MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 1004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020061	GCCG	2	8	1813	1820	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
2	NC_020061	GTTC	2	8	2239	2246	0 %	50 %	25 %	25 %	440222458
3	NC_020061	ATCG	2	8	2322	2329	25 %	25 %	25 %	25 %	440222458
4	NC_020061	AGCG	2	8	2338	2345	25 %	0 %	50 %	25 %	440222458
5	NC_020061	CTGA	2	8	2395	2402	25 %	25 %	25 %	25 %	440222458
6	NC_020061	ACGA	2	8	2421	2428	50 %	0 %	25 %	25 %	440222458
7	NC_020061	CCCT	2	8	3506	3513	0 %	25 %	0 %	75 %	440222460
8	NC_020061	CATG	2	8	3594	3601	25 %	25 %	25 %	25 %	440222460
9	NC_020061	AAGA	2	8	3809	3816	75 %	0 %	25 %	0 %	440222461
10	NC_020061	AAGC	2	8	4036	4043	50 %	0 %	25 %	25 %	440222462
11	NC_020061	GGCC	2	8	4430	4437	0 %	0 %	50 %	50 %	440222463
12	NC_020061	CGTT	2	8	4441	4448	0 %	50 %	25 %	25 %	440222463
13	NC_020061	GAGC	2	8	4556	4563	25 %	0 %	50 %	25 %	440222464
14	NC_020061	GAAA	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	440222464
15	NC_020061	GCGG	2	8	5873	5880	0 %	0 %	75 %	25 %	440222465
16	NC_020061	AGCC	2	8	6396	6403	25 %	0 %	25 %	50 %	440222465
17	NC_020061	TCGA	2	8	6514	6521	25 %	25 %	25 %	25 %	440222466
18	NC_020061	CACC	2	8	6848	6855	25 %	0 %	0 %	75 %	440222467
19	NC_020061	TCAA	2	8	8127	8134	50 %	25 %	0 %	25 %	440222468
20	NC_020061	ATCG	2	8	8351	8358	25 %	25 %	25 %	25 %	440222468
21	NC_020061	TTGA	2	8	8366	8373	25 %	50 %	25 %	0 %	440222468
22	NC_020061	CGGC	2	8	8745	8752	0 %	0 %	50 %	50 %	440222469
23	NC_020061	CGAG	2	8	9354	9361	25 %	0 %	50 %	25 %	440222469
24	NC_020061	GTCC	2	8	9813	9820	0 %	25 %	25 %	50 %	440222470
25	NC_020061	GCTC	2	8	10484	10491	0 %	25 %	25 %	50 %	440222471
26	NC_020061	TCGT	2	8	11849	11856	0 %	50 %	25 %	25 %	440222472
27	NC_020061	TGCC	2	8	12132	12139	0 %	25 %	25 %	50 %	440222473
28	NC_020061	ACCA	2	8	12179	12186	50 %	0 %	0 %	50 %	440222473
29	NC_020061	CCGA	2	8	12904	12911	25 %	0 %	25 %	50 %	440222474
30	NC_020061	CGGC	2	8	12936	12943	0 %	0 %	50 %	50 %	440222474
31	NC_020061	CGGT	2	8	13019	13026	0 %	25 %	50 %	25 %	440222474
32	NC_020061	CACG	2	8	14915	14922	25 %	0 %	25 %	50 %	440222476
33	NC_020061	GATA	2	8	15397	15404	50 %	25 %	25 %	0 %	440222477
34	NC_020061	CTGC	2	8	15578	15585	0 %	25 %	25 %	50 %	440222477
35	NC_020061	CACC	2	8	15811	15818	25 %	0 %	0 %	75 %	440222477
36	NC_020061	GATA	2	8	15910	15917	50 %	25 %	25 %	0 %	440222477
37	NC_020061	TTCG	2	8	16247	16254	0 %	50 %	25 %	25 %	440222477
38	NC_020061	GCCT	2	8	16302	16309	0 %	25 %	25 %	50 %	440222477
39	NC_020061	AGGT	2	8	16314	16321	25 %	25 %	50 %	0 %	440222477
40	NC_020061	CCGA	2	8	16757	16764	25 %	0 %	25 %	50 %	440222478
41	NC_020061	TCGC	2	8	16922	16929	0 %	25 %	25 %	50 %	440222478
42	NC_020061	TCGA	2	8	17627	17634	25 %	25 %	25 %	25 %	440222478
43	NC_020061	TGGC	2	8	19530	19537	0 %	25 %	50 %	25 %	440222479
44	NC_020061	CACC	2	8	19664	19671	25 %	0 %	0 %	75 %	440222479
45	NC_020061	GCCT	2	8	19800	19807	0 %	25 %	25 %	50 %	440222479
46	NC_020061	TCAA	2	8	20014	20021	50 %	25 %	0 %	25 %	440222480
47	NC_020061	GCAG	2	8	20426	20433	25 %	0 %	50 %	25 %	440222480
