MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019678	GTT	2	6	30576	30581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733642
502	NC_019678	GGT	2	6	30629	30634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733642
503	NC_019678	ATT	2	6	30646	30651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733642
504	NC_019678	GCT	2	6	30662	30667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733642
505	NC_019678	CTT	2	6	30695	30700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733642
506	NC_019678	TTA	2	6	30711	30716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733642
507	NC_019678	GAG	2	6	30721	30726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733642
508	NC_019678	TTG	2	6	30736	30741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733642
509	NC_019678	TCT	2	6	30777	30782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733642
510	NC_019678	TGC	2	6	30806	30811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733642
511	NC_019678	T	6	6	30824	30829	0 %	100 %	0 %	0 %	427733642
512	NC_019678	CAA	2	6	30910	30915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733642
513	NC_019678	TGG	2	6	30933	30938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733642
514	NC_019678	T	6	6	30959	30964	0 %	100 %	0 %	0 %	427733642
515	NC_019678	CTAC	2	8	31071	31078	25 %	25 %	0 %	50 %	427733642
516	NC_019678	TC	3	6	31092	31097	0 %	50 %	0 %	50 %	427733642
517	NC_019678	TAT	2	6	31168	31173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733642
518	NC_019678	AATT	2	8	31183	31190	50 %	50 %	0 %	0 %	427733642
519	NC_019678	TAC	2	6	31251	31256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733642
520	NC_019678	TGG	2	6	31265	31270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733642
521	NC_019678	TGC	2	6	31280	31285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733642
522	NC_019678	TAC	2	6	31287	31292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733642
523	NC_019678	AATT	2	8	31336	31343	50 %	50 %	0 %	0 %	427733642
524	NC_019678	ACC	2	6	31415	31420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733642
525	NC_019678	AAG	2	6	31472	31477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733642
526	NC_019678	AGCA	2	8	31585	31592	50 %	0 %	25 %	25 %	427733642
527	NC_019678	ATA	2	6	31609	31614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733642
528	NC_019678	TGG	2	6	31658	31663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733642
529	NC_019678	AGTAAG	2	12	31694	31705	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427733642
530	NC_019678	GAG	2	6	31723	31728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733642
531	NC_019678	CAA	2	6	31767	31772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733642
532	NC_019678	CT	3	6	31798	31803	0 %	50 %	0 %	50 %	427733642
533	NC_019678	AGCA	2	8	31838	31845	50 %	0 %	25 %	25 %	427733642
534	NC_019678	CTG	2	6	31894	31899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733642
535	NC_019678	AGT	2	6	31913	31918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733642
536	NC_019678	ACA	2	6	31931	31936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733642
537	NC_019678	TCC	2	6	31970	31975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733642
538	NC_019678	TGG	2	6	31994	31999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733642
539	NC_019678	TTG	2	6	32052	32057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733642
540	NC_019678	TTCC	2	8	32096	32103	0 %	50 %	0 %	50 %	427733642
541	NC_019678	GGTT	2	8	32141	32148	0 %	50 %	50 %	0 %	427733642
542	NC_019678	ATT	3	9	32244	32252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733642
543	NC_019678	ATGAAG	2	12	32266	32277	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427733642
544	NC_019678	ACGTC	2	10	32330	32339	20 %	20 %	20 %	40 %	427733642
545	NC_019678	ACA	2	6	32355	32360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733642
546	NC_019678	TGG	2	6	32438	32443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733642
547	NC_019678	TTG	2	6	32484	32489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733642
548	NC_019678	GGA	2	6	32500	32505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733642
549	NC_019678	AGC	2	6	32524	32529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733642
550	NC_019678	TCC	2	6	32537	32542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733642
551	NC_019678	ACT	2	6	32621	32626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733643
552	NC_019678	AAG	2	6	32627	32632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733643
553	NC_019678	TCC	2	6	32633	32638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733643
554	NC_019678	CGT	2	6	32669	32674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733643
555	NC_019678	GGC	2	6	32702	32707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733643
556	NC_019678	GCA	2	6	32753	32758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733643
557	NC_019678	TCA	2	6	32797	32802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733643
558	NC_019678	ATC	2	6	32850	32855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733643
559	NC_019678	TCA	2	6	32866	32871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733643
560	NC_019678	GTT	2	6	32932	32937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733643
561	NC_019678	GAA	2	6	33270	33275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733643
