MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019678	TTC	2	6	266814	266819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733829
4502	NC_019678	AGC	2	6	266826	266831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733829
4503	NC_019678	TCG	2	6	266853	266858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733829
4504	NC_019678	AGA	2	6	266925	266930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733829
4505	NC_019678	CTTA	2	8	266936	266943	25 %	50 %	0 %	25 %	427733829
4506	NC_019678	CGCT	2	8	266953	266960	0 %	25 %	25 %	50 %	427733829
4507	NC_019678	GCA	2	6	266983	266988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733829
4508	NC_019678	GCGCG	2	10	267154	267163	0 %	0 %	60 %	40 %	427733829
4509	NC_019678	CAA	2	6	267220	267225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733829
4510	NC_019678	ACCAGA	4	24	267369	267392	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427733829
4511	NC_019678	GTT	2	6	267394	267399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733829
4512	NC_019678	GCT	2	6	267947	267952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733830
4513	NC_019678	ACCA	2	8	268035	268042	50 %	0 %	0 %	50 %	427733830
4514	NC_019678	ATT	2	6	268050	268055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733830
4515	NC_019678	ACC	2	6	268113	268118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733830
4516	NC_019678	GTG	2	6	268160	268165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733830
4517	NC_019678	AGA	2	6	268205	268210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733830
4518	NC_019678	CTT	2	6	268232	268237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733830
4519	NC_019678	CAT	2	6	268259	268264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733830
4520	NC_019678	CCA	2	6	268278	268283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733830
4521	NC_019678	TCTG	2	8	268284	268291	0 %	50 %	25 %	25 %	427733830
4522	NC_019678	AGA	2	6	268302	268307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733830
4523	NC_019678	ATT	2	6	268312	268317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733830
4524	NC_019678	GC	3	6	268336	268341	0 %	0 %	50 %	50 %	427733830
4525	NC_019678	TAAA	2	8	268464	268471	75 %	25 %	0 %	0 %	427733830
4526	NC_019678	AGG	2	6	268491	268496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733830
4527	NC_019678	TAG	2	6	268542	268547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733830
4528	NC_019678	ATT	2	6	268650	268655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733830
4529	NC_019678	CAA	2	6	268689	268694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733830
4530	NC_019678	CTTC	2	8	268750	268757	0 %	50 %	0 %	50 %	427733830
4531	NC_019678	GGT	2	6	268760	268765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733830
4532	NC_019678	GCA	2	6	268804	268809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733830
4533	NC_019678	TAAAG	2	10	268810	268819	60 %	20 %	20 %	0 %	427733830
4534	NC_019678	A	6	6	268867	268872	100 %	0 %	0 %	0 %	427733830
4535	NC_019678	CTG	2	6	268970	268975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733830
4536	NC_019678	GTA	2	6	268985	268990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733830
4537	NC_019678	CCA	2	6	268995	269000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733830
4538	NC_019678	GGT	2	6	269008	269013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733830
4539	NC_019678	GCTT	2	8	269043	269050	0 %	50 %	25 %	25 %	427733830
4540	NC_019678	TTC	2	6	269109	269114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733830
4541	NC_019678	AGT	2	6	269151	269156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733830
4542	NC_019678	A	6	6	269228	269233	100 %	0 %	0 %	0 %	427733830
4543	NC_019678	TCC	2	6	269247	269252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733830
4544	NC_019678	ACA	2	6	269419	269424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733830
4545	NC_019678	TTAA	2	8	269682	269689	50 %	50 %	0 %	0 %	427733831
4546	NC_019678	ATT	3	9	269703	269711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733831
4547	NC_019678	TTTGC	2	10	269712	269721	0 %	60 %	20 %	20 %	427733831
4548	NC_019678	CACAA	2	10	269727	269736	60 %	0 %	0 %	40 %	427733831
4549	NC_019678	TGA	2	6	269763	269768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733831
4550	NC_019678	TTG	2	6	269881	269886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733831
4551	NC_019678	AAT	2	6	269919	269924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733831
