MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 27798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018609	TTG	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450787
2	NC_018609	AAG	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450787
3	NC_018609	ATT	2	6	1391	1396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450787
4	NC_018609	ATT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450787
5	NC_018609	ACT	2	6	1642	1647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450787
6	NC_018609	TAA	2	6	1650	1655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450787
7	NC_018609	ATA	2	6	1939	1944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450788
8	NC_018609	CTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450788
9	NC_018609	TAT	2	6	2000	2005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450788
10	NC_018609	TCA	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450788
11	NC_018609	GTT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450788
12	NC_018609	CAA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450788
13	NC_018609	CAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450788
14	NC_018609	TTC	2	6	2241	2246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450788
15	NC_018609	TGT	2	6	2421	2426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450788
16	NC_018609	TTG	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450788
17	NC_018609	CTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450788
18	NC_018609	TAT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
19	NC_018609	ATT	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
20	NC_018609	TAT	2	6	2987	2992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
21	NC_018609	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
22	NC_018609	AAC	3	9	3224	3232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450789
23	NC_018609	TTC	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
24	NC_018609	CTT	2	6	3343	3348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
25	NC_018609	AGT	2	6	3361	3366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450789
26	NC_018609	TCT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
27	NC_018609	GTT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450789
28	NC_018609	ATC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450789
29	NC_018609	ATT	2	6	3452	3457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
30	NC_018609	TCA	3	9	3648	3656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450789
31	NC_018609	TCT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
32	NC_018609	TTA	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
33	NC_018609	AGT	2	6	3868	3873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450789
34	NC_018609	TCT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
35	NC_018609	AGA	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450789
36	NC_018609	ATA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450789
37	NC_018609	TAA	2	6	4052	4057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450789
38	NC_018609	GTG	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450790
39	NC_018609	GTC	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450790
40	NC_018609	TTA	2	6	4628	4633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450790
41	NC_018609	TGT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450790
42	NC_018609	TTG	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450790
43	NC_018609	TAA	2	6	4863	4868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450790
44	NC_018609	GTT	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450791
45	NC_018609	ACA	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450791
46	NC_018609	ATG	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450791
47	NC_018609	TGA	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450791
48	NC_018609	TGC	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450791
49	NC_018609	AAC	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450791
50	NC_018609	TGC	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450792
51	NC_018609	ATG	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450792
52	NC_018609	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450792
53	NC_018609	ATT	2	6	5798	5803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450792
54	NC_018609	CAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450792
55	NC_018609	TAT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450792
56	NC_018609	TAA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450792
57	NC_018609	TCA	2	6	5955	5960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450792
58	NC_018609	AAT	2	6	6033	6038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450792
59	NC_018609	CTT	2	6	6175	6180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450792
60	NC_018609	AAT	2	6	6221	6226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450792
61	NC_018609	TTC	2	6	6609	6614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450793
62	NC_018609	TTC	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450793
63	NC_018609	TTA	2	6	6828	6833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450793
64	NC_018609	TTG	2	6	6835	6840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450793
65	NC_018609	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450794
66	NC_018609	ATT	2	6	6969	6974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450794
67	NC_018609	ATA	2	6	7002	7007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450794
68	NC_018609	AAC	2	6	7060	7065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450794
69	NC_018609	ATT	2	6	7105	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450794
70	NC_018609	GTT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450795
71	NC_018609	CAA	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450795
72	NC_018609	TAT	2	6	7488	7493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450795
73	NC_018609	GCT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450795
74	NC_018609	GCA	2	6	7583	7588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450795
75	NC_018609	TTC	2	6	7632	7637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
76	NC_018609	CAA	2	6	7638	7643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450795
77	NC_018609	GCA	2	6	7766	7771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450795
78	NC_018609	CAG	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450795
79	NC_018609	CTA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450795
80	NC_018609	CAA	2	6	7929	7934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450795
81	NC_018609	CAT	3	9	8049	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450795
82	NC_018609	TTC	2	6	8136	8141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
83	NC_018609	TCA	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450795
84	NC_018609	TTG	2	6	8221	8226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450795
85	NC_018609	TTC	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
86	NC_018609	CTT	2	6	8298	8303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
87	NC_018609	CTT	2	6	8463	8468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
88	NC_018609	TTC	2	6	9299	9304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450797
89	NC_018609	AAT	2	6	9312	9317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450797
90	NC_018609	TCG	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450797
91	NC_018609	TTC	3	9	9422	9430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450797
92	NC_018609	AAT	2	6	9679	9684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450797
93	NC_018609	TGG	3	9	9758	9766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450797
94	NC_018609	AGG	2	6	10025	10030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450797
95	NC_018609	GAA	2	6	10093	10098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450797
96	NC_018609	TCA	2	6	10113	10118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450797
97	NC_018609	TCT	2	6	10161	10166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
98	NC_018609	CTT	2	6	10231	10236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
99	NC_018609	TAA	2	6	10374	10379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450798
100	NC_018609	TAT	2	6	10474	10479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450798
101	NC_018609	TGT	2	6	10723	10728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450798
102	NC_018609	TTC	2	6	10799	10804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
103	NC_018609	CTT	2	6	10822	10827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
104	NC_018609	AAT	2	6	10849	10854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450798
105	NC_018609	AAT	2	6	10918	10923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450798
106	NC_018609	TTC	2	6	10983	10988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
107	NC_018609	GTT	2	6	10989	10994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450799
108	NC_018609	CTT	3	9	11056	11064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
109	NC_018609	TTG	2	6	11182	11187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450799
110	NC_018609	TGG	2	6	11277	11282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450799
111	NC_018609	GGC	2	6	11502	11507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407450799
112	NC_018609	TTC	2	6	11520	11525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
113	NC_018609	GTA	2	6	11556	11561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450799
114	NC_018609	TCT	2	6	11570	11575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
115	NC_018609	TTC	2	6	11577	11582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
116	NC_018609	ATT	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450799
117	NC_018609	GTT	2	6	11724	11729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450799
118	NC_018609	TTC	2	6	11785	11790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
119	NC_018609	ATA	2	6	12317	12322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450800
120	NC_018609	TCT	2	6	12333	12338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450800
121	NC_018609	TCT	2	6	12360	12365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450800
122	NC_018609	TCC	2	6	12377	12382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450800
123	NC_018609	TCC	2	6	12415	12420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450800
124	NC_018609	TCT	2	6	12430	12435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450800
125	NC_018609	AAT	2	6	12439	12444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450800
126	NC_018609	TTC	2	6	12616	12621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450801
127	NC_018609	AAT	2	6	12636	12641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450801
128	NC_018609	AAT	2	6	12657	12662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450801
129	NC_018609	GAT	2	6	12687	12692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450801
130	NC_018609	GTA	2	6	12754	12759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450801
131	NC_018609	CAA	2	6	13247	13252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450802
132	NC_018609	TAA	2	6	13322	13327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450802
133	NC_018609	CTT	2	6	13384	13389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450802
134	NC_018609	GAA	2	6	13449	13454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450802
135	NC_018609	TTG	2	6	13526	13531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450802
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140	NC_018609	TAA	2	6	13979	13984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450802
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142	NC_018609	CAT	2	6	14042	14047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450802
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159	NC_018609	TTG	2	6	16088	16093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450804
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