MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020061	GCCG	2	8	35339	35346	0 %	0 %	50 %	50 %	440222491
502	NC_020061	GAC	2	6	35364	35369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222491
503	NC_020061	GAA	2	6	35448	35453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222491
504	NC_020061	ATC	2	6	35475	35480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222491
505	NC_020061	TCT	2	6	35574	35579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222491
506	NC_020061	ATG	2	6	35602	35607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222491
507	NC_020061	CTG	2	6	35691	35696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222491
508	NC_020061	AGG	3	9	35713	35721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222491
509	NC_020061	GCC	2	6	35772	35777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222491
510	NC_020061	GGC	2	6	35792	35797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222491
511	NC_020061	TGCC	2	8	35928	35935	0 %	25 %	25 %	50 %	440222492
512	NC_020061	CG	3	6	35999	36004	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
513	NC_020061	CGG	2	6	36022	36027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222492
514	NC_020061	GCA	2	6	36034	36039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222492
515	NC_020061	CT	4	8	36057	36064	0 %	50 %	0 %	50 %	440222492
516	NC_020061	TCA	2	6	36192	36197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222492
517	NC_020061	GC	3	6	36290	36295	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
518	NC_020061	CG	4	8	36407	36414	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
519	NC_020061	GCGG	2	8	36439	36446	0 %	0 %	75 %	25 %	440222492
520	NC_020061	TGG	2	6	36546	36551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222492
521	NC_020061	GCGA	2	8	36599	36606	25 %	0 %	50 %	25 %	440222492
522	NC_020061	ACG	2	6	36656	36661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222492
523	NC_020061	CGA	2	6	36772	36777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222492
524	NC_020061	CGT	2	6	36802	36807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222492
525	NC_020061	GGC	2	6	36880	36885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222493
526	NC_020061	CTG	2	6	36886	36891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222493
527	NC_020061	TCG	2	6	36911	36916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222493
528	NC_020061	CTT	2	6	37009	37014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222493
529	NC_020061	TGC	2	6	37097	37102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222493
530	NC_020061	CAA	2	6	37113	37118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222493
531	NC_020061	GCC	2	6	37119	37124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222493
532	NC_020061	ATC	2	6	37162	37167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222493
533	NC_020061	GGC	2	6	37173	37178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222493
534	NC_020061	GGC	2	6	37246	37251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222493
535	NC_020061	TCA	2	6	37256	37261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222493
536	NC_020061	GCG	2	6	37279	37284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222493
537	NC_020061	GCT	2	6	37291	37296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222493
538	NC_020061	TGG	2	6	37301	37306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222493
539	NC_020061	CTT	2	6	37320	37325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222493
540	NC_020061	GGC	2	6	37428	37433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222493
541	NC_020061	TGG	2	6	37451	37456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222493
542	NC_020061	GC	3	6	37472	37477	0 %	0 %	50 %	50 %	440222493
543	NC_020061	TGG	2	6	37505	37510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222493
544	NC_020061	GGC	2	6	37540	37545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222493
545	NC_020061	TCG	2	6	37568	37573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222493
546	NC_020061	CGG	3	9	37632	37640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222493
547	NC_020061	GCA	2	6	37666	37671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222493
548	NC_020061	CGT	2	6	37741	37746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222494
549	NC_020061	ACC	2	6	37748	37753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222494
550	NC_020061	ATC	3	9	37755	37763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222494
551	NC_020061	GCC	2	6	37949	37954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222494
552	NC_020061	TGC	2	6	37975	37980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222494
553	NC_020061	CTG	2	6	38030	38035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222494
554	NC_020061	GGC	2	6	38047	38052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222494
555	NC_020061	CGC	2	6	38122	38127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222494
556	NC_020061	TTC	2	6	38132	38137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222494
557	NC_020061	GCC	2	6	38203	38208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222494
558	NC_020061	GTG	3	9	38273	38281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222494
559	NC_020061	GAC	2	6	38305	38310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222494
560	NC_020061	GC	3	6	38360	38365	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
561	NC_020061	ATC	2	6	38366	38371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222494
562	NC_020061	TCA	2	6	38421	38426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222494
563	NC_020061	GCCG	2	8	38476	38483	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
564	NC_020061	TCA	4	12	38517	38528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222494
565	NC_020061	CGG	2	6	38530	38535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222494
566	NC_020061	GCC	2	6	38567	38572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222494
567	NC_020061	TCG	2	6	38577	38582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222494
568	NC_020061	GGCC	2	8	38769	38776	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
569	NC_020061	GCC	2	6	38945	38950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222495
570	NC_020061	CGGC	2	8	39003	39010	0 %	0 %	50 %	50 %	440222495
571	NC_020061	GGT	2	6	39026	39031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222495
572	NC_020061	TCA	2	6	39051	39056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222495
573	NC_020061	GGC	2	6	39068	39073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222495
574	NC_020061	GCC	2	6	39173	39178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222495
575	NC_020061	GCT	3	9	39310	39318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222495
576	NC_020061	CGG	2	6	39370	39375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222495
577	NC_020061	AAG	2	6	39395	39400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222495
578	NC_020061	TCG	2	6	39402	39407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222495
579	NC_020061	GCA	2	6	39487	39492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222495
580	NC_020061	CCG	2	6	39544	39549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222495
581	NC_020061	CGT	2	6	39565	39570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222495
582	NC_020061	ATC	2	6	39644	39649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222495
583	NC_020061	CGGC	2	8	39687	39694	0 %	0 %	50 %	50 %	440222495
584	NC_020061	CGC	2	6	39697	39702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222495
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586	NC_020061	CGA	2	6	39919	39924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222495
