MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 3772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020060	ATC	2	6	31686	31691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228598
502	NC_020060	CGA	2	6	31714	31719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228598
503	NC_020060	TGCG	2	8	31731	31738	0 %	25 %	50 %	25 %	440228598
504	NC_020060	AGG	2	6	31878	31883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228598
505	NC_020060	GACG	2	8	31932	31939	25 %	0 %	50 %	25 %	440228599
506	NC_020060	CGC	2	6	31993	31998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
507	NC_020060	CG	3	6	32119	32124	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
508	NC_020060	CG	3	6	32131	32136	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
509	NC_020060	CGC	2	6	32183	32188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
510	NC_020060	TC	3	6	32362	32367	0 %	50 %	0 %	50 %	440228599
511	NC_020060	ATCA	2	8	32494	32501	50 %	25 %	0 %	25 %	440228599
512	NC_020060	GGCG	2	8	32541	32548	0 %	0 %	75 %	25 %	440228599
513	NC_020060	GGAT	2	8	32557	32564	25 %	25 %	50 %	0 %	440228599
514	NC_020060	CGATCG	2	12	32567	32578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440228599
515	NC_020060	CGA	2	6	32593	32598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
516	NC_020060	AGC	2	6	32636	32641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
517	NC_020060	CGC	2	6	32652	32657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
518	NC_020060	GTC	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228599
519	NC_020060	CGA	2	6	32754	32759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
520	NC_020060	AGC	2	6	32762	32767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
521	NC_020060	CGGC	2	8	32770	32777	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
522	NC_020060	CCT	2	6	32823	32828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228599
523	NC_020060	GATC	2	8	32905	32912	25 %	25 %	25 %	25 %	440228599
524	NC_020060	CGGC	2	8	32948	32955	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
525	NC_020060	TCT	2	6	33113	33118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228599
526	NC_020060	CGT	2	6	33140	33145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228599
527	NC_020060	GGCC	2	8	33174	33181	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
528	NC_020060	GCG	3	9	33222	33230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228599
529	NC_020060	GTC	2	6	33260	33265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228599
530	NC_020060	TGA	2	6	33267	33272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228599
531	NC_020060	CGG	2	6	33312	33317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228599
532	NC_020060	CAA	2	6	33325	33330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228599
533	NC_020060	GGT	2	6	33385	33390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228599
534	NC_020060	GCC	2	6	33404	33409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
535	NC_020060	CCT	2	6	33423	33428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228599
536	NC_020060	GCG	2	6	33475	33480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228599
537	NC_020060	CGG	2	6	33957	33962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
538	NC_020060	CCTGTT	2	12	33965	33976	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440228600
539	NC_020060	GTC	2	6	33986	33991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228600
540	NC_020060	CGA	3	9	34015	34023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228600
541	NC_020060	CGC	2	6	34054	34059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228600
542	NC_020060	GGC	2	6	34087	34092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
543	NC_020060	CGG	2	6	34123	34128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
544	NC_020060	GTG	2	6	34203	34208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228600
545	NC_020060	CGG	2	6	34233	34238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
546	NC_020060	TGC	2	6	34239	34244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228600
547	NC_020060	TCG	2	6	34251	34256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228600
548	NC_020060	TGC	2	6	34284	34289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228600
549	NC_020060	CGGC	2	8	34306	34313	0 %	0 %	50 %	50 %	440228600
550	NC_020060	GCC	2	6	34466	34471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228600
551	NC_020060	GC	3	6	34508	34513	0 %	0 %	50 %	50 %	440228600
552	NC_020060	GCG	2	6	34540	34545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
553	NC_020060	CGC	2	6	34635	34640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228600
554	NC_020060	GGC	2	6	34642	34647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
555	NC_020060	GCG	2	6	34648	34653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
556	NC_020060	GGGGAG	2	12	34687	34698	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	440228600
557	NC_020060	CT	3	6	34861	34866	0 %	50 %	0 %	50 %	440228601
558	NC_020060	GACG	2	8	34970	34977	25 %	0 %	50 %	25 %	440228601
559	NC_020060	CGA	2	6	34993	34998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228601
560	NC_020060	AAGCC	2	10	35001	35010	40 %	0 %	20 %	40 %	440228601
561	NC_020060	TCG	2	6	35044	35049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228601
562	NC_020060	CG	3	6	35134	35139	0 %	0 %	50 %	50 %	440228601
563	NC_020060	TCG	2	6	35158	35163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228601
564	NC_020060	TGCTT	2	10	35278	35287	0 %	60 %	20 %	20 %	440228601
565	NC_020060	CAG	2	6	35361	35366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228601
566	NC_020060	CGT	2	6	35448	35453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228601
567	NC_020060	GTGA	2	8	35546	35553	25 %	25 %	50 %	0 %	440228601
568	NC_020060	GTC	2	6	35568	35573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228601
569	NC_020060	ATGA	2	8	35739	35746	50 %	25 %	25 %	0 %	440228602
570	NC_020060	CGG	2	6	35772	35777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228602
571	NC_020060	GAT	2	6	35793	35798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228602
572	NC_020060	TCT	2	6	35872	35877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228602
573	NC_020060	TTG	2	6	35944	35949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228602
