MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 77319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020059	GCT	2	6	247168	247173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225105
5002	NC_020059	CAT	2	6	247198	247203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225105
5003	NC_020059	CCG	2	6	247300	247305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225105
5004	NC_020059	GC	3	6	247308	247313	0 %	0 %	50 %	50 %	440225105
5005	NC_020059	CGA	2	6	247336	247341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225105
5006	NC_020059	GCT	2	6	247394	247399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225105
5007	NC_020059	GCC	2	6	247400	247405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225105
5008	NC_020059	GCGG	2	8	247429	247436	0 %	0 %	75 %	25 %	440225105
5009	NC_020059	GC	3	6	247449	247454	0 %	0 %	50 %	50 %	440225105
5010	NC_020059	GCC	2	6	247487	247492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225106
5011	NC_020059	TGC	2	6	247494	247499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225106
5012	NC_020059	ATC	2	6	247523	247528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225106
5013	NC_020059	GAA	2	6	247554	247559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225106
5014	NC_020059	TCG	2	6	247605	247610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225106
5015	NC_020059	CCA	2	6	247623	247628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225106
5016	NC_020059	GCC	2	6	247630	247635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225106
5017	NC_020059	CGG	2	6	247753	247758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225106
5018	NC_020059	GCTTG	2	10	247798	247807	0 %	40 %	40 %	20 %	440225106
5019	NC_020059	TGCC	2	8	247864	247871	0 %	25 %	25 %	50 %	440225106
5020	NC_020059	CG	3	6	247890	247895	0 %	0 %	50 %	50 %	440225106
5021	NC_020059	GTC	2	6	247948	247953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225106
5022	NC_020059	GCCGC	2	10	248007	248016	0 %	0 %	40 %	60 %	440225106
5023	NC_020059	CGC	2	6	248133	248138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225106
5024	NC_020059	GC	3	6	248172	248177	0 %	0 %	50 %	50 %	440225106
5025	NC_020059	GCC	2	6	248264	248269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225106
5026	NC_020059	AGC	2	6	248270	248275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225106
5027	NC_020059	ATC	2	6	248290	248295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225106
5028	NC_020059	GAA	2	6	248296	248301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225106
5029	NC_020059	CGG	2	6	248319	248324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225106
5030	NC_020059	GCA	2	6	248355	248360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225106
5031	NC_020059	CAC	2	6	248437	248442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225106
5032	NC_020059	GCC	2	6	248489	248494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225106
5033	NC_020059	CGAT	2	8	248721	248728	25 %	25 %	25 %	25 %	440225107
5034	NC_020059	GCC	3	9	248831	248839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225107
5035	NC_020059	GCC	2	6	249141	249146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225108
5036	NC_020059	GC	4	8	249147	249154	0 %	0 %	50 %	50 %	440225108
5037	NC_020059	GCC	2	6	249172	249177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225108
5038	NC_020059	ATG	2	6	249182	249187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225108
5039	NC_020059	CG	3	6	249222	249227	0 %	0 %	50 %	50 %	440225108
5040	NC_020059	GGCC	2	8	249252	249259	0 %	0 %	50 %	50 %	440225108
5041	NC_020059	GGC	3	9	249262	249270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225108
5042	NC_020059	GCG	2	6	249342	249347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225108
5043	NC_020059	GCCGC	2	10	249354	249363	0 %	0 %	40 %	60 %	440225108
5044	NC_020059	CGA	2	6	249372	249377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225108
5045	NC_020059	CCG	2	6	249383	249388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225108
5046	NC_020059	AGC	2	6	249390	249395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225108
5047	NC_020059	TTC	2	6	249409	249414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225108
5048	NC_020059	GGC	2	6	249421	249426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225108
5049	NC_020059	GAC	2	6	249472	249477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225108
5050	NC_020059	GTC	2	6	249496	249501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225108
5051	NC_020059	GCC	2	6	249580	249585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225108
5052	NC_020059	GATC	2	8	249612	249619	25 %	25 %	25 %	25 %	440225108
5053	NC_020059	CCGG	2	8	249631	249638	0 %	0 %	50 %	50 %	440225108
5054	NC_020059	GAC	2	6	249643	249648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225108
5055	NC_020059	CGA	2	6	249714	249719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225108
5056	NC_020059	CT	3	6	249750	249755	0 %	50 %	0 %	50 %	440225109
5057	NC_020059	CCG	2	6	249793	249798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225109
5058	NC_020059	GAT	2	6	249815	249820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225109
5059	NC_020059	CGA	2	6	249841	249846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225109
5060	NC_020059	CGG	2	6	249953	249958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225109
5061	NC_020059	CAGG	2	8	249976	249983	25 %	0 %	50 %	25 %	440225109
5062	NC_020059	GC	3	6	250048	250053	0 %	0 %	50 %	50 %	440225109
5063	NC_020059	CGC	2	6	250136	250141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225109
5064	NC_020059	GA	3	6	250165	250170	50 %	0 %	50 %	0 %	440225109
5065	NC_020059	CGATC	2	10	250183	250192	20 %	20 %	20 %	40 %	440225109