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588	NC_020061	CAG	2	6	40052	40057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222495
589	NC_020061	AAG	2	6	40067	40072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222495
590	NC_020061	CGT	2	6	40078	40083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222495
591	NC_020061	GATTG	2	10	40088	40097	20 %	40 %	40 %	0 %	440222495
592	NC_020061	ATC	2	6	40124	40129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222495
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594	NC_020061	GCT	2	6	40413	40418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222496
595	NC_020061	GAC	3	9	40440	40448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222496
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597	NC_020061	CCG	2	6	40496	40501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222496
598	NC_020061	GCG	2	6	40502	40507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222496
599	NC_020061	CAC	2	6	40530	40535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222496
600	NC_020061	GCCG	2	8	40542	40549	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
601	NC_020061	GC	3	6	40557	40562	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
602	NC_020061	CGG	2	6	40632	40637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222496
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604	NC_020061	GA	3	6	40681	40686	50 %	0 %	50 %	0 %	440222496
605	NC_020061	CG	3	6	40723	40728	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
606	NC_020061	GGC	2	6	40764	40769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222496
607	NC_020061	CGA	2	6	40812	40817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222496
608	NC_020061	TCG	2	6	40841	40846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222496
609	NC_020061	GCG	2	6	40869	40874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222496
610	NC_020061	CG	3	6	40948	40953	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
611	NC_020061	CGA	2	6	41013	41018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222496
612	NC_020061	CAA	2	6	41072	41077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222496
613	NC_020061	CAT	2	6	41123	41128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222497
614	NC_020061	CGG	2	6	41173	41178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222497
615	NC_020061	GCCC	2	8	41195	41202	0 %	0 %	25 %	75 %	440222497
616	NC_020061	TCA	2	6	41206	41211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222497
617	NC_020061	CCG	2	6	41240	41245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222497
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619	NC_020061	CGG	3	9	41419	41427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222497
620	NC_020061	ATCG	2	8	41432	41439	25 %	25 %	25 %	25 %	440222497
621	NC_020061	GTC	2	6	41466	41471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222497
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624	NC_020061	TCC	2	6	41649	41654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222497
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626	NC_020061	GGGC	2	8	41703	41710	0 %	0 %	75 %	25 %	440222497
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751	NC_020061	TCG	2	6	49411	49416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222504
752	NC_020061	CGA	2	6	49421	49426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222504
753	NC_020061	CAA	2	6	49484	49489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222504
754	NC_020061	CAC	2	6	49511	49516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222504
755	NC_020061	CGG	2	6	49601	49606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222504
756	NC_020061	ATC	2	6	49620	49625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222504
757	NC_020061	CGAT	2	8	49633	49640	25 %	25 %	25 %	25 %	440222504
758	NC_020061	CGA	2	6	49664	49669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222504
759	NC_020061	CCG	2	6	49726	49731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222504
760	NC_020061	GCT	2	6	49796	49801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222504
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766	NC_020061	CGCGC	2	10	50163	50172	0 %	0 %	40 %	60 %	440222505
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772	NC_020061	CAT	2	6	50406	50411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222505
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782	NC_020061	TGC	2	6	50898	50903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222505
783	NC_020061	CG	4	8	50919	50926	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
784	NC_020061	T	6	6	50974	50979	0 %	100 %	0 %	0 %	440222505
785	NC_020061	GCT	2	6	51066	51071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222505
786	NC_020061	GGGCG	2	10	51077	51086	0 %	0 %	80 %	20 %	440222505
787	NC_020061	ATC	2	6	51088	51093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222505
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790	NC_020061	GGT	2	6	51214	51219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222505
791	NC_020061	GC	3	6	51220	51225	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
792	NC_020061	CGCA	2	8	51271	51278	25 %	0 %	25 %	50 %	440222505
793	NC_020061	GGAATG	2	12	52818	52829	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	440222506
794	NC_020061	CTTT	2	8	52853	52860	0 %	75 %	0 %	25 %	440222506
795	NC_020061	GCC	2	6	52912	52917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222506
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802	NC_020061	TTA	2	6	53099	53104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222506
803	NC_020061	GC	3	6	53106	53111	0 %	0 %	50 %	50 %	440222506
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815	NC_020061	CTTCA	2	10	53523	53532	20 %	40 %	0 %	40 %	440222506
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860	NC_020061	GCGG	2	8	57522	57529	0 %	0 %	75 %	25 %	440222510
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864	NC_020061	CGCA	2	8	57660	57667	25 %	0 %	25 %	50 %	440222510
865	NC_020061	TGA	2	6	57920	57925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222510
866	NC_020061	TGG	2	6	57947	57952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222510
867	NC_020061	ATC	2	6	57996	58001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222510
868	NC_020061	AAG	2	6	58036	58041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222510
869	NC_020061	GGC	2	6	58119	58124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222510
870	NC_020061	GGT	2	6	58239	58244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222510
871	NC_020061	CAC	2	6	58249	58254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222510
872	NC_020061	GGC	2	6	58290	58295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222510
873	NC_020061	CCATG	2	10	60283	60292	20 %	20 %	20 %	40 %	440222511
874	NC_020061	TGAAGA	2	12	60310	60321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440222511
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876	NC_020061	ATC	2	6	60416	60421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222511
877	NC_020061	GGCC	2	8	60612	60619	0 %	0 %	50 %	50 %	440222512
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879	NC_020061	CGG	2	6	60913	60918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222513
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997	NC_020061	ACA	2	6	69797	69802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222525
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1000	NC_020061	AGGAAC	2	12	70141	70152	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440222525

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