MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020061	TTC	2	6	412160	412165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222830
6002	NC_020061	CGG	2	6	412173	412178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222830
6003	NC_020061	ATC	2	6	412185	412190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222830
6004	NC_020061	TGAT	2	8	412195	412202	25 %	50 %	25 %	0 %	440222830
6005	NC_020061	CAG	2	6	412262	412267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6006	NC_020061	GCT	2	6	412294	412299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6007	NC_020061	GA	3	6	412337	412342	50 %	0 %	50 %	0 %	440222830
6008	NC_020061	ATG	2	6	412353	412358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222830
6009	NC_020061	TTGGT	2	10	412376	412385	0 %	60 %	40 %	0 %	440222830
6010	NC_020061	GGC	2	6	412489	412494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222830
6011	NC_020061	ACG	2	6	412504	412509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6012	NC_020061	CAG	2	6	412537	412542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6013	NC_020061	CAC	2	6	412621	412626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222830
6014	NC_020061	CCT	2	6	412660	412665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222830
6015	NC_020061	GCG	2	6	412693	412698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222830
6016	NC_020061	TGCG	2	8	412723	412730	0 %	25 %	50 %	25 %	440222830
6017	NC_020061	GGT	2	6	412744	412749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222830
6018	NC_020061	AGC	2	6	412824	412829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6019	NC_020061	CTCAG	2	10	412902	412911	20 %	20 %	20 %	40 %	440222830
6020	NC_020061	GCG	2	6	412912	412917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222830
6021	NC_020061	GCA	2	6	413070	413075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6022	NC_020061	TCCG	2	8	413136	413143	0 %	25 %	25 %	50 %	440222830
6023	NC_020061	CTG	2	6	413145	413150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6024	NC_020061	CTT	2	6	413192	413197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222830
6025	NC_020061	CGA	2	6	413254	413259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6026	NC_020061	CGCC	2	8	413356	413363	0 %	0 %	25 %	75 %	440222830
6027	NC_020061	CGC	2	6	413389	413394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222830
6028	NC_020061	TCC	2	6	413425	413430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222830
6029	NC_020061	ATCCG	2	10	413432	413441	20 %	20 %	20 %	40 %	440222830
6030	NC_020061	GTC	2	6	413485	413490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222831
6031	NC_020061	TCC	2	6	413567	413572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222831
6032	NC_020061	GCG	2	6	413583	413588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222831
6033	NC_020061	ATCG	2	8	413676	413683	25 %	25 %	25 %	25 %	440222831
6034	NC_020061	ACG	2	6	413686	413691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222831
6035	NC_020061	CGAA	2	8	413699	413706	50 %	0 %	25 %	25 %	440222831
6036	NC_020061	ATC	2	6	413725	413730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222831
6037	NC_020061	TGA	2	6	413733	413738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222831
6038	NC_020061	GGT	2	6	413740	413745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222831
6039	NC_020061	ACG	2	6	413775	413780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222831
6040	NC_020061	AGC	2	6	413869	413874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222831
6041	NC_020061	TTC	2	6	413971	413976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222831
6042	NC_020061	AG	4	8	414261	414268	50 %	0 %	50 %	0 %	440222832
6043	NC_020061	GATTG	2	10	414284	414293	20 %	40 %	40 %	0 %	440222832
6044	NC_020061	AG	3	6	414307	414312	50 %	0 %	50 %	0 %	440222832
6045	NC_020061	A	6	6	414423	414428	100 %	0 %	0 %	0 %	440222832
6046	NC_020061	GCC	2	6	414466	414471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222832
6047	NC_020061	TCCG	2	8	414498	414505	0 %	25 %	25 %	50 %	440222832
6048	NC_020061	TTC	2	6	414559	414564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222832
6049	NC_020061	CTC	2	6	414588	414593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222832
6050	NC_020061	GA	3	6	414726	414731	50 %	0 %	50 %	0 %	440222832
6051	NC_020061	GAAATA	2	12	415223	415234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440222833
6052	NC_020061	CCA	2	6	415239	415244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222833
6053	NC_020061	TGA	2	6	415275	415280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222833
6054	NC_020061	TCT	2	6	415440	415445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222834
