MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018609	A	7	7	228302	228308	100 %	0 %	0 %	0 %	407450999
4502	NC_018609	AGA	2	6	228364	228369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450999
4503	NC_018609	TAA	3	9	228402	228410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450999
4504	NC_018609	GAA	2	6	228425	228430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450999
4505	NC_018609	TTA	2	6	228434	228439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450999
4506	NC_018609	ATT	2	6	228598	228603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450999
4507	NC_018609	GGT	2	6	228607	228612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450999
4508	NC_018609	CTAT	2	8	228702	228709	25 %	50 %	0 %	25 %	407450999
4509	NC_018609	A	6	6	228727	228732	100 %	0 %	0 %	0 %	407450999
4510	NC_018609	AACT	2	8	228747	228754	50 %	25 %	0 %	25 %	407450999
4511	NC_018609	AAC	2	6	228829	228834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450999
4512	NC_018609	GAAA	2	8	228944	228951	75 %	0 %	25 %	0 %	407450999
4513	NC_018609	ATC	2	6	229063	229068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450999
4514	NC_018609	GTA	2	6	229148	229153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450999
4515	NC_018609	GACA	2	8	229177	229184	50 %	0 %	25 %	25 %	407450999
4516	NC_018609	TGC	2	6	229212	229217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450999
4517	NC_018609	AAT	2	6	229264	229269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450999
4518	NC_018609	ATC	2	6	229426	229431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450999
4519	NC_018609	TAA	2	6	229467	229472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450999
4520	NC_018609	AGA	2	6	229519	229524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450999
4521	NC_018609	A	6	6	229604	229609	100 %	0 %	0 %	0 %	407451000
4522	NC_018609	TAC	2	6	229714	229719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451000
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4524	NC_018609	A	6	6	229781	229786	100 %	0 %	0 %	0 %	407451000
4525	NC_018609	TTC	2	6	229870	229875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451000
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4527	NC_018609	TAA	2	6	230056	230061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451000
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4530	NC_018609	AAC	2	6	230162	230167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451000
4531	NC_018609	TACTA	2	10	230197	230206	40 %	40 %	0 %	20 %	407451000
4532	NC_018609	GAC	2	6	230234	230239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451000
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4534	NC_018609	CTA	2	6	230271	230276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451000
4535	NC_018609	TGA	2	6	230299	230304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451000
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4537	NC_018609	ATA	2	6	230415	230420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451000
4538	NC_018609	TTA	2	6	230448	230453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451000
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4540	NC_018609	TA	3	6	230546	230551	50 %	50 %	0 %	0 %	407451000
4541	NC_018609	GAA	2	6	230575	230580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451000
4542	NC_018609	AAGATA	2	12	230601	230612	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407451000
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4544	NC_018609	CTG	2	6	230682	230687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451000
4545	NC_018609	TG	3	6	230686	230691	0 %	50 %	50 %	0 %	407451000
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4550	NC_018609	TTTGAG	2	12	230941	230952	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407451001
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4553	NC_018609	TTC	2	6	231176	231181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451001
4554	NC_018609	TAT	2	6	231187	231192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451001
4555	NC_018609	TCC	2	6	231206	231211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451001
4556	NC_018609	TAG	2	6	231213	231218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451001
4557	NC_018609	TCT	2	6	231231	231236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451001
4558	NC_018609	A	6	6	231246	231251	100 %	0 %	0 %	0 %	407451001
4559	NC_018609	T	6	6	231254	231259	0 %	100 %	0 %	0 %	407451001
4560	NC_018609	CTTTA	2	10	231296	231305	20 %	60 %	0 %	20 %	407451001
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4564	NC_018609	ATT	2	6	231353	231358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451001
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4566	NC_018609	ATTT	2	8	231463	231470	25 %	75 %	0 %	0 %	407451001
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4582	NC_018609	ATA	2	6	231918	231923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451001
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4590	NC_018609	TTC	2	6	232300	232305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451002
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4605	NC_018609	TCAT	2	8	232712	232719	25 %	50 %	0 %	25 %	407451002
4606	NC_018609	AAT	2	6	232723	232728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451002
4607	NC_018609	CAC	2	6	232735	232740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451002
4608	NC_018609	TA	3	6	232768	232773	50 %	50 %	0 %	0 %	407451002
4609	NC_018609	ATT	2	6	232805	232810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451002
4610	NC_018609	CT	3	6	232837	232842	0 %	50 %	0 %	50 %	407451002
4611	NC_018609	CTC	2	6	232855	232860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451002
4612	NC_018609	T	7	7	232932	232938	0 %	100 %	0 %	0 %	407451002
4613	NC_018609	ACT	2	6	233013	233018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451003
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4994	NC_018609	ATG	2	6	252234	252239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451021
4995	NC_018609	ACT	2	6	252286	252291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451021
4996	NC_018609	ATG	2	6	252391	252396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451021
4997	NC_018609	TC	3	6	252443	252448	0 %	50 %	0 %	50 %	407451021
4998	NC_018609	GTA	2	6	252515	252520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451021
4999	NC_018609	A	7	7	252573	252579	100 %	0 %	0 %	0 %	407451021
5000	NC_018609	AAT	2	6	252638	252643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451021

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