MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018609	TCA	2	6	155937	155942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450927
3002	NC_018609	CCAA	2	8	156098	156105	50 %	0 %	0 %	50 %	407450927
3003	NC_018609	TA	3	6	156128	156133	50 %	50 %	0 %	0 %	407450927
3004	NC_018609	TCT	2	6	156171	156176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450927
3005	NC_018609	T	6	6	156209	156214	0 %	100 %	0 %	0 %	407450927
3006	NC_018609	AT	3	6	156264	156269	50 %	50 %	0 %	0 %	407450927
3007	NC_018609	TTAC	2	8	156321	156328	25 %	50 %	0 %	25 %	407450927
3008	NC_018609	TTA	2	6	156378	156383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450927
3009	NC_018609	CATT	2	8	156415	156422	25 %	50 %	0 %	25 %	407450927
3010	NC_018609	ATT	2	6	156434	156439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450927
3011	NC_018609	A	6	6	156449	156454	100 %	0 %	0 %	0 %	407450927
3012	NC_018609	TCA	2	6	156498	156503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450927
3013	NC_018609	TTTC	2	8	156514	156521	0 %	75 %	0 %	25 %	407450927
3014	NC_018609	TG	3	6	156556	156561	0 %	50 %	50 %	0 %	407450927
3015	NC_018609	AAT	2	6	156592	156597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450927
3016	NC_018609	AAG	2	6	156613	156618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450927
3017	NC_018609	TAT	2	6	156622	156627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450927
3018	NC_018609	TATTGA	2	12	156664	156675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407450927
3019	NC_018609	ACC	2	6	156684	156689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450927
3020	NC_018609	TTG	2	6	156690	156695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450927
3021	NC_018609	AGT	2	6	156710	156715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450927
3022	NC_018609	TAA	2	6	156753	156758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450927
3023	NC_018609	T	6	6	156791	156796	0 %	100 %	0 %	0 %	407450927
3024	NC_018609	CAT	2	6	156811	156816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450927
3025	NC_018609	TC	4	8	156840	156847	0 %	50 %	0 %	50 %	407450927
3026	NC_018609	AGAA	2	8	156872	156879	75 %	0 %	25 %	0 %	407450927
3027	NC_018609	AAT	2	6	156930	156935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450927
3028	NC_018609	TTTTAG	2	12	156959	156970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407450927
3029	NC_018609	CCA	2	6	157006	157011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450927
3030	NC_018609	TCA	2	6	157017	157022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450927
3031	NC_018609	AAT	2	6	157038	157043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450927
3032	NC_018609	T	8	8	157090	157097	0 %	100 %	0 %	0 %	407450927
3033	NC_018609	ATA	2	6	157109	157114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450927
3034	NC_018609	AACT	2	8	157120	157127	50 %	25 %	0 %	25 %	407450927
3035	NC_018609	T	7	7	157134	157140	0 %	100 %	0 %	0 %	407450927
3036	NC_018609	CATA	2	8	157269	157276	50 %	25 %	0 %	25 %	407450927
3037	NC_018609	TTC	3	9	157295	157303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450927
3038	NC_018609	CCGT	2	8	157347	157354	0 %	25 %	25 %	50 %	407450927
3039	NC_018609	TAC	2	6	157426	157431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450927
3040	NC_018609	A	6	6	157524	157529	100 %	0 %	0 %	0 %	407450927
3041	NC_018609	CTA	2	6	157615	157620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450927
3042	NC_018609	TA	3	6	157619	157624	50 %	50 %	0 %	0 %	407450927
3043	NC_018609	CTT	2	6	157627	157632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450927
3044	NC_018609	CTG	2	6	157666	157671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450927
3045	NC_018609	ATA	2	6	157736	157741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450927
3046	NC_018609	T	7	7	157825	157831	0 %	100 %	0 %	0 %	407450927
3047	NC_018609	ATA	2	6	157838	157843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450927
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3049	NC_018609	A	7	7	157868	157874	100 %	0 %	0 %	0 %	407450927
3050	NC_018609	CTATT	2	10	157879	157888	20 %	60 %	0 %	20 %	407450927
3051	NC_018609	CTT	2	6	157958	157963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450928
