MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019678	GAA	2	6	334219	334224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733873
5502	NC_019678	TTC	2	6	334289	334294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733873
5503	NC_019678	AAT	2	6	334360	334365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733873
5504	NC_019678	GCT	2	6	334405	334410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733873
5505	NC_019678	CTA	2	6	334465	334470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733873
5506	NC_019678	ATAA	2	8	334489	334496	75 %	25 %	0 %	0 %	427733873
5507	NC_019678	ACT	2	6	334662	334667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733873
5508	NC_019678	CTG	2	6	334750	334755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733873
5509	NC_019678	TCA	2	6	334836	334841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733873
5510	NC_019678	TCC	2	6	334907	334912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733873
5511	NC_019678	CTA	2	6	334927	334932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733873
5512	NC_019678	ATA	2	6	334941	334946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733873
5513	NC_019678	TTC	2	6	335030	335035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733873
5514	NC_019678	TCT	2	6	335040	335045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733873
5515	NC_019678	AAC	2	6	335092	335097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733873
5516	NC_019678	CCG	2	6	335108	335113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733873
5517	NC_019678	ATT	2	6	335150	335155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733873
5518	NC_019678	ATTA	2	8	335162	335169	50 %	50 %	0 %	0 %	427733873
5519	NC_019678	TTA	2	6	335211	335216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733873
5520	NC_019678	T	6	6	335227	335232	0 %	100 %	0 %	0 %	427733873
5521	NC_019678	CTA	2	6	335325	335330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733873
5522	NC_019678	CAG	2	6	335347	335352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733873
5523	NC_019678	CGCTAC	2	12	335419	335430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	427733873
5524	NC_019678	AGAA	2	8	335432	335439	75 %	0 %	25 %	0 %	427733873
5525	NC_019678	CG	3	6	335450	335455	0 %	0 %	50 %	50 %	427733873
5526	NC_019678	TCT	2	6	335466	335471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733873
5527	NC_019678	AT	3	6	335488	335493	50 %	50 %	0 %	0 %	427733873
5528	NC_019678	TTTGG	2	10	335505	335514	0 %	60 %	40 %	0 %	427733873
5529	NC_019678	CTG	2	6	335528	335533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733873
5530	NC_019678	TTC	2	6	335548	335553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733873
5531	NC_019678	GGA	2	6	335577	335582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733873
5532	NC_019678	TCT	2	6	335619	335624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733873
5533	NC_019678	AGT	2	6	335658	335663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733873
5534	NC_019678	TCA	2	6	335668	335673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733873
5535	NC_019678	AGC	2	6	335714	335719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733873
5536	NC_019678	TTC	2	6	335750	335755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733873
5537	NC_019678	ACC	2	6	335768	335773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733873
5538	NC_019678	T	6	6	335857	335862	0 %	100 %	0 %	0 %	427733873
5539	NC_019678	TGA	2	6	336197	336202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733874
5540	NC_019678	AAT	2	6	336221	336226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733874
5541	NC_019678	CAG	2	6	336309	336314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5542	NC_019678	TG	3	6	336321	336326	0 %	50 %	50 %	0 %	427733874
5543	NC_019678	AT	3	6	336377	336382	50 %	50 %	0 %	0 %	427733874
5544	NC_019678	CTT	2	6	336420	336425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5545	NC_019678	AAT	2	6	336511	336516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733874
5546	NC_019678	T	6	6	336555	336560	0 %	100 %	0 %	0 %	427733874
5547	NC_019678	TAG	2	6	336573	336578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733874
5548	NC_019678	CCAT	2	8	336587	336594	25 %	25 %	0 %	50 %	427733874
5549	NC_019678	CTT	2	6	336657	336662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5550	NC_019678	ATT	2	6	336760	336765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733874
5551	NC_019678	ATTG	2	8	336768	336775	25 %	50 %	25 %	0 %	427733874
5552	NC_019678	GCTAA	2	10	336836	336845	40 %	20 %	20 %	20 %	427733874
5553	NC_019678	TGT	2	6	336865	336870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733874
5554	NC_019678	CAC	2	6	336882	336887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733874
5555	NC_019678	TTC	2	6	337015	337020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5556	NC_019678	TCT	2	6	337043	337048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5557	NC_019678	AGA	2	6	337069	337074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733874
