MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 77319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020059	GAT	3	9	179737	179745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225045
3502	NC_020059	GCG	2	6	179751	179756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225045
3503	NC_020059	CGT	2	6	179845	179850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3504	NC_020059	GAC	2	6	179855	179860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3505	NC_020059	ACC	3	9	179887	179895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225046
3506	NC_020059	ATG	2	6	179896	179901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225046
3507	NC_020059	TCG	2	6	179909	179914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3508	NC_020059	GC	3	6	179944	179949	0 %	0 %	50 %	50 %	440225046
3509	NC_020059	CAT	3	9	179967	179975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225046
3510	NC_020059	CGC	2	6	179984	179989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225046
3511	NC_020059	AGC	2	6	179992	179997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3512	NC_020059	GCG	2	6	179999	180004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225046
3513	NC_020059	AGG	2	6	180011	180016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225046
3514	NC_020059	CGA	2	6	180047	180052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3515	NC_020059	CGGC	2	8	180098	180105	0 %	0 %	50 %	50 %	440225046
3516	NC_020059	GCC	2	6	180124	180129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225046
3517	NC_020059	CGA	2	6	180164	180169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3518	NC_020059	ATC	2	6	180178	180183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225046
3519	NC_020059	CGA	2	6	180209	180214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3520	NC_020059	TGA	2	6	180254	180259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225046
3521	NC_020059	CGG	2	6	180359	180364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225046
3522	NC_020059	GAT	2	6	180366	180371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225046
3523	NC_020059	GGC	2	6	180414	180419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225046
3524	NC_020059	AGC	2	6	180433	180438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3525	NC_020059	CGT	2	6	180447	180452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225046
3526	NC_020059	GAA	2	6	180507	180512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225046
3527	NC_020059	CGC	2	6	180555	180560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225046
3528	NC_020059	TCA	2	6	180632	180637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225046
3529	NC_020059	TCA	2	6	180644	180649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225046
3530	NC_020059	ATC	2	6	180782	180787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225047
3531	NC_020059	CTG	2	6	180877	180882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3532	NC_020059	TGA	2	6	180906	180911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225047
3533	NC_020059	TCG	2	6	181005	181010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3534	NC_020059	CG	3	6	181018	181023	0 %	0 %	50 %	50 %	440225047
3535	NC_020059	GAC	2	6	181117	181122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3536	NC_020059	CGGCAT	2	12	181161	181172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3537	NC_020059	CGT	2	6	181225	181230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3538	NC_020059	GTC	2	6	181264	181269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3539	NC_020059	AGG	2	6	181287	181292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225047
3540	NC_020059	CGG	2	6	181297	181302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225047
3541	NC_020059	GCG	2	6	181371	181376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225047
3542	NC_020059	TGC	2	6	181416	181421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3543	NC_020059	CTG	2	6	181444	181449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225047
3544	NC_020059	GCC	2	6	181501	181506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225047
3545	NC_020059	CAGCTT	2	12	181510	181521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440225047
3546	NC_020059	TTG	2	6	181538	181543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440225047
3547	NC_020059	TCGCAG	2	12	181562	181573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440225047
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3549	NC_020059	GAT	2	6	181591	181596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225047
3550	NC_020059	TCT	2	6	181608	181613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225047
3551	NC_020059	CCA	2	6	181627	181632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225047
3552	NC_020059	CGA	2	6	182028	182033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225048
3553	NC_020059	CTG	2	6	182035	182040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225048
3554	NC_020059	GCG	2	6	182047	182052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225048
3555	NC_020059	GAC	2	6	182053	182058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225048
3556	NC_020059	GCC	2	6	182096	182101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225048
3557	NC_020059	CTG	2	6	182116	182121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225048
3558	NC_020059	GCTG	2	8	182156	182163	0 %	25 %	50 %	25 %	440225048
3559	NC_020059	TCA	2	6	182180	182185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225048
3560	NC_020059	CGG	2	6	182191	182196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225048
3561	NC_020059	CCGG	2	8	182212	182219	0 %	0 %	50 %	50 %	440225048
3562	NC_020059	CGC	3	9	182437	182445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225048
3563	NC_020059	CCG	2	6	182488	182493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225048
3564	NC_020059	GCG	2	6	182510	182515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225048
3565	NC_020059	CGA	2	6	182577	182582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225048
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3567	NC_020059	GCCGGC	2	12	182728	182739	0 %	0 %	50 %	50 %	440225048
3568	NC_020059	CGA	2	6	182769	182774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225048
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3570	NC_020059	CGA	2	6	182895	182900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225048
3571	NC_020059	TCG	2	6	183155	183160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225048
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3573	NC_020059	GCG	2	6	183262	183267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225048
3574	NC_020059	GCTGC	2	10	183277	183286	0 %	20 %	40 %	40 %	440225048
3575	NC_020059	GAT	2	6	183307	183312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225048
