MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018609	ATA	2	6	307896	307901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451072
6002	NC_018609	ACC	2	6	308111	308116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451072
6003	NC_018609	ATA	2	6	308139	308144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451072
6004	NC_018609	TCT	2	6	308165	308170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451072
6005	NC_018609	CAC	2	6	308321	308326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451073
6006	NC_018609	TAC	2	6	308351	308356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451073
6007	NC_018609	TAA	2	6	308360	308365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451073
6008	NC_018609	AGT	2	6	308513	308518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451073
6009	NC_018609	AAT	2	6	308643	308648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451073
6010	NC_018609	TAT	2	6	308746	308751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451074
6011	NC_018609	CA	3	6	308780	308785	50 %	0 %	0 %	50 %	407451074
6012	NC_018609	TTG	2	6	308817	308822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451074
6013	NC_018609	AGGA	2	8	308823	308830	50 %	0 %	50 %	0 %	407451074
6014	NC_018609	ATA	3	9	308890	308898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451074
6015	NC_018609	CCT	2	6	308954	308959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451074
6016	NC_018609	TTAGT	2	10	308966	308975	20 %	60 %	20 %	0 %	407451074
6017	NC_018609	CTTCG	2	10	309024	309033	0 %	40 %	20 %	40 %	407451074
6018	NC_018609	A	6	6	309039	309044	100 %	0 %	0 %	0 %	407451074
6019	NC_018609	CTA	2	6	309143	309148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451074
6020	NC_018609	TCA	2	6	309154	309159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451074
6021	NC_018609	AGC	2	6	309183	309188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451074
6022	NC_018609	AGA	2	6	309228	309233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451074
6023	NC_018609	TTGG	2	8	309240	309247	0 %	50 %	50 %	0 %	407451074
6024	NC_018609	T	7	7	309309	309315	0 %	100 %	0 %	0 %	407451074
6025	NC_018609	CGGA	2	8	309332	309339	25 %	0 %	50 %	25 %	407451074
6026	NC_018609	T	6	6	309372	309377	0 %	100 %	0 %	0 %	407451074
6027	NC_018609	AC	3	6	309452	309457	50 %	0 %	0 %	50 %	407451074
6028	NC_018609	AAAC	2	8	309490	309497	75 %	0 %	0 %	25 %	407451074
6029	NC_018609	TAAA	2	8	309579	309586	75 %	25 %	0 %	0 %	407451074
6030	NC_018609	CCTT	2	8	309592	309599	0 %	50 %	0 %	50 %	407451074
6031	NC_018609	TA	3	6	309623	309628	50 %	50 %	0 %	0 %	407451074
6032	NC_018609	T	8	8	309718	309725	0 %	100 %	0 %	0 %	407451074
6033	NC_018609	TCA	2	6	309728	309733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451074
6034	NC_018609	TAA	2	6	310023	310028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451075
6035	NC_018609	AAC	2	6	310065	310070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451075
6036	NC_018609	TACA	2	8	310124	310131	50 %	25 %	0 %	25 %	407451075
6037	NC_018609	TCA	2	6	310145	310150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451075
6038	NC_018609	TGG	2	6	310195	310200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451075
6039	NC_018609	TGG	2	6	310208	310213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451075
6040	NC_018609	CAA	2	6	310236	310241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451075
6041	NC_018609	TAC	2	6	310314	310319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451075
6042	NC_018609	AAC	2	6	310355	310360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451075
6043	NC_018609	GGT	2	6	310402	310407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451075
6044	NC_018609	TAA	2	6	310434	310439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451075
6045	NC_018609	CCT	2	6	310524	310529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451075
6046	NC_018609	ACC	2	6	310735	310740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451075
6047	NC_018609	TGA	2	6	310749	310754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451075
6048	NC_018609	TTC	2	6	310813	310818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451075
6049	NC_018609	GAA	2	6	310834	310839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451075
6050	NC_018609	AAT	2	6	310861	310866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451075
6051	NC_018609	CCTT	2	8	310913	310920	0 %	50 %	0 %	50 %	407451075
6052	NC_018609	AT	3	6	310943	310948	50 %	50 %	0 %	0 %	407451075
6053	NC_018609	ATT	2	6	310957	310962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451075
6054	NC_018609	ATTAT	2	10	310985	310994	40 %	60 %	0 %	0 %	407451076
6055	NC_018609	AT	3	6	311017	311022	50 %	50 %	0 %	0 %	407451076
6056	NC_018609	CAAA	2	8	311024	311031	75 %	0 %	0 %	25 %	407451076
6057	NC_018609	CAT	2	6	311034	311039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451076
6058	NC_018609	TC	3	6	311132	311137	0 %	50 %	0 %	50 %	407451076
6059	NC_018609	AGA	2	6	311211	311216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451076
6060	NC_018609	CAA	2	6	311304	311309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451076
6061	NC_018609	CTT	2	6	311350	311355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451076
6062	NC_018609	CGG	2	6	311369	311374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407451076
6063	NC_018609	GTA	2	6	311389	311394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451076
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6065	NC_018609	A	6	6	311411	311416	100 %	0 %	0 %	0 %	407451076
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6070	NC_018609	A	7	7	311855	311861	100 %	0 %	0 %	0 %	407451076
6071	NC_018609	GATA	2	8	311910	311917	50 %	25 %	25 %	0 %	407451076
6072	NC_018609	TA	3	6	311989	311994	50 %	50 %	0 %	0 %	407451076
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6091	NC_018609	TA	4	8	312693	312700	50 %	50 %	0 %	0 %	407451077
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6094	NC_018609	TATT	2	8	312877	312884	25 %	75 %	0 %	0 %	407451077
6095	NC_018609	ACTT	2	8	312919	312926	25 %	50 %	0 %	25 %	407451077
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6097	NC_018609	A	6	6	313198	313203	100 %	0 %	0 %	0 %	407451077
6098	NC_018609	ATCT	2	8	313219	313226	25 %	50 %	0 %	25 %	407451077
6099	NC_018609	TAGCAG	2	12	313334	313345	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407451077
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6101	NC_018609	A	6	6	313423	313428	100 %	0 %	0 %	0 %	407451077
6102	NC_018609	GGT	2	6	313441	313446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451077
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6107	NC_018609	CACT	2	8	313575	313582	25 %	25 %	0 %	50 %	407451077
6108	NC_018609	GAA	2	6	313594	313599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451077
6109	NC_018609	TGTAG	2	10	313639	313648	20 %	40 %	40 %	0 %	407451077
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6111	NC_018609	CAT	2	6	313668	313673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451077
6112	NC_018609	T	6	6	313864	313869	0 %	100 %	0 %	0 %	407451078
6113	NC_018609	TCA	2	6	313975	313980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451078
6114	NC_018609	GAA	2	6	314054	314059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451078
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6116	NC_018609	ATTT	2	8	314148	314155	25 %	75 %	0 %	0 %	407451078
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