574	NC_020060	CTG	2	6	36099	36104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228602
575	NC_020060	CCA	2	6	36137	36142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228602
576	NC_020060	TTG	2	6	36160	36165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228602
577	NC_020060	GC	3	6	36301	36306	0 %	0 %	50 %	50 %	440228602
578	NC_020060	ATCTCA	2	12	36334	36345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228602
579	NC_020060	TTC	2	6	36367	36372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228602
580	NC_020060	TCA	2	6	36431	36436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228602
581	NC_020060	T	6	6	36458	36463	0 %	100 %	0 %	0 %	440228602
582	NC_020060	GCA	2	6	36478	36483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228602
583	NC_020060	ATG	2	6	36528	36533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228602
584	NC_020060	A	7	7	36581	36587	100 %	0 %	0 %	0 %	440228602
585	NC_020060	AGA	2	6	36646	36651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228602
586	NC_020060	TTG	2	6	36695	36700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228602
587	NC_020060	TCT	2	6	36707	36712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228602
588	NC_020060	GAT	2	6	36714	36719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228602
589	NC_020060	GCT	2	6	36770	36775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228602
590	NC_020060	TCA	2	6	36955	36960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228602
591	NC_020060	GAT	2	6	37044	37049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228602
592	NC_020060	CTC	3	9	37050	37058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228602
593	NC_020060	TGA	2	6	37061	37066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228602
594	NC_020060	GA	3	6	37156	37161	50 %	0 %	50 %	0 %	440228602
595	NC_020060	ACG	2	6	37166	37171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228602
596	NC_020060	GTT	2	6	37294	37299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228602
597	NC_020060	CAT	2	6	37307	37312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228602
598	NC_020060	GCAA	2	8	37324	37331	50 %	0 %	25 %	25 %	440228602
599	NC_020060	ACG	2	6	37444	37449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228602
600	NC_020060	ACC	2	6	37471	37476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228602
601	NC_020060	GA	3	6	37504	37509	50 %	0 %	50 %	0 %	440228602
602	NC_020060	GAG	2	6	37586	37591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228603
603	NC_020060	TCG	2	6	37620	37625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228603
604	NC_020060	GCCA	2	8	37644	37651	25 %	0 %	25 %	50 %	440228603
605	NC_020060	TCGT	2	8	37658	37665	0 %	50 %	25 %	25 %	440228603
606	NC_020060	A	6	6	37703	37708	100 %	0 %	0 %	0 %	440228603
607	NC_020060	TCG	2	6	37746	37751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228603
608	NC_020060	CAT	2	6	37778	37783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228603
609	NC_020060	GGAC	2	8	37801	37808	25 %	0 %	50 %	25 %	440228603
610	NC_020060	GCC	2	6	38019	38024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228603
611	NC_020060	CAT	2	6	38037	38042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228604
612	NC_020060	TGA	2	6	38051	38056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228604
613	NC_020060	CAT	2	6	38175	38180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228604
614	NC_020060	CGA	2	6	38346	38351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228604
615	NC_020060	AGC	2	6	38384	38389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228604
616	NC_020060	GAT	2	6	38509	38514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228604
617	NC_020060	GCT	2	6	38523	38528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228604
618	NC_020060	CAA	2	6	38677	38682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228604
619	NC_020060	ATC	2	6	38765	38770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228604
620	NC_020060	AGC	2	6	38849	38854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228604
621	NC_020060	AACG	2	8	38959	38966	50 %	0 %	25 %	25 %	440228604
622	NC_020060	GCTT	2	8	38977	38984	0 %	50 %	25 %	25 %	440228604
623	NC_020060	GAT	2	6	38995	39000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228604
624	NC_020060	GGC	2	6	39059	39064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228604
625	NC_020060	CAT	2	6	39091	39096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228604
626	NC_020060	GCG	2	6	39276	39281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228605
627	NC_020060	TGA	2	6	39528	39533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228606
628	NC_020060	ATC	2	6	39577	39582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228606
629	NC_020060	CGG	2	6	39749	39754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228606
630	NC_020060	GCT	2	6	39810	39815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228606
631	NC_020060	CCG	2	6	39866	39871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228606
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640	NC_020060	TCA	2	6	40239	40244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228606
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643	NC_020060	TCGA	2	8	40381	40388	25 %	25 %	25 %	25 %	440228606
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659	NC_020060	CGG	2	6	41005	41010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228607
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661	NC_020060	CCTG	2	8	41134	41141	0 %	25 %	25 %	50 %	440228607
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751	NC_020060	TCAC	2	8	45974	45981	25 %	25 %	0 %	50 %	440228610
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753	NC_020060	CGCA	2	8	46326	46333	25 %	0 %	25 %	50 %	440228611
754	NC_020060	GGA	2	6	46365	46370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228611
755	NC_020060	ACG	2	6	46391	46396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228611
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758	NC_020060	CG	3	6	46495	46500	0 %	0 %	50 %	50 %	440228611
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999	NC_020060	GGCG	2	8	63322	63329	0 %	0 %	75 %	25 %	440228629
1000	NC_020060	GAT	2	6	63374	63379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228629

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