MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020062	GAAG	2	8	248343	248350	50 %	0 %	50 %	0 %	440223188
4502	NC_020062	GAA	2	6	248378	248383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223188
4503	NC_020062	TC	3	6	248457	248462	0 %	50 %	0 %	50 %	440223188
4504	NC_020062	GCT	2	6	248528	248533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223188
4505	NC_020062	GAG	2	6	248553	248558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223188
4506	NC_020062	CGG	2	6	248663	248668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223188
4507	NC_020062	GGA	2	6	248675	248680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223188
4508	NC_020062	CTG	2	6	248681	248686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223188
4509	NC_020062	GGT	2	6	248795	248800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223188
4510	NC_020062	GGC	2	6	248859	248864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223188
4511	NC_020062	GAA	2	6	248909	248914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223188
4512	NC_020062	ACA	2	6	249001	249006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223188
4513	NC_020062	CTG	2	6	249254	249259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223189
4514	NC_020062	GTC	2	6	249422	249427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223189
4515	NC_020062	CCG	2	6	249444	249449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223189
4516	NC_020062	AAC	2	6	249473	249478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223189
4517	NC_020062	GCA	2	6	249515	249520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223189
4518	NC_020062	GCG	2	6	249530	249535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223189
4519	NC_020062	CTCGCT	2	12	249536	249547	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440223189
4520	NC_020062	AT	3	6	249580	249585	50 %	50 %	0 %	0 %	440223189
4521	NC_020062	TCA	2	6	249627	249632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223189
4522	NC_020062	GCG	2	6	249649	249654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223189
4523	NC_020062	CG	3	6	249902	249907	0 %	0 %	50 %	50 %	440223189
4524	NC_020062	TCG	2	6	249928	249933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223189
4525	NC_020062	CATC	2	8	249972	249979	25 %	25 %	0 %	50 %	440223189
4526	NC_020062	CA	3	6	250026	250031	50 %	0 %	0 %	50 %	440223189
4527	NC_020062	CCG	2	6	250170	250175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223189
4528	NC_020062	TCT	2	6	250191	250196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223189
4529	NC_020062	AGGG	2	8	250212	250219	25 %	0 %	75 %	0 %	440223189
4530	NC_020062	GTA	2	6	250231	250236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223189
4531	NC_020062	TCC	2	6	250280	250285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223190
4532	NC_020062	GGA	2	6	250312	250317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223190
4533	NC_020062	ATC	2	6	250321	250326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223190
4534	NC_020062	TGC	2	6	250344	250349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223190
4535	NC_020062	TTC	2	6	250385	250390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223190
4536	NC_020062	TGGC	2	8	250408	250415	0 %	25 %	50 %	25 %	440223190
4537	NC_020062	CGA	2	6	250422	250427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223190
4538	NC_020062	GAGCG	2	10	250467	250476	20 %	0 %	60 %	20 %	440223190
4539	NC_020062	GC	3	6	250507	250512	0 %	0 %	50 %	50 %	440223190
4540	NC_020062	GCTG	2	8	250533	250540	0 %	25 %	50 %	25 %	440223190
4541	NC_020062	CGAG	2	8	250560	250567	25 %	0 %	50 %	25 %	440223190
4542	NC_020062	GCG	2	6	250622	250627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223190
4543	NC_020062	CGA	2	6	250689	250694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223190
4544	NC_020062	CGA	2	6	250697	250702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223190
4545	NC_020062	ACT	2	6	250770	250775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223190
4546	NC_020062	TCA	2	6	250778	250783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223190
4547	NC_020062	TCG	2	6	250961	250966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223190
4548	NC_020062	ATG	2	6	250967	250972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223190
4549	NC_020062	AAT	2	6	251088	251093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223191
4550	NC_020062	GC	4	8	251161	251168	0 %	0 %	50 %	50 %	440223191
4551	NC_020062	GTG	2	6	251210	251215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223191
4552	NC_020062	CGTCAG	2	12	251251	251262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4553	NC_020062	CCAT	2	8	251372	251379	25 %	25 %	0 %	50 %	440223191
4554	NC_020062	GCC	2	6	251389	251394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4555	NC_020062	AAGC	2	8	251395	251402	50 %	0 %	25 %	25 %	440223191
4556	NC_020062	CGC	2	6	251442	251447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4557	NC_020062	CGG	2	6	251466	251471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223191
4558	NC_020062	GCC	3	9	251482	251490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4559	NC_020062	GAGC	2	8	251601	251608	25 %	0 %	50 %	25 %	440223191
4560	NC_020062	GTG	2	6	251630	251635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223191
4561	NC_020062	GGAC	2	8	251699	251706	25 %	0 %	50 %	25 %	440223191
4562	NC_020062	GAC	2	6	251750	251755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4563	NC_020062	TGT	2	6	251764	251769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223191