3052	NC_018609	TATC	2	8	157980	157987	25 %	50 %	0 %	25 %	407450928
3053	NC_018609	CT	3	6	158052	158057	0 %	50 %	0 %	50 %	407450928
3054	NC_018609	CAA	2	6	158059	158064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450928
3055	NC_018609	TGT	2	6	158102	158107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450928
3056	NC_018609	TCA	2	6	158111	158116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450928
3057	NC_018609	CAT	2	6	158152	158157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450928
3058	NC_018609	TCA	2	6	158264	158269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450928
3059	NC_018609	TAA	2	6	158274	158279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450928
3060	NC_018609	GTC	2	6	158288	158293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450928
3061	NC_018609	ACG	2	6	158380	158385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450928
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3063	NC_018609	TCA	2	6	158499	158504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450928
3064	NC_018609	TCA	2	6	158507	158512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450928
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3069	NC_018609	CAC	2	6	158751	158756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450928
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3072	NC_018609	TC	3	6	158822	158827	0 %	50 %	0 %	50 %	407450928
3073	NC_018609	TA	3	6	159061	159066	50 %	50 %	0 %	0 %	407450928
3074	NC_018609	CCCA	2	8	159127	159134	25 %	0 %	0 %	75 %	407450928
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3080	NC_018609	CCTT	2	8	159296	159303	0 %	50 %	0 %	50 %	407450929
3081	NC_018609	CTTAA	2	10	159347	159356	40 %	40 %	0 %	20 %	407450929
3082	NC_018609	CTTC	2	8	159503	159510	0 %	50 %	0 %	50 %	407450929
3083	NC_018609	TC	3	6	159509	159514	0 %	50 %	0 %	50 %	407450929
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3092	NC_018609	TATCT	2	10	159847	159856	20 %	60 %	0 %	20 %	407450929
3093	NC_018609	T	6	6	159898	159903	0 %	100 %	0 %	0 %	407450929
3094	NC_018609	TAGTA	2	10	159954	159963	40 %	40 %	20 %	0 %	407450929
3095	NC_018609	AC	3	6	160020	160025	50 %	0 %	0 %	50 %	407450929
3096	NC_018609	CAT	2	6	160044	160049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450929
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3105	NC_018609	TAG	2	6	160448	160453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450930
3106	NC_018609	ACC	2	6	160503	160508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450930
3107	NC_018609	TAC	2	6	160529	160534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450930
3108	NC_018609	A	6	6	160542	160547	100 %	0 %	0 %	0 %	407450930
3109	NC_018609	TCA	2	6	160577	160582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450930
3110	NC_018609	CAA	2	6	160605	160610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450930
3111	NC_018609	ACT	2	6	160648	160653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450930
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3116	NC_018609	TTCA	2	8	160866	160873	25 %	50 %	0 %	25 %	407450930
3117	NC_018609	CCTC	2	8	160912	160919	0 %	25 %	0 %	75 %	407450930
3118	NC_018609	T	6	6	160971	160976	0 %	100 %	0 %	0 %	407450930
3119	NC_018609	TTC	2	6	161049	161054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450930
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3122	NC_018609	GCA	2	6	161131	161136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450930
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3493	NC_018609	AAGA	2	8	180702	180709	75 %	0 %	25 %	0 %	407450954
3494	NC_018609	AGT	2	6	180734	180739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450954
3495	NC_018609	CCA	2	6	180756	180761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450954
3496	NC_018609	ACAT	2	8	180803	180810	50 %	25 %	0 %	25 %	407450954
3497	NC_018609	AAG	2	6	180823	180828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450954
3498	NC_018609	TTA	2	6	181053	181058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
3499	NC_018609	ACC	2	6	181089	181094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
3500	NC_018609	CT	3	6	181192	181197	0 %	50 %	0 %	50 %	407450955

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