562	NC_019678	TCA	2	6	33307	33312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733643
563	NC_019678	TAC	2	6	33317	33322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733643
564	NC_019678	CTT	2	6	33323	33328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733643
565	NC_019678	TCT	2	6	33331	33336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733643
566	NC_019678	ACC	2	6	33357	33362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733643
567	NC_019678	CT	3	6	33403	33408	0 %	50 %	0 %	50 %	427733643
568	NC_019678	T	8	8	33434	33441	0 %	100 %	0 %	0 %	427733643
569	NC_019678	TTGT	2	8	33446	33453	0 %	75 %	25 %	0 %	427733643
570	NC_019678	CTA	2	6	33647	33652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733644
571	NC_019678	TGT	2	6	33703	33708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733644
572	NC_019678	GCA	2	6	33784	33789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733644
573	NC_019678	CTC	2	6	33793	33798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733644
574	NC_019678	ATC	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733644
575	NC_019678	AGT	2	6	33959	33964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733644
576	NC_019678	AGC	2	6	34010	34015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733644
577	NC_019678	GTA	2	6	34065	34070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733644
578	NC_019678	TACT	2	8	34287	34294	25 %	50 %	0 %	25 %	427733644
579	NC_019678	A	6	6	34299	34304	100 %	0 %	0 %	0 %	427733644
580	NC_019678	TCT	2	6	34359	34364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733644
581	NC_019678	CCA	2	6	34399	34404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733644
582	NC_019678	ATTA	2	8	34484	34491	50 %	50 %	0 %	0 %	427733644
583	NC_019678	TTCAAA	2	12	34520	34531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	427733644
584	NC_019678	TCT	2	6	34545	34550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733644
585	NC_019678	TCA	2	6	34554	34559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733644
586	NC_019678	CAT	2	6	34591	34596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733644
587	NC_019678	TCA	2	6	34647	34652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733644
588	NC_019678	TAA	2	6	34694	34699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733644
589	NC_019678	CTA	2	6	34744	34749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733644
590	NC_019678	TGC	2	6	34751	34756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733644
591	NC_019678	GTT	2	6	34768	34773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733644
592	NC_019678	TTC	2	6	34805	34810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733644
593	NC_019678	TCTT	2	8	34961	34968	0 %	75 %	0 %	25 %	427733644
594	NC_019678	GCG	2	6	35216	35221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733644
595	NC_019678	GTT	2	6	35223	35228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733644
596	NC_019678	TCT	2	6	35232	35237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733644
597	NC_019678	TTG	2	6	35310	35315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733645
598	NC_019678	GGT	2	6	35405	35410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733645
599	NC_019678	TTCT	2	8	35481	35488	0 %	75 %	0 %	25 %	427733645
600	NC_019678	TCG	2	6	35618	35623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733645
601	NC_019678	AT	3	6	35641	35646	50 %	50 %	0 %	0 %	427733645
602	NC_019678	TTGC	2	8	35676	35683	0 %	50 %	25 %	25 %	427733645
603	NC_019678	ATC	2	6	35728	35733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733645
604	NC_019678	AGC	3	9	35738	35746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733645
605	NC_019678	TCG	2	6	35755	35760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733645
606	NC_019678	CAC	2	6	35779	35784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733645
607	NC_019678	CAAA	2	8	35790	35797	75 %	0 %	0 %	25 %	427733645
608	NC_019678	CAAC	2	8	35849	35856	50 %	0 %	0 %	50 %	427733645
609	NC_019678	CAA	2	6	35872	35877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733645
610	NC_019678	T	6	6	36090	36095	0 %	100 %	0 %	0 %	427733645
611	NC_019678	TAT	2	6	36138	36143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733645
612	NC_019678	TGC	2	6	36146	36151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733645
613	NC_019678	AC	3	6	36226	36231	50 %	0 %	0 %	50 %	427733645
614	NC_019678	TCC	2	6	36242	36247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733645
615	NC_019678	TTG	2	6	36280	36285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733645
616	NC_019678	TAA	3	9	36349	36357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733645
617	NC_019678	TGAT	2	8	36369	36376	25 %	50 %	25 %	0 %	427733645
618	NC_019678	ATT	2	6	36493	36498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733646
619	NC_019678	T	6	6	36504	36509	0 %	100 %	0 %	0 %	427733646
620	NC_019678	CTTG	2	8	36527	36534	0 %	50 %	25 %	25 %	427733646
621	NC_019678	TAA	2	6	36552	36557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733646
622	NC_019678	ATC	2	6	36585	36590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733646
623	NC_019678	CAT	2	6	36605	36610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733646
624	NC_019678	TGG	2	6	36657	36662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733646
625	NC_019678	CG	3	6	36690	36695	0 %	0 %	50 %	50 %	427733646
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