MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	TGT	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
2	NC_019679	TCT	2	6	265	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
3	NC_019679	CTA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
4	NC_019679	CTA	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
5	NC_019679	GTT	2	6	450	455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
6	NC_019679	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
7	NC_019679	CCT	2	6	538	543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740401
8	NC_019679	ATC	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
9	NC_019679	GCC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427740401
10	NC_019679	ACC	3	9	642	650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740401
11	NC_019679	TTG	2	6	741	746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
12	NC_019679	CTT	3	9	1041	1049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
13	NC_019679	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740403
14	NC_019679	CTT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
15	NC_019679	TCC	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740404
16	NC_019679	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740404
17	NC_019679	TCT	2	6	1423	1428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740404
18	NC_019679	GTT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740405
19	NC_019679	GAA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740406
20	NC_019679	ACA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740407
21	NC_019679	AGC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740407
22	NC_019679	TGA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
23	NC_019679	TGA	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
24	NC_019679	AGA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740407
25	NC_019679	TTC	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740408
26	NC_019679	GAA	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
27	NC_019679	CAT	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740408
28	NC_019679	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
29	NC_019679	AAT	2	6	2950	2955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
30	NC_019679	TAA	2	6	2959	2964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
31	NC_019679	AAG	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
32	NC_019679	AGA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
33	NC_019679	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
34	NC_019679	TAT	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740408
35	NC_019679	AAT	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
36	NC_019679	TGA	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740408
37	NC_019679	ATT	3	9	3438	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
38	NC_019679	TAG	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
39	NC_019679	GTA	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
40	NC_019679	TAG	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
41	NC_019679	AAT	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
42	NC_019679	TAA	2	6	4042	4047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
43	NC_019679	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740409
44	NC_019679	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
45	NC_019679	ATA	2	6	4194	4199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
46	NC_019679	GTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740410
47	NC_019679	TAC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740410
48	NC_019679	GTA	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740411
49	NC_019679	TAC	2	6	6193	6198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740411
50	NC_019679	ATT	2	6	6240	6245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740411
51	NC_019679	GTA	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740412
52	NC_019679	CCA	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740412
53	NC_019679	CAA	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740412
54	NC_019679	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
55	NC_019679	GCA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740413
56	NC_019679	GCT	2	6	6678	6683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740413
57	NC_019679	AAG	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740413
58	NC_019679	TAA	2	6	6812	6817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
59	NC_019679	AAT	2	6	6883	6888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
60	NC_019679	TAT	2	6	6932	6937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740413
61	NC_019679	AAG	2	6	6952	6957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740413
62	NC_019679	CAT	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740413
63	NC_019679	GAT	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740413
64	NC_019679	GTT	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740413
65	NC_019679	TTC	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740413
66	NC_019679	ATC	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740414
67	NC_019679	GAG	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740414
68	NC_019679	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
69	NC_019679	AAT	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740414
70	NC_019679	CAG	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
71	NC_019679	GGA	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740414
72	NC_019679	TTA	2	6	7825	7830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740414
73	NC_019679	AGC	2	6	7863	7868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
74	NC_019679	AGC	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
75	NC_019679	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740414
76	NC_019679	CAC	2	6	8261	8266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740415
77	NC_019679	CTT	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740415
78	NC_019679	CAG	2	6	8405	8410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740415
79	NC_019679	CTT	2	6	8615	8620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
80	NC_019679	CCA	2	6	8723	8728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740416
81	NC_019679	AAT	2	6	8921	8926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
82	NC_019679	TTG	2	6	8988	8993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740416
83	NC_019679	TTC	2	6	9038	9043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
84	NC_019679	ACC	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740416
85	NC_019679	TGG	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427740416
86	NC_019679	AAT	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
87	NC_019679	CAG	2	6	9332	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740416
88	NC_019679	CCT	2	6	9574	9579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740416
89	NC_019679	AAC	2	6	9672	9677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740416
90	NC_019679	AAT	2	6	9853	9858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
91	NC_019679	CTA	2	6	9908	9913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740416
92	NC_019679	CTA	2	6	9923	9928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740416
93	NC_019679	CAG	2	6	10019	10024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740416
94	NC_019679	ATT	2	6	10053	10058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740416
95	NC_019679	CTT	2	6	10088	10093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
96	NC_019679	CTT	2	6	10105	10110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
97	NC_019679	TTC	2	6	10152	10157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
98	NC_019679	TTA	2	6	10219	10224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740416
99	NC_019679	CTT	2	6	10253	10258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
100	NC_019679	AGC	2	6	10679	10684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740416
101	NC_019679	TAA	2	6	10797	10802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
102	NC_019679	ATA	2	6	10980	10985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
103	NC_019679	CTT	2	6	11012	11017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
104	NC_019679	GTA	2	6	11028	11033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740416
105	NC_019679	ATT	2	6	11113	11118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740416
106	NC_019679	TTC	2	6	11127	11132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
107	NC_019679	GAA	2	6	11238	11243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740416
108	NC_019679	CAG	2	6	11420	11425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740416
109	NC_019679	CGA	2	6	11549	11554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740416
110	NC_019679	GTT	2	6	11683	11688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740416
111	NC_019679	TGT	2	6	11707	11712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740416
112	NC_019679	AAT	2	6	11713	11718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
113	NC_019679	TAG	2	6	12005	12010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740416
114	NC_019679	CTT	2	6	12038	12043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
115	NC_019679	CTT	2	6	12155	12160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
116	NC_019679	CTT	2	6	12164	12169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
117	NC_019679	CTT	2	6	12173	12178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
118	NC_019679	TTC	2	6	12279	12284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
119	NC_019679	GCT	2	6	12392	12397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740417
120	NC_019679	ATC	2	6	12407	12412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740417
121	NC_019679	TCT	2	6	12444	12449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740417
122	NC_019679	CAC	2	6	12472	12477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740417
123	NC_019679	TCT	2	6	12897	12902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740417
124	NC_019679	ACT	2	6	12903	12908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740417
125	NC_019679	GCT	2	6	12948	12953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740417
126	NC_019679	TTG	2	6	12971	12976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740417
127	NC_019679	TGC	2	6	13927	13932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740419
128	NC_019679	GAA	2	6	13951	13956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740419
129	NC_019679	ACT	2	6	13975	13980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740419
130	NC_019679	ACC	2	6	14368	14373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740420
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.