MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_020061	CTT	2	6	489480	489485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222896
7003	NC_020061	GCG	2	6	489493	489498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222896
7004	NC_020061	CAT	2	6	489861	489866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222897
7005	NC_020061	GC	3	6	489880	489885	0 %	0 %	50 %	50 %	440222897
7006	NC_020061	GCA	2	6	489901	489906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222897
7007	NC_020061	TGCT	2	8	489945	489952	0 %	50 %	25 %	25 %	440222897
7008	NC_020061	TCCG	2	8	489968	489975	0 %	25 %	25 %	50 %	440222897
7009	NC_020061	CGA	2	6	490082	490087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222897
7010	NC_020061	TGC	2	6	490101	490106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222897
7011	NC_020061	CTG	2	6	490485	490490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222898
7012	NC_020061	CGG	2	6	490533	490538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222898
7013	NC_020061	TTG	2	6	490583	490588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222898
7014	NC_020061	AAG	2	6	490962	490967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222899
7015	NC_020061	GCA	2	6	491028	491033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222899
7016	NC_020061	GGA	2	6	491043	491048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222899
7017	NC_020061	TTGT	2	8	491058	491065	0 %	75 %	25 %	0 %	440222899
7018	NC_020061	GTTC	2	8	491073	491080	0 %	50 %	25 %	25 %	440222899
7019	NC_020061	CTT	2	6	491113	491118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222899
7020	NC_020061	TA	3	6	491124	491129	50 %	50 %	0 %	0 %	440222899
7021	NC_020061	GGCGT	2	10	491177	491186	0 %	20 %	60 %	20 %	440222899
7022	NC_020061	GAT	2	6	491263	491268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222899
7023	NC_020061	G	6	6	491464	491469	0 %	0 %	100 %	0 %	440222899
7024	NC_020061	TCG	2	6	491475	491480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222899
7025	NC_020061	CGG	2	6	491491	491496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222899
7026	NC_020061	TTG	2	6	491565	491570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222899
7027	NC_020061	AG	3	6	491588	491593	50 %	0 %	50 %	0 %	440222899
7028	NC_020061	CGA	2	6	491640	491645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222899
7029	NC_020061	AGG	2	6	491654	491659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222899
7030	NC_020061	GCTT	2	8	491685	491692	0 %	50 %	25 %	25 %	440222899
7031	NC_020061	TGA	2	6	491694	491699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222899
7032	NC_020061	TCG	2	6	491748	491753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222899
7033	NC_020061	TGG	2	6	491943	491948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222899
7034	NC_020061	GCA	2	6	492067	492072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222899
7035	NC_020061	CGGCC	2	10	492088	492097	0 %	0 %	40 %	60 %	440222899
7036	NC_020061	GGC	2	6	492101	492106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222899
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7039	NC_020061	TCG	2	6	492165	492170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222899
7040	NC_020061	ATGT	2	8	492447	492454	25 %	50 %	25 %	0 %	440222900
7041	NC_020061	AGGCG	2	10	492494	492503	20 %	0 %	60 %	20 %	440222900
7042	NC_020061	GCT	2	6	492514	492519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222900
7043	NC_020061	TGG	2	6	492548	492553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222900
7044	NC_020061	GCG	2	6	492559	492564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222900
7045	NC_020061	GGC	2	6	492621	492626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222900
7046	NC_020061	CGA	2	6	492630	492635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222900
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7048	NC_020061	CAA	2	6	492816	492821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222900
7049	NC_020061	GAC	2	6	492841	492846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222900
7050	NC_020061	CAG	2	6	493216	493221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222900
7051	NC_020061	GTC	2	6	493240	493245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222900
7052	NC_020061	AACG	2	8	493768	493775	50 %	0 %	25 %	25 %	440222901
7053	NC_020061	GC	3	6	493800	493805	0 %	0 %	50 %	50 %	440222901
7054	NC_020061	TCG	2	6	493845	493850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222901
7055	NC_020061	GCC	2	6	493861	493866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222901
7056	NC_020061	GCC	2	6	493906	493911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222901
7057	NC_020061	CGC	2	6	493938	493943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222901
