MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 3772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020060	TGA	2	6	204017	204022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228764
3502	NC_020060	GTC	2	6	204042	204047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228764
3503	NC_020060	GGT	2	6	204125	204130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228764
3504	NC_020060	GGT	2	6	204143	204148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228764
3505	NC_020060	GTCC	2	8	204151	204158	0 %	25 %	25 %	50 %	440228764
3506	NC_020060	CGG	2	6	204160	204165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228764
3507	NC_020060	GGC	3	9	204185	204193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228764
3508	NC_020060	GA	3	6	204198	204203	50 %	0 %	50 %	0 %	440228764
3509	NC_020060	TGA	2	6	204205	204210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228764
3510	NC_020060	CCG	2	6	204236	204241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228765
3511	NC_020060	TCT	2	6	204250	204255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228765
3512	NC_020060	CGA	2	6	204307	204312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228765
3513	NC_020060	TCA	2	6	204313	204318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228765
3514	NC_020060	TTC	2	6	204324	204329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228765
3515	NC_020060	GAC	2	6	204365	204370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228765
3516	NC_020060	GC	3	6	204463	204468	0 %	0 %	50 %	50 %	440228765
3517	NC_020060	ACC	2	6	204657	204662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228765
3518	NC_020060	TGACG	2	10	204665	204674	20 %	20 %	40 %	20 %	440228765
3519	NC_020060	CCG	2	6	204717	204722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228765
3520	NC_020060	CGC	2	6	204793	204798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228765
3521	NC_020060	GCG	2	6	204826	204831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228765
3522	NC_020060	GAC	2	6	204836	204841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228765
3523	NC_020060	GTC	2	6	204891	204896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228765
3524	NC_020060	GTT	2	6	204950	204955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228765
3525	NC_020060	GCTGT	2	10	205062	205071	0 %	40 %	40 %	20 %	440228766
3526	NC_020060	TGCGG	2	10	205130	205139	0 %	20 %	60 %	20 %	440228766
3527	NC_020060	CCTTGC	2	12	205185	205196	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440228766
3528	NC_020060	TTG	2	6	205256	205261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228766
3529	NC_020060	TCT	2	6	205329	205334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228766
3530	NC_020060	CGAT	2	8	205373	205380	25 %	25 %	25 %	25 %	440228766
3531	NC_020060	AT	3	6	205379	205384	50 %	50 %	0 %	0 %	440228766
3532	NC_020060	CG	3	6	205447	205452	0 %	0 %	50 %	50 %	440228766
3533	NC_020060	CAC	2	6	205453	205458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228766
3534	NC_020060	CGA	2	6	205527	205532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228766
3535	NC_020060	CGA	2	6	205614	205619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228766
3536	NC_020060	GCG	3	9	205628	205636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228766
3537	NC_020060	GC	3	6	205675	205680	0 %	0 %	50 %	50 %	440228766
3538	NC_020060	ATCG	2	8	205718	205725	25 %	25 %	25 %	25 %	440228766
3539	NC_020060	GC	3	6	205789	205794	0 %	0 %	50 %	50 %	440228767
3540	NC_020060	GATC	2	8	205825	205832	25 %	25 %	25 %	25 %	440228767
3541	NC_020060	CAG	2	6	205950	205955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228767
3542	NC_020060	AGC	2	6	205960	205965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228767
3543	NC_020060	CGC	2	6	205990	205995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228767
3544	NC_020060	GCC	2	6	206041	206046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228767
3545	NC_020060	ATG	2	6	206102	206107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228767
3546	NC_020060	ACG	3	9	206135	206143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228767
3547	NC_020060	GGTT	2	8	206192	206199	0 %	50 %	50 %	0 %	440228767
3548	NC_020060	TCCGA	2	10	206219	206228	20 %	20 %	20 %	40 %	440228767
3549	NC_020060	CCGA	2	8	206264	206271	25 %	0 %	25 %	50 %	440228767
3550	NC_020060	GACA	2	8	206377	206384	50 %	0 %	25 %	25 %	440228767
3551	NC_020060	CGA	2	6	206397	206402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228767
3552	NC_020060	ACG	2	6	206420	206425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228767
3553	NC_020060	GCG	2	6	206438	206443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228767
3554	NC_020060	TGG	2	6	206499	206504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228767
3555	NC_020060	CGGC	2	8	206532	206539	0 %	0 %	50 %	50 %	440228767
3556	NC_020060	GCC	2	6	206548	206553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228767
3557	NC_020060	ACT	2	6	206582	206587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228767
3558	NC_020060	GGTC	2	8	206599	206606	0 %	25 %	50 %	25 %	440228767
3559	NC_020060	CGA	2	6	206634	206639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228767
3560	NC_020060	TCG	2	6	206647	206652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228767
3561	NC_020060	GTT	2	6	206771	206776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228767
3562	NC_020060	GCTG	2	8	206846	206853	0 %	25 %	50 %	25 %	440228767
3563	NC_020060	GCC	2	6	206855	206860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228767
3564	NC_020060	GGT	2	6	206872	206877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228767
3565	NC_020060	CAC	2	6	206928	206933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228768
3566	NC_020060	CGC	2	6	206950	206955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228768
3567	NC_020060	TTC	2	6	206970	206975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228768
3568	NC_020060	GAA	2	6	206984	206989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228768
3569	NC_020060	ACG	2	6	206996	207001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228768
3570	NC_020060	AGC	2	6	207030	207035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228768
3571	NC_020060	GGC	2	6	207050	207055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228768
3572	NC_020060	GAG	2	6	207077	207082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228768
3573	NC_020060	T	6	6	207114	207119	0 %	100 %	0 %	0 %	440228769
3574	NC_020060	CGC	2	6	207120	207125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228769
