MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 77319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020059	CTC	2	6	48196	48201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224932
1002	NC_020059	GAA	2	6	48229	48234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224932
1003	NC_020059	CGGC	2	8	48264	48271	0 %	0 %	50 %	50 %	440224932
1004	NC_020059	GCA	2	6	48285	48290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224932
1005	NC_020059	ATTC	2	8	48339	48346	25 %	50 %	0 %	25 %	440224932
1006	NC_020059	GCA	2	6	48348	48353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224932
1007	NC_020059	CGT	2	6	48354	48359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224932
1008	NC_020059	AAG	2	6	48375	48380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224932
1009	NC_020059	GGCC	2	8	48399	48406	0 %	0 %	50 %	50 %	440224932
1010	NC_020059	GCA	2	6	48426	48431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224932
1011	NC_020059	GCG	2	6	48481	48486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224932
1012	NC_020059	CCGT	2	8	48515	48522	0 %	25 %	25 %	50 %	440224932
1013	NC_020059	GCT	2	6	48675	48680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224932
1014	NC_020059	CGACAG	2	12	48724	48735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224932
1015	NC_020059	TCG	2	6	48752	48757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224932
1016	NC_020059	GATC	2	8	48759	48766	25 %	25 %	25 %	25 %	440224932
1017	NC_020059	TTC	2	6	48844	48849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224932
1018	NC_020059	TAG	2	6	48863	48868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224932
1019	NC_020059	GCTG	2	8	48911	48918	0 %	25 %	50 %	25 %	440224932
1020	NC_020059	AGA	2	6	49047	49052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224933
1021	NC_020059	GCC	2	6	49068	49073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224933
1022	NC_020059	CCT	2	6	49129	49134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224933
1023	NC_020059	CGC	2	6	49148	49153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224933
1024	NC_020059	CGG	2	6	49165	49170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224933
1025	NC_020059	CAA	2	6	49171	49176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224933
1026	NC_020059	CGA	2	6	49222	49227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224933
1027	NC_020059	TTCG	2	8	49228	49235	0 %	50 %	25 %	25 %	440224933
1028	NC_020059	CCG	2	6	49371	49376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224934
1029	NC_020059	CCTT	2	8	49385	49392	0 %	50 %	0 %	50 %	440224934
1030	NC_020059	TCG	2	6	49409	49414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224934
1031	NC_020059	CGC	2	6	49425	49430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224934
1032	NC_020059	GCC	2	6	49600	49605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224934
1033	NC_020059	CGC	2	6	49638	49643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224934
1034	NC_020059	CGC	2	6	49661	49666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224934
1035	NC_020059	AAC	2	6	49681	49686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224934
1036	NC_020059	TTG	2	6	49736	49741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224934
1037	NC_020059	GCC	2	6	49745	49750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224934
1038	NC_020059	AGC	3	9	49781	49789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224934
1039	NC_020059	CGC	3	9	49815	49823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224934
1040	NC_020059	CGG	2	6	49851	49856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224934
1041	NC_020059	CCA	2	6	49863	49868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224934
1042	NC_020059	GGA	2	6	49894	49899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224934
1043	NC_020059	TCG	2	6	49925	49930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224934
1044	NC_020059	GAC	2	6	50008	50013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224934
1045	NC_020059	CCT	2	6	50072	50077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224935
1046	NC_020059	GCCT	2	8	50080	50087	0 %	25 %	25 %	50 %	440224935
1047	NC_020059	GATC	2	8	50111	50118	25 %	25 %	25 %	25 %	440224935
1048	NC_020059	CAT	2	6	50123	50128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224935
1049	NC_020059	GC	3	6	50132	50137	0 %	0 %	50 %	50 %	440224935
1050	NC_020059	ATC	2	6	50179	50184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224935
1051	NC_020059	ATC	2	6	50193	50198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224935
1052	NC_020059	GCGAG	2	10	50201	50210	20 %	0 %	60 %	20 %	440224935
1053	NC_020059	GCC	2	6	50211	50216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224935
1054	NC_020059	GAT	2	6	50313	50318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224935
1055	NC_020059	GCC	2	6	50406	50411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224935
1056	NC_020059	CG	3	6	50519	50524	0 %	0 %	50 %	50 %	440224935
1057	NC_020059	GCC	3	9	50559	50567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224935
1058	NC_020059	TTC	2	6	50581	50586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224935
1059	NC_020059	CGG	2	6	50609	50614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224935
1060	NC_020059	CGA	2	6	50654	50659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224935
1061	NC_020059	ATG	2	6	50803	50808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224935
1062	NC_020059	GC	3	6	50901	50906	0 %	0 %	50 %	50 %	440224936
1063	NC_020059	CCA	2	6	50945	50950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224936
1064	NC_020059	TCG	3	9	50955	50963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224936
1065	NC_020059	TCG	2	6	50972	50977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224936
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1068	NC_020059	GGGC	2	8	51233	51240	0 %	0 %	75 %	25 %	440224936
1069	NC_020059	CGG	2	6	51299	51304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224936
1070	NC_020059	TGCC	2	8	51396	51403	0 %	25 %	25 %	50 %	440224936
