MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018609	AAG	2	6	48691	48696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450832
1003	NC_018609	AAT	2	6	48763	48768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450832
1004	NC_018609	ATA	2	6	48800	48805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450832
1005	NC_018609	CTT	2	6	48869	48874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450832
1006	NC_018609	TTTC	2	8	48909	48916	0 %	75 %	0 %	25 %	407450832
1007	NC_018609	TTC	2	6	48920	48925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450832
1008	NC_018609	AGG	2	6	48935	48940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450832
1009	NC_018609	TTTA	2	8	49013	49020	25 %	75 %	0 %	0 %	407450832
1010	NC_018609	CTC	2	6	49022	49027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450832
1011	NC_018609	GATAT	2	10	49040	49049	40 %	40 %	20 %	0 %	407450832
1012	NC_018609	AG	3	6	49100	49105	50 %	0 %	50 %	0 %	407450832
1013	NC_018609	TC	3	6	49147	49152	0 %	50 %	0 %	50 %	407450832
1014	NC_018609	ACC	2	6	49169	49174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450832
1015	NC_018609	CAG	3	9	49213	49221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450832
1016	NC_018609	T	6	6	49227	49232	0 %	100 %	0 %	0 %	407450832
1017	NC_018609	T	6	6	49237	49242	0 %	100 %	0 %	0 %	407450832
1018	NC_018609	T	6	6	49331	49336	0 %	100 %	0 %	0 %	407450833
1019	NC_018609	AATA	2	8	49337	49344	75 %	25 %	0 %	0 %	407450833
1020	NC_018609	TC	3	6	49360	49365	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
1021	NC_018609	TC	3	6	49368	49373	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
1022	NC_018609	GAA	2	6	49437	49442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450833
1023	NC_018609	AGA	2	6	49444	49449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450833
1024	NC_018609	CTT	2	6	49459	49464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1025	NC_018609	GCTTCT	2	12	49569	49580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407450833
1026	NC_018609	CTT	2	6	49594	49599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1027	NC_018609	CTA	2	6	49665	49670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450833
1028	NC_018609	TCC	2	6	49677	49682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450833
1029	NC_018609	TAA	2	6	49820	49825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450833
1030	NC_018609	TTC	2	6	49847	49852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1031	NC_018609	ATAG	2	8	49916	49923	50 %	25 %	25 %	0 %	407450833
1032	NC_018609	CTT	2	6	50011	50016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1033	NC_018609	TCT	2	6	50019	50024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1034	NC_018609	TTA	2	6	50025	50030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450833
1035	NC_018609	A	6	6	50147	50152	100 %	0 %	0 %	0 %	407450833
1036	NC_018609	CTTC	2	8	50170	50177	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
1037	NC_018609	TTA	2	6	50214	50219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450833
1038	NC_018609	TCT	2	6	50244	50249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1039	NC_018609	T	6	6	50264	50269	0 %	100 %	0 %	0 %	407450833
1040	NC_018609	TCGGTA	2	12	50373	50384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407450833
1041	NC_018609	T	6	6	50651	50656	0 %	100 %	0 %	0 %	407450833
1042	NC_018609	ACC	2	6	50667	50672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450833
1043	NC_018609	TAG	2	6	50748	50753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450833
1044	NC_018609	TACC	2	8	50776	50783	25 %	25 %	0 %	50 %	407450833
1045	NC_018609	ATT	2	6	50789	50794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450833
1046	NC_018609	CCT	2	6	50835	50840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450833
1047	NC_018609	AG	3	6	50855	50860	50 %	0 %	50 %	0 %	407450833
1048	NC_018609	TCT	2	6	50884	50889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1049	NC_018609	AGT	2	6	50931	50936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450833
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1051	NC_018609	TTTAT	2	10	51042	51051	20 %	80 %	0 %	0 %	407450833
1052	NC_018609	CTC	2	6	51092	51097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450833
1053	NC_018609	TCT	2	6	51117	51122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1054	NC_018609	TAGA	2	8	51143	51150	50 %	25 %	25 %	0 %	407450833
1055	NC_018609	TA	3	6	51176	51181	50 %	50 %	0 %	0 %	407450833
1056	NC_018609	TC	3	6	51345	51350	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
