MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_018609	ATA	2	6	203596	203601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450977
4003	NC_018609	CTT	2	6	203611	203616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450977
4004	NC_018609	GAAC	2	8	203664	203671	50 %	0 %	25 %	25 %	407450977
4005	NC_018609	A	6	6	203673	203678	100 %	0 %	0 %	0 %	407450977
4006	NC_018609	CAT	2	6	203679	203684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450977
4007	NC_018609	A	6	6	203694	203699	100 %	0 %	0 %	0 %	407450977
4008	NC_018609	A	6	6	203737	203742	100 %	0 %	0 %	0 %	407450977
4009	NC_018609	A	6	6	203836	203841	100 %	0 %	0 %	0 %	407450977
4010	NC_018609	ATG	2	6	203902	203907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450977
4011	NC_018609	ATC	2	6	203986	203991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450977
4012	NC_018609	T	6	6	203993	203998	0 %	100 %	0 %	0 %	407450977
4013	NC_018609	CAA	2	6	204037	204042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450977
4014	NC_018609	AAG	2	6	204047	204052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450977
4015	NC_018609	ATTT	2	8	204116	204123	25 %	75 %	0 %	0 %	407450978
4016	NC_018609	TG	3	6	204182	204187	0 %	50 %	50 %	0 %	407450978
4017	NC_018609	GGTAA	2	10	204286	204295	40 %	20 %	40 %	0 %	407450978
4018	NC_018609	ATCA	2	8	204322	204329	50 %	25 %	0 %	25 %	407450978
4019	NC_018609	ATC	2	6	204346	204351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450978
4020	NC_018609	CCA	2	6	204420	204425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450978
4021	NC_018609	ACA	2	6	204462	204467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450978
4022	NC_018609	TAA	2	6	204552	204557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450978
4023	NC_018609	CCA	2	6	204678	204683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450978
4024	NC_018609	TTAA	2	8	204805	204812	50 %	50 %	0 %	0 %	407450978
4025	NC_018609	A	6	6	204855	204860	100 %	0 %	0 %	0 %	407450979
4026	NC_018609	GGA	2	6	204892	204897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450979
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4029	NC_018609	AACC	2	8	205017	205024	50 %	0 %	0 %	50 %	407450979
4030	NC_018609	CTA	2	6	205042	205047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450979
4031	NC_018609	ATA	2	6	205198	205203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450979
4032	NC_018609	ATT	2	6	205272	205277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450979
4033	NC_018609	CAT	2	6	205290	205295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450979
4034	NC_018609	A	6	6	205298	205303	100 %	0 %	0 %	0 %	407450979
4035	NC_018609	TGG	2	6	205308	205313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450979
4036	NC_018609	ATG	2	6	205381	205386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450979
4037	NC_018609	AT	3	6	205409	205414	50 %	50 %	0 %	0 %	407450979
4038	NC_018609	TCA	2	6	205484	205489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450979
4039	NC_018609	TAT	2	6	205500	205505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450979
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4041	NC_018609	AGA	2	6	205517	205522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450979
4042	NC_018609	A	7	7	205559	205565	100 %	0 %	0 %	0 %	407450979
4043	NC_018609	TAT	2	6	205597	205602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450979
4044	NC_018609	AATC	2	8	205614	205621	50 %	25 %	0 %	25 %	407450979
4045	NC_018609	ACCA	2	8	205704	205711	50 %	0 %	0 %	50 %	407450979
4046	NC_018609	TC	3	6	205720	205725	0 %	50 %	0 %	50 %	407450979
4047	NC_018609	TGA	2	6	205778	205783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450979
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4049	NC_018609	CTA	2	6	205797	205802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450979
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4053	NC_018609	AAGTT	2	10	205903	205912	40 %	40 %	20 %	0 %	407450979
4054	NC_018609	AC	3	6	205914	205919	50 %	0 %	0 %	50 %	407450979
4055	NC_018609	TAG	2	6	205922	205927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450979
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4057	NC_018609	TAAAT	2	10	205958	205967	60 %	40 %	0 %	0 %	407450979
4058	NC_018609	TCAA	2	8	205968	205975	50 %	25 %	0 %	25 %	407450979
4059	NC_018609	TTA	2	6	206041	206046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450979
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4063	NC_018609	A	7	7	206144	206150	100 %	0 %	0 %	0 %	407450979
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4065	NC_018609	ATA	2	6	206499	206504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450980
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4072	NC_018609	A	7	7	206813	206819	100 %	0 %	0 %	0 %	407450980
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4074	NC_018609	TTA	2	6	206868	206873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450980
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4094	NC_018609	A	6	6	207615	207620	100 %	0 %	0 %	0 %	407450981
4095	NC_018609	GTTTT	2	10	207669	207678	0 %	80 %	20 %	0 %	407450981
4096	NC_018609	T	6	6	207675	207680	0 %	100 %	0 %	0 %	407450981
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4110	NC_018609	AAT	2	6	208137	208142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450981
4111	NC_018609	ATC	2	6	208160	208165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450981
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4113	NC_018609	T	6	6	208209	208214	0 %	100 %	0 %	0 %	407450981
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4125	NC_018609	TGT	2	6	208527	208532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450982
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4368	NC_018609	A	6	6	221179	221184	100 %	0 %	0 %	0 %	407450995
4369	NC_018609	GATTTT	2	12	221349	221360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407450995
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4371	NC_018609	TAAG	2	8	221548	221555	50 %	25 %	25 %	0 %	407450995
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4497	NC_018609	TGG	2	6	228111	228116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450999
4498	NC_018609	ACA	2	6	228128	228133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450999
4499	NC_018609	CTC	2	6	228179	228184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450999
4500	NC_018609	GGA	2	6	228214	228219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450999

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