MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018609	TGC	2	6	181209	181214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
3502	NC_018609	TTTC	2	8	181243	181250	0 %	75 %	0 %	25 %	407450955
3503	NC_018609	CTG	2	6	181322	181327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
3504	NC_018609	CTG	3	9	181373	181381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
3505	NC_018609	ACC	2	6	181416	181421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
3506	NC_018609	TACC	2	8	181460	181467	25 %	25 %	0 %	50 %	407450955
3507	NC_018609	CCA	2	6	181475	181480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
3508	NC_018609	TCC	2	6	181501	181506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450955
3509	NC_018609	CATA	2	8	181532	181539	50 %	25 %	0 %	25 %	407450955
3510	NC_018609	TTC	2	6	181589	181594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
3511	NC_018609	CAAAG	2	10	181623	181632	60 %	0 %	20 %	20 %	407450955
3512	NC_018609	CTC	2	6	181663	181668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450955
3513	NC_018609	ACG	2	6	181678	181683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450955
3514	NC_018609	TAT	2	6	181703	181708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
3515	NC_018609	CCA	2	6	181774	181779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
3516	NC_018609	GAA	2	6	181781	181786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450955
3517	NC_018609	TTA	2	6	181795	181800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
3518	NC_018609	TCT	2	6	181861	181866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
3519	NC_018609	ACGCC	2	10	181872	181881	20 %	0 %	20 %	60 %	407450955
3520	NC_018609	AAT	3	9	182039	182047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450955
3521	NC_018609	CTT	2	6	182057	182062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
3522	NC_018609	CAT	2	6	182066	182071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450955
3523	NC_018609	TTCT	2	8	182163	182170	0 %	75 %	0 %	25 %	407450955
3524	NC_018609	CTC	2	6	182171	182176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450955
3525	NC_018609	T	6	6	182213	182218	0 %	100 %	0 %	0 %	407450955
3526	NC_018609	A	6	6	182322	182327	100 %	0 %	0 %	0 %	407450955
3527	NC_018609	CTT	2	6	182368	182373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
3528	NC_018609	AAT	2	6	182386	182391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450955
3529	NC_018609	CTG	2	6	182393	182398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
3530	NC_018609	ATT	2	6	182449	182454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
3531	NC_018609	ATTG	2	8	182467	182474	25 %	50 %	25 %	0 %	407450955
3532	NC_018609	A	6	6	182527	182532	100 %	0 %	0 %	0 %	407450956
3533	NC_018609	CTTC	2	8	182554	182561	0 %	50 %	0 %	50 %	407450956
3534	NC_018609	ATA	2	6	182661	182666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450956
3535	NC_018609	T	6	6	182674	182679	0 %	100 %	0 %	0 %	407450956
3536	NC_018609	ATA	2	6	182720	182725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450956
3537	NC_018609	A	6	6	182820	182825	100 %	0 %	0 %	0 %	407450956
3538	NC_018609	GAA	2	6	182833	182838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450956
3539	NC_018609	AAT	2	6	182844	182849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450956
3540	NC_018609	A	6	6	182862	182867	100 %	0 %	0 %	0 %	407450956
3541	NC_018609	AAC	2	6	182910	182915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450956
3542	NC_018609	ACC	2	6	182916	182921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450956
3543	NC_018609	T	7	7	182938	182944	0 %	100 %	0 %	0 %	407450956
3544	NC_018609	TCC	2	6	182966	182971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450956
3545	NC_018609	TCT	2	6	183013	183018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450956
3546	NC_018609	ATT	2	6	183053	183058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450956
3547	NC_018609	GAA	2	6	183373	183378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
3548	NC_018609	TC	3	6	183417	183422	0 %	50 %	0 %	50 %	407450957
3549	NC_018609	GA	3	6	183442	183447	50 %	0 %	50 %	0 %	407450957
3550	NC_018609	AAG	2	6	183471	183476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
3551	NC_018609	ACTAA	2	10	183485	183494	60 %	20 %	0 %	20 %	407450957
3552	NC_018609	AGAAA	2	10	183514	183523	80 %	0 %	20 %	0 %	407450957
3553	NC_018609	AAT	2	6	183685	183690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450957
3554	NC_018609	CTAC	2	8	183711	183718	25 %	25 %	0 %	50 %	407450957
3555	NC_018609	TGA	2	6	183805	183810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450957
3556	NC_018609	GTG	2	6	183819	183824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450957
3557	NC_018609	TCA	2	6	183825	183830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450957
3558	NC_018609	ATC	2	6	183833	183838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450957
3559	NC_018609	GAA	2	6	184032	184037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
3560	NC_018609	AGA	2	6	184055	184060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
3561	NC_018609	ATG	2	6	184065	184070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450957
3562	NC_018609	TGA	2	6	184126	184131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450957
3563	NC_018609	TAA	2	6	184147	184152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450957
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3565	NC_018609	AGGT	2	8	184207	184214	25 %	25 %	50 %	0 %	407450957
3566	NC_018609	TACT	2	8	184236	184243	25 %	50 %	0 %	25 %	407450957
3567	NC_018609	TTA	2	6	184268	184273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450957
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3569	NC_018609	AG	3	6	184313	184318	50 %	0 %	50 %	0 %	407450957
3570	NC_018609	CTAA	2	8	184322	184329	50 %	25 %	0 %	25 %	407450957
3571	NC_018609	TAGA	2	8	184374	184381	50 %	25 %	25 %	0 %	407450957
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3574	NC_018609	CAT	2	6	184499	184504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450957
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3579	NC_018609	CAA	2	6	184685	184690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450957
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3590	NC_018609	ATA	2	6	185208	185213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450957
3591	NC_018609	AAC	2	6	185241	185246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450957
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3593	NC_018609	TTA	2	6	185280	185285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450957
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3602	NC_018609	GGT	2	6	185775	185780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450958
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3604	NC_018609	GGT	2	6	185970	185975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450958
3605	NC_018609	TC	3	6	186010	186015	0 %	50 %	0 %	50 %	407450958
3606	NC_018609	TC	3	6	186174	186179	0 %	50 %	0 %	50 %	407450958
3607	NC_018609	TAA	2	6	186185	186190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450958
3608	NC_018609	CTT	2	6	186193	186198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450958
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3610	NC_018609	TTA	2	6	186289	186294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450958
3611	NC_018609	CTA	2	6	186322	186327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450958
3612	NC_018609	AATT	2	8	186533	186540	50 %	50 %	0 %	0 %	407450958
3613	NC_018609	TA	3	6	186606	186611	50 %	50 %	0 %	0 %	407450958
3614	NC_018609	TTATG	2	10	186644	186653	20 %	60 %	20 %	0 %	407450958
3615	NC_018609	CTT	2	6	186776	186781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450958
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3619	NC_018609	GATT	2	8	186901	186908	25 %	50 %	25 %	0 %	407450958
3620	NC_018609	ACTT	2	8	186944	186951	25 %	50 %	0 %	25 %	407450958
3621	NC_018609	A	7	7	187029	187035	100 %	0 %	0 %	0 %	407450959
3622	NC_018609	A	6	6	187044	187049	100 %	0 %	0 %	0 %	407450959
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3997	NC_018609	TAC	2	6	203223	203228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450976
3998	NC_018609	ATC	2	6	203284	203289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450976
3999	NC_018609	GGT	2	6	203393	203398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450976
4000	NC_018609	T	6	6	203446	203451	0 %	100 %	0 %	0 %	407450976

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