MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017807	GAA	2	6	267	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844948
2	NC_017807	GCAC	2	8	274	281	25 %	0 %	25 %	50 %	386844948
3	NC_017807	CCG	2	6	294	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844948
4	NC_017807	G	6	6	321	326	0 %	0 %	100 %	0 %	386844948
5	NC_017807	ACG	2	6	335	340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844948
6	NC_017807	TTC	2	6	370	375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844948
7	NC_017807	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844948
8	NC_017807	CTGACG	2	12	563	574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386844948
9	NC_017807	CCG	2	6	776	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844949
10	NC_017807	CGT	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
11	NC_017807	GAA	2	6	837	842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844949
12	NC_017807	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
13	NC_017807	AAG	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844949
14	NC_017807	TGC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
15	NC_017807	AAATC	2	10	1004	1013	60 %	20 %	0 %	20 %	386844949
16	NC_017807	ACG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844949
17	NC_017807	GCA	3	9	1060	1068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844949
18	NC_017807	TGC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
19	NC_017807	TTTG	2	8	1098	1105	0 %	75 %	25 %	0 %	386844949
20	NC_017807	GGC	2	6	1289	1294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844949
21	NC_017807	A	7	7	1323	1329	100 %	0 %	0 %	0 %	386844949
22	NC_017807	GCCGC	2	10	1358	1367	0 %	0 %	40 %	60 %	386844949
23	NC_017807	G	6	6	1430	1435	0 %	0 %	100 %	0 %	386844949
24	NC_017807	CAC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844949
25	NC_017807	GAT	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844949
26	NC_017807	A	7	7	1545	1551	100 %	0 %	0 %	0 %	386844949
27	NC_017807	GCA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844950
28	NC_017807	GCGA	2	8	1665	1672	25 %	0 %	50 %	25 %	386844950
29	NC_017807	GT	3	6	1695	1700	0 %	50 %	50 %	0 %	386844950
30	NC_017807	TGC	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844950
31	NC_017807	T	6	6	1819	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	386844950
32	NC_017807	GAT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844950
33	NC_017807	AC	3	6	1876	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	386844950
34	NC_017807	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
35	NC_017807	ATT	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
36	NC_017807	TTG	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844951
37	NC_017807	CTG	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844951
38	NC_017807	TG	3	6	2139	2144	0 %	50 %	50 %	0 %	386844951
39	NC_017807	CAG	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844951
40	NC_017807	AT	4	8	2159	2166	50 %	50 %	0 %	0 %	386844951
41	NC_017807	TACAGG	2	12	2302	2313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386844951
42	NC_017807	TCT	2	6	2397	2402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844951
43	NC_017807	CCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844951
44	NC_017807	ATT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
45	NC_017807	ATTT	2	8	3348	3355	25 %	75 %	0 %	0 %	386844952
46	NC_017807	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	386844952
47	NC_017807	TCC	2	6	3438	3443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386844952
48	NC_017807	A	6	6	3480	3485	100 %	0 %	0 %	0 %	386844952
49	NC_017807	ATG	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844952
50	NC_017807	ATG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844952
51	NC_017807	GGA	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844952
52	NC_017807	GCC	2	6	3675	3680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844952
53	NC_017807	AGA	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844952
54	NC_017807	CCGCCA	2	12	3810	3821	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386844953
55	NC_017807	CTG	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844953
56	NC_017807	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
57	NC_017807	CG	3	6	3971	3976	0 %	0 %	50 %	50 %	386844953
58	NC_017807	T	6	6	3992	3997	0 %	100 %	0 %	0 %	386844953
59	NC_017807	CTG	2	6	4013	4018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844953
60	NC_017807	ATC	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844953
61	NC_017807	CAC	2	6	4063	4068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844953
62	NC_017807	GCA	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844953
63	NC_017807	TCA	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844953
64	NC_017807	TAA	2	6	4147	4152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
65	NC_017807	CTCC	2	8	4158	4165	0 %	25 %	0 %	75 %	386844953
66	NC_017807	TAA	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
67	NC_017807	T	6	6	4183	4188	0 %	100 %	0 %	0 %	386844953
68	NC_017807	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844953
69	NC_017807	GGC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844953
70	NC_017807	TCT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844953