4564	NC_020062	TTC	2	6	251780	251785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223191
4565	NC_020062	CTG	2	6	251794	251799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4566	NC_020062	CCG	2	6	251807	251812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4567	NC_020062	TCG	2	6	251831	251836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4568	NC_020062	CGA	2	6	251913	251918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4569	NC_020062	ACG	2	6	251929	251934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4570	NC_020062	TGG	2	6	251996	252001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223191
4571	NC_020062	TCA	2	6	252021	252026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223191
4572	NC_020062	GCC	3	9	252181	252189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4573	NC_020062	TCG	2	6	252212	252217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4574	NC_020062	CAT	2	6	252222	252227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223191
4575	NC_020062	GC	3	6	252306	252311	0 %	0 %	50 %	50 %	440223191
4576	NC_020062	GGT	2	6	252328	252333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223191
4577	NC_020062	AAG	2	6	252338	252343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223191
4578	NC_020062	GCG	2	6	252351	252356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223191
4579	NC_020062	ATC	2	6	252457	252462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223191
4580	NC_020062	TCG	2	6	252518	252523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4581	NC_020062	CCG	2	6	252529	252534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4582	NC_020062	GTC	2	6	252581	252586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223191
4583	NC_020062	GCC	2	6	252637	252642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4584	NC_020062	C	6	6	252826	252831	0 %	0 %	0 %	100 %	440223191
4585	NC_020062	GGA	2	6	252832	252837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223191
4586	NC_020062	GCC	2	6	252997	253002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223191
4587	NC_020062	TTC	2	6	253009	253014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223191
4588	NC_020062	TCTT	2	8	253043	253050	0 %	75 %	0 %	25 %	440223191
4589	NC_020062	AT	3	6	254341	254346	50 %	50 %	0 %	0 %	440223192
4590	NC_020062	ATGGCG	2	12	254410	254421	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223192
4591	NC_020062	TCC	2	6	254442	254447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223192
4592	NC_020062	GGC	2	6	254470	254475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223192
4593	NC_020062	TCT	2	6	254529	254534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223192
4594	NC_020062	TGT	2	6	254571	254576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223192
4595	NC_020062	CT	3	6	254577	254582	0 %	50 %	0 %	50 %	440223192
4596	NC_020062	GCAG	2	8	254619	254626	25 %	0 %	50 %	25 %	440223192
4597	NC_020062	GGT	2	6	254637	254642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223192
4598	NC_020062	GCC	2	6	254701	254706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223192
4599	NC_020062	CGT	2	6	254739	254744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223192
4600	NC_020062	TGA	2	6	254807	254812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223192
4601	NC_020062	TTG	2	6	255004	255009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223193
4602	NC_020062	AGCG	2	8	255020	255027	25 %	0 %	50 %	25 %	440223193
4603	NC_020062	CTT	2	6	255051	255056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223193
4604	NC_020062	GCGG	2	8	255134	255141	0 %	0 %	75 %	25 %	440223193
4605	NC_020062	CGG	2	6	255209	255214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223193
4606	NC_020062	CTC	2	6	255231	255236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223193
4607	NC_020062	CTC	2	6	255282	255287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223193
4608	NC_020062	GGT	2	6	255308	255313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223193
4609	NC_020062	GCT	2	6	255365	255370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223193
4610	NC_020062	CCGA	2	8	255423	255430	25 %	0 %	25 %	50 %	440223193
4611	NC_020062	CTGA	2	8	255537	255544	25 %	25 %	25 %	25 %	440223193
4612	NC_020062	CTG	2	6	255594	255599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223193
4613	NC_020062	TCA	2	6	256045	256050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223194
4614	NC_020062	GCA	3	9	256060	256068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223194
4615	NC_020062	GATG	2	8	257104	257111	25 %	25 %	50 %	0 %	440223195
4616	NC_020062	GA	3	6	257164	257169	50 %	0 %	50 %	0 %	440223195
4617	NC_020062	CGG	2	6	257196	257201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223195
4618	NC_020062	CAA	2	6	257328	257333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223195
4619	NC_020062	GCA	2	6	257401	257406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223195
4620	NC_020062	TGC	2	6	257421	257426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223195
4621	NC_020062	TGG	2	6	257444	257449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223195
4622	NC_020062	GTC	2	6	257450	257455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223195
4623	NC_020062	CAA	2	6	257492	257497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223195
4624	NC_020062	TCG	2	6	257682	257687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223195