3575	NC_020060	GAA	2	6	207151	207156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228769
3576	NC_020060	CAT	2	6	207217	207222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228769
3577	NC_020060	CTG	2	6	207229	207234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3578	NC_020060	CTG	2	6	207271	207276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3579	NC_020060	CGG	2	6	207321	207326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228769
3580	NC_020060	CTC	2	6	207361	207366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228769
3581	NC_020060	GGT	2	6	207451	207456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228769
3582	NC_020060	ACG	2	6	207462	207467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3583	NC_020060	GGTT	2	8	207480	207487	0 %	50 %	50 %	0 %	440228769
3584	NC_020060	GCT	2	6	207513	207518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3585	NC_020060	GCA	2	6	207519	207524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3586	NC_020060	TCG	2	6	207527	207532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3587	NC_020060	CGA	2	6	207570	207575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3588	NC_020060	TGC	2	6	207576	207581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3589	NC_020060	GCA	2	6	207645	207650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228769
3590	NC_020060	GCTG	2	8	207693	207700	0 %	25 %	50 %	25 %	440228769
3591	NC_020060	GTT	2	6	207763	207768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228769
3592	NC_020060	GGC	2	6	207790	207795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228769
3593	NC_020060	GCCG	2	8	207832	207839	0 %	0 %	50 %	50 %	440228769
3594	NC_020060	GCC	2	6	207851	207856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228769
3595	NC_020060	AGCA	2	8	207862	207869	50 %	0 %	25 %	25 %	440228769
3596	NC_020060	AGC	2	6	207885	207890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228769
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3598	NC_020060	GC	3	6	207961	207966	0 %	0 %	50 %	50 %	440228770
3599	NC_020060	TTC	2	6	207980	207985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228770
3600	NC_020060	CGG	2	6	208044	208049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228770
3601	NC_020060	GAC	2	6	208061	208066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228770
3602	NC_020060	GCG	2	6	208164	208169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228770
3603	NC_020060	GAT	2	6	208217	208222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228770
3604	NC_020060	ACG	2	6	208263	208268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228770
3605	NC_020060	GCA	2	6	208285	208290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228770
3606	NC_020060	AGGT	2	8	208407	208414	25 %	25 %	50 %	0 %	440228770
3607	NC_020060	TCA	2	6	208447	208452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228770
3608	NC_020060	ATG	2	6	208544	208549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228770
3609	NC_020060	CGC	2	6	208579	208584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228770
3610	NC_020060	CGGC	2	8	208605	208612	0 %	0 %	50 %	50 %	440228770
3611	NC_020060	TCGC	2	8	208731	208738	0 %	25 %	25 %	50 %	440228770
3612	NC_020060	CCCTC	2	10	208768	208777	0 %	20 %	0 %	80 %	440228770
3613	NC_020060	CGC	2	6	208810	208815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228770
3614	NC_020060	CTGCG	2	10	208892	208901	0 %	20 %	40 %	40 %	440228770
3615	NC_020060	CGT	2	6	208963	208968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228770
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3618	NC_020060	CAGA	2	8	209073	209080	50 %	0 %	25 %	25 %	440228770
3619	NC_020060	CGG	2	6	209229	209234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228770
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3741	NC_020060	GC	3	6	215051	215056	0 %	0 %	50 %	50 %	440228776
3742	NC_020060	AGAGCA	2	12	215112	215123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440228776
3743	NC_020060	AGGA	2	8	215144	215151	50 %	0 %	50 %	0 %	440228776
3744	NC_020060	GCC	2	6	215165	215170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228776
3745	NC_020060	GAC	2	6	215415	215420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228777
3746	NC_020060	GCG	2	6	215430	215435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228777
3747	NC_020060	GCG	2	6	215457	215462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228777
3748	NC_020060	GCT	2	6	215544	215549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228777
3749	NC_020060	CG	3	6	215668	215673	0 %	0 %	50 %	50 %	440228777
3750	NC_020060	GGCG	2	8	215682	215689	0 %	0 %	75 %	25 %	440228777
3751	NC_020060	TGG	2	6	215717	215722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228777
3752	NC_020060	GGT	2	6	215782	215787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228777
3753	NC_020060	CGC	2	6	215822	215827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228777
3754	NC_020060	TGCT	2	8	215828	215835	0 %	50 %	25 %	25 %	440228777
3755	NC_020060	TCA	2	6	215942	215947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228777
3756	NC_020060	GCA	2	6	215950	215955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228777
3757	NC_020060	CG	3	6	216026	216031	0 %	0 %	50 %	50 %	440228777
3758	NC_020060	ACG	2	6	216049	216054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228777
3759	NC_020060	TAG	2	6	216129	216134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228777
3760	NC_020060	ATG	2	6	216140	216145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228777
3761	NC_020060	AGC	2	6	216155	216160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228777
3762	NC_020060	GAA	2	6	216252	216257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228777
3763	NC_020060	CGA	2	6	216305	216310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228777
3764	NC_020060	G	6	6	216327	216332	0 %	0 %	100 %	0 %	440228777
3765	NC_020060	CTG	2	6	216359	216364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228777
3766	NC_020060	GGT	2	6	216366	216371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228777
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3769	NC_020060	TCA	2	6	216482	216487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228777
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3771	NC_020060	G	6	6	216533	216538	0 %	0 %	100 %	0 %	440228777
3772	NC_020060	GAT	2	6	216555	216560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228777

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