5066	NC_020059	CAG	3	9	250224	250232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225109
5067	NC_020059	TCGA	2	8	250246	250253	25 %	25 %	25 %	25 %	440225109
5068	NC_020059	GCC	2	6	250254	250259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225109
5069	NC_020059	GTTG	2	8	250274	250281	0 %	50 %	50 %	0 %	440225109
5070	NC_020059	GCTT	2	8	250351	250358	0 %	50 %	25 %	25 %	440225109
5071	NC_020059	GGC	3	9	250365	250373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225109
5072	NC_020059	ATCG	2	8	250413	250420	25 %	25 %	25 %	25 %	440225109
5073	NC_020059	GCG	2	6	250424	250429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225109
5074	NC_020059	AGG	2	6	250451	250456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225109
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5080	NC_020059	GCG	2	6	250787	250792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225109
5081	NC_020059	ACG	2	6	250798	250803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225109
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5084	NC_020059	GCCG	2	8	251044	251051	0 %	0 %	50 %	50 %	440225110
5085	NC_020059	TGA	2	6	251141	251146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225110
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5089	NC_020059	TGC	2	6	251549	251554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225110
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5091	NC_020059	CAT	2	6	251708	251713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225110
5092	NC_020059	TCG	2	6	251785	251790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225110
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5094	NC_020059	GGTC	2	8	251981	251988	0 %	25 %	50 %	25 %	440225111
5095	NC_020059	TGC	2	6	252030	252035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225111
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5097	NC_020059	CG	3	6	252136	252141	0 %	0 %	50 %	50 %	440225111
5098	NC_020059	GCC	2	6	252229	252234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225111
5099	NC_020059	CAC	3	9	252258	252266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225111
5100	NC_020059	CG	3	6	252361	252366	0 %	0 %	50 %	50 %	440225111
5101	NC_020059	CCAT	2	8	252419	252426	25 %	25 %	0 %	50 %	440225111
5102	NC_020059	AGGCG	2	10	252433	252442	20 %	0 %	60 %	20 %	440225111
5103	NC_020059	CGC	2	6	252459	252464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225111
5104	NC_020059	GC	3	6	252490	252495	0 %	0 %	50 %	50 %	440225111
5105	NC_020059	CGC	2	6	252521	252526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225111
5106	NC_020059	ATG	2	6	252561	252566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225111
5107	NC_020059	CGC	2	6	252599	252604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225111
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5109	NC_020059	CGC	2	6	252629	252634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225111
5110	NC_020059	CGG	2	6	252692	252697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225111
5111	NC_020059	TGC	2	6	252710	252715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225111
5112	NC_020059	CGA	2	6	252722	252727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225111
5113	NC_020059	GGTC	2	8	252746	252753	0 %	25 %	50 %	25 %	440225111
5114	NC_020059	ATG	2	6	252866	252871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225112
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5117	NC_020059	CGC	2	6	252993	252998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225112
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5119	NC_020059	CTG	2	6	253013	253018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225112
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5121	NC_020059	GGCC	2	8	253057	253064	0 %	0 %	50 %	50 %	440225112
5122	NC_020059	CGT	2	6	253085	253090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225112
5123	NC_020059	TCC	2	6	253092	253097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440225112
5124	NC_020059	ATC	2	6	253115	253120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225112
5125	NC_020059	GCC	2	6	253148	253153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225112
5126	NC_020059	GAC	2	6	253168	253173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225112
5127	NC_020059	GCT	2	6	253258	253263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225112
5128	NC_020059	CGC	2	6	253266	253271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225112
5129	NC_020059	TCG	2	6	253272	253277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225112
5130	NC_020059	TCG	2	6	253317	253322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225112
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5134	NC_020059	GGCC	2	8	253507	253514	0 %	0 %	50 %	50 %	440225112
5135	NC_020059	CCG	2	6	253549	253554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225112
5136	NC_020059	CTG	2	6	253571	253576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225112
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5140	NC_020059	AGC	2	6	253695	253700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225113
5141	NC_020059	GA	3	6	253701	253706	50 %	0 %	50 %	0 %	440225113
5142	NC_020059	CTG	2	6	253736	253741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225113
5143	NC_020059	GTC	2	6	253742	253747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225113
5144	NC_020059	CGG	2	6	253809	253814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225113
5145	NC_020059	CTG	2	6	253823	253828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225113
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5148	NC_020059	TCA	2	6	253953	253958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225113
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5151	NC_020059	GCG	2	6	254081	254086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225113