7058	NC_020061	GAC	2	6	493957	493962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222901
7059	NC_020061	ATC	2	6	494040	494045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222902
7060	NC_020061	CTG	2	6	494085	494090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222902
7061	NC_020061	CGC	2	6	494113	494118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222902
7062	NC_020061	ACCA	2	8	494126	494133	50 %	0 %	0 %	50 %	440222902
7063	NC_020061	TGG	2	6	494179	494184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222902
7064	NC_020061	GAT	2	6	494241	494246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222902
7065	NC_020061	TCGC	2	8	494268	494275	0 %	25 %	25 %	50 %	440222902
7066	NC_020061	T	7	7	494278	494284	0 %	100 %	0 %	0 %	440222902
7067	NC_020061	GGC	2	6	496642	496647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222903
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7069	NC_020061	TCGCC	2	10	496684	496693	0 %	20 %	20 %	60 %	440222903
7070	NC_020061	TG	3	6	496694	496699	0 %	50 %	50 %	0 %	440222903
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7072	NC_020061	TAAAAT	2	12	496767	496778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222903
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7081	NC_020061	TGG	2	6	497272	497277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222904
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7085	NC_020061	GGCA	2	8	497426	497433	25 %	0 %	50 %	25 %	440222904
7086	NC_020061	CAC	2	6	497453	497458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222904
7087	NC_020061	GC	3	6	497470	497475	0 %	0 %	50 %	50 %	440222904
7088	NC_020061	CGAG	2	8	497479	497486	25 %	0 %	50 %	25 %	440222904
7089	NC_020061	CAG	2	6	497534	497539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222904
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7091	NC_020061	GCTGC	2	10	497609	497618	0 %	20 %	40 %	40 %	440222904
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7121	NC_020061	CGA	2	6	498910	498915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222904
7122	NC_020061	CGT	2	6	498919	498924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222904
7123	NC_020061	CGA	2	6	498925	498930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222904
7124	NC_020061	TACC	2	8	498934	498941	25 %	25 %	0 %	50 %	440222904
7125	NC_020061	GAC	2	6	498965	498970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222904
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7128	NC_020061	GAAG	2	8	499066	499073	50 %	0 %	50 %	0 %	440222904
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7153	NC_020061	CGG	2	6	500403	500408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222905
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7229	NC_020061	CAC	2	6	505592	505597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222909
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7240	NC_020061	TCG	2	6	506207	506212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222910
7241	NC_020061	CAC	2	6	506233	506238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222910
7242	NC_020061	CGCGAT	2	12	506293	506304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440222910
7243	NC_020061	GGC	2	6	506342	506347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222910
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7262	NC_020061	TCT	2	6	507710	507715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222912
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7363	NC_020061	CTA	2	6	516738	516743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222919
7364	NC_020061	CTCG	2	8	516793	516800	0 %	25 %	25 %	50 %	440222919
7365	NC_020061	CGAG	2	8	516831	516838	25 %	0 %	50 %	25 %	440222919
7366	NC_020061	GCT	2	6	516869	516874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222919
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7390	NC_020061	TGA	2	6	518666	518671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222922
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7480	NC_020061	CGC	2	6	524198	524203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222932
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7482	NC_020061	CGGC	2	8	524277	524284	0 %	0 %	50 %	50 %	440222932
7483	NC_020061	CG	4	8	524287	524294	0 %	0 %	50 %	50 %	440222932
7484	NC_020061	GC	3	6	524321	524326	0 %	0 %	50 %	50 %	440222932
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7487	NC_020061	CG	3	6	524410	524415	0 %	0 %	50 %	50 %	440222932
7488	NC_020061	TGA	2	6	524455	524460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222932
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7490	NC_020061	TCG	2	6	524491	524496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222932
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