MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020061	CT	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	440222457
2	NC_020061	GC	3	6	1919	1924	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
3	NC_020061	CG	3	6	1986	1991	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
4	NC_020061	GC	3	6	2257	2262	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
5	NC_020061	GC	3	6	4186	4191	0 %	0 %	50 %	50 %	440222463
6	NC_020061	AG	3	6	4799	4804	50 %	0 %	50 %	0 %	440222464
7	NC_020061	GC	3	6	4808	4813	0 %	0 %	50 %	50 %	440222464
8	NC_020061	CG	3	6	4902	4907	0 %	0 %	50 %	50 %	440222464
9	NC_020061	GC	3	6	5999	6004	0 %	0 %	50 %	50 %	440222465
10	NC_020061	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	440222465
11	NC_020061	GC	3	6	7160	7165	0 %	0 %	50 %	50 %	440222467
12	NC_020061	CG	3	6	7209	7214	0 %	0 %	50 %	50 %	440222467
13	NC_020061	GC	3	6	10057	10062	0 %	0 %	50 %	50 %	440222470
14	NC_020061	GC	3	6	11731	11736	0 %	0 %	50 %	50 %	440222472
15	NC_020061	AT	3	6	12244	12249	50 %	50 %	0 %	0 %	440222473
16	NC_020061	GC	3	6	12258	12263	0 %	0 %	50 %	50 %	440222473
17	NC_020061	GC	3	6	13146	13151	0 %	0 %	50 %	50 %	440222474
18	NC_020061	GC	5	10	13494	13503	0 %	0 %	50 %	50 %	440222475
19	NC_020061	CG	3	6	13616	13621	0 %	0 %	50 %	50 %	440222475
20	NC_020061	TG	3	6	15036	15041	0 %	50 %	50 %	0 %	440222476
21	NC_020061	AT	3	6	16391	16396	50 %	50 %	0 %	0 %	440222478
22	NC_020061	GC	3	6	16437	16442	0 %	0 %	50 %	50 %	440222478
23	NC_020061	CT	3	6	17413	17418	0 %	50 %	0 %	50 %	440222478
24	NC_020061	GA	3	6	18328	18333	50 %	0 %	50 %	0 %	440222479
25	NC_020061	GC	3	6	18456	18461	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
26	NC_020061	CG	3	6	19029	19034	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
27	NC_020061	GC	4	8	19135	19142	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
28	NC_020061	CG	3	6	19714	19719	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
29	NC_020061	AG	3	6	21130	21135	50 %	0 %	50 %	0 %	440222481
30	NC_020061	CT	3	6	21513	21518	0 %	50 %	0 %	50 %	440222481
31	NC_020061	TC	3	6	22241	22246	0 %	50 %	0 %	50 %	440222482
32	NC_020061	CA	3	6	22748	22753	50 %	0 %	0 %	50 %	440222482
33	NC_020061	GA	4	8	23753	23760	50 %	0 %	50 %	0 %	440222484
34	NC_020061	CG	3	6	31466	31471	0 %	0 %	50 %	50 %	440222488
35	NC_020061	GC	3	6	31500	31505	0 %	0 %	50 %	50 %	440222488
36	NC_020061	CG	3	6	32619	32624	0 %	0 %	50 %	50 %	440222489
37	NC_020061	GT	3	6	35305	35310	0 %	50 %	50 %	0 %	440222491
38	NC_020061	CG	3	6	35999	36004	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
39	NC_020061	CT	4	8	36057	36064	0 %	50 %	0 %	50 %	440222492
40	NC_020061	GC	3	6	36290	36295	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
41	NC_020061	CG	4	8	36407	36414	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
42	NC_020061	GC	3	6	37472	37477	0 %	0 %	50 %	50 %	440222493
43	NC_020061	GC	3	6	38360	38365	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
44	NC_020061	GC	3	6	40557	40562	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
45	NC_020061	GA	3	6	40681	40686	50 %	0 %	50 %	0 %	440222496
46	NC_020061	CG	3	6	40723	40728	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