5558	NC_019678	CGT	2	6	337143	337148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5559	NC_019678	CGG	2	6	337153	337158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733874
5560	NC_019678	T	6	6	337306	337311	0 %	100 %	0 %	0 %	427733874
5561	NC_019678	TGCT	2	8	337448	337455	0 %	50 %	25 %	25 %	427733874
5562	NC_019678	GAA	2	6	337461	337466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733874
5563	NC_019678	TGC	2	6	337603	337608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5564	NC_019678	CTG	2	6	337611	337616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5565	NC_019678	CTT	2	6	337617	337622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5566	NC_019678	ATTT	2	8	337642	337649	25 %	75 %	0 %	0 %	427733874
5567	NC_019678	TCCT	2	8	337720	337727	0 %	50 %	0 %	50 %	427733874
5568	NC_019678	TTC	2	6	337789	337794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5569	NC_019678	T	6	6	337809	337814	0 %	100 %	0 %	0 %	427733874
5570	NC_019678	TGT	2	6	337827	337832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733874
5571	NC_019678	AAT	2	6	337892	337897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733874
5572	NC_019678	TGTT	2	8	337931	337938	0 %	75 %	25 %	0 %	427733874
5573	NC_019678	GTA	2	6	337985	337990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733874
5574	NC_019678	GTT	2	6	338010	338015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733874
5575	NC_019678	TAC	2	6	338098	338103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733874
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5577	NC_019678	AT	3	6	338137	338142	50 %	50 %	0 %	0 %	427733874
5578	NC_019678	GCT	2	6	338187	338192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5579	NC_019678	CGC	2	6	338199	338204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733874
5580	NC_019678	TTA	2	6	338252	338257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733874
5581	NC_019678	GAC	2	6	338274	338279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5582	NC_019678	GCA	2	6	338382	338387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733874
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5585	NC_019678	TTC	2	6	338503	338508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
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5587	NC_019678	TTC	2	6	338545	338550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5588	NC_019678	CTG	2	6	338599	338604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5589	NC_019678	CTG	2	6	338685	338690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5590	NC_019678	TCT	2	6	338693	338698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5591	NC_019678	AAG	2	6	338714	338719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733874
5592	NC_019678	TAATT	2	10	338881	338890	40 %	60 %	0 %	0 %	427733874
5593	NC_019678	ATT	2	6	338962	338967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733874
5594	NC_019678	AGCA	2	8	338978	338985	50 %	0 %	25 %	25 %	427733874
5595	NC_019678	CTG	2	6	338995	339000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5596	NC_019678	GCTT	2	8	339056	339063	0 %	50 %	25 %	25 %	427733874
5597	NC_019678	CTG	2	6	339066	339071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
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5600	NC_019678	CAA	2	6	339211	339216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733874
5601	NC_019678	CCA	2	6	339231	339236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733874
5602	NC_019678	GTA	2	6	339255	339260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733874
5603	NC_019678	CTG	3	9	339262	339270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5604	NC_019678	CAC	2	6	339388	339393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733874
5605	NC_019678	AGC	2	6	339481	339486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733874
5606	NC_019678	TTGT	2	8	339538	339545	0 %	75 %	25 %	0 %	427733874
5607	NC_019678	TCA	2	6	339563	339568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733874
5608	NC_019678	CTT	2	6	339591	339596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5609	NC_019678	T	6	6	339648	339653	0 %	100 %	0 %	0 %	427733874
5610	NC_019678	CAA	2	6	339654	339659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733874
5611	NC_019678	TCTT	2	8	339754	339761	0 %	75 %	0 %	25 %	427733874
5612	NC_019678	AGC	2	6	339819	339824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733874
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5614	NC_019678	TTC	2	6	339961	339966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
5615	NC_019678	AT	3	6	339991	339996	50 %	50 %	0 %	0 %	427733874
5616	NC_019678	CTAT	2	8	340028	340035	25 %	50 %	0 %	25 %	427733874
5617	NC_019678	TACCAG	2	12	340152	340163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427733874
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5619	NC_019678	AT	3	6	340218	340223	50 %	50 %	0 %	0 %	427733874
5620	NC_019678	GCG	2	6	340276	340281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733874
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5622	NC_019678	TCT	2	6	340349	340354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733874
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