48	NC_020061	GATG	2	8	20479	20486	25 %	25 %	50 %	0 %	440222480
49	NC_020061	GAAC	2	8	20537	20544	50 %	0 %	25 %	25 %	440222480
50	NC_020061	CCGA	2	8	21158	21165	25 %	0 %	25 %	50 %	440222481
51	NC_020061	AGCG	2	8	21503	21510	25 %	0 %	50 %	25 %	440222481
52	NC_020061	GTTC	2	8	21991	21998	0 %	50 %	25 %	25 %	440222481
53	NC_020061	GGCG	2	8	22496	22503	0 %	0 %	75 %	25 %	440222482
54	NC_020061	CGGT	2	8	23024	23031	0 %	25 %	50 %	25 %	440222483
55	NC_020061	CAGG	2	8	23192	23199	25 %	0 %	50 %	25 %	440222484
56	NC_020061	CGGC	2	8	23507	23514	0 %	0 %	50 %	50 %	440222484
57	NC_020061	GGCA	2	8	23842	23849	25 %	0 %	50 %	25 %	440222484
58	NC_020061	AGGT	2	8	23965	23972	25 %	25 %	50 %	0 %	440222484
59	NC_020061	TTGG	2	8	25061	25068	0 %	50 %	50 %	0 %	440222485
60	NC_020061	GTCG	2	8	25682	25689	0 %	25 %	50 %	25 %	440222486
61	NC_020061	GCCT	2	8	26163	26170	0 %	25 %	25 %	50 %	440222487
62	NC_020061	CGCT	2	8	26175	26182	0 %	25 %	25 %	50 %	440222487
63	NC_020061	GACC	2	8	31178	31185	25 %	0 %	25 %	50 %	440222488
64	NC_020061	CAGC	2	8	32640	32647	25 %	0 %	25 %	50 %	440222489
65	NC_020061	AGCG	2	8	34838	34845	25 %	0 %	50 %	25 %	440222491
66	NC_020061	TCAG	2	8	34921	34928	25 %	25 %	25 %	25 %	440222491
67	NC_020061	CCTG	2	8	34973	34980	0 %	25 %	25 %	50 %	440222491
68	NC_020061	GATC	2	8	35240	35247	25 %	25 %	25 %	25 %	440222491
69	NC_020061	GCCG	2	8	35339	35346	0 %	0 %	50 %	50 %	440222491
70	NC_020061	TGCC	2	8	35928	35935	0 %	25 %	25 %	50 %	440222492
71	NC_020061	GCGG	2	8	36439	36446	0 %	0 %	75 %	25 %	440222492
72	NC_020061	GCGA	2	8	36599	36606	25 %	0 %	50 %	25 %	440222492
73	NC_020061	GCCG	2	8	38476	38483	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
74	NC_020061	GGCC	2	8	38769	38776	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
75	NC_020061	CGGC	2	8	39003	39010	0 %	0 %	50 %	50 %	440222495
76	NC_020061	CGGC	2	8	39687	39694	0 %	0 %	50 %	50 %	440222495
77	NC_020061	GCCG	2	8	40542	40549	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
78	NC_020061	GCCC	2	8	41195	41202	0 %	0 %	25 %	75 %	440222497
79	NC_020061	ATCG	2	8	41432	41439	25 %	25 %	25 %	25 %	440222497
80	NC_020061	GGGC	2	8	41703	41710	0 %	0 %	75 %	25 %	440222497
81	NC_020061	ATGA	2	8	42718	42725	50 %	25 %	25 %	0 %	440222498
82	NC_020061	GAAA	2	8	44519	44526	75 %	0 %	25 %	0 %	440222500
83	NC_020061	CCGG	2	8	45110	45117	0 %	0 %	50 %	50 %	440222501
84	NC_020061	GCTG	2	8	45213	45220	0 %	25 %	50 %	25 %	440222501
85	NC_020061	ATCG	2	8	45541	45548	25 %	25 %	25 %	25 %	440222501
86	NC_020061	ATGC	2	8	46233	46240	25 %	25 %	25 %	25 %	440222502
87	NC_020061	AGGC	2	8	46540	46547	25 %	0 %	50 %	25 %	440222502
88	NC_020061	TGCG	2	8	47845	47852	0 %	25 %	50 %	25 %	440222503
89	NC_020061	GCGA	2	8	47874	47881	25 %	0 %	50 %	25 %	440222503
90	NC_020061	GCGG	2	8	48182	48189	0 %	0 %	75 %	25 %	440222503
91	NC_020061	GGGA	2	8	49015	49022	25 %	0 %	75 %	0 %	440222504
92	NC_020061	CGAT	2	8	49633	49640	25 %	25 %	25 %	25 %	440222504
93	NC_020061	CGGT	2	8	50258	50265	0 %	25 %	50 %	25 %	440222505
94	NC_020061	CGCA	2	8	51271	51278	25 %	0 %	25 %	50 %	440222505