1071	NC_020059	TGG	2	6	51429	51434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224936
1072	NC_020059	TCC	2	6	51489	51494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224937
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1074	NC_020059	TCC	2	6	51619	51624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224937
1075	NC_020059	TGA	2	6	51677	51682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224937
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1077	NC_020059	GCA	2	6	51800	51805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224937
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1080	NC_020059	GCCT	2	8	52037	52044	0 %	25 %	25 %	50 %	440224938
1081	NC_020059	GATC	2	8	52051	52058	25 %	25 %	25 %	25 %	440224938
1082	NC_020059	GC	4	8	52077	52084	0 %	0 %	50 %	50 %	440224938
1083	NC_020059	TTG	2	6	52119	52124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224938
1084	NC_020059	GAA	2	6	52181	52186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224938
1085	NC_020059	GC	3	6	52225	52230	0 %	0 %	50 %	50 %	440224938
1086	NC_020059	GCC	2	6	52278	52283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224938
1087	NC_020059	TCGTC	2	10	52291	52300	0 %	40 %	20 %	40 %	440224938
1088	NC_020059	TCGA	2	8	52311	52318	25 %	25 %	25 %	25 %	440224938
1089	NC_020059	TGGCC	2	10	52363	52372	0 %	20 %	40 %	40 %	440224938
1090	NC_020059	TGG	2	6	52401	52406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224938
1091	NC_020059	TCG	2	6	52407	52412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224938
1092	NC_020059	GAA	2	6	52487	52492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224938
1093	NC_020059	TCG	2	6	52510	52515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224938
1094	NC_020059	GAC	2	6	52827	52832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224939
1095	NC_020059	TGA	2	6	52904	52909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224939
1096	NC_020059	GC	3	6	52918	52923	0 %	0 %	50 %	50 %	440224939
1097	NC_020059	CGC	2	6	52930	52935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224939
1098	NC_020059	CCG	2	6	52976	52981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224939
1099	NC_020059	AAG	2	6	53011	53016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224939
1100	NC_020059	GC	3	6	53043	53048	0 %	0 %	50 %	50 %	440224939
1101	NC_020059	ATG	2	6	53107	53112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224939
1102	NC_020059	CGG	2	6	53199	53204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224939
1103	NC_020059	GCT	2	6	53218	53223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224939
1104	NC_020059	CCG	2	6	53252	53257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224939
1105	NC_020059	CGCC	2	8	53265	53272	0 %	0 %	25 %	75 %	440224939
1106	NC_020059	CGC	2	6	53286	53291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224939
1107	NC_020059	ACCA	2	8	53308	53315	50 %	0 %	0 %	50 %	440224939
1108	NC_020059	C	6	6	53410	53415	0 %	0 %	0 %	100 %	440224940
1109	NC_020059	GC	3	6	53468	53473	0 %	0 %	50 %	50 %	440224940
1110	NC_020059	GCC	2	6	53503	53508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224940
1111	NC_020059	AGC	2	6	53509	53514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1112	NC_020059	CGA	2	6	53531	53536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1113	NC_020059	TGA	2	6	53557	53562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224940
1114	NC_020059	CGT	2	6	53598	53603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1115	NC_020059	GC	3	6	53620	53625	0 %	0 %	50 %	50 %	440224940
1116	NC_020059	TCA	2	6	53629	53634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224940
1117	NC_020059	CCA	2	6	53644	53649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224940
1118	NC_020059	GC	3	6	53741	53746	0 %	0 %	50 %	50 %	440224940
1119	NC_020059	GTTG	2	8	53798	53805	0 %	50 %	50 %	0 %	440224940
1120	NC_020059	CG	3	6	53827	53832	0 %	0 %	50 %	50 %	440224940
1121	NC_020059	AAG	2	6	53844	53849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224940
1122	NC_020059	CGA	2	6	53867	53872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1123	NC_020059	CGG	2	6	53918	53923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224940
1124	NC_020059	GGC	2	6	53997	54002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224940
1125	NC_020059	AAG	2	6	54009	54014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224940
1126	NC_020059	CGA	2	6	54056	54061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1127	NC_020059	CGA	2	6	54140	54145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1128	NC_020059	CGC	2	6	54158	54163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224940
1129	NC_020059	GGC	2	6	54171	54176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224940
1130	NC_020059	CTG	2	6	54216	54221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1131	NC_020059	ACG	2	6	54237	54242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1132	NC_020059	CGA	2	6	54247	54252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
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1134	NC_020059	TGC	2	6	54328	54333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1135	NC_020059	CCG	2	6	54395	54400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224940
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1137	NC_020059	CGA	2	6	54482	54487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224940
1138	NC_020059	GCC	2	6	54639	54644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224940
1139	NC_020059	CCA	2	6	54673	54678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224940
1140	NC_020059	AAGC	2	8	54706	54713	50 %	0 %	25 %	25 %	440224940
1141	NC_020059	GCG	2	6	54873	54878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224941
1142	NC_020059	CTT	2	6	54892	54897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224941
1143	NC_020059	GCG	2	6	54940	54945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224941
1144	NC_020059	AGC	2	6	54977	54982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224941