5152	NC_020059	CTG	2	6	254108	254113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225113
5153	NC_020059	ATG	2	6	254118	254123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225113
5154	NC_020059	ATG	2	6	254136	254141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225113
5155	NC_020059	CCG	2	6	254145	254150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225113
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5214	NC_020059	GGCTC	2	10	257126	257135	0 %	20 %	40 %	40 %	440225117
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5220	NC_020059	CGG	2	6	257285	257290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225117
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5225	NC_020059	GTC	2	6	257628	257633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225118
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5229	NC_020059	GCC	2	6	257991	257996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225118
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5231	NC_020059	GCGA	2	8	258018	258025	25 %	0 %	50 %	25 %	440225118
5232	NC_020059	TTA	2	6	258088	258093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440225118
5233	NC_020059	CGG	2	6	258163	258168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225118
5234	NC_020059	TCG	3	9	258202	258210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225118
5235	NC_020059	GC	3	6	258212	258217	0 %	0 %	50 %	50 %	440225118
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5237	NC_020059	TCG	2	6	258274	258279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225118
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5240	NC_020059	GGCT	2	8	258348	258355	0 %	25 %	50 %	25 %	440225118
5241	NC_020059	GCT	2	6	258437	258442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225118
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5243	NC_020059	GCC	2	6	258673	258678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225119
5244	NC_020059	CGC	2	6	258792	258797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225119
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5340	NC_020059	CGG	2	6	263291	263296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225124
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5345	NC_020059	TCG	2	6	263641	263646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225124
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5351	NC_020059	ACA	2	6	263878	263883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440225124
5352	NC_020059	CGT	2	6	263948	263953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225124
5353	NC_020059	GAAG	2	8	264038	264045	50 %	0 %	50 %	0 %	440225124
5354	NC_020059	GAC	2	6	264066	264071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225124
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5356	NC_020059	GCT	2	6	264105	264110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225124
5357	NC_020059	GAA	2	6	264185	264190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225124
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5361	NC_020059	GC	3	6	264600	264605	0 %	0 %	50 %	50 %	440225125
5362	NC_020059	GAT	2	6	264688	264693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225125
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5364	NC_020059	CGCGG	2	10	264749	264758	0 %	0 %	60 %	40 %	440225125
5365	NC_020059	CGA	2	6	264772	264777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225125
5366	NC_020059	GCCG	2	8	264796	264803	0 %	0 %	50 %	50 %	440225125
5367	NC_020059	TCA	2	6	264864	264869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225125
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5432	NC_020059	CGTTC	2	10	267333	267342	0 %	40 %	20 %	40 %	440225127
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5473	NC_020059	GA	3	6	269092	269097	50 %	0 %	50 %	0 %	440225130
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5479	NC_020059	GC	3	6	269342	269347	0 %	0 %	50 %	50 %	440225130
5480	NC_020059	CGA	2	6	269368	269373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225130
5481	NC_020059	GATC	2	8	269374	269381	25 %	25 %	25 %	25 %	440225130
5482	NC_020059	GGTCC	2	10	269465	269474	0 %	20 %	40 %	40 %	440225130
5483	NC_020059	GC	3	6	269527	269532	0 %	0 %	50 %	50 %	440225130
5484	NC_020059	CGAT	2	8	269544	269551	25 %	25 %	25 %	25 %	440225130
5485	NC_020059	TCA	2	6	269565	269570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225130
5486	NC_020059	CAT	2	6	269620	269625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225130
5487	NC_020059	GC	3	6	269629	269634	0 %	0 %	50 %	50 %	440225130
5488	NC_020059	GCCG	2	8	269668	269675	0 %	0 %	50 %	50 %	440225130
5489	NC_020059	CAT	2	6	269728	269733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225130
5490	NC_020059	CGA	2	6	269788	269793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225130
5491	NC_020059	CGG	2	6	269812	269817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225130
5492	NC_020059	ATC	2	6	269867	269872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225131
5493	NC_020059	GGGGC	2	10	269935	269944	0 %	0 %	80 %	20 %	440225131
5494	NC_020059	GGA	2	6	270007	270012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225131
5495	NC_020059	GCTC	2	8	270038	270045	0 %	25 %	25 %	50 %	440225131
5496	NC_020059	TC	3	6	270123	270128	0 %	50 %	0 %	50 %	440225131
5497	NC_020059	GCTC	2	8	270133	270140	0 %	25 %	25 %	50 %	440225131
5498	NC_020059	CGC	3	9	270145	270153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225131
5499	NC_020059	GAT	2	6	270172	270177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225131
5500	NC_020059	CGG	2	6	270202	270207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225131

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