1057	NC_018609	T	6	6	51393	51398	0 %	100 %	0 %	0 %	407450833
1058	NC_018609	GTT	2	6	51576	51581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450833
1059	NC_018609	CAT	2	6	51643	51648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450833
1060	NC_018609	ATA	2	6	51666	51671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450833
1061	NC_018609	CTG	2	6	51736	51741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450833
1062	NC_018609	ACC	2	6	51840	51845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450833
1063	NC_018609	TC	3	6	51889	51894	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
1064	NC_018609	TTC	2	6	51914	51919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450833
1065	NC_018609	CTC	2	6	51934	51939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450833
1066	NC_018609	GAA	2	6	52005	52010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450833
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1070	NC_018609	GTTCT	2	10	52138	52147	0 %	60 %	20 %	20 %	407450833
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1072	NC_018609	AAGG	2	8	52204	52211	50 %	0 %	50 %	0 %	407450833
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1074	NC_018609	TAT	2	6	52303	52308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450833
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1079	NC_018609	ATC	2	6	52517	52522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450833
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1081	NC_018609	AAT	2	6	52536	52541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450833
1082	NC_018609	TTCT	2	8	52554	52561	0 %	75 %	0 %	25 %	407450833
1083	NC_018609	GGC	2	6	52635	52640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407450833
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1085	NC_018609	TCTT	2	8	52707	52714	0 %	75 %	0 %	25 %	407450833
1086	NC_018609	TA	3	6	52803	52808	50 %	50 %	0 %	0 %	407450834
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1088	NC_018609	GTA	2	6	52825	52830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450834
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1092	NC_018609	A	6	6	52994	52999	100 %	0 %	0 %	0 %	407450834
1093	NC_018609	T	6	6	53026	53031	0 %	100 %	0 %	0 %	407450834
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1098	NC_018609	T	6	6	53313	53318	0 %	100 %	0 %	0 %	407450834
1099	NC_018609	TTA	2	6	53324	53329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450834
1100	NC_018609	TCA	2	6	53476	53481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450834
1101	NC_018609	CT	4	8	53526	53533	0 %	50 %	0 %	50 %	407450834
1102	NC_018609	TAA	2	6	53553	53558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450834
1103	NC_018609	ACT	2	6	53568	53573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450834
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1105	NC_018609	TA	3	6	53603	53608	50 %	50 %	0 %	0 %	407450834
1106	NC_018609	AAAT	2	8	53643	53650	75 %	25 %	0 %	0 %	407450835
1107	NC_018609	ATG	2	6	53694	53699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450835
1108	NC_018609	TGA	2	6	53821	53826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450835
1109	NC_018609	TAG	2	6	53842	53847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450835
1110	NC_018609	TAA	2	6	53859	53864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450835
1111	NC_018609	TA	3	6	53873	53878	50 %	50 %	0 %	0 %	407450835
1112	NC_018609	TGGTGC	2	12	54077	54088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407450835
1113	NC_018609	ATA	2	6	54111	54116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450835
1114	NC_018609	ATC	2	6	54299	54304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450835
1115	NC_018609	CCA	2	6	54309	54314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450835
1116	NC_018609	CAT	2	6	54322	54327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450835
1117	NC_018609	CTG	2	6	54364	54369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450835
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1122	NC_018609	ATC	2	6	54737	54742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450835
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1124	NC_018609	ATA	2	6	54782	54787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450835
1125	NC_018609	T	6	6	54802	54807	0 %	100 %	0 %	0 %	407450835
1126	NC_018609	AC	3	6	54811	54816	50 %	0 %	0 %	50 %	407450835
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1128	NC_018609	AGG	2	6	54874	54879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450835
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