MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020061	TGA	2	6	347096	347101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222773
5002	NC_020061	CGA	2	6	347109	347114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5003	NC_020061	CGC	2	6	347159	347164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222773
5004	NC_020061	GAC	2	6	347232	347237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5005	NC_020061	GCG	2	6	347255	347260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222773
5006	NC_020061	TTC	2	6	347273	347278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222773
5007	NC_020061	GTGTG	2	10	347364	347373	0 %	40 %	60 %	0 %	440222773
5008	NC_020061	TCG	2	6	347453	347458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5009	NC_020061	GGCG	2	8	347499	347506	0 %	0 %	75 %	25 %	440222773
5010	NC_020061	CCG	2	6	347524	347529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222773
5011	NC_020061	TCG	2	6	347579	347584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5012	NC_020061	G	6	6	347625	347630	0 %	0 %	100 %	0 %	440222773
5013	NC_020061	GGC	2	6	347649	347654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222773
5014	NC_020061	CGG	3	9	347787	347795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222773
5015	NC_020061	CAAT	2	8	347808	347815	50 %	25 %	0 %	25 %	440222773
5016	NC_020061	TTG	2	6	347857	347862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222773
5017	NC_020061	TCG	2	6	347918	347923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5018	NC_020061	CGT	2	6	347988	347993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5019	NC_020061	TCG	2	6	348033	348038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5020	NC_020061	CGT	2	6	348039	348044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5021	NC_020061	CAG	2	6	348056	348061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222773
5022	NC_020061	ATT	2	6	348064	348069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222773
5023	NC_020061	GA	3	6	348119	348124	50 %	0 %	50 %	0 %	440222774
5024	NC_020061	TGCGT	2	10	348151	348160	0 %	40 %	40 %	20 %	440222774
5025	NC_020061	CAA	2	6	348184	348189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222774
5026	NC_020061	A	7	7	348188	348194	100 %	0 %	0 %	0 %	440222774
5027	NC_020061	GTG	2	6	348195	348200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222774
5028	NC_020061	GCC	2	6	348203	348208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222774
5029	NC_020061	TTC	2	6	348211	348216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222774
5030	NC_020061	CAAG	2	8	348367	348374	50 %	0 %	25 %	25 %	440222774
5031	NC_020061	TTG	2	6	348393	348398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222774
5032	NC_020061	GCA	2	6	348435	348440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222774
5033	NC_020061	CTCG	2	8	348462	348469	0 %	25 %	25 %	50 %	440222774
5034	NC_020061	GCT	2	6	348486	348491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222774
5035	NC_020061	GC	3	6	348513	348518	0 %	0 %	50 %	50 %	440222774
5036	NC_020061	CAA	2	6	348593	348598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222774
5037	NC_020061	AGC	2	6	348659	348664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222774
5038	NC_020061	ATC	2	6	348684	348689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222774
5039	NC_020061	GC	4	8	348807	348814	0 %	0 %	50 %	50 %	440222774
5040	NC_020061	GACGC	2	10	348845	348854	20 %	0 %	40 %	40 %	440222774
5041	NC_020061	TTG	2	6	348928	348933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222774
5042	NC_020061	CGA	2	6	348956	348961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222774
5043	NC_020061	AAC	2	6	349058	349063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222774
5044	NC_020061	TGA	2	6	349071	349076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222774
5045	NC_020061	AGC	2	6	349207	349212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222775
5046	NC_020061	ACT	2	6	349224	349229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222775
5047	NC_020061	CTT	2	6	349264	349269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222775
5048	NC_020061	CG	3	6	349274	349279	0 %	0 %	50 %	50 %	440222775
5049	NC_020061	TGG	2	6	349331	349336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222775
5050	NC_020061	TCGA	2	8	349415	349422	25 %	25 %	25 %	25 %	440222775
5051	NC_020061	GTT	2	6	349432	349437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222775
5052	NC_020061	CCA	2	6	349464	349469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222775
5053	NC_020061	GCA	2	6	349483	349488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222775
5054	NC_020061	CGG	2	6	349625	349630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222775
5055	NC_020061	GTC	2	6	349645	349650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222775
5056	NC_020061	GGT	2	6	349663	349668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222775
5057	NC_020061	CAG	2	6	349726	349731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222775
5058	NC_020061	ACC	2	6	349766	349771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222775
5059	NC_020061	GAT	2	6	349782	349787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222775
5060	NC_020061	CCGC	2	8	349898	349905	0 %	0 %	25 %	75 %	440222775
5061	NC_020061	GC	3	6	349999	350004	0 %	0 %	50 %	50 %	440222776
5062	NC_020061	GAGC	2	8	350014	350021	25 %	0 %	50 %	25 %	440222776
5063	NC_020061	GGCT	2	8	350062	350069	0 %	25 %	50 %	25 %	440222776
5064	NC_020061	TGT	3	9	350109	350117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222776
5065	NC_020061	AT	3	6	350184	350189	50 %	50 %	0 %	0 %	440222776
5066	NC_020061	GGATC	2	10	350196	350205	20 %	20 %	40 %	20 %	440222776
5067	NC_020061	GGT	2	6	350207	350212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222776
5068	NC_020061	TCAG	2	8	350229	350236	25 %	25 %	25 %	25 %	440222776
5069	NC_020061	CTA	2	6	350322	350327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222776
5070	NC_020061	CCGG	2	8	350335	350342	0 %	0 %	50 %	50 %	440222776