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4628	NC_020062	GCA	2	6	257947	257952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223195
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4630	NC_020062	CGG	2	6	257980	257985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223195
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4635	NC_020062	CG	3	6	258950	258955	0 %	0 %	50 %	50 %	440223196
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4650	NC_020062	GCA	2	6	259694	259699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223196
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4656	NC_020062	TGC	2	6	259850	259855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223196
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4665	NC_020062	GAC	2	6	260252	260257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223196
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4683	NC_020062	TGA	2	6	260655	260660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223197
4684	NC_020062	TGG	2	6	260781	260786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223197
4685	NC_020062	CCAG	2	8	260830	260837	25 %	0 %	25 %	50 %	440223197
4686	NC_020062	GCC	2	6	261296	261301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223198
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4694	NC_020062	TGGA	2	8	261746	261753	25 %	25 %	50 %	0 %	440223198
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4730	NC_020062	CGG	2	6	264341	264346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223200
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4733	NC_020062	CGA	2	6	264427	264432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223200
4734	NC_020062	AAT	2	6	264589	264594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223200
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4736	NC_020062	CTTC	2	8	264670	264677	0 %	50 %	0 %	50 %	440223200
4737	NC_020062	GAT	2	6	264712	264717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223200
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4739	NC_020062	TCG	2	6	264789	264794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223200
4740	NC_020062	GCCA	2	8	264839	264846	25 %	0 %	25 %	50 %	440223200
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4742	NC_020062	GAG	2	6	265035	265040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223200
4743	NC_020062	GTC	2	6	265124	265129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223201
4744	NC_020062	ATTC	2	8	265170	265177	25 %	50 %	0 %	25 %	440223201
4745	NC_020062	CGG	2	6	265195	265200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223201
4746	NC_020062	CG	3	6	265233	265238	0 %	0 %	50 %	50 %	440223201
4747	NC_020062	GAT	2	6	265262	265267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223201
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4756	NC_020062	TTG	2	6	265728	265733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223201
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4859	NC_020062	CCAT	2	8	272501	272508	25 %	25 %	0 %	50 %	440223207
4860	NC_020062	ATCCG	2	10	272515	272524	20 %	20 %	20 %	40 %	440223207
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4862	NC_020062	ATC	2	6	272558	272563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223207
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4864	NC_020062	CGA	2	6	272652	272657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223207
4865	NC_020062	GATC	2	8	272691	272698	25 %	25 %	25 %	25 %	440223207
4866	NC_020062	CCT	2	6	272700	272705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223207
4867	NC_020062	CGTG	2	8	272742	272749	0 %	25 %	50 %	25 %	440223207
4868	NC_020062	CGC	2	6	272769	272774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223207
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4870	NC_020062	ATCCC	2	10	272892	272901	20 %	20 %	0 %	60 %	440223207
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4980	NC_020062	GAC	2	6	280057	280062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223212
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4984	NC_020062	CG	4	8	280237	280244	0 %	0 %	50 %	50 %	440223212
4985	NC_020062	ATCG	2	8	280279	280286	25 %	25 %	25 %	25 %	440223213
4986	NC_020062	CG	3	6	280285	280290	0 %	0 %	50 %	50 %	440223213
4987	NC_020062	GGT	2	6	280318	280323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223213
4988	NC_020062	AT	3	6	280336	280341	50 %	50 %	0 %	0 %	440223213
4989	NC_020062	CCGGC	2	10	280344	280353	0 %	0 %	40 %	60 %	440223213
4990	NC_020062	CGT	2	6	280387	280392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223213
4991	NC_020062	CGG	2	6	280408	280413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223213
4992	NC_020062	CAA	2	6	280453	280458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223213
4993	NC_020062	ATC	2	6	280463	280468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223213
4994	NC_020062	TGG	2	6	280515	280520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223213
4995	NC_020062	TCG	3	9	280533	280541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223213
4996	NC_020062	ACGGC	2	10	280598	280607	20 %	0 %	40 %	40 %	440223213
4997	NC_020062	CGA	2	6	280645	280650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223213
4998	NC_020062	CGC	2	6	280658	280663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223213
4999	NC_020062	GGC	2	6	280798	280803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223213
5000	NC_020062	GC	3	6	280829	280834	0 %	0 %	50 %	50 %	440223213

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