4552	NC_019678	ATT	2	6	269928	269933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733831
4553	NC_019678	GAA	2	6	269951	269956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733831
4554	NC_019678	TGC	2	6	269961	269966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733831
4555	NC_019678	CAA	2	6	269994	269999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733831
4556	NC_019678	TGTT	2	8	270021	270028	0 %	75 %	25 %	0 %	427733831
4557	NC_019678	CG	3	6	270138	270143	0 %	0 %	50 %	50 %	427733831
4558	NC_019678	TGG	2	6	270179	270184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733831
4559	NC_019678	ACA	2	6	270806	270811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733832
4560	NC_019678	TAG	2	6	270832	270837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733832
4561	NC_019678	GTG	2	6	271003	271008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733832
4562	NC_019678	CTA	2	6	271024	271029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733832
4563	NC_019678	AATG	2	8	271109	271116	50 %	25 %	25 %	0 %	427733832
4564	NC_019678	TGG	2	6	271153	271158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733832
4565	NC_019678	GAA	2	6	271164	271169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733832
4566	NC_019678	CGT	2	6	271197	271202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733832
4567	NC_019678	GCAAT	2	10	271210	271219	40 %	20 %	20 %	20 %	427733832
4568	NC_019678	TCG	2	6	271247	271252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733832
4569	NC_019678	GAA	3	9	271371	271379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733832
4570	NC_019678	ATT	2	6	271389	271394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733832
4571	NC_019678	TAC	2	6	271459	271464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733832
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4573	NC_019678	AGCA	2	8	271522	271529	50 %	0 %	25 %	25 %	427733832
4574	NC_019678	ATTA	2	8	271532	271539	50 %	50 %	0 %	0 %	427733832
4575	NC_019678	GAA	2	6	271650	271655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733832
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4577	NC_019678	GTAA	2	8	271680	271687	50 %	25 %	25 %	0 %	427733832
4578	NC_019678	ACCA	2	8	271692	271699	50 %	0 %	0 %	50 %	427733832
4579	NC_019678	T	6	6	271712	271717	0 %	100 %	0 %	0 %	427733832
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4582	NC_019678	AGA	2	6	271802	271807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733832
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4588	NC_019678	T	6	6	272354	272359	0 %	100 %	0 %	0 %	427733833
4589	NC_019678	TTAAA	2	10	272362	272371	60 %	40 %	0 %	0 %	427733833
4590	NC_019678	GAG	2	6	272541	272546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733833
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4592	NC_019678	TGA	2	6	272651	272656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733833
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4604	NC_019678	TTTG	2	8	273218	273225	0 %	75 %	25 %	0 %	427733834
4605	NC_019678	GA	3	6	273248	273253	50 %	0 %	50 %	0 %	427733834
4606	NC_019678	AT	3	6	273311	273316	50 %	50 %	0 %	0 %	427733834
4607	NC_019678	AAC	2	6	273321	273326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733834
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4609	NC_019678	AT	3	6	273365	273370	50 %	50 %	0 %	0 %	427733834
4610	NC_019678	AAGCGA	2	12	273389	273400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	427733834
4611	NC_019678	TAA	2	6	273408	273413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733834
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4987	NC_019678	GCT	2	6	303925	303930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733852
4988	NC_019678	GTT	2	6	304057	304062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733852
4989	NC_019678	CTT	2	6	304072	304077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733852
4990	NC_019678	TGT	2	6	304095	304100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733852
4991	NC_019678	GATTC	2	10	304124	304133	20 %	40 %	20 %	20 %	427733852
4992	NC_019678	CAA	2	6	304136	304141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733852
4993	NC_019678	TGC	2	6	304236	304241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733852
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4999	NC_019678	TTCTT	2	10	304452	304461	0 %	80 %	0 %	20 %	427733852
5000	NC_019678	AGCT	2	8	304469	304476	25 %	25 %	25 %	25 %	427733852

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