1145	NC_020059	CG	3	6	55013	55018	0 %	0 %	50 %	50 %	440224941
1146	NC_020059	CGATC	2	10	55125	55134	20 %	20 %	20 %	40 %	440224941
1147	NC_020059	GC	3	6	55145	55150	0 %	0 %	50 %	50 %	440224941
1148	NC_020059	TAC	2	6	55201	55206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224941
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1150	NC_020059	CGA	2	6	55266	55271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224941
1151	NC_020059	GCAAGG	2	12	55301	55312	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440224941
1152	NC_020059	GAC	2	6	55357	55362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224941
1153	NC_020059	CGG	2	6	55380	55385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224941
1154	NC_020059	TCT	2	6	55418	55423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224941
1155	NC_020059	GCGG	2	8	55543	55550	0 %	0 %	75 %	25 %	440224941
1156	NC_020059	TCGC	2	8	55582	55589	0 %	25 %	25 %	50 %	440224941
1157	NC_020059	TCG	2	6	55592	55597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224941
1158	NC_020059	GAC	2	6	55621	55626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224941
1159	NC_020059	GC	3	6	55707	55712	0 %	0 %	50 %	50 %	440224941
1160	NC_020059	CGC	3	9	55710	55718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224941
1161	NC_020059	CGC	2	6	55722	55727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224941
1162	NC_020059	GAA	2	6	55762	55767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224941
1163	NC_020059	TAC	2	6	55771	55776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224941
1164	NC_020059	GGCT	2	8	55777	55784	0 %	25 %	50 %	25 %	440224941
1165	NC_020059	CCG	2	6	55969	55974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224942
1166	NC_020059	GCC	2	6	55995	56000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224942
1167	NC_020059	ATC	2	6	56014	56019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224942
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1169	NC_020059	GCC	2	6	56158	56163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224942
1170	NC_020059	CTG	2	6	56221	56226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224942
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1173	NC_020059	CCTG	2	8	56536	56543	0 %	25 %	25 %	50 %	440224942
1174	NC_020059	CGG	2	6	56565	56570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224942
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1182	NC_020059	CGC	2	6	56907	56912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224942
1183	NC_020059	GAG	2	6	56917	56922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224942
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1188	NC_020059	TTC	2	6	57107	57112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224942
1189	NC_020059	CG	3	6	57167	57172	0 %	0 %	50 %	50 %	440224942
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1198	NC_020059	TCC	2	6	58079	58084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224943
1199	NC_020059	CGG	2	6	58086	58091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224943
1200	NC_020059	AGG	2	6	58139	58144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224943
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1203	NC_020059	CCGCG	2	10	58303	58312	0 %	0 %	40 %	60 %	440224943
1204	NC_020059	GAC	2	6	58317	58322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224943
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1220	NC_020059	CGC	2	6	58744	58749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224943
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1223	NC_020059	CATG	2	8	58776	58783	25 %	25 %	25 %	25 %	440224943
1224	NC_020059	AGC	3	9	58808	58816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224943
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1226	NC_020059	TGCGC	2	10	58854	58863	0 %	20 %	40 %	40 %	440224943
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1231	NC_020059	GGC	2	6	59023	59028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224943
1232	NC_020059	CGGC	2	8	59058	59065	0 %	0 %	50 %	50 %	440224943
1233	NC_020059	CCG	2	6	59091	59096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224943
1234	NC_020059	AGA	2	6	59171	59176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224943
1235	NC_020059	TCG	2	6	59177	59182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224943
1236	NC_020059	CGC	2	6	59217	59222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224943
1237	NC_020059	ATCG	2	8	59275	59282	25 %	25 %	25 %	25 %	440224943
1238	NC_020059	TAT	2	6	59368	59373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224943
1239	NC_020059	CGT	2	6	59448	59453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224943
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1241	NC_020059	CGA	2	6	59547	59552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224943
1242	NC_020059	CG	3	6	59579	59584	0 %	0 %	50 %	50 %	440224943
1243	NC_020059	GGC	2	6	59592	59597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224943
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1245	NC_020059	ATT	2	6	59748	59753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224943
1246	NC_020059	AGG	2	6	59928	59933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224944
1247	NC_020059	CTT	2	6	59965	59970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224944
1248	NC_020059	TGA	2	6	60055	60060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224944
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1250	NC_020059	CCG	2	6	60195	60200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224944
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1497	NC_020059	CAT	2	6	78080	78085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224953
1498	NC_020059	CCA	2	6	78110	78115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224953
1499	NC_020059	ATG	2	6	78144	78149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224953
1500	NC_020059	GGC	2	6	78158	78163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224953

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