5071	NC_020061	CG	3	6	350373	350378	0 %	0 %	50 %	50 %	440222776
5072	NC_020061	AT	3	6	350442	350447	50 %	50 %	0 %	0 %	440222776
5073	NC_020061	GCG	2	6	350450	350455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222776
5074	NC_020061	TGC	2	6	350498	350503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222776
5075	NC_020061	GTG	2	6	350558	350563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222776
5076	NC_020061	ACT	2	6	350570	350575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222776
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5078	NC_020061	CG	3	6	350662	350667	0 %	0 %	50 %	50 %	440222776
5079	NC_020061	TCT	2	6	350678	350683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222776
5080	NC_020061	CT	3	6	350722	350727	0 %	50 %	0 %	50 %	440222776
5081	NC_020061	TGG	2	6	350819	350824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222776
5082	NC_020061	GAA	2	6	350883	350888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222776
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5084	NC_020061	CATTT	2	10	350996	351005	20 %	60 %	0 %	20 %	440222776
5085	NC_020061	ACG	2	6	351023	351028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222776
5086	NC_020061	GAGT	2	8	351118	351125	25 %	25 %	50 %	0 %	440222776
5087	NC_020061	CG	3	6	351261	351266	0 %	0 %	50 %	50 %	440222777
5088	NC_020061	GAA	2	6	351353	351358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222777
5089	NC_020061	GCG	2	6	351416	351421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222777
5090	NC_020061	CG	3	6	351420	351425	0 %	0 %	50 %	50 %	440222777
5091	NC_020061	TCGAT	2	10	351486	351495	20 %	40 %	20 %	20 %	440222777
5092	NC_020061	TGC	2	6	351562	351567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222777
5093	NC_020061	CTG	2	6	351587	351592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222777
5094	NC_020061	GAC	2	6	351602	351607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222777
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5099	NC_020061	CAT	2	6	351823	351828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222777
5100	NC_020061	CG	3	6	351833	351838	0 %	0 %	50 %	50 %	440222777
5101	NC_020061	ATGCG	2	10	351859	351868	20 %	20 %	40 %	20 %	440222777
5102	NC_020061	CAT	2	6	351908	351913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222777
5103	NC_020061	C	6	6	351993	351998	0 %	0 %	0 %	100 %	440222777
5104	NC_020061	GAA	2	6	352025	352030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222777
5105	NC_020061	GGC	2	6	352078	352083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222777
5106	NC_020061	TGC	2	6	352246	352251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222777
5107	NC_020061	GGA	2	6	352274	352279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222777
5108	NC_020061	CATCAA	2	12	352713	352724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440222778
5109	NC_020061	CGA	2	6	352808	352813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5110	NC_020061	TC	3	6	352934	352939	0 %	50 %	0 %	50 %	440222778
5111	NC_020061	TAT	2	6	352960	352965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222778
5112	NC_020061	TAC	2	6	353107	353112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222778
5113	NC_020061	CGA	2	6	353132	353137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5114	NC_020061	AGA	3	9	353138	353146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222778
5115	NC_020061	CGT	2	6	353181	353186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5116	NC_020061	GATC	2	8	353247	353254	25 %	25 %	25 %	25 %	440222778
5117	NC_020061	CGC	2	6	353325	353330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222778
5118	NC_020061	CGA	2	6	353337	353342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5119	NC_020061	GAT	2	6	353343	353348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222778
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5121	NC_020061	GAA	2	6	353460	353465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222778
5122	NC_020061	ACG	2	6	353468	353473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5123	NC_020061	TGC	2	6	353474	353479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5124	NC_020061	CGA	2	6	353487	353492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5125	NC_020061	GTTCG	2	10	353526	353535	0 %	40 %	40 %	20 %	440222778
5126	NC_020061	GCC	2	6	353713	353718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222778
5127	NC_020061	TCG	2	6	353738	353743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5128	NC_020061	TCG	2	6	353828	353833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5129	NC_020061	GTG	2	6	353843	353848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222778
5130	NC_020061	GCT	2	6	353941	353946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222778
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5132	NC_020061	CAC	2	6	354015	354020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222778
5133	NC_020061	CGA	2	6	354033	354038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222778
5134	NC_020061	CAC	2	6	354273	354278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222779
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5136	NC_020061	GC	5	10	354423	354432	0 %	0 %	50 %	50 %	440222779
5137	NC_020061	ATC	2	6	354454	354459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222779
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5139	NC_020061	CT	3	6	354562	354567	0 %	50 %	0 %	50 %	440222779
5140	NC_020061	GAG	2	6	354571	354576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222779
5141	NC_020061	ATC	2	6	354667	354672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222779
5142	NC_020061	CGG	2	6	354738	354743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222779
5143	NC_020061	CTG	2	6	354754	354759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222779
5144	NC_020061	TGG	2	6	354809	354814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222779
5145	NC_020061	ATC	2	6	354835	354840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222779
5146	NC_020061	CGT	2	6	354843	354848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222779