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3577	NC_020059	TCG	2	6	183389	183394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225048
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3579	NC_020059	CTGG	2	8	183432	183439	0 %	25 %	50 %	25 %	440225048
3580	NC_020059	GGT	2	6	183507	183512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225048
3581	NC_020059	CTC	2	6	183516	183521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440225048
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3585	NC_020059	CGG	2	6	183624	183629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225048
3586	NC_020059	TGA	2	6	183632	183637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225048
3587	NC_020059	GAG	2	6	183652	183657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225048
3588	NC_020059	CGC	2	6	183728	183733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225048
3589	NC_020059	TGG	2	6	183736	183741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225048
3590	NC_020059	GC	3	6	183782	183787	0 %	0 %	50 %	50 %	440225048
3591	NC_020059	CTCC	2	8	183809	183816	0 %	25 %	0 %	75 %	440225048
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3594	NC_020059	GA	3	6	184265	184270	50 %	0 %	50 %	0 %	440225049
3595	NC_020059	CCTT	2	8	184393	184400	0 %	50 %	0 %	50 %	440225049
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3598	NC_020059	CGG	2	6	184441	184446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225049
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3601	NC_020059	GGGC	2	8	184648	184655	0 %	0 %	75 %	25 %	440225049
3602	NC_020059	TCG	2	6	184684	184689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225049
3603	NC_020059	CCGG	2	8	184726	184733	0 %	0 %	50 %	50 %	440225049
3604	NC_020059	GGC	2	6	184786	184791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225049
3605	NC_020059	CAT	2	6	184828	184833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225049
3606	NC_020059	CTGCG	2	10	184896	184905	0 %	20 %	40 %	40 %	440225049
3607	NC_020059	TGG	2	6	184913	184918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225049
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3609	NC_020059	AAT	2	6	184956	184961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440225049
3610	NC_020059	CGC	2	6	185348	185353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225050
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3612	NC_020059	GC	3	6	185430	185435	0 %	0 %	50 %	50 %	440225050
3613	NC_020059	CGGA	2	8	185446	185453	25 %	0 %	50 %	25 %	440225050
3614	NC_020059	CGGC	2	8	185464	185471	0 %	0 %	50 %	50 %	440225050
3615	NC_020059	TC	3	6	185585	185590	0 %	50 %	0 %	50 %	440225050
3616	NC_020059	CCA	2	6	185593	185598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225050
3617	NC_020059	TCA	2	6	185671	185676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225050
3618	NC_020059	CGT	2	6	185699	185704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225050
3619	NC_020059	CATC	2	8	185710	185717	25 %	25 %	0 %	50 %	440225050
3620	NC_020059	GAT	2	6	185729	185734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225050
3621	NC_020059	CGAT	2	8	185758	185765	25 %	25 %	25 %	25 %	440225050
3622	NC_020059	TGC	2	6	185800	185805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225050
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3624	NC_020059	TCG	2	6	185893	185898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225050
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3730	NC_020059	CGGC	2	8	190753	190760	0 %	0 %	50 %	50 %	440225056
3731	NC_020059	GA	3	6	190790	190795	50 %	0 %	50 %	0 %	440225056
3732	NC_020059	GCG	2	6	190809	190814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225056
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3735	NC_020059	ACGA	2	8	190869	190876	50 %	0 %	25 %	25 %	440225056
3736	NC_020059	TTCCGG	2	12	190970	190981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225056
3737	NC_020059	CTGC	2	8	190993	191000	0 %	25 %	25 %	50 %	440225056
3738	NC_020059	CGA	2	6	191092	191097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225056
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3849	NC_020059	TCT	2	6	196183	196188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225062
3850	NC_020059	TTCC	2	8	196211	196218	0 %	50 %	0 %	50 %	440225062
3851	NC_020059	GAG	2	6	196256	196261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225062
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3853	NC_020059	ACG	2	6	196296	196301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225062
3854	NC_020059	ATCGA	2	10	196323	196332	40 %	20 %	20 %	20 %	440225062
3855	NC_020059	CCGA	2	8	196340	196347	25 %	0 %	25 %	50 %	440225062
3856	NC_020059	TGC	2	6	196442	196447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225063
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3979	NC_020059	TCG	2	6	202427	202432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3980	NC_020059	TCCGGC	2	12	202438	202449	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440225067
3981	NC_020059	GAC	2	6	202452	202457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3982	NC_020059	GCT	2	6	202458	202463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3983	NC_020059	ATC	2	6	202468	202473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225067
3984	NC_020059	GGT	2	6	202503	202508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225067
3985	NC_020059	CGGCAT	2	12	202563	202574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3986	NC_020059	TC	3	6	202577	202582	0 %	50 %	0 %	50 %	440225067
3987	NC_020059	GC	3	6	202648	202653	0 %	0 %	50 %	50 %	440225067
3988	NC_020059	CCG	2	6	202716	202721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225067
3989	NC_020059	CGG	2	6	202737	202742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225067
3990	NC_020059	CAG	3	9	202744	202752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3991	NC_020059	CG	3	6	202768	202773	0 %	0 %	50 %	50 %	440225067
3992	NC_020059	TGC	2	6	202796	202801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3993	NC_020059	CGA	2	6	202803	202808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3994	NC_020059	TGC	2	6	202868	202873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225067
3995	NC_020059	CGG	2	6	202889	202894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225067
3996	NC_020059	CGC	2	6	202982	202987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225067
3997	NC_020059	CAT	2	6	203043	203048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225067
3998	NC_020059	GGC	2	6	203052	203057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225067
3999	NC_020059	CGAT	2	8	203171	203178	25 %	25 %	25 %	25 %	440225067
4000	NC_020059	TGC	2	6	203193	203198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225067

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