95	NC_020061	CTTT	2	8	52853	52860	0 %	75 %	0 %	25 %	440222506
96	NC_020061	TCGG	2	8	53643	53650	0 %	25 %	50 %	25 %	440222506
97	NC_020061	AGGC	2	8	54354	54361	25 %	0 %	50 %	25 %	440222507
98	NC_020061	GCGG	2	8	57522	57529	0 %	0 %	75 %	25 %	440222510
99	NC_020061	CGCA	2	8	57660	57667	25 %	0 %	25 %	50 %	440222510
100	NC_020061	GGCC	2	8	60612	60619	0 %	0 %	50 %	50 %	440222512
101	NC_020061	CGGG	2	8	60932	60939	0 %	0 %	75 %	25 %	440222513
102	NC_020061	AGGT	2	8	62777	62784	25 %	25 %	50 %	0 %	440222516
103	NC_020061	GCCC	2	8	63064	63071	0 %	0 %	25 %	75 %	440222516
104	NC_020061	CCAA	2	8	63510	63517	50 %	0 %	0 %	50 %	440222517
105	NC_020061	ATCG	2	8	63833	63840	25 %	25 %	25 %	25 %	440222518
106	NC_020061	GCTG	2	8	63868	63875	0 %	25 %	50 %	25 %	440222518
107	NC_020061	ACTG	2	8	64004	64011	25 %	25 %	25 %	25 %	440222518
108	NC_020061	AACC	2	8	64591	64598	50 %	0 %	0 %	50 %	440222518
109	NC_020061	TCCA	2	8	64725	64732	25 %	25 %	0 %	50 %	440222518
110	NC_020061	TCTG	2	8	66372	66379	0 %	50 %	25 %	25 %	440222520
111	NC_020061	CCGA	2	8	67990	67997	25 %	0 %	25 %	50 %	440222522
112	NC_020061	AGCG	2	8	68407	68414	25 %	0 %	50 %	25 %	440222522
113	NC_020061	GATG	2	8	68576	68583	25 %	25 %	50 %	0 %	440222522
114	NC_020061	CGTT	2	8	68829	68836	0 %	50 %	25 %	25 %	440222523
115	NC_020061	CGGA	2	8	69533	69540	25 %	0 %	50 %	25 %	440222524
116	NC_020061	ATCC	2	8	69771	69778	25 %	25 %	0 %	50 %	440222525
117	NC_020061	GTCG	2	8	70318	70325	0 %	25 %	50 %	25 %	440222526
118	NC_020061	CAGC	2	8	70392	70399	25 %	0 %	25 %	50 %	440222526
119	NC_020061	GGCC	2	8	71016	71023	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
120	NC_020061	GGCG	2	8	71906	71913	0 %	0 %	75 %	25 %	440222528
121	NC_020061	CATC	2	8	71981	71988	25 %	25 %	0 %	50 %	440222528
122	NC_020061	TTGC	2	8	72111	72118	0 %	50 %	25 %	25 %	440222528
123	NC_020061	GGCC	2	8	72435	72442	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
124	NC_020061	GACG	2	8	73215	73222	25 %	0 %	50 %	25 %	440222528
125	NC_020061	GCGT	2	8	73496	73503	0 %	25 %	50 %	25 %	440222529
126	NC_020061	CTGC	2	8	73956	73963	0 %	25 %	25 %	50 %	440222529
127	NC_020061	CAGA	2	8	74233	74240	50 %	0 %	25 %	25 %	440222529
128	NC_020061	CCGG	2	8	74793	74800	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
129	NC_020061	ATGC	2	8	74977	74984	25 %	25 %	25 %	25 %	440222530
130	NC_020061	CCAG	2	8	75765	75772	25 %	0 %	25 %	50 %	440222530
131	NC_020061	TGCA	2	8	76159	76166	25 %	25 %	25 %	25 %	440222531
132	NC_020061	GCGA	2	8	76255	76262	25 %	0 %	50 %	25 %	440222531
133	NC_020061	GGCT	2	8	76852	76859	0 %	25 %	50 %	25 %	440222532
134	NC_020061	CTGG	2	8	76909	76916	0 %	25 %	50 %	25 %	440222532
135	NC_020061	GCTG	2	8	77759	77766	0 %	25 %	50 %	25 %	440222533
136	NC_020061	ACGC	2	8	78748	78755	25 %	0 %	25 %	50 %	440222534
137	NC_020061	GGAT	2	8	78856	78863	25 %	25 %	50 %	0 %	440222534
138	NC_020061	CACC	2	8	79519	79526	25 %	0 %	0 %	75 %	440222534
139	NC_020061	ACCT	2	8	80507	80514	25 %	25 %	0 %	50 %	440222535
140	NC_020061	CGAA	2	8	80733	80740	50 %	0 %	25 %	25 %	440222536
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