71	NC_017807	CTTTCA	2	12	4368	4379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386844953
72	NC_017807	TGA	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844954
73	NC_017807	GGTAGC	2	12	4618	4629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386844954
74	NC_017807	CGC	2	6	4738	4743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844954
75	NC_017807	GGT	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844954
76	NC_017807	TTA	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844954
77	NC_017807	TTA	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844954
78	NC_017807	TTC	2	6	4985	4990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844954
79	NC_017807	ATTA	2	8	4997	5004	50 %	50 %	0 %	0 %	386844954
80	NC_017807	CAG	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844955
81	NC_017807	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844955
82	NC_017807	TTC	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844955
83	NC_017807	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844955
84	NC_017807	A	6	6	5197	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	386844955
85	NC_017807	TGG	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844955
86	NC_017807	CTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844955
87	NC_017807	GAAA	2	8	5382	5389	75 %	0 %	25 %	0 %	386844956
88	NC_017807	GCTGGC	2	12	5409	5420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386844956
89	NC_017807	TGG	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844956
90	NC_017807	A	6	6	5501	5506	100 %	0 %	0 %	0 %	386844956
91	NC_017807	CAC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844956
92	NC_017807	CAA	2	6	5574	5579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844956
93	NC_017807	CGC	2	6	5646	5651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844956
94	NC_017807	A	6	6	5692	5697	100 %	0 %	0 %	0 %	386844956
95	NC_017807	AAG	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844956
96	NC_017807	CT	3	6	5809	5814	0 %	50 %	0 %	50 %	386844956
97	NC_017807	CAT	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844956
98	NC_017807	CTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844957
99	NC_017807	TCG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
100	NC_017807	GCT	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
101	NC_017807	CT	3	6	6265	6270	0 %	50 %	0 %	50 %	386844957
102	NC_017807	AGCC	2	8	6368	6375	25 %	0 %	25 %	50 %	386844957
103	NC_017807	GGT	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844957
104	NC_017807	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844957
105	NC_017807	GCG	2	6	6452	6457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844957
106	NC_017807	CG	3	6	6456	6461	0 %	0 %	50 %	50 %	386844957
107	NC_017807	CTG	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
108	NC_017807	CCGTG	2	10	6610	6619	0 %	20 %	40 %	40 %	386844957
109	NC_017807	TGT	2	6	6621	6626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844957
110	NC_017807	CGG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844957
111	NC_017807	TCT	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844957
112	NC_017807	CGC	2	6	6724	6729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844958
113	NC_017807	GT	4	8	6751	6758	0 %	50 %	50 %	0 %	386844958
114	NC_017807	CCA	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844958
115	NC_017807	GAA	2	6	6819	6824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844958
116	NC_017807	CGG	2	6	6855	6860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844958
117	NC_017807	CGG	2	6	6896	6901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844958
118	NC_017807	CAG	2	6	6910	6915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
119	NC_017807	CAAAA	2	10	6916	6925	80 %	0 %	0 %	20 %	386844958
120	NC_017807	AGC	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
121	NC_017807	CAG	3	9	6967	6975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
122	NC_017807	GCC	2	6	7041	7046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844958
123	NC_017807	CCGGC	2	10	7124	7133	0 %	0 %	40 %	60 %	386844958
124	NC_017807	G	6	6	7176	7181	0 %	0 %	100 %	0 %	386844958
125	NC_017807	GGGCA	2	10	7183	7192	20 %	0 %	60 %	20 %	386844958
126	NC_017807	G	6	6	7263	7268	0 %	0 %	100 %	0 %	386844958
127	NC_017807	CAG	2	6	7399	7404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
128	NC_017807	TCA	2	6	7421	7426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844958
129	NC_017807	ACA	2	6	7466	7471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844958
130	NC_017807	G	6	6	7502	7507	0 %	0 %	100 %	0 %	386844958
131	NC_017807	ATC	2	6	7657	7662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844958
132	NC_017807	GCT	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844958
133	NC_017807	CT	3	6	7687	7692	0 %	50 %	0 %	50 %	386844958
134	NC_017807	GCC	2	6	7717	7722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844958
135	NC_017807	GGC	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844958
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263	NC_017807	GCA	2	6	13671	13676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844965
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