MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020061	CAT	2	6	104396	104401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222559
1502	NC_020061	CGG	2	6	107001	107006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222560
1503	NC_020061	CCT	2	6	107024	107029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222560
1504	NC_020061	AGT	2	6	107113	107118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222560
1505	NC_020061	TGC	2	6	107164	107169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222560
1506	NC_020061	CGTT	2	8	107197	107204	0 %	50 %	25 %	25 %	440222560
1507	NC_020061	CGG	2	6	107217	107222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222560
1508	NC_020061	ACG	3	9	107242	107250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222560
1509	NC_020061	TC	3	6	107352	107357	0 %	50 %	0 %	50 %	440222560
1510	NC_020061	CAT	2	6	107414	107419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222560
1511	NC_020061	CGC	2	6	107486	107491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222560
1512	NC_020061	ATC	2	6	107502	107507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222560
1513	NC_020061	CAG	2	6	107543	107548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222560
1514	NC_020061	CGCGC	2	10	107557	107566	0 %	0 %	40 %	60 %	440222560
1515	NC_020061	CGA	2	6	107626	107631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222560
1516	NC_020061	GGGC	2	8	107639	107646	0 %	0 %	75 %	25 %	440222560
1517	NC_020061	CT	3	6	107655	107660	0 %	50 %	0 %	50 %	440222560
1518	NC_020061	AAT	2	6	107664	107669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222560
1519	NC_020061	GAGCA	2	10	107685	107694	40 %	0 %	40 %	20 %	440222560
1520	NC_020061	GAA	2	6	107775	107780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222560
1521	NC_020061	CCG	2	6	107798	107803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222560
1522	NC_020061	TGGC	3	12	107810	107821	0 %	25 %	50 %	25 %	440222560
1523	NC_020061	TGC	2	6	107831	107836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222560
1524	NC_020061	GC	3	6	107835	107840	0 %	0 %	50 %	50 %	440222560
1525	NC_020061	CGC	3	9	107838	107846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222560
1526	NC_020061	TCA	2	6	107864	107869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222560
1527	NC_020061	AGA	2	6	107887	107892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222560
1528	NC_020061	ATC	2	6	108057	108062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222561
1529	NC_020061	ATG	2	6	108105	108110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222561
1530	NC_020061	GGC	2	6	108135	108140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222561
1531	NC_020061	TGCG	2	8	108148	108155	0 %	25 %	50 %	25 %	440222561
1532	NC_020061	ACA	2	6	108189	108194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222561
1533	NC_020061	CCA	2	6	108367	108372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222561
1534	NC_020061	TGA	2	6	108394	108399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222561
1535	NC_020061	GCG	2	6	108401	108406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222561
1536	NC_020061	GC	3	6	108615	108620	0 %	0 %	50 %	50 %	440222561
1537	NC_020061	ATCG	2	8	108956	108963	25 %	25 %	25 %	25 %	440222562
1538	NC_020061	T	6	6	109006	109011	0 %	100 %	0 %	0 %	440222562
1539	NC_020061	AAG	2	6	109047	109052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222562
1540	NC_020061	CGG	2	6	109103	109108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222562
1541	NC_020061	TTG	2	6	109281	109286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222563
1542	NC_020061	CGC	2	6	109324	109329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222563
1543	NC_020061	TA	3	6	109354	109359	50 %	50 %	0 %	0 %	440222563
1544	NC_020061	GC	3	6	109375	109380	0 %	0 %	50 %	50 %	440222563
1545	NC_020061	CCGAAA	2	12	109437	109448	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440222563
1546	NC_020061	GCCC	2	8	109504	109511	0 %	0 %	25 %	75 %	440222563
1547	NC_020061	GGT	2	6	109519	109524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222563
1548	NC_020061	AG	3	6	109671	109676	50 %	0 %	50 %	0 %	440222563
1549	NC_020061	CCA	2	6	109824	109829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222563
1550	NC_020061	GAA	2	6	109903	109908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222563
1551	NC_020061	CGA	2	6	110424	110429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1552	NC_020061	ATG	2	6	110431	110436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222564
1553	NC_020061	TGC	2	6	110477	110482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1554	NC_020061	GAT	2	6	110487	110492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222564
1555	NC_020061	TGC	2	6	110499	110504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1556	NC_020061	GAA	2	6	110559	110564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222564
1557	NC_020061	CGGG	2	8	110617	110624	0 %	0 %	75 %	25 %	440222564
1558	NC_020061	GCCGC	2	10	110685	110694	0 %	0 %	40 %	60 %	440222564
1559	NC_020061	CGG	2	6	110714	110719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222564
1560	NC_020061	AGG	2	6	110726	110731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222564
1561	NC_020061	TGA	2	6	110763	110768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222564
1562	NC_020061	GAG	2	6	110827	110832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222564
1563	NC_020061	ACCT	2	8	110905	110912	25 %	25 %	0 %	50 %	440222564
1564	NC_020061	GGT	2	6	110926	110931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222564
1565	NC_020061	ATC	2	6	110953	110958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222564
1566	NC_020061	CCGAGG	2	12	111017	111028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440222564
1567	NC_020061	TTC	2	6	111044	111049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222564
1568	NC_020061	GCG	2	6	111074	111079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222564
1569	NC_020061	TCG	2	6	111086	111091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1570	NC_020061	AGC	2	6	111377	111382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1571	NC_020061	GCG	2	6	111438	111443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222564
