MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 57707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020059	CTT	2	6	444	449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224889
2	NC_020059	CCG	2	6	494	499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224889
3	NC_020059	AGC	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224889
4	NC_020059	TCG	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224889
5	NC_020059	TGA	2	6	713	718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224889
6	NC_020059	CGC	3	9	751	759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224889
7	NC_020059	TGA	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224889
8	NC_020059	ATT	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224889
9	NC_020059	ATG	3	9	830	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224889
10	NC_020059	ATG	3	9	857	865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224889
11	NC_020059	GTC	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224889
12	NC_020059	ATC	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224889
13	NC_020059	CGA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224889
14	NC_020059	TCG	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224889
15	NC_020059	TTG	2	6	1022	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224889
16	NC_020059	CGA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224889
17	NC_020059	ACG	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224889
18	NC_020059	GGC	2	6	1096	1101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224889
19	NC_020059	GAG	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224889
20	NC_020059	GCC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224889
21	NC_020059	TTG	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224889
22	NC_020059	TCC	2	6	1306	1311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224890
23	NC_020059	CGG	2	6	1321	1326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224890
24	NC_020059	CGC	2	6	1365	1370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224890
25	NC_020059	ATC	2	6	1571	1576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224890
26	NC_020059	CGC	2	6	1705	1710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224890
27	NC_020059	TGC	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224890
28	NC_020059	GAT	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224890
29	NC_020059	CGC	2	6	1944	1949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224891
30	NC_020059	AGC	2	6	1971	1976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224891
31	NC_020059	CGC	2	6	2026	2031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224891
32	NC_020059	TCG	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224891
33	NC_020059	GCG	2	6	2102	2107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224891
34	NC_020059	GAA	2	6	2141	2146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224891
35	NC_020059	GGC	2	6	2177	2182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224891
36	NC_020059	CGT	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224891
37	NC_020059	CGC	2	6	2568	2573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224891
38	NC_020059	TCG	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224891
39	NC_020059	TGC	3	9	2625	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224891
40	NC_020059	CGG	2	6	2676	2681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224891
41	NC_020059	ATC	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224891
42	NC_020059	GTC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224892
43	NC_020059	GGA	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224892
44	NC_020059	GGC	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224892
45	NC_020059	ATT	2	6	3291	3296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224892
46	NC_020059	GCG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224892
47	NC_020059	AGC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224892
48	NC_020059	ATC	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224893
49	NC_020059	TCA	2	6	3432	3437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224893
50	NC_020059	GCC	2	6	3550	3555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224893
51	NC_020059	CTT	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224893
52	NC_020059	GCC	2	6	3666	3671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224893
53	NC_020059	CGG	2	6	3716	3721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224893
54	NC_020059	CTG	2	6	3821	3826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224893
55	NC_020059	GAT	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224893
56	NC_020059	CGG	2	6	3850	3855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224893
57	NC_020059	GGA	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224893
58	NC_020059	TCG	3	9	3933	3941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224893
59	NC_020059	GAG	3	9	3983	3991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224893
60	NC_020059	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224893
61	NC_020059	TTC	2	6	4184	4189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224894
62	NC_020059	ATC	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224894
63	NC_020059	GCG	2	6	4240	4245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224894
64	NC_020059	GCC	2	6	4250	4255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224894
65	NC_020059	GAT	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224894
66	NC_020059	CAG	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224894
67	NC_020059	AGC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224894
68	NC_020059	GCA	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224894
69	NC_020059	CGC	2	6	4369	4374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224894
70	NC_020059	ACG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224894
71	NC_020059	GCA	2	6	4599	4604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224894
72	NC_020059	CGA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224895
73	NC_020059	CGG	2	6	4862	4867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224895
74	NC_020059	CGA	4	12	4884	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224895
75	NC_020059	AGC	2	6	4946	4951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224895
76	NC_020059	GAT	2	6	4957	4962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224895
77	NC_020059	GCA	2	6	4980	4985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224895
78	NC_020059	GAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224895
79	NC_020059	GGC	2	6	4996	5001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224895
80	NC_020059	ACG	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224895
81	NC_020059	CGC	2	6	5043	5048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224895
82	NC_020059	AGC	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224895
83	NC_020059	AGC	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224895
84	NC_020059	ATC	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224895
85	NC_020059	GAA	2	6	5226	5231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224895
86	NC_020059	TGG	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224896
87	NC_020059	TCT	2	6	5443	5448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224896
88	NC_020059	GCC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224896
89	NC_020059	GCC	2	6	5492	5497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224896
90	NC_020059	GGT	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224896
91	NC_020059	TGC	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224896
92	NC_020059	CGC	2	6	5638	5643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224896
93	NC_020059	GAT	2	6	5729	5734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224896
94	NC_020059	CTG	2	6	5778	5783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224896
95	NC_020059	GCC	2	6	5811	5816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224896
96	NC_020059	CCG	2	6	5890	5895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224896
97	NC_020059	TCA	2	6	5917	5922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224896
98	NC_020059	GAT	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224896
99	NC_020059	GAG	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224897
100	NC_020059	GAT	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224897
101	NC_020059	CTC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224897
102	NC_020059	GCG	2	6	6278	6283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224897
103	NC_020059	GAG	2	6	6329	6334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224897
104	NC_020059	CGC	2	6	6356	6361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224897
105	NC_020059	GCG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224897