47	NC_020061	CG	3	6	40948	40953	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
48	NC_020061	GC	3	6	42273	42278	0 %	0 %	50 %	50 %	440222497
49	NC_020061	GA	3	6	43886	43891	50 %	0 %	50 %	0 %	440222500
50	NC_020061	GA	3	6	44825	44830	50 %	0 %	50 %	0 %	440222501
51	NC_020061	AG	3	6	45296	45301	50 %	0 %	50 %	0 %	440222501
52	NC_020061	GA	3	6	45453	45458	50 %	0 %	50 %	0 %	440222501
53	NC_020061	GT	3	6	46871	46876	0 %	50 %	50 %	0 %	440222502
54	NC_020061	GA	3	6	46925	46930	50 %	0 %	50 %	0 %	440222502
55	NC_020061	GC	4	8	48267	48274	0 %	0 %	50 %	50 %	440222503
56	NC_020061	CG	3	6	48874	48879	0 %	0 %	50 %	50 %	440222504
57	NC_020061	GA	3	6	49363	49368	50 %	0 %	50 %	0 %	440222504
58	NC_020061	GC	3	6	49384	49389	0 %	0 %	50 %	50 %	440222504
59	NC_020061	GC	4	8	49830	49837	0 %	0 %	50 %	50 %	440222504
60	NC_020061	CG	4	8	50178	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
61	NC_020061	CG	4	8	50919	50926	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
62	NC_020061	GC	3	6	51220	51225	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
63	NC_020061	GC	3	6	53106	53111	0 %	0 %	50 %	50 %	440222506
64	NC_020061	GC	3	6	53655	53660	0 %	0 %	50 %	50 %	440222506
65	NC_020061	TC	3	6	53701	53706	0 %	50 %	0 %	50 %	440222506
66	NC_020061	GC	3	6	55859	55864	0 %	0 %	50 %	50 %	440222508
67	NC_020061	AG	3	6	55878	55883	50 %	0 %	50 %	0 %	440222508
68	NC_020061	GC	3	6	56604	56609	0 %	0 %	50 %	50 %	440222508
69	NC_020061	GT	3	6	57320	57325	0 %	50 %	50 %	0 %	440222510
70	NC_020061	GC	3	6	63400	63405	0 %	0 %	50 %	50 %	440222517
71	NC_020061	GC	3	6	64298	64303	0 %	0 %	50 %	50 %	440222518
72	NC_020061	AG	3	6	64372	64377	50 %	0 %	50 %	0 %	440222518
73	NC_020061	CG	3	6	66667	66672	0 %	0 %	50 %	50 %	440222520
74	NC_020061	TC	3	6	66702	66707	0 %	50 %	0 %	50 %	440222520
75	NC_020061	CG	3	6	68026	68031	0 %	0 %	50 %	50 %	440222522
76	NC_020061	CG	4	8	71192	71199	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
77	NC_020061	GC	3	6	71322	71327	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
78	NC_020061	GC	3	6	71333	71338	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
79	NC_020061	GC	3	6	71451	71456	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
80	NC_020061	GC	3	6	71736	71741	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
81	NC_020061	GC	3	6	71782	71787	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
82	NC_020061	GC	5	10	71952	71961	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
83	NC_020061	GC	4	8	72089	72096	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
84	NC_020061	CG	3	6	72648	72653	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
85	NC_020061	GC	3	6	73612	73617	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
86	NC_020061	CG	3	6	73837	73842	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
87	NC_020061	GC	3	6	74415	74420	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
88	NC_020061	CG	3	6	74947	74952	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
89	NC_020061	GC	3	6	75204	75209	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
90	NC_020061	GC	3	6	75256	75261	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
91	NC_020061	GC	6	12	75267	75278	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