6055	NC_020061	GCGTTT	2	12	415709	415720	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	440222835
6056	NC_020061	GGT	2	6	415762	415767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222835
6057	NC_020061	CAG	2	6	416841	416846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6058	NC_020061	CAA	2	6	416851	416856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222836
6059	NC_020061	CTGG	2	8	416863	416870	0 %	25 %	50 %	25 %	440222836
6060	NC_020061	GCA	2	6	416907	416912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6061	NC_020061	CAT	2	6	416950	416955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222836
6062	NC_020061	GTT	3	9	416975	416983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222836
6063	NC_020061	GCG	2	6	417014	417019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222836
6064	NC_020061	TCG	2	6	417058	417063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6065	NC_020061	CAT	2	6	417105	417110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222836
6066	NC_020061	CGA	2	6	417138	417143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6067	NC_020061	GCC	2	6	417148	417153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222836
6068	NC_020061	ATC	2	6	417214	417219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222836
6069	NC_020061	GCC	2	6	417386	417391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222836
6070	NC_020061	ACA	2	6	417426	417431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222836
6071	NC_020061	CAA	2	6	417462	417467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222836
6072	NC_020061	ACG	2	6	417505	417510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6073	NC_020061	GCT	2	6	417571	417576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6074	NC_020061	CG	3	6	417655	417660	0 %	0 %	50 %	50 %	440222836
6075	NC_020061	CGT	2	6	417690	417695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6076	NC_020061	ATA	2	6	417712	417717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222836
6077	NC_020061	AGA	2	6	417782	417787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222836
6078	NC_020061	CTC	2	6	418066	418071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222836
6079	NC_020061	GAC	2	6	418173	418178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6080	NC_020061	TGTC	2	8	418287	418294	0 %	50 %	25 %	25 %	440222836
6081	NC_020061	TTA	2	6	418326	418331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222836
6082	NC_020061	CGA	2	6	418452	418457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222836
6083	NC_020061	GGTC	2	8	418677	418684	0 %	25 %	50 %	25 %	440222837
6084	NC_020061	CAG	2	6	418746	418751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222837
6085	NC_020061	TGA	2	6	418769	418774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222837
6086	NC_020061	CGG	2	6	418778	418783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222837
6087	NC_020061	CGT	2	6	418802	418807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222837
6088	NC_020061	GGTC	2	8	418823	418830	0 %	25 %	50 %	25 %	440222837
6089	NC_020061	AAC	2	6	418903	418908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222837
6090	NC_020061	GCT	2	6	418914	418919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222837
6091	NC_020061	CGCAA	2	10	418921	418930	40 %	0 %	20 %	40 %	440222837
6092	NC_020061	ATT	2	6	419094	419099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222837
6093	NC_020061	GAG	2	6	419451	419456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222838
6094	NC_020061	TCG	2	6	419537	419542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222838
6095	NC_020061	TCG	2	6	419600	419605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222838
6096	NC_020061	GTA	2	6	420038	420043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222839
6097	NC_020061	AGCGC	2	10	420058	420067	20 %	0 %	40 %	40 %	440222839
6098	NC_020061	GC	4	8	420064	420071	0 %	0 %	50 %	50 %	440222839
6099	NC_020061	CG	3	6	420158	420163	0 %	0 %	50 %	50 %	440222839
6100	NC_020061	CGC	2	6	420184	420189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222839
6101	NC_020061	TGGC	2	8	420190	420197	0 %	25 %	50 %	25 %	440222839
6102	NC_020061	GC	3	6	420201	420206	0 %	0 %	50 %	50 %	440222839
6103	NC_020061	GACCA	2	10	420277	420286	40 %	0 %	20 %	40 %	440222839
6104	NC_020061	TGC	2	6	420613	420618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222840
6105	NC_020061	ACCG	2	8	420624	420631	25 %	0 %	25 %	50 %	440222840
6106	NC_020061	CTG	2	6	420664	420669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222840
6107	NC_020061	GAT	2	6	420981	420986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222841