106	NC_020059	CCG	2	6	6417	6422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224897
107	NC_020059	CGC	2	6	6455	6460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224897
108	NC_020059	TCT	2	6	6639	6644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224897
109	NC_020059	GCG	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224897
110	NC_020059	TGC	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224897
111	NC_020059	CGG	2	6	6735	6740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224897
112	NC_020059	CTG	2	6	6767	6772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224897
113	NC_020059	TCT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224897
114	NC_020059	TGG	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224897
115	NC_020059	CTT	2	6	6988	6993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224897
116	NC_020059	TCG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224897
117	NC_020059	GGC	3	9	7183	7191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224897
118	NC_020059	GGC	2	6	7329	7334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224898
119	NC_020059	AGC	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224898
120	NC_020059	CCG	2	6	7439	7444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224898
121	NC_020059	GCC	2	6	7445	7450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224898
122	NC_020059	ATC	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224898
123	NC_020059	CTG	2	6	7570	7575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224898
124	NC_020059	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224898
125	NC_020059	CGG	2	6	7734	7739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224898
126	NC_020059	GGC	2	6	7853	7858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224899
127	NC_020059	CTG	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224899
128	NC_020059	CAT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224899
129	NC_020059	GTC	2	6	8019	8024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224899
130	NC_020059	TGG	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224900
131	NC_020059	GTC	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224900
132	NC_020059	GCG	2	6	8694	8699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224900
133	NC_020059	CGG	2	6	8709	8714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224900
134	NC_020059	CGG	2	6	8743	8748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224900
135	NC_020059	CGG	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224900
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137	NC_020059	CCG	2	6	8845	8850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224900
138	NC_020059	CGA	2	6	8926	8931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224900
139	NC_020059	ACG	2	6	9102	9107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224900
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142	NC_020059	CAA	2	6	9259	9264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224900
143	NC_020059	CGG	2	6	9280	9285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224900
144	NC_020059	CCT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224900
145	NC_020059	AAG	2	6	9359	9364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224900
146	NC_020059	CGA	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224900
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149	NC_020059	CGT	2	6	9490	9495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224900
150	NC_020059	GTC	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224900
151	NC_020059	GCC	2	6	9587	9592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224900
152	NC_020059	CGC	2	6	9626	9631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224900
153	NC_020059	TCG	2	6	9714	9719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224900
154	NC_020059	ATC	3	9	9926	9934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224900
155	NC_020059	TGC	2	6	9975	9980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224900
156	NC_020059	CTT	3	9	9985	9993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224900
157	NC_020059	GCC	2	6	10042	10047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224900
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159	NC_020059	GTC	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224900
160	NC_020059	GGC	2	6	10270	10275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224900
161	NC_020059	ATG	2	6	10338	10343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224900
162	NC_020059	GGC	2	6	10412	10417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224900
163	NC_020059	GTC	2	6	10454	10459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224900
164	NC_020059	CGC	2	6	10559	10564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224900
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168	NC_020059	ACG	2	6	10691	10696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224900
169	NC_020059	GCC	2	6	11038	11043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224901
170	NC_020059	CGG	2	6	11204	11209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224901
171	NC_020059	CGC	2	6	11219	11224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224901
172	NC_020059	AGC	2	6	11248	11253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224901
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224	NC_020059	GCC	2	6	15378	15383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224905
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228	NC_020059	CAC	2	6	15910	15915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224906
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230	NC_020059	CCG	2	6	16044	16049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224906
231	NC_020059	TCG	2	6	16077	16082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224906
232	NC_020059	GCT	2	6	16108	16113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224906
233	NC_020059	GGA	2	6	16213	16218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224906
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235	NC_020059	ACC	2	6	16248	16253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224906
236	NC_020059	GTC	2	6	16271	16276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224906
237	NC_020059	GGC	4	12	16306	16317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224906
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239	NC_020059	CGT	2	6	16350	16355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224906
240	NC_020059	GTC	2	6	16454	16459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224906
241	NC_020059	CTT	2	6	16573	16578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224906
242	NC_020059	ACG	2	6	16632	16637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224906
243	NC_020059	CGG	2	6	16662	16667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224906
244	NC_020059	TCA	2	6	16698	16703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224906
245	NC_020059	ACG	2	6	16800	16805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224906
246	NC_020059	CCG	2	6	16930	16935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224906
247	NC_020059	TCA	2	6	17007	17012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224906
248	NC_020059	CTA	2	6	17392	17397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224907
249	NC_020059	TCT	2	6	17425	17430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224907
250	NC_020059	GAC	2	6	17589	17594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224907
251	NC_020059	CAA	2	6	17732	17737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224907
252	NC_020059	GGC	2	6	17757	17762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224907
253	NC_020059	GCT	2	6	17887	17892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224908
254	NC_020059	CGG	2	6	18025	18030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224908
255	NC_020059	GGC	2	6	18064	18069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224908
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257	NC_020059	CTG	2	6	18170	18175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224908
258	NC_020059	TCG	2	6	18237	18242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224908
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286	NC_020059	GCC	2	6	20253	20258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224911
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377	NC_020059	CAT	2	6	25636	25641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224916
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499	NC_020059	TCG	2	6	32775	32780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224919
500	NC_020059	CGC	2	6	32864	32869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224919

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