92	NC_020061	CG	3	6	75603	75608	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
93	NC_020061	GC	3	6	75618	75623	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
94	NC_020061	CG	3	6	75796	75801	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
95	NC_020061	CT	3	6	75934	75939	0 %	50 %	0 %	50 %	440222531
96	NC_020061	CG	3	6	75976	75981	0 %	0 %	50 %	50 %	440222531
97	NC_020061	CG	3	6	76470	76475	0 %	0 %	50 %	50 %	440222531
98	NC_020061	CG	3	6	76691	76696	0 %	0 %	50 %	50 %	440222531
99	NC_020061	CA	3	6	77020	77025	50 %	0 %	0 %	50 %	440222532
100	NC_020061	GC	3	6	77177	77182	0 %	0 %	50 %	50 %	440222533
101	NC_020061	GC	3	6	77969	77974	0 %	0 %	50 %	50 %	440222533
102	NC_020061	GC	3	6	78137	78142	0 %	0 %	50 %	50 %	440222533
103	NC_020061	GC	3	6	79085	79090	0 %	0 %	50 %	50 %	440222534
104	NC_020061	GC	3	6	79206	79211	0 %	0 %	50 %	50 %	440222534
105	NC_020061	AC	3	6	80758	80763	50 %	0 %	0 %	50 %	440222536
106	NC_020061	GC	3	6	81128	81133	0 %	0 %	50 %	50 %	440222537
107	NC_020061	GC	3	6	86988	86993	0 %	0 %	50 %	50 %	440222540
108	NC_020061	CG	3	6	87011	87016	0 %	0 %	50 %	50 %	440222540
109	NC_020061	GC	3	6	87428	87433	0 %	0 %	50 %	50 %	440222540
110	NC_020061	CG	3	6	87994	87999	0 %	0 %	50 %	50 %	440222540
111	NC_020061	CG	4	8	88094	88101	0 %	0 %	50 %	50 %	440222540
112	NC_020061	GC	3	6	89990	89995	0 %	0 %	50 %	50 %	440222543
113	NC_020061	AC	3	6	90639	90644	50 %	0 %	0 %	50 %	440222544
114	NC_020061	CA	3	6	92552	92557	50 %	0 %	0 %	50 %	440222546
115	NC_020061	CG	3	6	94607	94612	0 %	0 %	50 %	50 %	440222549
116	NC_020061	GA	3	6	94812	94817	50 %	0 %	50 %	0 %	440222549
117	NC_020061	GA	3	6	94902	94907	50 %	0 %	50 %	0 %	440222549
118	NC_020061	CA	3	6	97123	97128	50 %	0 %	0 %	50 %	440222551
119	NC_020061	GA	3	6	97154	97159	50 %	0 %	50 %	0 %	440222551
120	NC_020061	AG	3	6	97966	97971	50 %	0 %	50 %	0 %	440222552
121	NC_020061	AC	3	6	101756	101761	50 %	0 %	0 %	50 %	440222557
122	NC_020061	CG	3	6	101861	101866	0 %	0 %	50 %	50 %	440222557
123	NC_020061	GC	3	6	102126	102131	0 %	0 %	50 %	50 %	440222557
124	NC_020061	TC	3	6	107352	107357	0 %	50 %	0 %	50 %	440222560
125	NC_020061	CT	3	6	107655	107660	0 %	50 %	0 %	50 %	440222560
126	NC_020061	GC	3	6	107835	107840	0 %	0 %	50 %	50 %	440222560
127	NC_020061	GC	3	6	108615	108620	0 %	0 %	50 %	50 %	440222561
128	NC_020061	TA	3	6	109354	109359	50 %	50 %	0 %	0 %	440222563
129	NC_020061	GC	3	6	109375	109380	0 %	0 %	50 %	50 %	440222563
130	NC_020061	AG	3	6	109671	109676	50 %	0 %	50 %	0 %	440222563
131	NC_020061	GC	4	8	114600	114607	0 %	0 %	50 %	50 %	440222567
132	NC_020061	GC	3	6	115614	115619	0 %	0 %	50 %	50 %	440222568
133	NC_020061	CT	3	6	115760	115765	0 %	50 %	0 %	50 %	440222568
134	NC_020061	GC	3	6	116875	116880	0 %	0 %	50 %	50 %	440222568
135	NC_020061	CG	3	6	117432	117437	0 %	0 %	50 %	50 %	440222569
136	NC_020061	CA	3	6	119095	119100	50 %	0 %	0 %	50 %	440222571
137	NC_020061	GC	3	6	119314	119319	0 %	0 %	50 %	50 %	440222571
138	NC_020061	CG	3	6	119570	119575	0 %	0 %	50 %	50 %	440222571
139	NC_020061	CG	3	6	119757	119762	0 %	0 %	50 %	50 %	440222571
140	NC_020061	GC	3	6	120364	120369	0 %	0 %	50 %	50 %	440222572
141	NC_020061	GC	3	6	120746	120751	0 %	0 %	50 %	50 %	440222572
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