6108	NC_020061	CGA	2	6	421004	421009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222841
6109	NC_020061	ATC	2	6	421078	421083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222841
6110	NC_020061	GCTTCA	2	12	421091	421102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440222841
6111	NC_020061	TTC	2	6	421137	421142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222841
6112	NC_020061	TTCA	2	8	421476	421483	25 %	50 %	0 %	25 %	440222842
6113	NC_020061	CGC	2	6	421521	421526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222842
6114	NC_020061	CGAG	2	8	421695	421702	25 %	0 %	50 %	25 %	440222842
6115	NC_020061	GA	3	6	421712	421717	50 %	0 %	50 %	0 %	440222842
6116	NC_020061	TTA	2	6	422130	422135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222843
6117	NC_020061	CGT	2	6	422216	422221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222843
6118	NC_020061	GGT	2	6	422223	422228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222843
6119	NC_020061	ACG	2	6	422321	422326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222843
6120	NC_020061	AAG	2	6	422347	422352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222843
6121	NC_020061	CTC	2	6	422431	422436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222843
6122	NC_020061	GAAGG	2	10	422437	422446	40 %	0 %	60 %	0 %	440222843
6123	NC_020061	TTC	2	6	422500	422505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222843
6124	NC_020061	GCG	2	6	422508	422513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222843
6125	NC_020061	ATC	2	6	422530	422535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222843
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6129	NC_020061	CGA	2	6	422618	422623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222844
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6131	NC_020061	TCA	2	6	422746	422751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222844
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6135	NC_020061	TCTT	2	8	422986	422993	0 %	75 %	0 %	25 %	440222844
6136	NC_020061	CT	3	6	423083	423088	0 %	50 %	0 %	50 %	440222844
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6142	NC_020061	GCA	2	6	423352	423357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222844
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6144	NC_020061	GAC	2	6	423458	423463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222844
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6151	NC_020061	AT	3	6	423734	423739	50 %	50 %	0 %	0 %	440222844
6152	NC_020061	CGA	2	6	423749	423754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222844
6153	NC_020061	GAAAA	2	10	423765	423774	80 %	0 %	20 %	0 %	440222844
6154	NC_020061	GGA	2	6	423830	423835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222844
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6157	NC_020061	AGAA	2	8	424157	424164	75 %	0 %	25 %	0 %	440222845
6158	NC_020061	AGA	2	6	424187	424192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222845
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6177	NC_020061	ACGCT	2	10	425125	425134	20 %	20 %	20 %	40 %	440222845
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6234	NC_020061	CAA	2	6	428507	428512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222848
6235	NC_020061	TG	3	6	428542	428547	0 %	50 %	50 %	0 %	440222848
6236	NC_020061	CGAC	2	8	428585	428592	25 %	0 %	25 %	50 %	440222848
6237	NC_020061	AAC	2	6	428599	428604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222848
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6239	NC_020061	GC	3	6	428728	428733	0 %	0 %	50 %	50 %	440222848
6240	NC_020061	CGT	2	6	428762	428767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222848
6241	NC_020061	GTTT	2	8	428795	428802	0 %	75 %	25 %	0 %	440222848
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6243	NC_020061	AGC	2	6	428845	428850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222848
6244	NC_020061	CCAC	2	8	428852	428859	25 %	0 %	0 %	75 %	440222848
6245	NC_020061	GC	3	6	428909	428914	0 %	0 %	50 %	50 %	440222848
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6282	NC_020061	CGCTT	2	10	430797	430806	0 %	40 %	20 %	40 %	440222848
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6354	NC_020061	CGAC	2	8	437734	437741	25 %	0 %	25 %	50 %	440222851
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6488	NC_020061	CAGG	2	8	447017	447024	25 %	0 %	50 %	25 %	440222856
6489	NC_020061	TTTGC	2	10	447038	447047	0 %	60 %	20 %	20 %	440222856
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6493	NC_020061	TCA	2	6	447096	447101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222856
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