1572	NC_020061	GTC	2	6	111451	111456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1573	NC_020061	ACG	3	9	111470	111478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1574	NC_020061	GCT	3	9	111501	111509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1575	NC_020061	GAT	2	6	111580	111585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222564
1576	NC_020061	TCA	2	6	111590	111595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222564
1577	NC_020061	CAG	2	6	111602	111607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222564
1578	NC_020061	ACC	2	6	111996	112001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222565
1579	NC_020061	CAT	2	6	112042	112047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222565
1580	NC_020061	AACA	2	8	112095	112102	75 %	0 %	0 %	25 %	440222565
1581	NC_020061	CTTT	2	8	112114	112121	0 %	75 %	0 %	25 %	440222565
1582	NC_020061	A	6	6	112150	112155	100 %	0 %	0 %	0 %	440222565
1583	NC_020061	ACTC	2	8	112157	112164	25 %	25 %	0 %	50 %	440222565
1584	NC_020061	GTT	2	6	112265	112270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222565
1585	NC_020061	CAA	2	6	112406	112411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222565
1586	NC_020061	GGC	2	6	113252	113257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222566
1587	NC_020061	GCC	2	6	113261	113266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222566
1588	NC_020061	TGG	2	6	113313	113318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222566
1589	NC_020061	AAGCC	2	10	113328	113337	40 %	0 %	20 %	40 %	440222566
1590	NC_020061	CGG	2	6	113363	113368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222566
1591	NC_020061	CTT	2	6	114118	114123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222567
1592	NC_020061	CGC	3	9	114168	114176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222567
1593	NC_020061	GCA	2	6	114192	114197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1594	NC_020061	CTG	2	6	114220	114225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1595	NC_020061	CAG	2	6	114268	114273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1596	NC_020061	CTG	2	6	114297	114302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1597	NC_020061	CGC	2	6	114368	114373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222567
1598	NC_020061	GCG	2	6	114386	114391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222567
1599	NC_020061	ACG	2	6	114446	114451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1600	NC_020061	CGC	2	6	114465	114470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222567
1601	NC_020061	CGTC	2	8	114497	114504	0 %	25 %	25 %	50 %	440222567
1602	NC_020061	GCC	2	6	114517	114522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222567
1603	NC_020061	CGC	2	6	114544	114549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222567
1604	NC_020061	TTG	2	6	114556	114561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222567
1605	NC_020061	ACC	2	6	114579	114584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222567
1606	NC_020061	GC	4	8	114600	114607	0 %	0 %	50 %	50 %	440222567
1607	NC_020061	GAT	2	6	114609	114614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222567
1608	NC_020061	ACA	2	6	114623	114628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222567
1609	NC_020061	C	6	6	114731	114736	0 %	0 %	0 %	100 %	440222567
1610	NC_020061	TGG	2	6	114764	114769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222567
1611	NC_020061	TGA	2	6	114801	114806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222567
1612	NC_020061	CGC	2	6	114870	114875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222567
1613	NC_020061	CGA	2	6	115008	115013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1614	NC_020061	CTC	2	6	115021	115026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222567
1615	NC_020061	ATC	2	6	115028	115033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222567
1616	NC_020061	TCG	2	6	115053	115058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1617	NC_020061	CGCC	2	8	115068	115075	0 %	0 %	25 %	75 %	440222567
1618	NC_020061	GCA	2	6	115125	115130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222567
1619	NC_020061	TTG	2	6	115208	115213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222567
1620	NC_020061	CGC	2	6	115588	115593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222568
1621	NC_020061	GC	3	6	115614	115619	0 %	0 %	50 %	50 %	440222568
1622	NC_020061	GCGT	2	8	115633	115640	0 %	25 %	50 %	25 %	440222568
1623	NC_020061	GTCG	2	8	115672	115679	0 %	25 %	50 %	25 %	440222568
1624	NC_020061	TTC	3	9	115688	115696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222568
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1630	NC_020061	TCG	2	6	115952	115957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222568
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1634	NC_020061	CGC	2	6	116334	116339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222568
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1652	NC_020061	CTG	2	6	117438	117443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222569
1653	NC_020061	TCG	3	9	117469	117477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222569
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1728	NC_020061	GCA	2	6	120623	120628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222572
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1731	NC_020061	GC	3	6	120746	120751	0 %	0 %	50 %	50 %	440222572
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1734	NC_020061	CAA	2	6	121052	121057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222572
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1737	NC_020061	GGAA	2	8	123468	123475	50 %	0 %	50 %	0 %	440222573
1738	NC_020061	TCGG	2	8	123520	123527	0 %	25 %	50 %	25 %	440222573
1739	NC_020061	GGC	2	6	123860	123865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222574
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1741	NC_020061	TCA	2	6	123931	123936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222574
