MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_018609	TCA	2	6	2274553	2274558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452933
45002	NC_018609	AAAT	2	8	2274588	2274595	75 %	25 %	0 %	0 %	407452933
45003	NC_018609	TAA	2	6	2274599	2274604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407452934
45004	NC_018609	ATT	2	6	2274607	2274612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45005	NC_018609	TA	3	6	2274628	2274633	50 %	50 %	0 %	0 %	407452934
45006	NC_018609	ATC	2	6	2274643	2274648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452934
45007	NC_018609	TTG	2	6	2274662	2274667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407452934
45008	NC_018609	CTTT	2	8	2274668	2274675	0 %	75 %	0 %	25 %	407452934
45009	NC_018609	ATG	2	6	2274712	2274717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452934
45010	NC_018609	CTA	2	6	2274726	2274731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452934
45011	NC_018609	CTG	2	6	2274764	2274769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407452934
45012	NC_018609	GGT	2	6	2274843	2274848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407452934
45013	NC_018609	T	6	6	2274864	2274869	0 %	100 %	0 %	0 %	407452934
45014	NC_018609	T	7	7	2274897	2274903	0 %	100 %	0 %	0 %	407452934
45015	NC_018609	TTA	2	6	2274920	2274925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45016	NC_018609	AG	3	6	2274949	2274954	50 %	0 %	50 %	0 %	407452934
45017	NC_018609	ATT	2	6	2275005	2275010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45018	NC_018609	AGT	2	6	2275015	2275020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452934
45019	NC_018609	CA	3	6	2275074	2275079	50 %	0 %	0 %	50 %	407452934
45020	NC_018609	CTA	2	6	2275112	2275117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452934
45021	NC_018609	ATT	3	9	2275189	2275197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45022	NC_018609	GGC	2	6	2275261	2275266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407452934
45023	NC_018609	A	7	7	2275311	2275317	100 %	0 %	0 %	0 %	407452934
45024	NC_018609	A	6	6	2275341	2275346	100 %	0 %	0 %	0 %	407452934
45025	NC_018609	ATT	2	6	2275348	2275353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45026	NC_018609	AT	3	6	2275393	2275398	50 %	50 %	0 %	0 %	407452934
45027	NC_018609	T	7	7	2275444	2275450	0 %	100 %	0 %	0 %	407452934
45028	NC_018609	ATT	2	6	2275535	2275540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45029	NC_018609	GTT	2	6	2275552	2275557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407452934
45030	NC_018609	GTA	2	6	2275597	2275602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452934
45031	NC_018609	ATC	2	6	2275606	2275611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452934
45032	NC_018609	A	6	6	2275658	2275663	100 %	0 %	0 %	0 %	407452934
45033	NC_018609	ACC	2	6	2275714	2275719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407452934
45034	NC_018609	TAT	2	6	2275743	2275748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45035	NC_018609	T	6	6	2275748	2275753	0 %	100 %	0 %	0 %	407452934
45036	NC_018609	CTA	2	6	2275826	2275831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452934
45037	NC_018609	CAG	2	6	2275841	2275846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407452934
45038	NC_018609	AAC	2	6	2275861	2275866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407452934
45039	NC_018609	GGT	3	9	2275939	2275947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407452934
45040	NC_018609	TAT	2	6	2276067	2276072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452934
45041	NC_018609	T	7	7	2276118	2276124	0 %	100 %	0 %	0 %	407452934
45042	NC_018609	CT	3	6	2276208	2276213	0 %	50 %	0 %	50 %	407452934
45043	NC_018609	TGT	2	6	2276270	2276275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407452934
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45046	NC_018609	TAG	2	6	2276373	2276378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452935
45047	NC_018609	CTT	2	6	2276397	2276402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407452935
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45050	NC_018609	TGA	2	6	2276598	2276603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452935
45051	NC_018609	TCA	2	6	2276640	2276645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452935
45052	NC_018609	TGA	2	6	2276695	2276700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452935
45053	NC_018609	AGA	3	9	2276713	2276721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407452935
45054	NC_018609	A	7	7	2276740	2276746	100 %	0 %	0 %	0 %	407452935
45055	NC_018609	TGAAC	2	10	2276776	2276785	40 %	20 %	20 %	20 %	407452935
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45059	NC_018609	T	6	6	2277028	2277033	0 %	100 %	0 %	0 %	407452935
45060	NC_018609	A	6	6	2277039	2277044	100 %	0 %	0 %	0 %	407452935
45061	NC_018609	A	6	6	2277051	2277056	100 %	0 %	0 %	0 %	407452935
45062	NC_018609	CTC	2	6	2277132	2277137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407452936
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45073	NC_018609	A	8	8	2277710	2277717	100 %	0 %	0 %	0 %	407452937
45074	NC_018609	ATTC	2	8	2277730	2277737	25 %	50 %	0 %	25 %	407452937
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45090	NC_018609	A	6	6	2278405	2278410	100 %	0 %	0 %	0 %	407452937
45091	NC_018609	ATA	2	6	2278441	2278446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407452937
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45101	NC_018609	GAC	2	6	2278933	2278938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407452938
45102	NC_018609	TGG	2	6	2278997	2279002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407452938
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45105	NC_018609	A	6	6	2279205	2279210	100 %	0 %	0 %	0 %	407452939
45106	NC_018609	TTTC	2	8	2279273	2279280	0 %	75 %	0 %	25 %	407452939
45107	NC_018609	T	7	7	2279333	2279339	0 %	100 %	0 %	0 %	407452939
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45109	NC_018609	TAAA	2	8	2279400	2279407	75 %	25 %	0 %	0 %	407452939
45110	NC_018609	CA	3	6	2279409	2279414	50 %	0 %	0 %	50 %	407452939
45111	NC_018609	ATA	2	6	2279425	2279430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407452939
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45116	NC_018609	AGC	2	6	2279598	2279603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407452939
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