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5148	NC_020061	CGG	2	6	354915	354920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222779
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5150	NC_020061	GGC	2	6	355143	355148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222779
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5153	NC_020061	AGG	2	6	355214	355219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222779
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5183	NC_020061	TCGGCA	2	12	356549	356560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440222781
5184	NC_020061	TCCG	2	8	356646	356653	0 %	25 %	25 %	50 %	440222781
5185	NC_020061	CTT	2	6	356721	356726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222781
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5189	NC_020061	GTG	2	6	356893	356898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222781
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5194	NC_020061	CGT	2	6	357015	357020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222781
5195	NC_020061	ATCG	2	8	357190	357197	25 %	25 %	25 %	25 %	440222782
5196	NC_020061	TGC	2	6	357274	357279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222782
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5200	NC_020061	TGC	2	6	357351	357356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222782
5201	NC_020061	GC	3	6	357380	357385	0 %	0 %	50 %	50 %	440222782
5202	NC_020061	GCA	2	6	357481	357486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222782
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5205	NC_020061	GAT	2	6	357547	357552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222782
5206	NC_020061	GAT	2	6	357559	357564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222782
5207	NC_020061	CCG	2	6	357612	357617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222782
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5210	NC_020061	AGGCCG	2	12	357687	357698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440222782
5211	NC_020061	CGA	2	6	357721	357726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222782
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5213	NC_020061	AAGG	2	8	357842	357849	50 %	0 %	50 %	0 %	440222782
5214	NC_020061	CCG	2	6	357858	357863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222782
5215	NC_020061	GCC	3	9	357890	357898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222782
5216	NC_020061	CTG	2	6	357902	357907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222782
5217	NC_020061	GC	3	6	357950	357955	0 %	0 %	50 %	50 %	440222782
5218	NC_020061	CGGC	2	8	357972	357979	0 %	0 %	50 %	50 %	440222782
5219	NC_020061	CAA	2	6	358111	358116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222782
5220	NC_020061	GTCAAT	2	12	358142	358153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440222782
5221	NC_020061	GCCATC	2	12	358160	358171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440222782
5222	NC_020061	GCT	2	6	358213	358218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222782
5223	NC_020061	CGG	3	9	358270	358278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222782
5224	NC_020061	GAG	2	6	358311	358316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222782
5225	NC_020061	CCG	2	6	358332	358337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222783
5226	NC_020061	CGGT	2	8	358452	358459	0 %	25 %	50 %	25 %	440222783
5227	NC_020061	GCG	2	6	358490	358495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222783
5228	NC_020061	GTC	2	6	358544	358549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222783
5229	NC_020061	CCG	2	6	358576	358581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222783
5230	NC_020061	CTA	2	6	358615	358620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222783
5231	NC_020061	CGAT	2	8	358659	358666	25 %	25 %	25 %	25 %	440222783
5232	NC_020061	CGGCG	2	10	358673	358682	0 %	0 %	60 %	40 %	440222783
5233	NC_020061	CTG	2	6	358703	358708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222783
5234	NC_020061	CCGC	2	8	358749	358756	0 %	0 %	25 %	75 %	440222783
5235	NC_020061	CTG	2	6	358811	358816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222783
5236	NC_020061	CGGTT	2	10	359021	359030	0 %	40 %	40 %	20 %	440222784
5237	NC_020061	GGC	2	6	359110	359115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222784
5238	NC_020061	TGA	2	6	359168	359173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222784
5239	NC_020061	CGG	2	6	359205	359210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222784
5240	NC_020061	GC	3	6	359219	359224	0 %	0 %	50 %	50 %	440222784
5241	NC_020061	GATC	2	8	359229	359236	25 %	25 %	25 %	25 %	440222784
5242	NC_020061	CG	3	6	359237	359242	0 %	0 %	50 %	50 %	440222784
5243	NC_020061	CGC	2	6	359249	359254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222784
5244	NC_020061	CGC	2	6	359275	359280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222784
5245	NC_020061	CAA	2	6	359295	359300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222784
5246	NC_020061	GAT	2	6	359373	359378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222784
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5248	NC_020061	CCGA	2	8	359401	359408	25 %	0 %	25 %	50 %	440222784
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5251	NC_020061	GCCG	2	8	359464	359471	0 %	0 %	50 %	50 %	440222784
5252	NC_020061	TGC	2	6	359568	359573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222784
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5272	NC_020061	TCG	2	6	361810	361815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222785
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5274	NC_020061	GCC	2	6	361857	361862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222785
5275	NC_020061	GGC	2	6	362044	362049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222785
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5282	NC_020061	CGA	2	6	362213	362218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222785
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