1742	NC_020061	CGT	2	6	123947	123952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222574
1743	NC_020061	ACC	2	6	124125	124130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222574
1744	NC_020061	GCG	2	6	124139	124144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222574
1745	NC_020061	CCAG	2	8	124170	124177	25 %	0 %	25 %	50 %	440222574
1746	NC_020061	CGC	2	6	124215	124220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222574
1747	NC_020061	CAG	2	6	124280	124285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222574
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1749	NC_020061	TGCAT	2	10	124350	124359	20 %	40 %	20 %	20 %	440222574
1750	NC_020061	AGA	2	6	124420	124425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222574
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1752	NC_020061	CCG	2	6	124716	124721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222575
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1760	NC_020061	CGA	2	6	124940	124945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222575
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1762	NC_020061	ACG	2	6	125098	125103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222575
1763	NC_020061	TGCT	2	8	125115	125122	0 %	50 %	25 %	25 %	440222575
1764	NC_020061	ACAG	2	8	125237	125244	50 %	0 %	25 %	25 %	440222575
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1769	NC_020061	CGT	2	6	126388	126393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222576
1770	NC_020061	GCAG	2	8	126402	126409	25 %	0 %	50 %	25 %	440222576
1771	NC_020061	CG	4	8	126438	126445	0 %	0 %	50 %	50 %	440222576
1772	NC_020061	CAT	2	6	126463	126468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222576
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1774	NC_020061	CG	3	6	126523	126528	0 %	0 %	50 %	50 %	440222576
1775	NC_020061	GTC	2	6	126568	126573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222576
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1780	NC_020061	CGC	2	6	126751	126756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222576
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1842	NC_020061	CGG	2	6	129394	129399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222578
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1845	NC_020061	ATCG	2	8	129584	129591	25 %	25 %	25 %	25 %	440222578
1846	NC_020061	ACG	2	6	129635	129640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222578
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1848	NC_020061	ATTGGC	2	12	129743	129754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440222578
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1850	NC_020061	CGGT	2	8	130423	130430	0 %	25 %	50 %	25 %	440222579
1851	NC_020061	GCCA	2	8	130499	130506	25 %	0 %	25 %	50 %	440222579
1852	NC_020061	AGC	2	6	130516	130521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222579
1853	NC_020061	CTT	2	6	131133	131138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222580
1854	NC_020061	CGA	2	6	131168	131173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222580
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1856	NC_020061	G	6	6	131194	131199	0 %	0 %	100 %	0 %	440222580
1857	NC_020061	TTC	2	6	131227	131232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222580
1858	NC_020061	GCTG	2	8	131260	131267	0 %	25 %	50 %	25 %	440222580
1859	NC_020061	GATC	2	8	131285	131292	25 %	25 %	25 %	25 %	440222580
1860	NC_020061	GCG	2	6	131325	131330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222580
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1862	NC_020061	CG	3	6	131380	131385	0 %	0 %	50 %	50 %	440222580
1863	NC_020061	GCG	2	6	131412	131417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222580
1864	NC_020061	TCTCG	2	10	131423	131432	0 %	40 %	20 %	40 %	440222580
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1866	NC_020061	GC	3	6	131551	131556	0 %	0 %	50 %	50 %	440222580
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1969	NC_020061	CGGC	2	8	140352	140359	0 %	0 %	50 %	50 %	440222586
1970	NC_020061	GCA	2	6	140397	140402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222586
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1979	NC_020061	CAG	2	6	140830	140835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222586
1980	NC_020061	GCGG	2	8	140865	140872	0 %	0 %	75 %	25 %	440222586
1981	NC_020061	CGG	3	9	140895	140903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222586
1982	NC_020061	GCG	2	6	140914	140919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222586
1983	NC_020061	GAT	2	6	141034	141039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222586
1984	NC_020061	GCA	2	6	141041	141046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222586
1985	NC_020061	CCG	2	6	141053	141058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222586
1986	NC_020061	CG	3	6	141066	141071	0 %	0 %	50 %	50 %	440222586
1987	NC_020061	GTCG	2	8	141106	141113	0 %	25 %	50 %	25 %	440222586
1988	NC_020061	AGA	2	6	141174	141179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222586
1989	NC_020061	TAT	2	6	141247	141252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222586
1990	NC_020061	AT	3	6	141251	141256	50 %	50 %	0 %	0 %	440222586
1991	NC_020061	GC	3	6	141260	141265	0 %	0 %	50 %	50 %	440222586
1992	NC_020061	TGC	2	6	141346	141351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222586
1993	NC_020061	CGA	2	6	141378	141383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222586
1994	NC_020061	CCG	2	6	141386	141391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222586
1995	NC_020061	GCC	2	6	141434	141439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222586
1996	NC_020061	T	6	6	141468	141473	0 %	100 %	0 %	0 %	440222586
1997	NC_020061	GAG	2	6	141532	141537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222587
1998	NC_020061	GCA	2	6	141545	141550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222587
1999	NC_020061	CTGC	2	8	141625	141632	0 %	25 %	25 %	50 %	440222587
2000	NC_020061	TCGA	2	8	141757	141764	25 %	25 %	25 %	25 %	440222587

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