AGCG	2	8	319033	319040	25 %	0 %	50 %	25 %	440223244
5778	NC_020062	CGT	2	6	319060	319065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223244
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5784	NC_020062	CGA	2	6	319209	319214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223244
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5814	NC_020062	CACGG	2	10	320541	320550	20 %	0 %	40 %	40 %	440223245
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5823	NC_020062	GCT	2	6	321245	321250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223246
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5844	NC_020062	GAT	2	6	322000	322005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223247
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5850	NC_020062	CGG	2	6	322241	322246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223247
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5854	NC_020062	GCA	2	6	322320	322325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223247
5855	NC_020062	GC	3	6	322355	322360	0 %	0 %	50 %	50 %	440223247
5856	NC_020062	CTTC	2	8	322365	322372	0 %	50 %	0 %	50 %	440223247
5857	NC_020062	GGC	2	6	322420	322425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223247
5858	NC_020062	CAG	2	6	322513	322518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
5859	NC_020062	CGA	2	6	322572	322577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
5860	NC_020062	GAAT	2	8	322623	322630	50 %	25 %	25 %	0 %	440223248
5861	NC_020062	GAC	2	6	322636	322641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
5862	NC_020062	TTCG	2	8	322696	322703	0 %	50 %	25 %	25 %	440223248
5863	NC_020062	GC	3	6	322911	322916	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
5864	NC_020062	CTC	2	6	322927	322932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223248
5865	NC_020062	CGG	2	6	322989	322994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223248
5866	NC_020062	GC	3	6	323088	323093	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
5867	NC_020062	GCA	2	6	323211	323216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
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5869	NC_020062	TCG	2	6	323552	323557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223248
5870	NC_020062	CAG	2	6	323623	323628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
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5873	NC_020062	CGAG	2	8	323748	323755	25 %	0 %	50 %	25 %	440223248
5874	NC_020062	GC	3	6	323972	323977	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
5875	NC_020062	GGATCG	2	12	324000	324011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223248
5876	NC_020062	GGCCGA	2	12	324016	324027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223248
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5878	NC_020062	CG	3	6	324171	324176	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
5879	NC_020062	CCTT	2	8	324239	324246	0 %	50 %	0 %	50 %	440223248
5880	NC_020062	GGCCG	2	10	324517	324526	0 %	0 %	60 %	40 %	440223249
5881	NC_020062	GCCG	2	8	324530	324537	0 %	0 %	50 %	50 %	440223249
5882	NC_020062	GCT	2	6	324584	324589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
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5884	NC_020062	GACC	2	8	324623	324630	25 %	0 %	25 %	50 %	440223249
5885	NC_020062	GCT	2	6	324671	324676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
5886	NC_020062	CT	3	6	324680	324685	0 %	50 %	0 %	50 %	440223249
5887	NC_020062	TGG	2	6	324700	324705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223249
5888	NC_020062	GAC	2	6	324711	324716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223249
5889	NC_020062	GCCG	2	8	324799	324806	0 %	0 %	50 %	50 %	440223249
5890	NC_020062	AGC	2	6	324814	324819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223249
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5892	NC_020062	GTC	2	6	324873	324878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
5893	NC_020062	GC	3	6	324911	324916	0 %	0 %	50 %	50 %	440223249
5894	NC_020062	CTT	2	6	324917	324922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223249
5895	NC_020062	TGC	2	6	325066	325071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
5896	NC_020062	CG	3	6	325096	325101	0 %	0 %	50 %	50 %	440223249
5897	NC_020062	TCGA	2	8	325107	325114	25 %	25 %	25 %	25 %	440223249
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5900	NC_020062	TGA	2	6	325163	325168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223249
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5902	NC_020062	TGC	2	6	325235	325240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
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5904	NC_020062	GTC	2	6	325472	325477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223250
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5924	NC_020062	CGT	3	9	326327	326335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223250
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5972	NC_020062	TCT	2	6	328287	328292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223252
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5976	NC_020062	CGGC	2	8	328402	328409	0 %	0 %	50 %	50 %	440223252
5977	NC_020062	CG	3	6	328612	328617	0 %	0 %	50 %	50 %	440223252
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5982	NC_020062	CAT	2	6	328810	328815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223252
5983	NC_020062	CAA	2	6	328816	328821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223252
5984	NC_020062	AAG	2	6	328851	328856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223252
5985	NC_020062	TCG	2	6	328863	328868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223252
5986	NC_020062	CTCCGG	2	12	328887	328898	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440223252
5987	NC_020062	TGA	2	6	328953	328958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223252
5988	NC_020062	GCT	2	6	328999	329004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223252
5989	NC_020062	GCT	2	6	329043	329048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223253
5990	NC_020062	CCG	2	6	329066	329071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223253
5991	NC_020062	GCC	2	6	329083	329088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223253
5992	NC_020062	CGG	2	6	329099	329104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223253
5993	NC_020062	CCG	2	6	329152	329157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223253
5994	NC_020062	GC	3	6	329227	329232	0 %	0 %	50 %	50 %	440223253
5995	NC_020062	CTG	2	6	329288	329293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223253
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6000	NC_020062	CTT	2	6	329426	329431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223253

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